Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0RKC6

Protein Details
Accession A0A4T0RKC6    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
643-696SSSSDSDSNSRKKRKKNKQSKSKSKSRSKSKSKSKSKSRKKSKRRDSSDSESSEHydrophilic
700-743ESESSDDDRRKKKKSKSRSKSKSRSRSRSRSKSKKHSDSDDDSABasic
752-775SESEEDSKKKKKKESKAIDSTDSEHydrophilic
784-817DSSSSEEDTKKKKKKKKTKSKKSKKESSSEEEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
653-687RKKRKKNKQSKSKSKSRSKSKSKSKSKSRKKSKRR
708-734RRKKKKSKSRSKSKSRSRSRSRSKSKK
759-767KKKKKKESK
792-808TKKKKKKKKTKSKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 12.333, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045088  ALAT1/2-like  
IPR004839  Aminotransferase_I/II  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0030170  F:pyridoxal phosphate binding  
GO:0008483  F:transaminase activity  
GO:0042853  P:L-alanine catabolic process  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF00155  Aminotran_1_2  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
CDD cd00609  AAT_like  
Amino Acid Sequences MPCNIGNPQQQGLNQKPLTFWRQVAALTECPELIDNTQLFPKDVRDRARELLNEIGSVGAYSHSKGVPFIREQVAKFLEARDGYPSDPENIFLTAGASGGVSLLFHLLLSGDPDGVMIPIPQYPLYSASLALAGSRTIQYHLDENRGWELNMNLLEKSFNDAQSQGTEVKALVIINPGNPTGAILSEENMRDIARFAQKHELVLLADEVYQSNIYDKNKPFVSFKKVIKDLKLDDLQLASFHSISKGFSGECGRRGGFVEYVNFSEDFLTEATKLASISLCPPLQGQIAVDLMIRPPKEGEESYEQYRKEKDEVLASYASRSKLLAERFNQMEGVSCNNSEGAMYAFPQIRLPQKAIDAAKKQGKSPDSFYCLELLDNTGICVVPGSGFGQAPDTLHFRTTCLVPELTEKLFTDFDVTEKLEAINKLLKKNLLQLVNLSTGGTGYKAVSKESAKKYKEMDSDEQLAYQYIDAAGNEGIWTKTLKMKTNLHQTVVNRVLKSLESRGSIKAVKSVKHPTRKIYMLASISPSVELTGGPWYTDNELDTEFVGQLKSAVLSYVRGCTYPKIKDNIKPIYAISKVDYPNVRKVHKWLSKSGLTQVELGLEHIQSLLEVLMFDGEVERLPALRASFSSDDEDYSESESSSSSDSDSNSRKKRKKNKQSKSKSKSRSKSKSKSKSKSRKKSKRRDSSDSESSESESESESSDDDRRKKKKSKSRSKSKSRSRSRSRSKSKKHSDSDDDSASKSESDSESESEEDSKKKKKKESKAIDSTDSENEKEKKKDDSSSSEEDTKKKKKKKKTKSKKSKKESSSEEEDEDLVSVGGDSEDERKLEDKMSDPYSSSVYRAIKNTDSDDVGPVVGWTEAPCGRCPVFEFCSQGGPTNASQCKYFDTWLQGEVDEDMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.44
4 0.46
5 0.49
6 0.45
7 0.4
8 0.32
9 0.33
10 0.32
11 0.35
12 0.33
13 0.3
14 0.29
15 0.29
16 0.26
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.17
21 0.2
22 0.17
23 0.18
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.29
29 0.31
30 0.38
31 0.44
32 0.45
33 0.5
34 0.53
35 0.59
36 0.54
37 0.49
38 0.5
39 0.43
40 0.37
41 0.32
42 0.27
43 0.2
44 0.18
45 0.14
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.16
53 0.19
54 0.23
55 0.25
56 0.3
57 0.35
58 0.39
59 0.39
60 0.44
61 0.42
62 0.38
63 0.36
64 0.32
65 0.3
66 0.26
67 0.26
68 0.24
69 0.24
70 0.23
71 0.25
72 0.26
73 0.24
74 0.23
75 0.24
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.15
80 0.14
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.05
105 0.06
106 0.07
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.11
111 0.13
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.1
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.12
126 0.14
127 0.2
128 0.22
129 0.26
130 0.26
131 0.28
132 0.31
133 0.31
134 0.29
135 0.24
