Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4MH60

Protein Details
Accession A0A4V4MH60    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-71EARQQSEKKSAEKKRHQKKRIQRRDESPEYDSBasic
101-125IDAIAKGNKNSRRKRKRTDEDLDAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-62KKSAEKKRHQKKRIQR
106-117KGNKNSRRKRKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MANPPVDPTLDPPEESNDRLNEELSQFPDFSRSQANNEEEARQQSEKKSAEKKRHQKKRIQRRDESPEYDSSHQPPIEQEEDNSQFLEPSQQKRLDLHSKIDAIAKGNKNSRRKRKRTDEDLDAAADEELHNLREQMFQAAEEDEEYKKFNKPALNKLKLLPKVVETMQKTHLETSILENNFLDGVRRWLEPFSDKSLPPLNIQTEFFQILSNMYIDTQSLKSSKLGPVILFYSRHPRVNKSIKKAADALVTRWMRPLLRRSANPRSYQFSTNSNVVRTSDVNLTSREDNEEDYSNRTRIPELERKKYRVAATRGVDGIKSSNVTLSNQESERQRQLSRKFSMLKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.36
4 0.29
5 0.31
6 0.31
7 0.31
8 0.27
9 0.26
10 0.28
11 0.25
12 0.25
13 0.22
14 0.21
15 0.26
16 0.23
17 0.22
18 0.27
19 0.26
20 0.28
21 0.36
22 0.39
23 0.39
24 0.41
25 0.42
26 0.37
27 0.39
28 0.39
29 0.34
30 0.34
31 0.33
32 0.4
33 0.41
34 0.46
35 0.52
36 0.56
37 0.64
38 0.72
39 0.79
40 0.81
41 0.88
42 0.89
43 0.89
44 0.91
45 0.91
46 0.92
47 0.91
48 0.89
49 0.88
50 0.89
51 0.87
52 0.82
53 0.74
54 0.68
55 0.63
56 0.58
57 0.51
58 0.44
59 0.41
60 0.36
61 0.32
62 0.28
63 0.29
64 0.29
65 0.26
66 0.24
67 0.26
68 0.29
69 0.29
70 0.28
71 0.22
72 0.19
73 0.18
74 0.26
75 0.23
76 0.24
77 0.31
78 0.32
79 0.34
80 0.36
81 0.43
82 0.44
83 0.42
84 0.41
85 0.39
86 0.38
87 0.37
88 0.39
89 0.33
90 0.26
91 0.32
92 0.32
93 0.32
94 0.39
95 0.45
96 0.52
97 0.61
98 0.69
99 0.72
100 0.78
101 0.83
102 0.87
103 0.9
104 0.9
105 0.88
106 0.84
107 0.77
108 0.68
109 0.58
110 0.46
111 0.36
112 0.26
113 0.18
114 0.1
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.14
137 0.17
138 0.21
139 0.25
140 0.35
141 0.45
142 0.48
143 0.47
144 0.5
145 0.54
146 0.51
147 0.48
148 0.38
149 0.29
150 0.27
151 0.27
152 0.29
153 0.23
154 0.23
155 0.25
156 0.27
157 0.26
158 0.23
159 0.22
160 0.17
161 0.16
162 0.17
163 0.2
164 0.18
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.12
171 0.05
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.2
181 0.22
182 0.22
183 0.24
184 0.29
185 0.29
186 0.27
187 0.28
188 0.24
189 0.22
190 0.24
191 0.22
192 0.19
193 0.18
194 0.17
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.14
211 0.17
212 0.18
213 0.19
214 0.17
215 0.18
216 0.2
217 0.21
218 0.19
219 0.18
220 0.24
221 0.25
222 0.31
223 0.31
224 0.34
225 0.41
226 0.51
227 0.57
228 0.56
229 0.62
230 0.58
231 0.59
232 0.57
233 0.5
234 0.46
235 0.4
236 0.33
237 0.34
238 0.33
239 0.3
240 0.3
241 0.29
242 0.23
243 0.27
244 0.32
245 0.33
246 0.39
247 0.45
248 0.52
249 0.61
250 0.65
251 0.67
252 0.64
253 0.61
254 0.58
255 0.56
256 0.5
257 0.44
258 0.42
259 0.41
260 0.4
261 0.34
262 0.31
263 0.28
264 0.28
265 0.24
266 0.23
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.23
271 0.26
272 0.25
273 0.25
274 0.25
275 0.22
276 0.22
277 0.23
278 0.25
279 0.23
280 0.27
281 0.3
282 0.27
283 0.28
284 0.26
285 0.25
286 0.26
287 0.33
288 0.38
289 0.43
290 0.53
291 0.6
292 0.64
293 0.68
294 0.7
295 0.68
296 0.68
297 0.65
298 0.64
299 0.59
300 0.59
301 0.55
302 0.5
303 0.43
304 0.34
305 0.3
306 0.23
307 0.21
308 0.16
309 0.17
310 0.18
311 0.19
312 0.22
313 0.24
314 0.28
315 0.27
316 0.32
317 0.35
318 0.4
319 0.46
320 0.47
321 0.48
322 0.51
323 0.59
324 0.63
325 0.63
326 0.64
327 0.66