Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0RAN5

Protein Details
Accession A0A4T0RAN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
960-999PLDMRHKKTRAIRRRLTPKEQNAKTVRQHKREIHFGRRKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
955-1003KGKRIPLDMRHKKTRAIRRRLTPKEQNAKTVRQHKREIHFGRRKFAIKA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001854  Ribosomal_L29/L35  
IPR036049  Ribosomal_L29/L35_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR045111  Vps41/Vps8  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006623  P:protein targeting to vacuole  
GO:0006412  P:translation  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF00831  Ribosomal_L29  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
CDD cd00427  Ribosomal_L29_HIP  
Amino Acid Sequences MSSISLEIDYDEEPPFKYTKIGADVSTSTLKDSASVLRCCDQFIALGTHAGYLHLFSHSGHRIKAFKPHSATISDISLDSEQNYIATASVDGQVFISSIYGQERYYFDIKRPMRCVALDPHFSTKSSRAFICGGLNGRLTLNEKGWLGHRQIDLQPTDREEGPIYNCIWNNHLVAWSNDSGIRLYDVQLMKLIAFIPKLDISPRPDLFRVSLSFIDHHTLIIGWGSIIRLVKIRYRHSAPLHNYEHPQLLAEIESTFEMDAMISSVLPFENSLLVLAWLEPDGALLNDETITDKNAQRKRASKRPELRVLTLDGEENAEDRLPIRNFYLYGCNDYKLVPSLFPTRNGLKAGFYFMSPRDVVRVEARDEIDHVEWLIEGKHYGEALESAKTLTVEHDFNIDELGQMYLRSLITDGEYEAAASRATEILKLNTSAWEDFFYTFANYDKLDVIIPVIPKKQPQLDEQVYAIILHHLLQTNHRDFYTSIIEWPSDIYDIGSIISAVQNEIENDEKEILLESLAELYLRNRQPGKVLPIYLKLEKYEVFDLIKKYSLWTDIQYQALELVKFDEGLTMSESQSQWIEGGRGTVIKMLVDHTYSIQLRSSLIVKKVSRVVDQLQHESRYLYLYLDTLRELDGMIVEPYADNMVELYAEYDYSKLEGYLRTNTRYNLEKAYKVCEKRDYVQEMVFILGRMGSNKLALSLIIERLGDVKRAIAFAKEQSDDDLWEDLLKYSESRPTFIRGLLENVGPEIDPVRLIKRIKNGLEIPGLKDALIKILRDFQIQVSCCSYYRYPNKQKISLLEGCQTVMHTDCQRILDELLKAHSKGQLGGPNTSCAKSQEKAYKKNETTLVYNDGRTYLASSLLGERTGEVRLKTIDQKIAWKVQVRAHELQSKNKTDLLNQLHELKGELVQLRVAKVAGGSASKLTKIHSVRKSIARVLTVINQKQRQHVAEAYKGKRIPLDMRHKKTRAIRRRLTPKEQNAKTVRQHKREIHFGRRKFAIKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.16
4 0.18
5 0.19
6 0.23
7 0.28
8 0.3
9 0.28
10 0.31
11 0.32
12 0.34
13 0.35
14 0.29
15 0.24
16 0.23
17 0.22
18 0.18
19 0.19
20 0.23
21 0.26
22 0.29
23 0.31
24 0.35
25 0.36
26 0.36
27 0.35
28 0.27
29 0.22
30 0.22
31 0.24
32 0.19
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.18
37 0.17
38 0.14
39 0.1
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.1
44 0.18
45 0.25
46 0.28
47 0.29
48 0.33
49 0.37
50 0.39
51 0.48
52 0.45
53 0.46
54 0.49
55 0.52
56 0.5
57 0.48
58 0.48
59 0.41
60 0.38
61 0.31
62 0.25
63 0.23
64 0.21
65 0.18
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.06
85 0.07
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.14
90 0.15
91 0.2
92 0.25
93 0.25
94 0.26
95 0.35
96 0.4
97 0.45
98 0.48
99 0.47
100 0.45
101 0.45
102 0.46
103 0.45
104 0.48
105 0.46
106 0.45
107 0.48
108 0.46
109 0.45
110 0.45
111 0.42
112 0.4
113 0.38
114 0.35
115 0.31
116 0.32
117 0.33
118 0.33
119 0.31
120 0.28
121 0.26
122 0.27
123 0.24
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.23
133 0.26
134 0.25
135 0.29
136 0.29
137 0.3
138 0.33
139 0.38
140 0.37
141 0.36
142 0.36
143 0.33
144 0.35
145 0.31
146 0.29
147 0.25
148 0.25
149 0.24
150 0.25
151 0.24
152 0.26
153 0.27
154 0.27
155 0.27
156 0.26
157 0.24
158 0.22
159 0.22
160 0.19
161 0.18
162 0.22
163 0.2
164 0.19
165 0.19
166 0.18
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.12
171 0.13
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.18
188 0.22
189 0.3
190 0.31
191 0.33
192 0.33
193 0.34
194 0.34
195 0.33
196 0.3
197 0.25
198 0.25
199 0.23
200 0.23
201 0.22
202 0.24
203 0.19
204 0.17
205 0.14
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.11
217 0.13
218 0.18
219 0.24
220 0.29
221 0.34
222 0.38
223 0.45
224 0.48
225 0.55
226 0.57
227 0.6
228 0.6
229 0.56
230 0.54
231 0.48
232 0.45
233 0.35
234 0.31
235 0.21
236 0.17
237 0.13
238 0.12
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.12
280 0.15
281 0.23
282 0.28
283 0.34
284 0.39
285 0.47
286 0.54
287 0.6
288 0.65
289 0.67
290 0.73
291 0.76
292 0.8
293 0.76
294 0.7
295 0.63
296 0.57
297 0.48
298 0.39
299 0.3
300 0.21
301 0.17
302 0.14
303 0.11
304 0.09
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.18
315 0.24
316 0.19
317 0.24
318 0.24
319 0.24
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.18
324 0.18
325 0.12
326 0.14
327 0.22
328 0.23
329 0.24
330 0.27
331 0.26
332 0.28
333 0.3
334 0.27
335 0.21
336 0.2
337 0.22
338 0.18
339 0.16
340 0.16
341 0.15
342 0.18
343 0.16
344 0.15
345 0.14
346 0.14
347 0.16
348 0.18
349 0.19
350 0.18
351 0.21
352 0.22
353 0.19
354 0.2
355 0.2
356 0.16
357 0.14
358 0.12
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.09
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.07
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.1
440 0.12
441 0.13
442 0.14
443 0.17
444 0.2
445 0.2
446 0.22
447 0.29
448 0.29
449 0.3
450 0.28
451 0.26
452 0.22
453 0.2
454 0.17
455 0.08
456 0.06
457 0.05
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.11
462 0.17
463 0.18
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.17
468 0.2
469 0.21
470 0.16
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.13
475 0.14
476 0.11
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.03
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.05
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.03
508 0.04
509 0.11
510 0.12
511 0.15
512 0.16
513 0.16
514 0.19
515 0.23
516 0.29
517 0.24
518 0.25
519 0.24
520 0.28
521 0.31
522 0.3
523 0.27
524 0.21
525 0.2
526 0.19
527 0.2
528 0.16
529 0.14
530 0.13
531 0.16
532 0.17
533 0.16
534 0.17
535 0.14
536 0.14
537 0.14
538 0.15
539 0.13
540 0.13
541 0.17
542 0.18
543 0.19
544 0.18
545 0.17
546 0.16
547 0.16
548 0.14
549 0.1
550 0.09
551 0.07
552 0.08
553 0.08
554 0.07
555 0.06
556 0.07
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.1
565 0.09
566 0.08
567 0.09
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.12
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.15
590 0.14
591 0.16
592 0.22
593 0.22
594 0.25
595 0.29
596 0.3
597 0.28
598 0.28
599 0.28
600 0.29
601 0.31
602 0.35
603 0.32
604 0.31
605 0.3
606 0.28
607 0.24
608 0.19
609 0.17
610 0.11
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.09
616 0.08
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.06
621 0.05
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.04
627 0.05
628 0.05
629 0.04
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.06
643 0.05
644 0.07
645 0.09
646 0.11
647 0.19
648 0.22
649 0.25
650 0.27
651 0.28
652 0.31
653 0.33
654 0.33
655 0.33
656 0.34
657 0.34
658 0.33
659 0.39
660 0.43
661 0.42
662 0.43
663 0.42
664 0.42
665 0.43
666 0.49
667 0.48
668 0.43
669 0.4
670 0.38
671 0.31
672 0.28
673 0.24
674 0.16
675 0.1
676 0.09
677 0.08
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.08
685 0.08
686 0.09
687 0.09
688 0.1
689 0.1
690 0.1
691 0.09
692 0.12
693 0.13
694 0.12
695 0.1
696 0.11
697 0.11
698 0.12
699 0.13
700 0.11
701 0.13
702 0.15
703 0.19
704 0.19
705 0.18
706 0.2
707 0.2
708 0.19
709 0.19
710 0.16
711 0.12
712 0.11
713 0.12
714 0.09
715 0.1
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.16
720 0.16
721 0.18
722 0.19
723 0.23
724 0.24
725 0.25
726 0.26
727 0.21
728 0.24
729 0.24
730 0.23
731 0.18
732 0.17
733 0.16
734 0.12
735 0.11
736 0.08
737 0.06
738 0.07
739 0.08
740 0.1
741 0.16
742 0.18
743 0.22
744 0.29
745 0.37
746 0.38
747 0.43
748 0.43
749 0.42
750 0.47
751 0.44
752 0.39
753 0.35
754 0.33
755 0.26
756 0.25
757 0.21
758 0.2
759 0.2
760 0.18
761 0.16
762 0.23
763 0.24
764 0.24
765 0.25
766 0.22
767 0.27
768 0.28
769 0.29
770 0.25
771 0.26
772 0.24
773 0.27
774 0.26
775 0.28
776 0.37
777 0.46
778 0.53
779 0.61
780 0.68
781 0.7
782 0.72
783 0.67
784 0.65
785 0.6
786 0.53
787 0.48
788 0.41
789 0.36
790 0.32
791 0.28
792 0.21
793 0.16
794 0.17
795 0.15
796 0.17
797 0.18
798 0.2
799 0.2
800 0.2
801 0.2
802 0.2
803 0.2
804 0.19
805 0.21
806 0.22
807 0.22
808 0.22
809 0.24
810 0.21
811 0.21
812 0.25
813 0.27
814 0.27
815 0.32
816 0.32
817 0.33
818 0.34
819 0.33
820 0.29
821 0.27
822 0.29
823 0.26
824 0.33
825 0.38
826 0.45
827 0.54
828 0.6
829 0.66
830 0.64
831 0.69
832 0.67
833 0.6
834 0.56
835 0.5
836 0.51
837 0.42
838 0.41
839 0.34
840 0.29
841 0.26
842 0.22
843 0.2
844 0.13
845 0.12
846 0.11
847 0.12
848 0.14
849 0.15
850 0.15
851 0.13
852 0.13
853 0.13
854 0.16
855 0.18
856 0.15
857 0.16
858 0.18
859 0.22
860 0.28
861 0.32
862 0.35
863 0.34
864 0.41
865 0.43
866 0.48
867 0.49
868 0.48
869 0.47
870 0.46
871 0.52
872 0.52
873 0.52
874 0.51
875 0.55
876 0.53
877 0.58
878 0.62
879 0.59
880 0.54
881 0.53
882 0.48
883 0.42
884 0.49
885 0.46
886 0.43
887 0.41
888 0.43
889 0.39
890 0.39
891 0.37
892 0.28
893 0.23
894 0.22
895 0.2
896 0.16
897 0.19
898 0.2
899 0.2
900 0.2
901 0.18
902 0.14
903 0.12
904 0.13
905 0.12
906 0.11
907 0.11
908 0.14
909 0.15
910 0.17
911 0.17
912 0.18
913 0.25
914 0.3
915 0.38
916 0.42
917 0.48
918 0.53
919 0.61
920 0.65
921 0.63
922 0.61
923 0.53
924 0.48
925 0.44
926 0.45
927 0.46
928 0.47
929 0.5
930 0.52
931 0.53
932 0.58
933 0.62
934 0.57
935 0.53
936 0.53
937 0.51
938 0.53
939 0.6
940 0.57
941 0.57
942 0.56
943 0.52
944 0.48
945 0.46
946 0.46
947 0.46
948 0.54
949 0.57
950 0.65
951 0.74
952 0.74
953 0.77
954 0.78
955 0.79
956 0.79
957 0.79
958 0.79
959 0.8
960 0.88
961 0.9
962 0.91
963 0.9
964 0.9
965 0.9
966 0.85
967 0.84
968 0.79
969 0.78
970 0.77
971 0.78
972 0.77
973 0.74
974 0.8
975 0.79
976 0.8
977 0.82
978 0.81
979 0.82
980 0.82
981 0.79
982 0.77
983 0.76