136 0.22
137 0.21
138 0.23
139 0.22
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.15
144 0.21
145 0.19
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.19
150 0.2
151 0.22
152 0.17
153 0.14
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.13
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.11
179 0.12
180 0.16
181 0.2
182 0.21
183 0.23
184 0.32
185 0.33
186 0.33
187 0.33
188 0.29
189 0.21
190 0.21
191 0.19
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.12
201 0.15
202 0.23
203 0.24
204 0.29
205 0.32
206 0.34
207 0.37
208 0.39
209 0.46
210 0.46
211 0.49
212 0.52
213 0.57
214 0.58
215 0.58
216 0.58
217 0.52
218 0.51
219 0.49
220 0.4
221 0.34
222 0.31
223 0.26
224 0.2
225 0.18
226 0.12
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.12
236 0.18
237 0.19
238 0.21
239 0.24
240 0.23
241 0.23
242 0.25
243 0.24
244 0.21
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.19
249 0.2
250 0.18
251 0.16
252 0.14
253 0.12
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.15
272 0.14
273 0.12
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.14
286 0.15
287 0.19
288 0.23
289 0.26
290 0.31
291 0.36
292 0.35
293 0.34
294 0.36
295 0.33
296 0.28
297 0.28
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.28
302 0.27
303 0.25
304 0.24
305 0.24
306 0.22
307 0.16
308 0.15
309 0.14
310 0.17
311 0.21
312 0.26
313 0.25
314 0.3
315 0.3
316 0.31
317 0.29
318 0.24
319 0.22
320 0.17
321 0.18
322 0.14
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.09
328 0.09
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.14
337 0.17
338 0.19
339 0.2
340 0.19
341 0.19
342 0.24
343 0.26
344 0.29
345 0.28
346 0.32
347 0.37
348 0.36
349 0.37
350 0.37
351 0.38
352 0.34
353 0.36
354 0.35
355 0.34
356 0.35
357 0.34
358 0.29
359 0.26
360 0.23
361 0.19
362 0.14
363 0.1
364 0.08
365 0.08
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.03
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.14
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.11
411 0.13
412 0.16
413 0.17
414 0.18
415 0.19
416 0.18
417 0.23
418 0.27
419 0.24
420 0.22
421 0.22
422 0.23
423 0.23
424 0.22
425 0.16
426 0.11
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.05
431 0.04
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.11
436 0.13
437 0.21
438 0.28
439 0.36
440 0.35
441 0.37
442 0.4
443 0.44
444 0.46
445 0.44
446 0.39
447 0.34
448 0.38
449 0.34
450 0.32
451 0.26
452 0.21
453 0.16
454 0.12
455 0.08
456 0.04
457 0.05
458 0.04
459 0.05
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.1
469 0.14
470 0.18
471 0.23
472 0.29
473 0.35
474 0.46
475 0.46
476 0.44
477 0.44
478 0.41
479 0.43
480 0.45
481 0.41
482 0.3
483 0.28
484 0.27
485 0.24
486 0.26
487 0.21
488 0.16
489 0.16
490 0.17
491 0.18
492 0.2
493 0.21
494 0.2
495 0.23
496 0.23
497 0.22
498 0.26
499 0.35
500 0.4
501 0.47
502 0.5
503 0.48
504 0.51
505 0.51
506 0.48
507 0.41
508 0.37
509 0.3
510 0.28
511 0.26
512 0.21
513 0.18
514 0.16
515 0.14
516 0.1
517 0.08
518 0.07
519 0.05
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.07
545 0.1
546 0.1
547 0.11
548 0.12
549 0.15
550 0.21
551 0.25
552 0.29
553 0.32
554 0.36
555 0.41
556 0.49
557 0.52
558 0.47
559 0.42
560 0.38
561 0.37
562 0.34
563 0.3
564 0.23
565 0.22
566 0.22
567 0.25
568 0.3
569 0.28
570 0.35
571 0.39
572 0.39
573 0.35
574 0.39
575 0.45
576 0.47
577 0.47
578 0.44
579 0.45
580 0.48
581 0.48
582 0.49
583 0.43
584 0.37
585 0.34
586 0.29
587 0.24
588 0.19
589 0.19
590 0.14
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.05
596 0.06
597 0.05
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.05
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.08
615 0.13
616 0.14
617 0.16
618 0.19
619 0.17
620 0.18
621 0.18
622 0.19
623 0.14
624 0.15
625 0.13
626 0.1
627 0.1
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.08
633 0.09
634 0.11
635 0.17
636 0.24
637 0.32
638 0.4
639 0.5
640 0.57
641 0.66
642 0.76
643 0.81
644 0.86
645 0.88
646 0.9
647 0.91
648 0.95
649 0.96
650 0.95
651 0.94
652 0.93
653 0.92
654 0.91
655 0.91
656 0.9
657 0.9
658 0.91
659 0.92
660 0.92
661 0.92
662 0.93
663 0.93
664 0.93
665 0.94
666 0.94
667 0.95
668 0.95
669 0.95
670 0.96
671 0.96
672 0.95
673 0.93
674 0.91
675 0.88
676 0.86
677 0.84
678 0.76
679 0.68
680 0.57
681 0.5
682 0.41
683 0.32
684 0.24
685 0.16
686 0.13
687 0.11
688 0.11
689 0.1
690 0.12
691 0.17
692 0.23
693 0.3
694 0.39
695 0.45
696 0.55
697 0.64
698 0.71
699 0.77
700 0.82
701 0.85
702 0.87
703 0.91
704 0.92
705 0.95
706 0.95
707 0.95
708 0.95
709 0.94
710 0.94
711 0.94
712 0.94
713 0.94
714 0.94
715 0.94
716 0.94
717 0.94
718 0.94
719 0.94
720 0.94
721 0.9
722 0.88
723 0.85
724 0.81
725 0.76
726 0.72
727 0.62
728 0.52
729 0.46
730 0.37
731 0.29
732 0.22
733 0.19
734 0.14
735 0.15
736 0.17
737 0.17
738 0.18
739 0.19
740 0.19
741 0.19
742 0.21
743 0.24
744 0.27
745 0.36
746 0.42
747 0.49
748 0.58
749 0.66
750 0.74
751 0.8
752 0.85
753 0.86
754 0.89
755 0.87
756 0.82
757 0.74
758 0.67
759 0.62
760 0.54
761 0.44
762 0.41
763 0.4
764 0.42
765 0.44
766 0.43
767 0.44
768 0.46
769 0.53
770 0.53
771 0.56
772 0.56
773 0.58
774 0.59
775 0.59
776 0.58
777 0.56
778 0.6
779 0.62
780 0.65
781 0.69
782 0.74
783 0.77
784 0.85
785 0.9
786 0.92
787 0.93
788 0.94
789 0.96
790 0.98
791 0.97
792 0.97
793 0.96
794 0.93
795 0.92
796 0.89
797 0.86
798 0.83
799 0.76
800 0.67
801 0.58
802 0.49
803 0.39
804 0.31
805 0.23
806 0.13
807 0.09
808 0.07
809 0.06
810 0.05
811 0.05
812 0.06
813 0.09
814 0.11
815 0.11
816 0.13
817 0.14
818 0.15
819 0.18
820 0.2
821 0.21
822 0.26
823 0.3
824 0.3
825 0.3
826 0.3
827 0.31
828 0.3
829 0.27
830 0.28
831 0.28
832 0.31
833 0.33
834 0.37
835 0.37
836 0.39
837 0.42
838 0.38
839 0.37
840 0.34
841 0.32
842 0.28
843 0.24
844 0.2
845 0.16
846 0.13
847 0.1
848 0.09
849 0.07
850 0.11
851 0.14
852 0.16
853 0.18
854 0.22
855 0.23
856 0.25
857 0.28
858 0.3
859 0.32
860 0.34
861 0.38
862 0.34
863 0.4
864 0.39
865 0.39
866 0.34
867 0.33
868 0.31
869 0.35
870 0.37
871 0.32
872 0.33
873 0.31
874 0.35
875 0.34
876 0.34
877 0.3
878 0.33
879 0.33
880 0.35
881 0.35
882 0.29
883 0.27
884 0.26