FuNGI

A0A4V4N0C2

Protein Details

Accession

A0A4V4N0C2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
367-387	VEERERMRREKRNEREREMRI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
205-229	RFKHKKVPRGPPSPPPPILRSPPRK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSTAFSTGLTNVLPPPKIQDDEEELDQTTLLETMSKRLVAPPYTHRTGWKPSTPQDFGDGGAYPECHIAQYPLEMGRKKAKSSKTLSLTVDGSGKVKYDAIAKQGRGDNAHLIQTSYQDVLPLAKRTDVDNKEMDRPSEDQIAETTERTKAALEKIVGNKIKSSHSREIAGKPAQAQYVRYTPNEGSQRVIQIRDAVEDPLEPPRFKHKKVPRGPPSPPPPILRSPPRKATAAEQKEWMIPPCISNWKNNKGYTIPLDKRLAADGRGLQDVQINDNFAKFSEALFIGERHARDEVRQRNVMQQRLAEKEKLSKEENLRQLAQKAREERSGGTSSGQRAAMPNLAAYGSDSDASESESESESESDQGVEERERMRREKRNEREREMRISHMGHEQRAKQLAREQNRDISEKVALGLAKPTLSKEAMFDSRLYNQEKLGTSFGDDESYNLYDKPLFHGSSAAAAIYKHRNQDGDDELVGGGTEEGVDNALKNDRFNLGANATKGFEGAELQEAREGPVEFEKDVDPFGVDQFLNEAIQGNNTSKRGLDEAPADSRKRQKARDDDL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.26
3	0.3
4	0.32
5	0.32
6	0.34
7	0.36
8	0.4
9	0.42
10	0.38
11	0.33
12	0.3
13	0.29
14	0.23
15	0.16
16	0.11
17	0.08
18	0.1
19	0.09
20	0.13
21	0.16
22	0.17
23	0.17
24	0.22
25	0.28
26	0.28
27	0.33
28	0.38
29	0.44
30	0.48
31	0.49
32	0.49
33	0.49
34	0.55
35	0.57
36	0.56
37	0.55
38	0.58
39	0.66
40	0.64
41	0.59
42	0.55
43	0.48
44	0.4
45	0.35
46	0.28
47	0.2
48	0.19
49	0.18
50	0.13
51	0.14
52	0.13
53	0.11
54	0.11
55	0.12
56	0.11
57	0.13
58	0.15
59	0.18
60	0.24
61	0.25
62	0.29
63	0.37
64	0.39
65	0.42
66	0.48
67	0.5
68	0.53
69	0.59
70	0.65
71	0.61
72	0.64
73	0.61
74	0.57
75	0.51
76	0.43
77	0.38
78	0.29
79	0.24
80	0.18
81	0.17
82	0.14
83	0.13
84	0.13
85	0.16
86	0.17
87	0.24
88	0.3
89	0.3
90	0.35
91	0.38
92	0.4
93	0.37
94	0.37
95	0.35
96	0.3
97	0.33
98	0.27
99	0.24
100	0.22
101	0.21
102	0.21
103	0.16
104	0.14
105	0.11
106	0.11
107	0.14
108	0.17
109	0.19
110	0.18
111	0.19
112	0.19
113	0.22
114	0.32
115	0.31
116	0.32
117	0.35
118	0.37
119	0.43
120	0.44
121	0.41
122	0.35
123	0.34
124	0.33
125	0.33
126	0.3
127	0.23
128	0.22
129	0.25
130	0.23
131	0.21
132	0.2
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.14
138	0.16
139	0.2
140	0.2
141	0.25
142	0.28
143	0.36
144	0.37
145	0.35
146	0.34
147	0.32
148	0.37
149	0.37
150	0.41
151	0.41
152	0.41
153	0.45
154	0.47
155	0.48
156	0.49
157	0.45
158	0.38
159	0.33
160	0.33
161	0.31
162	0.28
163	0.26
164	0.23
165	0.26
166	0.28
167	0.26
168	0.27
169	0.24
170	0.31
171	0.34
172	0.31
173	0.28
174	0.27
175	0.32
176	0.3
177	0.3
178	0.24
179	0.22
180	0.21
181	0.21
182	0.2
183	0.14
184	0.13
185	0.12
186	0.13
187	0.17
188	0.19
189	0.17
190	0.17
191	0.28
192	0.33
193	0.36
194	0.45
195	0.47
196	0.56
197	0.65
198	0.75
199	0.74
200	0.77
201	0.79
202	0.78
203	0.76
204	0.72
205	0.67
206	0.59
207	0.54
208	0.5
209	0.53
210	0.53
211	0.54
212	0.53
213	0.56
214	0.56
215	0.53
216	0.49
217	0.5
218	0.51
219	0.48
220	0.44
221	0.38
222	0.36
