FuNGI

A0A4T0R9C1

Protein Details

Accession

A0A4T0R9C1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-83	LSTVLNHPNKRPKPLRASRYPLPAI	Hydrophilic
1204-1229	NSNKTKPASSKAKSKNQKKKNKKGKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1209-1229	KPASSKAKSKNQKKKNKKGKK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MVSSIPSSPGSTRQSLDSAAESLAFSRASTRGDAAMSWSLDRYRSSPSISTQSTGFNALSTVLNHPNKRPKPLRASRYPLPAISSVDLRLSSTSAIETYLEDIQGEYTEFIDNINQSAASTSAQPESDLPSLDDIPRLFFKPDFDLGDPATFAAVTKSIGDSAGLDIFESPEDIGINEILHSRLEHHANAVDKILVHELSQRAPSLFSALDNLQHLGRYASEALEKFNTLRELLESSIKSRFETKYKTINGVIDQRNLEEILTVITDVKSISQALLALQQMSELGHYFDALELVENISKTVVENIRSKDVDDILKIQSSTDFSQLQVFNDVASDLEQHTSVILDSISRDLADTLFIDYEHSLKDTDHDHQELVKDIEQSICVLDRAGMLSKCLEVYETRLIRNVVEILYSVLPVDLQTKPLDFNAKSNGNILASQLPKELRQLGQPEYCDFLNNCKEQLKLMVKSSNAQKEILESSFDSSSETVSNTLERISNRIIEEVYSEIASVIRLRKDIEAELSLEEYLAFDGIVWKFINETEVQGNVPSNALFVLPAAASNQLQEFLELFHANYTTQSAKLVEMEIWSQAEVTPAVQHVINMIIRSAVDDIPESSYDLSNCEGKNESQLQIETMSFFTVEALNKVLVLLLNYIRIMLQVPHSATEIMTRILEILKYKAFADEIPKQFNSRTCQVVLGAGAMRSAGLKNITAKHLALASQSLSVMISLIPYIREAVRRRLKTNQATLLIEFDRLKRDYQEHQYEIHAKLVSILGDRLTAHSKALAATKFDRAKEEEKTKPNSYAEGLVKETATLHRVLNKYLLEATVQFVFKQVFDAINKRIGDYYQRLPIKTELGKEKLMTDARFLCARLNALQGIDELGTSLIDIANNRQVSKSSIDSPRPSMSIEADQMARRSMSVDLQRRESLDKSRMSIGGTSSQDNVLKIDESVENVDISAPQEEISMDKKSQDGDKNKESATANISQEAQNNVESDQPPQQQVKSSDEVIAGTGKEVTAEPASEPERPSEFEQPVESASTSVKPEGSIEADKPVESVPLSEPEHTAESEKPVESIITEPETEKLEPTTEFAADEKEVVDRKDSPIARTEEVSISGTQKVENTDRTTESAEKGDEIMEASQKEPNLEANNDVTEGPENKDETNEDAKDVKKNDQKVTEVGAKSDIKEEIKNDNNNNNSNNEENSDMPMSAETENSNKTKPASSKAKSKNQKKKNKKGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.33
3	0.33
4	0.28
5	0.24
6	0.2
7	0.2
8	0.16
9	0.15
10	0.15
11	0.13
12	0.1
13	0.12
14	0.14
15	0.16
16	0.17
17	0.18
18	0.18
19	0.19
20	0.19
21	0.21
22	0.24
23	0.23
24	0.22
25	0.22
26	0.21
27	0.23
28	0.25
29	0.22
30	0.24
31	0.26
32	0.3
33	0.32
34	0.36
35	0.42
36	0.42
37	0.42
38	0.36
39	0.36
40	0.33
41	0.32
42	0.27
43	0.18
44	0.17
45	0.17
46	0.17
47	0.15
48	0.18
49	0.25
50	0.32
51	0.35
52	0.43
53	0.52
54	0.56
55	0.65
56	0.69
57	0.69
58	0.73
59	0.81
60	0.83
61	0.82
62	0.85
63	0.81
64	0.83
65	0.76
66	0.66
67	0.6
68	0.53
69	0.46
70	0.4
71	0.35
72	0.27
73	0.25
74	0.24
75	0.2
76	0.18
77	0.16
78	0.14
79	0.12
80	0.12
81	0.1
82	0.11
83	0.11
84	0.1
85	0.12
86	0.13
87	0.12
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.09
94	0.08
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.11
99	0.11
100	0.11
101	0.12
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.12
106	0.09
107	0.11
108	0.12
109	0.14
110	0.14
111	0.15
112	0.15
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.18
117	0.19
118	0.21
119	0.2
120	0.23
121	0.18
122	0.2
123	0.22
124	0.23
125	0.22
126	0.22
127	0.24
128	0.26
129	0.3
130	0.31
131	0.3
132	0.31
133	0.3
134	0.3
135	0.27
136	0.21
137	0.17
138	0.13
139	0.11
140	0.09
141	0.08
142	0.07
143	0.08
144	0.09
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.07
158	0.06
159	0.07
160	0.06
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.08
166	0.08
167	0.09
168	0.09
169	0.11
170	0.16
171	0.19
172	0.19
173	0.2
174	0.23
175	0.25
176	0.26
177	0.24
178	0.2
179	0.17
180	0.18
181	0.18
182	0.14
183	0.13
184	0.17
185	0.17
186	0.19
187	0.21
188	0.2
189	0.18
190	0.19
191	0.18
192	0.16
193	0.15
194	0.13
195	0.15
196	0.14
197	0.16
198	0.17
199	0.18
200	0.15
201	0.15
202	0.15
203	0.12
204	0.11
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.15
209	0.15
210	0.18
211	0.18
212	0.19
213	0.17
214	0.19
215	0.2
216	0.16
217	0.16
218	0.15
219	0.16
220	0.17
221	0.22
222	0.2
223	0.2
224	0.25
225	0.25
226	0.24
227	0.27
228	0.3
229	0.31
230	0.38
231	0.41
232	0.46
233	0.48
234	0.52
235	0.49
236	0.49
237	0.46
238	0.48
239	0.46
240	0.41
241	0.39
242	0.35
243	0.33
244	0.3
245	0.25
246	0.15
247	0.12
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.06
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.05
280	0.07
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.13
288	0.15
289	0.18
290	0.23
291	0.26
292	0.32
293	0.33
294	0.33
295	0.3
296	0.3
297	0.28
298	0.24
299	0.24
300	0.2
301	0.21
302	0.21
303	0.18
304	0.17
305	0.18
306	0.18
307	0.18
308	0.17
309	0.16
310	0.22
311	0.23
312	0.22
313	0.2
314	0.19
315	0.15
316	0.14
317	0.14
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.1
351	0.12
352	0.16
353	0.19
354	0.2
355	0.19
356	0.2
357	0.21
358	0.22
359	0.22
360	0.2
361	0.16
362	0.16
363	0.16
364	0.15
365	0.14
366	0.12
367	0.1
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.11
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.07
382	0.12
383	0.19
384	0.2
385	0.2
386	0.23
387	0.23
388	0.22
389	0.23
390	0.2
391	0.12
392	0.1
393	0.1
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.08
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.09
402	0.07
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.13
408	0.19
409	0.16
410	0.18
411	0.24
412	0.25
413	0.25
414	0.26
415	0.26
416	0.2
417	0.2
418	0.19
419	0.17
420	0.15
421	0.16
422	0.16
423	0.16
424	0.16
425	0.18
426	0.2
427	0.15
428	0.19
429	0.22
430	0.24
431	0.27
432	0.27
433	0.26
434	0.25
435	0.24
436	0.22
437	0.18
438	0.2
439	0.23
440	0.23
441	0.23
442	0.23
443	0.23
444	0.22
445	0.29
446	0.29
447	0.26
448	0.28
449	0.3
450	0.29
451	0.33
452	0.39
453	0.37
454	0.33
455	0.31
456	0.27
457	0.26
458	0.28
459	0.25
460	0.19
461	0.13
462	0.14
463	0.14
464	0.14
465	0.12
466	0.1
467	0.1
468	0.09
469	0.09
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.08
475	0.1
476	0.1
477	0.13
478	0.13
479	0.16
480	0.16
481	0.16
482	0.16
483	0.13
484	0.14
485	0.12
486	0.11
487	0.08
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.09
494	0.09
495	0.1
496	0.11
497	0.12
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.13
502	0.13
503	0.13
504	0.12
505	0.11
506	0.09
507	0.08
508	0.06
509	0.05
510	0.04
511	0.03
512	0.03
513	0.06
514	0.06
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.1
521	0.07
522	0.09
523	0.08
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.06
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.08
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.09
563	0.09
564	0.08
