Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0MCH1

Protein Details
Accession A0A4T0MCH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-94QFVLQRCTNKPPKKFDRSVIHydrophilic
167-186RWIHRQKRNNHQDTRPQRIIHydrophilic
501-525VWEQVASRRRQSREKVRLQAEKEERHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MIGRLRRGVNSGSIFQQFTGINLRRTKNLPRTVRWLYDELEMETNQLNRNNKIWSKYLQCVESNQAAFLPQSIHQFVLQRCTNKPPKKFDRSVIERYLHNQDRLRFTIDQMRINNFKPTLDDYKFILDRFALMGSRSGCRRIMREVLDNGLQLDLECYNTTLMAYVRWIHRQKRNNHQDTRPQRIISAEISGLLEEMAKNSIQPNEDTYNYVLSILKDIQDFDGLIQLLESTYGIDISNPDQQPIQFLDFHAQNPEIIPPKVSPSVLRSIIDAVGNHSNLSTLISVFEALVNPITKDGIQTYVWKVTPEEASTSQVSIKGKNLSVSVLDRLLYHITQKGPSFLVKHYLQYAMLAYNEEKANNMAYRNSILDNASLDSLKHAHMRIPRIFFSAQLLTSIRIGVLDHHGIKIGVIRYLIDKLPMIIQSQEEEYQELANWTKEYESKVNELLTNEEATKMDNETFDNLLSKFETDIKLLNERASTLKLHNRFLRVAGNTWMPKVWEQVASRRRQSREKVRLQAEKEEREEKAKTLQDDYFVAASAPVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.31
3 0.33
4 0.25
5 0.22
6 0.3
7 0.29
8 0.33
9 0.39
10 0.42
11 0.43
12 0.49
13 0.57
14 0.57
15 0.63
16 0.65
17 0.64
18 0.7
19 0.72
20 0.73
21 0.68
22 0.61
23 0.53
24 0.5
25 0.46
26 0.4
27 0.36
28 0.29
29 0.26
30 0.25
31 0.26
32 0.24
33 0.28
34 0.3
35 0.29
36 0.33
37 0.39
38 0.41
39 0.44
40 0.44
41 0.46
42 0.48
43 0.52
44 0.55
45 0.51
46 0.48
47 0.47
48 0.48
49 0.48
50 0.41
51 0.34
52 0.28
53 0.25
54 0.23
55 0.2
56 0.17
57 0.13
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.2
62 0.26
63 0.26
64 0.33
65 0.35
66 0.34
67 0.35
68 0.44
69 0.53
70 0.55
71 0.62
72 0.64
73 0.7
74 0.77
75 0.8
76 0.79
77 0.79
78 0.78
79 0.78
80 0.75
81 0.68
82 0.59
83 0.57
84 0.59
85 0.53
86 0.51
87 0.48
88 0.45
89 0.49
90 0.5
91 0.51
92 0.42
93 0.39
94 0.43
95 0.43
96 0.44
97 0.4
98 0.43
99 0.42
100 0.43
101 0.46
102 0.37
103 0.33
104 0.29
105 0.32
106 0.35
107 0.33
108 0.33
109 0.29
110 0.35
111 0.36
112 0.33
113 0.28
114 0.2
115 0.18
116 0.17
117 0.17
118 0.11
119 0.1
120 0.13
121 0.14
122 0.17
123 0.18
124 0.19
125 0.22
126 0.24
127 0.26
128 0.28
129 0.34
130 0.34
131 0.39
132 0.38
133 0.38
134 0.37
135 0.34
136 0.29
137 0.22
138 0.18
139 0.11
140 0.1
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.08
152 0.11
153 0.13
154 0.22
155 0.28
156 0.34
157 0.43
158 0.51
159 0.58
160 0.66
161 0.75
162 0.76
163 0.78
164 0.77
165 0.79
166 0.79
167 0.8
168 0.74
169 0.63
170 0.54
171 0.48
172 0.43
173 0.33
174 0.27
175 0.17
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.15
192 0.17
193 0.18
194 0.2
195 0.19
196 0.17
197 0.16
198 0.17
199 0.13
200 0.1
201 0.12
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.07
210 0.1
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.17
232 0.17
233 0.11
234 0.11
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.13
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.14
251 0.14
252 0.19
253 0.2
254 0.19
255 0.17
256 0.16
257 0.17
258 0.17
259 0.13
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.07
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.11
288 0.13
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.17
295 0.15
296 0.17
297 0.14
298 0.16
299 0.16
300 0.16
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.15
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.13
322 0.14
323 0.16
324 0.16
325 0.17
326 0.16
327 0.18
328 0.19
329 0.16
330 0.22
331 0.2
332 0.21
333 0.21
334 0.21
335 0.19
336 0.17
337 0.17
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.12
351 0.12
352 0.14
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.13
367 0.12
368 0.16
369 0.21
370 0.29
371 0.33
372 0.36
373 0.36
374 0.37
375 0.37
376 0.33
377 0.32
378 0.27
379 0.22
380 0.2
381 0.19
382 0.16
383 0.16
384 0.16
385 0.11
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.11
390 0.14
391 0.15
392 0.15
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.18
397 0.15
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.16
403 0.16
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.14
408 0.15
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.16
414 0.17
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.11
425 0.12
426 0.14
427 0.19
428 0.23
429 0.25
430 0.26
431 0.29
432 0.3
433 0.31
434 0.29
435 0.27
436 0.24
437 0.22
438 0.19
439 0.18
440 0.16
441 0.16
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.13
446 0.14
447 0.16
448 0.17
449 0.16
450 0.18
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.15
455 0.14
456 0.17
457 0.18
458 0.16
459 0.2
460 0.22
461 0.27
462 0.27
463 0.28
464 0.24
465 0.25
466 0.26
467 0.25
468 0.24
469 0.25
470 0.33
471 0.35
472 0.43
473 0.46
474 0.48
475 0.47
476 0.47
477 0.49
478 0.43
479 0.41
480 0.37
481 0.4
482 0.37
483 0.37
484 0.35
485 0.3
486 0.28
487 0.29
488 0.28
489 0.27
490 0.29
491 0.38
492 0.45
493 0.51
494 0.59
495 0.63
496 0.66
497 0.68
498 0.76
499 0.77
500 0.79
501 0.81
502 0.82
503 0.83
504 0.86
505 0.81
506 0.81
507 0.79
508 0.75
509 0.71
510 0.67
511 0.6
512 0.57
513 0.55
514 0.46
515 0.46
516 0.44
517 0.42
518 0.41
519 0.41
520 0.38
521 0.38
522 0.38
523 0.3
524 0.25
525 0.21