Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0NVQ2

Protein Details
Accession A0A4T0NVQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-83YDYDRERDIRSRDRSRERHDRRRSNYDDRRDRDDRREDRSHRRRRSRSRQRDERPRRERSPEIPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-78SRDRSRERHDRRRSNYDDRRDRDDRREDRSHRRRRSRSRQRDERPRRER
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSAGDRYSPRLSPEDVREDYDYDRERDIRSRDRSRERHDRRRSNYDDRRDRDDRREDRSHRRRRSRSRQRDERPRRERSPEIPIEENVDSLESEQRSVFVSQLSTRTNSSDLRRFFQDRLGERSIVDARIVMDKNSRRSKGIGYVEVKTASLIDKALELTGELLNGIPMIVTQSEADKNRQAKASSSLQTQSVQAEEVRRSTKSRDYDNRSSTINPANDPTLYKVYVGSLSYTLKEYDVRSVFEPFGEIEDVELSVDDQNRSKGYAYVKYKRMEDSRMACEQMNRFELAGRTLKVQLVNYYGDPVRMPEQSIENEGLNLNSVSRHELMKTLMRSHDPNAQFEQELAAREKEKKVQERMKTKGVLLKYMFKASEETEAGWEKELAEDVKTECENKYGKVQEIGVDKESEEGEIVVKFYTIESAEDAINGLNGRWFGGRQVKAVNIADKFLKLIKDVVIVDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.48
4 0.46
5 0.44
6 0.42
7 0.43
8 0.4
9 0.33
10 0.36
11 0.34
12 0.36
13 0.41
14 0.46
15 0.48
16 0.54
17 0.61
18 0.67
19 0.75
20 0.81
21 0.83
22 0.86
23 0.87
24 0.88
25 0.89
26 0.9
27 0.88
28 0.89
29 0.88
30 0.88
31 0.88
32 0.88
33 0.87
34 0.82
35 0.82
36 0.79
37 0.77
38 0.76
39 0.76
40 0.72
41 0.7
42 0.75
43 0.74
44 0.78
45 0.82
46 0.83
47 0.84
48 0.88
49 0.9
50 0.91
51 0.95
52 0.95
53 0.95
54 0.96
55 0.96
56 0.96
57 0.96
58 0.96
59 0.96
60 0.94
61 0.92
62 0.89
63 0.86
64 0.83
65 0.77
66 0.76
67 0.72
68 0.68
69 0.61
70 0.54
71 0.51
72 0.43
73 0.38
74 0.27
75 0.21
76 0.15
77 0.13
78 0.17
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.23
95 0.26
96 0.3
97 0.34
98 0.34
99 0.36
100 0.41
101 0.43
102 0.41
103 0.42
104 0.44
105 0.4
106 0.45
107 0.45
108 0.39
109 0.36
110 0.39
111 0.35
112 0.27
113 0.24
114 0.17
115 0.14
116 0.19
117 0.2
118 0.16
119 0.22
120 0.26
121 0.35
122 0.42
123 0.43
124 0.39
125 0.41
126 0.43
127 0.45
128 0.45
129 0.44
130 0.39
131 0.39
132 0.39
133 0.38
134 0.34
135 0.25
136 0.2
137 0.13
138 0.1
139 0.09
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.03
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.07
161 0.11
162 0.13
163 0.16
164 0.2
165 0.22
166 0.25
167 0.28
168 0.27
169 0.25
170 0.29
171 0.33
172 0.3
173 0.3
174 0.29
175 0.27
176 0.27
177 0.26
178 0.21
179 0.14
180 0.13
181 0.11
182 0.13
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.2
189 0.26
190 0.27
191 0.35
192 0.41
193 0.48
194 0.56
195 0.57
196 0.56
197 0.51
198 0.47
199 0.42
200 0.39
201 0.31
202 0.23
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.09
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.16
231 0.16
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.13
251 0.15
252 0.23
253 0.3
254 0.36
255 0.42
256 0.44
257 0.45
258 0.46
259 0.46
260 0.42
261 0.41
262 0.38
263 0.37
264 0.37
265 0.37
266 0.33
267 0.33
268 0.31
269 0.29
270 0.25
271 0.2
272 0.18
273 0.18
274 0.18
275 0.18
276 0.19
277 0.16
278 0.16
279 0.17
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.17
284 0.16
285 0.17
286 0.15
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.14
295 0.13
296 0.16
297 0.16
298 0.19
299 0.19
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.13
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.13
314 0.16
315 0.21
316 0.23
317 0.24
318 0.25
319 0.28
320 0.29
321 0.3
322 0.36
323 0.32
324 0.33
325 0.33
326 0.32
327 0.29
328 0.27
329 0.27
330 0.2
331 0.21
332 0.2
333 0.18
334 0.19
335 0.23
336 0.26
337 0.3
338 0.37
339 0.43
340 0.5
341 0.57
342 0.63
343 0.69
344 0.72
345 0.73
346 0.67
347 0.62
348 0.57
349 0.5
350 0.48
351 0.42
352 0.44
353 0.39
354 0.4
355 0.38
356 0.33
357 0.33
358 0.27
359 0.3
360 0.23
361 0.21
362 0.21
363 0.23
364 0.23
365 0.22
366 0.2
367 0.15
368 0.14
369 0.16
370 0.13
371 0.11
372 0.13
373 0.12
374 0.17
375 0.17
376 0.18
377 0.17
378 0.21
379 0.23
380 0.23
381 0.3
382 0.31
383 0.32
384 0.34
385 0.35
386 0.34
387 0.37
388 0.39
389 0.32
390 0.29
391 0.26
392 0.24
393 0.23
394 0.19
395 0.14
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.1
413 0.11
414 0.1
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.17
422 0.26
423 0.28
424 0.29
425 0.33
426 0.34
427 0.39
428 0.43
429 0.42
430 0.34
431 0.35
432 0.34
433 0.3
434 0.3
435 0.27
436 0.25
437 0.2
438 0.22
439 0.21
440 0.24