565	0.07
566	0.08
567	0.07
568	0.07
569	0.06
570	0.06
571	0.05
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.06
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.06
586	0.06
587	0.07
588	0.08
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.08
600	0.08
601	0.1
602	0.1
603	0.11
604	0.12
605	0.11
606	0.15
607	0.17
608	0.17
609	0.15
610	0.15
611	0.15
612	0.14
613	0.14
614	0.11
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.07
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.05
629	0.05
630	0.06
631	0.05
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.05
639	0.07
640	0.09
641	0.09
642	0.1
643	0.1
644	0.1
645	0.1
646	0.11
647	0.1
648	0.08
649	0.08
650	0.07
651	0.07
652	0.07
653	0.08
654	0.07
655	0.08
656	0.08
657	0.09
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.1
662	0.15
663	0.21
664	0.23
665	0.26
666	0.26
667	0.27
668	0.28
669	0.32
670	0.31
671	0.26
672	0.26
673	0.23
674	0.23
675	0.22
676	0.21
677	0.17
678	0.13
679	0.1
680	0.07
681	0.07
682	0.06
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.06
689	0.09
690	0.12
691	0.13
692	0.14
693	0.14
694	0.14
695	0.14
696	0.13
697	0.11
698	0.1
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.07
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.03
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.05
713	0.06
714	0.13
715	0.15
716	0.25
717	0.34
718	0.37
719	0.4
720	0.47
721	0.55
722	0.56
723	0.6
724	0.56
725	0.51
726	0.48
727	0.45
728	0.4
729	0.32
730	0.26
731	0.21
732	0.16
733	0.17
734	0.17
735	0.18
736	0.17
737	0.21
738	0.25
739	0.33
740	0.39
741	0.36
742	0.37
743	0.39
744	0.41
745	0.38
746	0.35
747	0.27
748	0.19
749	0.19
750	0.18
751	0.16
752	0.12
753	0.11
754	0.07
755	0.08
756	0.08
757	0.09
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.11
762	0.11
763	0.12
764	0.16
765	0.15
766	0.15
767	0.17
768	0.24
769	0.26
770	0.27
771	0.28
772	0.28
773	0.31
774	0.35
775	0.41
776	0.42
777	0.45
778	0.52
779	0.51
780	0.52
781	0.49
782	0.44
783	0.38
784	0.36
785	0.32
786	0.27
787	0.26
788	0.22
789	0.21
790	0.19
791	0.18
792	0.13
793	0.12
794	0.11
795	0.11
796	0.16
797	0.17
798	0.18
799	0.22
800	0.2
801	0.2
802	0.19
803	0.19
804	0.13
805	0.13
806	0.13
807	0.12
808	0.13
809	0.11
810	0.12
811	0.12
812	0.11
813	0.13
814	0.12
815	0.11
816	0.13
817	0.18
818	0.19
819	0.24
820	0.24
821	0.23
822	0.23
823	0.21
824	0.25
825	0.25
826	0.27
827	0.29
828	0.31
829	0.31
830	0.33
831	0.34
832	0.34
833	0.32
834	0.34
835	0.32
836	0.33
837	0.35
838	0.33
839	0.32
840	0.31
841	0.32
842	0.27
843	0.24
844	0.23
845	0.24
846	0.25
847	0.24
848	0.2
849	0.17
850	0.19
851	0.17
852	0.17
853	0.15
854	0.14
855	0.14
856	0.12
857	0.12
858	0.1
859	0.08
860	0.06
861	0.05
862	0.05
863	0.04
864	0.05
865	0.04
866	0.05
867	0.05
868	0.07
869	0.13
870	0.14
871	0.15
872	0.15
873	0.16
874	0.18
875	0.21
876	0.22
877	0.23
878	0.3
879	0.35
880	0.38
881	0.41
882	0.4
883	0.38
884	0.35
885	0.3
886	0.25
887	0.23
888	0.21
889	0.19
890	0.19
891	0.19
892	0.19
893	0.19
894	0.16
895	0.13
896	0.13
897	0.12
898	0.16
899	0.23
900	0.31