223	0.36
224	0.36
225	0.29
226	0.21
227	0.15
228	0.14
229	0.15
230	0.23
231	0.22
232	0.29
233	0.35
234	0.41
235	0.46
236	0.46
237	0.46
238	0.38
239	0.4
240	0.38
241	0.4
242	0.34
243	0.33
244	0.34
245	0.32
246	0.31
247	0.31
248	0.26
249	0.18
250	0.18
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.14
255	0.12
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.08
265	0.09
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.11
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.11
279	0.13
280	0.22
281	0.27
282	0.3
283	0.33
284	0.32
285	0.4
286	0.45
287	0.46
288	0.38
289	0.34
290	0.33
291	0.36
292	0.37
293	0.3
294	0.26
295	0.3
296	0.31
297	0.32
298	0.3
299	0.3
300	0.34
301	0.4
302	0.45
303	0.42
304	0.4
305	0.38
306	0.4
307	0.4
308	0.39
309	0.36
310	0.35
311	0.34
312	0.35
313	0.35
314	0.32
315	0.32
316	0.3
317	0.25
318	0.23
319	0.22
320	0.21
321	0.22
322	0.21
323	0.16
324	0.15
325	0.16
326	0.16
327	0.13
328	0.12
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.1
356	0.12
357	0.17
358	0.21
359	0.26
360	0.34
361	0.42
362	0.51
363	0.6
364	0.67
365	0.73
366	0.78
367	0.81
368	0.82
369	0.77
370	0.77
371	0.68
372	0.61
373	0.55
374	0.47
375	0.42
376	0.4
377	0.38
378	0.33
379	0.35
380	0.34
381	0.34
382	0.4
383	0.38
384	0.32
385	0.37
386	0.42
387	0.46
388	0.5
389	0.48
390	0.48
391	0.51
392	0.51
393	0.44
394	0.38
395	0.31
396	0.25
397	0.22
398	0.17
399	0.14
400	0.12
401	0.13
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.13
407	0.14
408	0.13
409	0.13
410	0.18
411	0.2
412	0.21
413	0.21
414	0.21
415	0.25
416	0.3
417	0.32
418	0.27
419	0.25
420	0.29
421	0.3
422	0.3
423	0.27
424	0.22
425	0.2
426	0.21
427	0.2
428	0.16
429	0.15
430	0.13
431	0.15
432	0.15
433	0.15
434	0.13
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.19
439	0.21
440	0.2
441	0.2
442	0.21
443	0.21
444	0.21
445	0.21
446	0.16
447	0.11
448	0.1
449	0.15
450	0.21
451	0.24
452	0.25
453	0.27
454	0.29
455	0.3
456	0.36
457	0.35
458	0.31
459	0.28
460	0.25
461	0.23
462	0.21
463	0.19
464	0.13
465	0.08
466	0.04
467	0.04
468	0.03
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.07
474	0.13
475	0.14
476	0.14
477	0.16
478	0.17
479	0.19
480	0.21
481	0.23
482	0.22
483	0.26
484	0.27
485	0.27
486	0.26
487	0.24
488	0.22
489	0.18
490	0.14
491	0.11
492	0.11
493	0.16
494	0.15
495	0.16
496	0.18
497	0.18
498	0.19
499	0.21
500	0.2
501	0.16
502	0.21
503	0.23
504	0.2
505	0.22
506	0.21
507	0.19
508	0.19
509	0.17
510	0.13
511	0.11
512	0.12
513	0.15
514	0.13
515	0.13
516	0.14
517	0.14
518	0.13
519	0.13
520	0.14
521	0.1
522	0.13
523	0.15
524	0.17
525	0.21
526	0.22
527	0.23
528	0.22
529	0.25
530	0.26
531	0.26
532	0.27
533	0.26
534	0.3
535	0.38
536	0.43
537	0.43
538	0.46
539	0.54
540	0.59
541	0.63
542	0.66
543	0.67

A0A4V4N0C2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer