Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0PQM3

Protein Details
Accession A0A4T0PQM3    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-36GKKDVVKSVEKKEKKDKKEKKAAKKEPTPPPKPASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-33VEKKEKKDKKEKKAAKKEPTPPPK
89-97KKEDAKKPA
390-419QGGAPRGRGGFGGRGGRGGAPRGRGGNPNR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKKDVVKSVEKKEKKDKKEKKAAKKEPTPPPKPASSSSDSSDSSDSSDSEDEKKPVAKKQAAKKEASSDSSDSSDSSDSSDDEKPAAKKEDAKKPAAKKQDSSDSSDSSDSSDSEDEKPAAKPAAKKDDSDSSDSSDSSDDEKPAAKKEEAKKADSSSDSSDSSSDEEDEKPAEKPAAAPAPVAEEPSKKRKADDMEAAEAITLDNTPQIFVGQLSWNIDDDWLKSEFEQLGPVKTARVQLDRQSGRSRGFGYVEFESHELAVKAMDQFAGKEIDGRPVRVDLSVPRAPNPEKRAKSFGDQRSDPSNTLFIGNLSFNTNEDRVWEFFGEFGSVESVRVPTDRETGAPKGFGYVSFADVDTAKAAIDGAAGSELDGRVIRLDFSTPKDRQGGAPRGRGGFGGRGGRGGAPRGRGGNPNRTGAIAPPQGKKMTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.86
4 0.86
5 0.86
6 0.91
7 0.93
8 0.94
9 0.95
10 0.95
11 0.94
12 0.94
13 0.92
14 0.92
15 0.92
16 0.87
17 0.84
18 0.79
19 0.76
20 0.7
21 0.66
22 0.62
23 0.57
24 0.55
25 0.51
26 0.5
27 0.44
28 0.41
29 0.37
30 0.3
31 0.26
32 0.23
33 0.2
34 0.18
35 0.19
36 0.18
37 0.22
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.33
42 0.34
43 0.39
44 0.47
45 0.5
46 0.54
47 0.63
48 0.7
49 0.71
50 0.71
51 0.68
52 0.66
53 0.63
54 0.59
55 0.53
56 0.45
57 0.41
58 0.39
59 0.35
60 0.26
61 0.23
62 0.2
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.16
68 0.18
69 0.16
70 0.17
71 0.21
72 0.22
73 0.26
74 0.3
75 0.28
76 0.35
77 0.43
78 0.52
79 0.54
80 0.59
81 0.62
82 0.65
83 0.71
84 0.73
85 0.69
86 0.62
87 0.63
88 0.67
89 0.61
90 0.61
91 0.56
92 0.48
93 0.46
94 0.42
95 0.35
96 0.27
97 0.25
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.2
107 0.19
108 0.2
109 0.21
110 0.24
111 0.3
112 0.4
113 0.4
114 0.4
115 0.42
116 0.48
117 0.47
118 0.47
119 0.4
120 0.33
121 0.33
122 0.32
123 0.28
124 0.2
125 0.18
126 0.17
127 0.19
128 0.15
129 0.16
130 0.21
131 0.22
132 0.25
133 0.28
134 0.26
135 0.31
136 0.38
137 0.47
138 0.46
139 0.47
140 0.46
141 0.44
142 0.47
143 0.4
144 0.36
145 0.29
146 0.28
147 0.26
148 0.23
149 0.21
150 0.18
151 0.17
152 0.15
153 0.12
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.13
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.16
173 0.15
174 0.19
175 0.27
176 0.33
177 0.29
178 0.3
179 0.34
180 0.38
181 0.4
182 0.44
183 0.4
184 0.37
185 0.37
186 0.36
187 0.3
188 0.24
189 0.18
190 0.1
191 0.06
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.13
224 0.17
225 0.15
226 0.18
227 0.19
228 0.24
229 0.33
230 0.34
231 0.36
232 0.36
233 0.37
234 0.35
235 0.35
236 0.31
237 0.23
238 0.24
239 0.21
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.16
244 0.15
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.11
261 0.11
262 0.19
263 0.2
264 0.21
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.18
269 0.18
270 0.12
271 0.19
272 0.22
273 0.22
274 0.22
275 0.27
276 0.29
277 0.35
278 0.4
279 0.43
280 0.43
281 0.47
282 0.51
283 0.49
284 0.54
285 0.57
286 0.57
287 0.55
288 0.52
289 0.51
290 0.52
291 0.52
292 0.45
293 0.37
294 0.31
295 0.23
296 0.23
297 0.19
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.14
309 0.16
310 0.15
311 0.18
312 0.18
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.13
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.15
329 0.15
330 0.17
331 0.21
332 0.25
333 0.26
334 0.25
335 0.23
336 0.21
337 0.21
338 0.19
339 0.19
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.13
369 0.16
370 0.22
371 0.31
372 0.31
373 0.35
374 0.39
375 0.39
376 0.42
377 0.49
378 0.53
379 0.51
380 0.58
381 0.57
382 0.55
383 0.54
384 0.48
385 0.41
386 0.36
387 0.34
388 0.33
389 0.29
390 0.28
391 0.29
392 0.3
393 0.29
394 0.31
395 0.29
396 0.27
397 0.3
398 0.33
399 0.36
400 0.41
401 0.46
402 0.51
403 0.51
404 0.52
405 0.49
406 0.47
407 0.44
408 0.39
409 0.41
410 0.39
411 0.4
412 0.4
413 0.44
414 0.46