Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0M783

Protein Details
Accession A0A4T0M783    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-405AQSKMFYKTAKKQNSCCVISHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR010908  Longin_dom  
IPR022894  Oligoribonuclease  
IPR045848  R-SNARE_YKT6  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR001388  Synaptobrevin-like  
IPR042855  V_SNARE_CC  
Gene Ontology GO:0005886  C:plasma membrane  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF00957  Synaptobrevin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50859  LONGIN  
PS50892  V_SNARE  
CDD cd14824  Longin  
cd06135  Orn  
cd15867  R-SNARE_YKT6  
Amino Acid Sequences MPVNRSRSSNLSSEDKPLVWVDLEMTGLDMNNDHILEIAIIITDGELNKVDDGISLIVKRPKTVLDNMNEWCISTHGLSGLTKQVLTSPFSHQTVSKVAYEYIKRWIPDPRISVIAGNTVHMDLRFLEMDAHKEGWSRIASHLGYRVVDVSSFKEIAARWYPTLPLKSKKTSKHRALDDVQASIDELKYYRQSIFKPTERSVDVVTAGAFDSAEKPAINIQQCDDLGSFSFYQRSSVREFLVFMAKTVAERTENGQRQSVQENNYTAHVYRQAVAIVTEQYPVRPAFSLLQKVLDAVPGAVRTTATYSEWVDGIRKGNNTTQSPVVLPELNTLIMKYQDPKQADTIMRVQQELDETKVVMHKTIESVLERGEKLDNLVERSNALSAQSKMFYKTAKKQNSCCVIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.39
3 0.37
4 0.32
5 0.28
6 0.22
7 0.2
8 0.16
9 0.13
10 0.14
11 0.11
12 0.11
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.07
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.05
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.05
31 0.05
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.16
44 0.21
45 0.21
46 0.22
47 0.22
48 0.25
49 0.28
50 0.35
51 0.38
52 0.38
53 0.44
54 0.44
55 0.47
56 0.43
57 0.38
58 0.31
59 0.24
60 0.2
61 0.15
62 0.14
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.18
72 0.18
73 0.21
74 0.21
75 0.23
76 0.27
77 0.28
78 0.3
79 0.26
80 0.27
81 0.29
82 0.29
83 0.25
84 0.21
85 0.22
86 0.26
87 0.28
88 0.27
89 0.29
90 0.3
91 0.28
92 0.29
93 0.35
94 0.36
95 0.4
96 0.42
97 0.37
98 0.36
99 0.36
100 0.35
101 0.28
102 0.27
103 0.2
104 0.17
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.11
109 0.12
110 0.07
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.11
115 0.11
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.14
120 0.15
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.22
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.17
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.13
142 0.12
143 0.17
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.18
148 0.21
149 0.22
150 0.27
151 0.27
152 0.3
153 0.34
154 0.41
155 0.48
156 0.55
157 0.62
158 0.67
159 0.71
160 0.72
161 0.71
162 0.7
163 0.66
164 0.64
165 0.55
166 0.45
167 0.36
168 0.27
169 0.24
170 0.17
171 0.14
172 0.07
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.09
177 0.11
178 0.13
179 0.14
180 0.21
181 0.28
182 0.32
183 0.36
184 0.36
185 0.38
186 0.36
187 0.36
188 0.3
189 0.24
190 0.19
191 0.14
192 0.12
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.08
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.17
210 0.18
211 0.15
212 0.11
213 0.1
214 0.12
215 0.12
216 0.09
217 0.11
218 0.1
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.17
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.17
228 0.23
229 0.2
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.09
237 0.09
238 0.13
239 0.21
240 0.25
241 0.26
242 0.29
243 0.28
244 0.3
245 0.34
246 0.35
247 0.28
248 0.28
249 0.28
250 0.26
251 0.26
252 0.25
253 0.2
254 0.18
255 0.19
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.11
264 0.1
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.15
274 0.2
275 0.26
276 0.23
277 0.25
278 0.24
279 0.24
280 0.22
281 0.19
282 0.14
283 0.09
284 0.1
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.19
302 0.2
303 0.22
304 0.26
305 0.33
306 0.34
307 0.35
308 0.33
309 0.31
310 0.3
311 0.29
312 0.27
313 0.21
314 0.19
315 0.18
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.2
325 0.26
326 0.29
327 0.31
328 0.33
329 0.38
330 0.38
331 0.4
332 0.4
333 0.39
334 0.38
335 0.36
336 0.33
337 0.27
338 0.31
339 0.28
340 0.24
341 0.19
342 0.18
343 0.19
344 0.23
345 0.22
346 0.19
347 0.18
348 0.17
349 0.18
350 0.2
351 0.22
352 0.2
353 0.21
354 0.23
355 0.26
356 0.25
357 0.24
358 0.24
359 0.21
360 0.21
361 0.25
362 0.25
363 0.25
364 0.27
365 0.26
366 0.24
367 0.25
368 0.24
369 0.2
370 0.19
371 0.19
372 0.19
373 0.23
374 0.25
375 0.26
376 0.28
377 0.31
378 0.34
379 0.38
380 0.46
381 0.53
382 0.6
383 0.67
384 0.7
385 0.78