Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0MVA2

Protein Details
Accession A0A4T0MVA2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-170GMRPPFRPPPPQFRPPPPPRPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-168PGMRPPFRPPPPQFRPPPPPR
Subcellular Location(s) mito 8, cysk 8, cyto 5, mito_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences VQVVCKAAWVELGIWPLDYVKTPDPAPIVPRAFMNINYFCHRRPIDRMTKQKFYCDYCDVFLTHNSAAVRKAHNSGRNHLINVKDYYASLGHDKAQFIIDEICRIHESGLARPPPTLNKFNGPAGLTAPPMMRPPPPGAPPGVRPAFPGMRPPFRPPPPQFRPPPPPRPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.12
6 0.14
7 0.15
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.25
14 0.28
15 0.27
16 0.25
17 0.25
18 0.26
19 0.25
20 0.25
21 0.28
22 0.24
23 0.26
24 0.3
25 0.32
26 0.3
27 0.36
28 0.35
29 0.33
30 0.37
31 0.43
32 0.48
33 0.56
34 0.66
35 0.65
36 0.73
37 0.7
38 0.69
39 0.65
40 0.58
41 0.54
42 0.48
43 0.42
44 0.35
45 0.35
46 0.29
47 0.25
48 0.22
49 0.2
50 0.15
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.2
59 0.22
60 0.29
61 0.31
62 0.33
63 0.38
64 0.37
65 0.37
66 0.35
67 0.32
68 0.28
69 0.27
70 0.24
71 0.16
72 0.15
73 0.15
74 0.12
75 0.12
76 0.1
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.14
96 0.21
97 0.21
98 0.21
99 0.22
100 0.23
101 0.28
102 0.32
103 0.32
104 0.28
105 0.31
106 0.34
107 0.35
108 0.36
109 0.3
110 0.25
111 0.23
112 0.22
113 0.17
114 0.15
115 0.14
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.16
121 0.2
122 0.25
123 0.27
124 0.28
125 0.3
126 0.32
127 0.34
128 0.39
129 0.37
130 0.32
131 0.31
132 0.36
133 0.36
134 0.33
135 0.4
136 0.38
137 0.44
138 0.48
139 0.54
140 0.57
141 0.6
142 0.69
143 0.67
144 0.7
145 0.7
146 0.76
147 0.77
148 0.77
149 0.81
150 0.8