FuNGI

A0A4T0M189

Protein Details

Accession

A0A4T0M189

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
265-289	ITPKINRTNKFKRPRPAHKVVRSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-279	KRPR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010920 LSM_dom_sf IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM
CDD	cd01717 Sm_B

Amino Acid Sequences

MLTLINYRLRVTLNDTRQLVGQMLAFDRHMNLVLVDTIEFRRLKGPSSQGDIPKEMKRALGLIVLRGETIISISVEGPPPVKEEDPISNGPGVGAPAGRGMPLGAGAGPAPPAFQARPMPYAGGPPPPGFPGAAPGFRPPPGFPGAPPQSMPGFPAPPPGVQDKLTEQGIPASQLPDIISNLAKDGHLSNFITAETLENVKHFANTDNLEATFVSLDGVLSLIDSLLVSSPKQDSLLDEEPLEEISFMSTLDSPRKDQVLPSDGITPKINRTNKFKRPRPAHKVVRSSSSVTDLSDYYPSDNELQSPSTSSPPQTPNLDNIPDSYNNLNGLMLSSNNQNNDALIQTQNQIRELEKRNNELEKRLKESERSYTQTTSQNEDYISVMEDQLKDNDMKLEALAREEKDLRAKDRQNMFTINKLEHDIATYQRQTESARMQANSLQNQVQDVNAEIDSLRDSLREKDRDVREARSRADRYEHEIKKWENERKGYEDALQRIKSQLEIARKSERVLEVQKSENVGLKETIDRLRGDLSHQLTYSGSSQDENAGQLGSVSRNLGKELARQLTEVDNSAGKTLSNEPSEGEIETIVTTRRRKVKPSISSLRNIETDNNTDSTESPPPYSQGNEFEIVEDVKKVTNRGVQVTPESKTIETQTSTDEDKSNDKEAHSQDSKKSSFWKKLSSNLTFKRRRSVSHTITIYSTIVFLCGMIGGAWILPSTTSSLEAVRSLSGYDDKALFVAYNTFDGASTLLNSDGSLTHFLQTLVWNGLDSSQLFPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.45
3	0.44
4	0.44
5	0.43
6	0.36
7	0.27
8	0.22
9	0.17
10	0.18
11	0.18
12	0.17
13	0.17
14	0.16
15	0.16
16	0.16
17	0.13
18	0.12
19	0.12
20	0.12
21	0.12
22	0.11
23	0.13
24	0.12
25	0.18
26	0.18
27	0.18
28	0.23
29	0.23
30	0.25
31	0.31
32	0.37
33	0.37
34	0.45
35	0.51
36	0.52
37	0.56
38	0.57
39	0.55
40	0.52
41	0.51
42	0.44
43	0.39
44	0.33
45	0.3
46	0.26
47	0.27
48	0.23
49	0.22
50	0.23
51	0.22
52	0.2
53	0.19
54	0.17
55	0.11
56	0.11
57	0.09
58	0.07
59	0.07
60	0.08
61	0.11
62	0.12
63	0.13
64	0.14
65	0.13
66	0.15
67	0.18
68	0.18
69	0.17
70	0.2
71	0.25
72	0.3
73	0.31
74	0.3
75	0.28
76	0.27
77	0.26
78	0.22
79	0.17
80	0.12
81	0.1
82	0.08
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.08
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.05
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.07
96	0.07
97	0.06
98	0.07
99	0.1
100	0.1
101	0.14
102	0.2
103	0.23
104	0.25
105	0.26
106	0.28
107	0.25
108	0.3
109	0.28
110	0.28
111	0.27
112	0.26
113	0.26
114	0.25
115	0.26
116	0.21
117	0.19
118	0.19
119	0.2
120	0.22
121	0.22
122	0.24
123	0.26
124	0.27
125	0.3
126	0.23
127	0.24
128	0.26
129	0.26
130	0.23
131	0.3
132	0.34
133	0.33
134	0.33
135	0.31
136	0.29
137	0.28
138	0.3
139	0.23
140	0.21
141	0.19
142	0.26
143	0.25
144	0.23
145	0.26
146	0.27
147	0.26
148	0.25
149	0.27
150	0.23
151	0.26
152	0.26
153	0.23
154	0.19
155	0.2
156	0.19
157	0.19
158	0.16
159	0.13
160	0.12
161	0.13
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.14
175	0.14
176	0.14
177	0.14
178	0.14
179	0.13
180	0.11
181	0.11
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.09
186	0.11
187	0.11
188	0.12
189	0.11
190	0.12
191	0.15
192	0.16
193	0.18
194	0.18
195	0.18
196	0.18
197	0.17
198	0.15
199	0.11
200	0.09
201	0.07
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.07
217	0.08
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.18
223	0.21
224	0.2
225	0.19
226	0.19
227	0.18
228	0.18
229	0.17
230	0.09
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.08
238	0.13
239	0.15
240	0.17
241	0.19
242	0.21
243	0.21
244	0.21
245	0.26
246	0.26
247	0.25
248	0.24
249	0.29
250	0.27
251	0.29
252	0.29
253	0.24
254	0.24
255	0.31
256	0.36
257	0.33
258	0.42
259	0.5
260	0.59
261	0.68
262	0.72
263	0.73
264	0.78
265	0.85
266	0.85
267	0.85
268	0.86
269	0.84
270	0.85
271	0.77
272	0.72
273	0.64
274	0.57
275	0.47
276	0.4
277	0.32
278	0.23
279	0.22
280	0.17
281	0.15
282	0.14
283	0.14
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.12
292	0.11
293	0.13
294	0.13
295	0.14
296	0.15
297	0.15
298	0.19
299	0.21
300	0.24
301	0.26
302	0.26
303	0.27
304	0.29
305	0.3
306	0.24
307	0.23
308	0.23
309	0.19
310	0.2
311	0.17
312	0.15
313	0.13
314	0.13
315	0.11
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.09
322	0.11
323	0.11
324	0.12
325	0.12
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.09
330	0.08
331	0.09
332	0.1
333	0.12
334	0.13
335	0.14
336	0.14
337	0.13
338	0.2
339	0.25
340	0.31
341	0.32
342	0.35
343	0.37
344	0.43
345	0.43
346	0.43
347	0.45
348	0.41
349	0.43
350	0.44
351	0.42
352	0.39
353	0.41
354	0.42
355	0.39
356	0.39
357	0.36
358	0.33
359	0.36
360	0.38
361	0.37
362	0.34
363	0.29
364	0.26
365	0.24
366	0.23
367	0.2
368	0.13
369	0.12
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.08
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.09
384	0.08
385	0.09
386	0.11
387	0.11
388	0.12
389	0.13
390	0.14
391	0.18
392	0.2
393	0.21
394	0.27
395	0.3
396	0.36
397	0.42
398	0.44
399	0.41
400	0.45
401	0.42
402	0.4
403	0.39
404	0.32
405	0.26
406	0.24
407	0.22
408	0.17
409	0.17
410	0.12
411	0.12
412	0.16
413	0.15
414	0.14
415	0.14
416	0.15
417	0.15
418	0.17
419	0.18
420	0.19
421	0.22
422	0.21
423	0.22
424	0.25
425	0.28
426	0.27
427	0.26
428	0.22
429	0.19
430	0.19
431	0.19
432	0.14
433	0.1
434	0.09
435	0.09
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.07
445	0.13
446	0.2
447	0.22
448	0.24
449	0.32
450	0.35
451	0.42
452	0.43
453	0.45
454	0.45
455	0.47
456	0.48
457	0.48
458	0.47
459	0.41
460	0.44
461	0.39
462	0.38
463	0.45
464	0.44
465	0.38
466	0.42
467	0.41
468	0.44
469	0.51
470	0.51
471	0.47
472	0.5
473	0.51
474	0.5
475	0.51
476	0.44
477	0.41
478	0.39
479	0.37
480	0.39
481	0.36
482	0.32
483	0.31
484	0.3
485	0.25
486	0.23
487	0.23
488	0.25
489	0.27
490	0.3
491	0.35
492	0.35
493	0.35
494	0.36
495	0.33
496	0.29
497	0.31
498	0.31
499	0.29
500	0.31
501	0.32
502	0.29
503	0.29
504	0.28
505	0.23
506	0.21
507	0.18
508	0.16
509	0.16
510	0.17
511	0.19
512	0.17
513	0.17
514	0.17
515	0.18
516	0.17
517	0.18
518	0.22
519	0.22
520	0.22
521	0.22
522	0.21
523	0.2
524	0.21
525	0.2
526	0.15
527	0.12
528	0.1
529	0.11
530	0.12
531	0.13
532	0.11
533	0.1
534	0.09
535	0.08
536	0.08
537	0.09
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.14
545	0.14
546	0.18
547	0.23
548	0.26
549	0.25
550	0.25
551	0.26
552	0.26
553	0.26
554	0.22
555	0.17
556	0.15
557	0.14
558	0.15
559	0.13
560	0.1
561	0.11
562	0.15
563	0.19
564	0.18
565	0.18
566	0.18
567	0.21
568	0.22
569	0.2
570	0.15
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.1
575	0.09
576	0.14
577	0.16
578	0.23
579	0.32
580	0.36
581	0.42
582	0.51
583	0.59
584	0.63
585	0.7
586	0.74
587	0.7
588	0.73
589	0.7
590	0.63
591	0.55
592	0.47
593	0.41
594	0.35
595	0.33
596	0.29
597	0.27
598	0.24
599	0.23
600	0.22
601	0.22
602	0.24
603	0.22
604	0.21
605	0.21
606	0.22
607	0.23
608	0.25
609	0.23
610	0.22
611	0.24
612	0.24
613	0.23
614	0.23
615	0.22
616	0.21
617	0.18
618	0.14
619	0.12
620	0.13
621	0.14
622	0.14
623	0.17
624	0.21
625	0.24
626	0.28
627	0.3
628	0.3
629	0.36
630	0.38
631	0.36
632	0.34
633	0.33
634	0.29
635	0.28
636	0.28
637	0.25
638	0.23
639	0.22
640	0.22
641	0.23
642	0.26
643	0.26
644	0.25
645	0.23
646	0.27
647	0.3
648	0.33
649	0.32
650	0.31
651	0.36
652	0.37
653	0.44
654	0.44
655	0.45
656	0.46
657	0.52
658	0.52
659	0.48
660	0.54
661	0.54
662	0.57
663	0.58
664	0.61
665	0.57
666	0.65
667	0.71
668	0.7
669	0.71
670	0.71
671	0.76
672	0.75
673	0.73
674	0.75
675	0.69
676	0.66
677	0.64
678	0.66
679	0.62
680	0.63
681	0.64
682	0.55
683	0.53
684	0.5
685	0.41
686	0.31
687	0.24
688	0.14
689	0.12
690	0.1
691	0.08
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.04
703	0.05
704	0.07
705	0.08
706	0.1
707	0.11
708	0.12
709	0.13
710	0.14
711	0.15
712	0.13
713	0.13
714	0.11
715	0.13
716	0.15
717	0.15
718	0.16
719	0.16
720	0.15
721	0.15
722	0.15
723	0.13
724	0.11
725	0.14
726	0.12
727	0.13
728	0.13
729	0.13
730	0.13
731	0.13
732	0.13
733	0.1
734	0.1
735	0.1
736	0.1
737	0.09
738	0.09
739	0.1
740	0.1
741	0.12
742	0.15
743	0.15
744	0.16
745	0.17
746	0.17
747	0.18
748	0.19
749	0.2
750	0.18
751	0.17
752	0.16
753	0.15
754	0.16
755	0.17
756	0.16

A0A4T0M189

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer