Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0U4C6

Protein Details
Accession A0A4T0U4C6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-90KKGTLKQKLEQKEKERKERMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-89KKKPAPTPAKKAPAAAPPKKKGTLKQKLEQKEKERKER
211-224RANKAAAAKNKKTK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023194  eIF3-like_dom_sf  
IPR013906  eIF3j  
Gene Ontology GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08597  eIF3_subunit  
Amino Acid Sequences MDDWDASSSDEQPQKVAPVSAPAPARKGKWDDEDEDDKVEDSWDAPSEDEEKKKPAPTPAKKAPAAAPPKKKGTLKQKLEQKEKERKERMDKEGEIDDGDAIDWLEKQRAERQAAKEKEIASDLANAADLFAGMNVAPSTSQTLKKKPTKLAEFQQLAGAVQEVYFKPHASNPQYQQYVTTIVKNLADSLKENEIKGLATRLNTIAAEKARANKAAAAKNKKTKPSLGGGHTTSGTRLDTNIYDEALDDGDDDDLEFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.26
4 0.19
5 0.21
6 0.22
7 0.26
8 0.29
9 0.28
10 0.31
11 0.33
12 0.35
13 0.36
14 0.4
15 0.4
16 0.44
17 0.47
18 0.47
19 0.5
20 0.54
21 0.48
22 0.45
23 0.39
24 0.31
25 0.26
26 0.22
27 0.15
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.16
35 0.2
36 0.24
37 0.24
38 0.27
39 0.31
40 0.34
41 0.37
42 0.42
43 0.49
44 0.54
45 0.61
46 0.66
47 0.7
48 0.68
49 0.67
50 0.61
51 0.59
52 0.6
53 0.59
54 0.59
55 0.56
56 0.61
57 0.64
58 0.63
59 0.63
60 0.64
61 0.66
62 0.65
63 0.67
64 0.7
65 0.74
66 0.8
67 0.79
68 0.78
69 0.77
70 0.78
71 0.8
72 0.79
73 0.77
74 0.78
75 0.78
76 0.75
77 0.73
78 0.65
79 0.58
80 0.52
81 0.45
82 0.35
83 0.26
84 0.2
85 0.11
86 0.1
87 0.07
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.14
96 0.2
97 0.24
98 0.3
99 0.36
100 0.44
101 0.45
102 0.47
103 0.44
104 0.39
105 0.35
106 0.3
107 0.25
108 0.15
109 0.15
110 0.12
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.02
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.06
127 0.09
128 0.15
129 0.18
130 0.24
131 0.33
132 0.4
133 0.46
134 0.5
135 0.56
136 0.57
137 0.6
138 0.61
139 0.61
140 0.56
141 0.51
142 0.45
143 0.37
144 0.3
145 0.24
146 0.17
147 0.08
148 0.06
149 0.08
150 0.06
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.14
156 0.21
157 0.24
158 0.32
159 0.33
160 0.41
161 0.42
162 0.41
163 0.4
164 0.34
165 0.34
166 0.28
167 0.26
168 0.19
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.18
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.22
181 0.21
182 0.2
183 0.19
184 0.19
185 0.14
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.17
193 0.16
194 0.18
195 0.18
196 0.24
197 0.25
198 0.27
199 0.28
200 0.28
201 0.34
202 0.39
203 0.46
204 0.5
205 0.55
206 0.63
207 0.69
208 0.72
209 0.69
210 0.67
211 0.63
212 0.62
213 0.61
214 0.57
215 0.57
216 0.51
217 0.49
218 0.44
219 0.39
220 0.31
221 0.26
222 0.22
223 0.16
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.19
228 0.2
229 0.18
230 0.16
231 0.16
232 0.16
233 0.13
234 0.12
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07