Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0P2D1

Protein Details
Accession A0A4T0P2D1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-333SESSVAQKEKKPPRSPKKNQLSLLERTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-184K
314-324KEKKPPRSPKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003923  TFIID_30kDa  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03540  TFIID_30kDa  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSQQQQHTENDKQKEAQLKHDKKLSEFLGLLETNEPLVDQVTDHYLNKAGFECNDPRLKRLFALASQKFISDIANDAYQYARIRTTAGPGGRGRPTGTSKSKTVLTSDDLTAALSDYGIHKSKADSERWGNDMYIKSIGGELGARMTNQSLLKKIPQSTSQTPSLQSRISGLAKRQEKNTAKAKLAKNNKIKGSSKQSIQVTILNLAAGTSADDVKVALSSYGTITSAELNPASSTNDSVAVNIYFENLDEAKAAAEAFDGLLADGKILTVKVIEQKSVDDVKDLFKDSKMYADTLPPPAPSPPKASESSVAQKEKKPPRSPKKNQLSLLERTQMQPKAQLSSQSGTQQSKKNQKASLLERINKDSFAGKTLASRFGLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.55
3 0.56
4 0.59
5 0.61
6 0.63
7 0.67
8 0.64
9 0.57
10 0.62
11 0.54
12 0.48
13 0.41
14 0.34
15 0.34
16 0.32
17 0.3
18 0.23
19 0.21
20 0.15
21 0.14
22 0.13
23 0.07
24 0.08
25 0.07
26 0.06
27 0.08
28 0.13
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.22
36 0.18
37 0.17
38 0.22
39 0.25
40 0.28
41 0.36
42 0.36
43 0.37
44 0.4
45 0.4
46 0.36
47 0.37
48 0.35
49 0.32
50 0.42
51 0.4
52 0.4
53 0.39
54 0.38
55 0.33
56 0.29
57 0.24
58 0.14
59 0.14
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.15
71 0.15
72 0.19
73 0.23
74 0.22
75 0.27
76 0.27
77 0.32
78 0.32
79 0.32
80 0.29
81 0.28
82 0.32
83 0.35
84 0.41
85 0.4
86 0.4
87 0.41
88 0.44
89 0.4
90 0.37
91 0.31
92 0.28
93 0.26
94 0.25
95 0.23
96 0.19
97 0.18
98 0.16
99 0.13
100 0.09
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.21
110 0.25
111 0.26
112 0.29
113 0.33
114 0.36
115 0.38
116 0.38
117 0.3
118 0.29
119 0.28
120 0.23
121 0.19
122 0.16
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.15
139 0.19
140 0.22
141 0.25
142 0.24
143 0.27
144 0.33
145 0.37
146 0.39
147 0.4
148 0.37
149 0.36
150 0.36
151 0.34
152 0.27
153 0.22
154 0.19
155 0.18
156 0.2
157 0.2
158 0.2
159 0.25
160 0.31
161 0.33
162 0.33
163 0.39
164 0.4
165 0.44
166 0.5
167 0.47
168 0.44
169 0.5
170 0.53
171 0.51
172 0.57
173 0.6
174 0.59
175 0.61
176 0.61
177 0.6
178 0.58
179 0.56
180 0.56
181 0.51
182 0.44
183 0.44
184 0.42
185 0.37
186 0.36
187 0.32
188 0.23
189 0.2
190 0.19
191 0.12
192 0.11
193 0.09
194 0.08
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.04
256 0.05
257 0.04
258 0.06
259 0.13
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.21
265 0.24
266 0.23
267 0.18
268 0.18
269 0.21
270 0.23
271 0.25
272 0.21
273 0.19
274 0.22
275 0.2
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.2
280 0.24
281 0.26
282 0.29
283 0.3
284 0.25
285 0.25
286 0.27
287 0.31
288 0.28
289 0.32
290 0.31
291 0.34
292 0.36
293 0.38
294 0.37
295 0.38
296 0.44
297 0.46
298 0.48
299 0.47
300 0.5
301 0.58
302 0.65
303 0.68
304 0.7
305 0.73
306 0.78
307 0.86
308 0.91
309 0.92
310 0.92
311 0.92
312 0.87
313 0.85
314 0.81
315 0.75
316 0.71
317 0.66
318 0.56
319 0.49
320 0.51
321 0.45
322 0.4
323 0.4
324 0.36
325 0.36
326 0.37
327 0.4
328 0.37
329 0.36
330 0.39
331 0.38
332 0.42
333 0.42
334 0.46
335 0.48
336 0.53
337 0.61
338 0.66
339 0.67
340 0.66
341 0.67
342 0.71
343 0.69
344 0.71
345 0.69
346 0.68
347 0.66
348 0.69
349 0.63
350 0.54
351 0.48
352 0.43
353 0.34
354 0.31
355 0.27
356 0.21
357 0.26
358 0.29
359 0.33