901	0.33
902	0.37
903	0.38
904	0.39
905	0.41
906	0.38
907	0.37
908	0.35
909	0.35
910	0.33
911	0.35
912	0.34
913	0.32
914	0.3
915	0.25
916	0.26
917	0.25
918	0.24
919	0.22
920	0.23
921	0.23
922	0.22
923	0.2
924	0.14
925	0.13
926	0.12
927	0.13
928	0.11
929	0.12
930	0.13
931	0.13
932	0.12
933	0.11
934	0.11
935	0.09
936	0.1
937	0.09
938	0.07
939	0.07
940	0.07
941	0.07
942	0.09
943	0.12
944	0.14
945	0.14
946	0.14
947	0.15
948	0.17
949	0.24
950	0.31
951	0.37
952	0.41
953	0.47
954	0.5
955	0.49
956	0.53
957	0.47
958	0.41
959	0.37
960	0.36
961	0.3
962	0.28
963	0.3
964	0.26
965	0.27
966	0.27
967	0.24
968	0.18
969	0.18
970	0.17
971	0.2
972	0.19
973	0.2
974	0.24
975	0.25
976	0.28
977	0.3
978	0.31
979	0.33
980	0.36
981	0.39
982	0.35
983	0.34
984	0.32
985	0.3
986	0.29
987	0.23
988	0.21
989	0.14
990	0.11
991	0.1
992	0.08
993	0.08
994	0.08
995	0.1
996	0.09
997	0.1
998	0.1
999	0.14
1000	0.17
1001	0.19
1002	0.19
1003	0.2
1004	0.22
1005	0.24
1006	0.28
1007	0.32
1008	0.31
1009	0.3
1010	0.31
1011	0.28
1012	0.27
1013	0.26
1014	0.22
1015	0.15
1016	0.15
1017	0.15
1018	0.15
1019	0.16
1020	0.15
1021	0.13
1022	0.14
1023	0.16
1024	0.19
1025	0.19
1026	0.18
1027	0.22
1028	0.23
1029	0.22
1030	0.22
1031	0.19
1032	0.17
1033	0.14
1034	0.15
1035	0.12
1036	0.18
1037	0.2
1038	0.21
1039	0.21
1040	0.22
1041	0.24
1042	0.23
1043	0.23
1044	0.18
1045	0.21
1046	0.23
1047	0.22
1048	0.2
1049	0.18
1050	0.18
1051	0.16
1052	0.16
1053	0.15
1054	0.14
1055	0.15
1056	0.15
1057	0.17
1058	0.2
1059	0.19
1060	0.19
1061	0.16
1062	0.16
1063	0.16
1064	0.18
1065	0.18
1066	0.15
1067	0.15
1068	0.15
1069	0.16
1070	0.15
1071	0.15
1072	0.12
1073	0.14
1074	0.16
1075	0.16
1076	0.19
1077	0.19
1078	0.22
1079	0.3
1080	0.32
1081	0.3
1082	0.36
1083	0.4
1084	0.38
1085	0.38
1086	0.37
1087	0.3
1088	0.3
1089	0.3
1090	0.24
1091	0.21
1092	0.22
1093	0.2
1094	0.18
1095	0.18
1096	0.21
1097	0.24
1098	0.28
1099	0.31
1100	0.32
1101	0.34
1102	0.36
1103	0.39
1104	0.36
1105	0.34
1106	0.32
1107	0.28
1108	0.25
1109	0.23
1110	0.21
1111	0.17
1112	0.16
1113	0.15
1114	0.15
1115	0.15
1116	0.15
1117	0.17
1118	0.18
1119	0.18
1120	0.18
1121	0.21
1122	0.23
1123	0.23
1124	0.25
1125	0.25
1126	0.25
1127	0.25
1128	0.24
1129	0.2
1130	0.2
1131	0.2
1132	0.2
1133	0.22
1134	0.22
1135	0.22
1136	0.24
1137	0.25
1138	0.26
1139	0.32
1140	0.29
1141	0.28
1142	0.31
1143	0.33
1144	0.38
1145	0.4
1146	0.44
1147	0.43
1148	0.5
1149	0.55
1150	0.57
1151	0.58
1152	0.54
1153	0.58
1154	0.57
1155	0.5
1156	0.44
1157	0.43
1158	0.38
1159	0.35
1160	0.36
1161	0.33
1162	0.28
1163	0.31
1164	0.33
1165	0.36
1166	0.42
1167	0.49
1168	0.52
1169	0.56
1170	0.6
1171	0.62
1172	0.61
1173	0.55
1174	0.51
1175	0.46
1176	0.42
1177	0.36
1178	0.32
1179	0.28
1180	0.29
1181	0.28
1182	0.23
1183	0.21
1184	0.19
1185	0.19
1186	0.17
1187	0.17
1188	0.14
1189	0.17
1190	0.22
1191	0.25
1192	0.26
1193	0.26
1194	0.28
1195	0.35
1196	0.38
1197	0.43
1198	0.49
1199	0.52
1200	0.61
1201	0.69
1202	0.77
1203	0.8
1204	0.86
1205	0.87
1206	0.87
1207	0.92
1208	0.93
1209	0.94

A0A4T0R9C1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer