Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W1G3

Protein Details
Accession A0A4U0W1G3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-179QPIESPSKARRKEEKERKDRLDRQSRAEBasic
250-275PVIDEFSKKKKEKKKRPVQIDVSDESHydrophilic
290-310ARSESKGKSRQREAKKPSRLGBasic
332-352AAHRPLLKKKRAKRLPASSESHydrophilic
846-912VVETGLAKRKRKEGRTRGRKQPSPLKREKKKKKAPKSPKQKVDQRSRSKSPQKKKRKKYAQSGGSSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-176SKARRKEEKERKDRLDRQS
256-266SKKKKEKKKRP
281-314RKSSRRRDDARSESKGKSRQREAKKPSRLGGTRR
335-346RPLLKKKRAKRL
852-903AKRKRKEGRTRGRKQPSPLKREKKKKKAPKSPKQKVDQRSRSKSPQKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MYSNYGPNKRRPGPPPTLNSGGSHYSDPYSTSRPGQAFTVPTPYGRGPDERGYPKPSTVTADNFHHAQPQPPPSTSQWNRRPEYHRNSQSHAGNGFPYGDRGVFALDDDHNLSPADMCRPPANASEAGFRHAALVDRAMDVRSRVRGAQAAQPIESPSKARRKEEKERKDRLDRQSRAEAEEEAAAKRRQARDSEQQLKQARQKSEASSSANIPRPGALVDKLVAKLPSSKRTSSASAGVPKPAAPSKLPVIDEFSKKKKEKKKRPVQIDVSDESGGEDERKSSRRRDDARSESKGKSRQREAKKPSRLGGTRRAGFDDDNGGDSDSGPSVAAHRPLLKKKRAKRLPASSESPVREPSPEKATPLLDLFKEKEDGNVTLSDSSDDEDTLERLRESRARADSRFDSPYPDFDPTQAPVNPDTLCPFCDQPLPDNPSEDLLRKKDALLNDPSARRKRTMQNSKAVRLRDGHVVRTAEFCKQHRDERIFIPEGRAQGWPAEIDWAALPGRIERLLGVHLNNIVLGKVETPFLERAHSDFARVGGKRGNAVNDLATFGVEEPGYYGPKGRKVICDAVTHLLTVTFPLLTPHRVEPLDVDFYVRRVLLPECAIELVRDDLGGSATVSRERAEQTVQDSRGYGKAMFPDVGDGEERGMTQAPVDVDIDESTSSSDIEVEEVESVPDRTGTTSSQQSRKRKTLHVSSDNDDDDEGSVSDSHDAIATSSKSKAPSVAAPAKQGGLRMPKSFGGAGSKPSSSGSSTSAATSSRTSKASHSTGITIPDAEASEDEDLRPPPSAQHPSAKSAKSSLFASVTTPAKTGGLLDGMPSSSAIELSDSETSNDSDASLDEVVETGLAKRKRKEGRTRGRKQPSPLKREKKKKKAPKSPKQKVDQRSRSKSPQKKKRKKYAQSGGSSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.73
4 0.72
5 0.65
6 0.6
7 0.55
8 0.48
9 0.41
10 0.36
11 0.3
12 0.25
13 0.24
14 0.25
15 0.25
16 0.25
17 0.26
18 0.29
19 0.34
20 0.33
21 0.34
22 0.34
23 0.34
24 0.34
25 0.33
26 0.37
27 0.31
28 0.3
29 0.33
30 0.31
31 0.3
32 0.29
33 0.31
34 0.28
35 0.34
36 0.43
37 0.44
38 0.49
39 0.51
40 0.51
41 0.5
42 0.47
43 0.43
44 0.4
45 0.39
46 0.39
47 0.38
48 0.41
49 0.41
50 0.4
51 0.38
52 0.4
53 0.36
54 0.35
55 0.37
56 0.41
57 0.42
58 0.42
59 0.46
60 0.43
61 0.53
62 0.56
63 0.59
64 0.6
65 0.65
66 0.68
67 0.71
68 0.75
69 0.74
70 0.76
71 0.76
72 0.77
73 0.72
74 0.74
75 0.74
76 0.71
77 0.66
78 0.58
79 0.48
80 0.39
81 0.35
82 0.31
83 0.23
84 0.2
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.16
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.15
102 0.18
103 0.16
104 0.19
105 0.2
106 0.22
107 0.25
108 0.26
109 0.29
110 0.26
111 0.26
112 0.31
113 0.3
114 0.3
115 0.28
116 0.25
117 0.21
118 0.2
119 0.2
120 0.13
121 0.15
122 0.13
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.21
131 0.2
132 0.22
133 0.25
134 0.27
135 0.32
136 0.34
137 0.33
138 0.31
139 0.31
140 0.31
141 0.29
142 0.28
143 0.24
144 0.25
145 0.33
146 0.39
147 0.46
148 0.53
149 0.61
150 0.71
151 0.79
152 0.82
153 0.83
154 0.87
155 0.88
156 0.89
157 0.89
158 0.88
159 0.88
160 0.81
161 0.77
162 0.77
163 0.7
164 0.62
165 0.55
166 0.45
167 0.35
168 0.34
169 0.28
170 0.2
171 0.23
172 0.2
173 0.21
174 0.27
175 0.3
176 0.31
177 0.35
178 0.41
179 0.47
180 0.57
181 0.64
182 0.61
183 0.65
184 0.66
185 0.67
186 0.67
187 0.64
188 0.56
189 0.52
190 0.52
191 0.48
192 0.5
193 0.49
194 0.46
195 0.4
196 0.41
197 0.44
198 0.46
199 0.42
200 0.35
201 0.3
202 0.27
203 0.25
204 0.24
205 0.17
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.16
210 0.18
211 0.17
212 0.15
213 0.22
214 0.26
215 0.33
216 0.35
217 0.36
218 0.37
219 0.41
220 0.44
221 0.39
222 0.38
223 0.35
224 0.38
225 0.38
226 0.36
227 0.33
228 0.29
229 0.3
230 0.28
231 0.25
232 0.19
233 0.21
234 0.24
235 0.28
236 0.29
237 0.26
238 0.29
239 0.32
240 0.37
241 0.4
242 0.42
243 0.47
244 0.51
245 0.59
246 0.63
247 0.69
248 0.74
249 0.79
250 0.84
251 0.85
252 0.91
253 0.92
254 0.9
255 0.86
256 0.81
257 0.71
258 0.63
259 0.53
260 0.42
261 0.32
262 0.23
263 0.16
264 0.11
265 0.09
266 0.08
267 0.12
268 0.17
269 0.2
270 0.27
271 0.35
272 0.43
273 0.5
274 0.56
275 0.63
276 0.68
277 0.74
278 0.74
279 0.72
280 0.66
281 0.67
282 0.66
283 0.63
284 0.61
285 0.62
286 0.65
287 0.69
288 0.76
289 0.79
290 0.81
291 0.83
292 0.8
293 0.74
294 0.74
295 0.69
296 0.64
297 0.64
298 0.62
299 0.56
300 0.52
301 0.5
302 0.42
303 0.37
304 0.33
305 0.27
306 0.2
307 0.17
308 0.16
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.07
318 0.09
319 0.11
320 0.11
321 0.17
322 0.22
323 0.31
324 0.4
325 0.47
326 0.54
327 0.61
328 0.71
329 0.74
330 0.78
331 0.79
332 0.81
333 0.81
334 0.79
335 0.75
336 0.68
337 0.66
338 0.58
339 0.5
340 0.41
341 0.33
342 0.29
343 0.26
344 0.25
345 0.26
346 0.25
347 0.25
348 0.25
349 0.25
350 0.24
351 0.23
352 0.22
353 0.15
354 0.17
355 0.17
356 0.16
357 0.17
358 0.15
359 0.15
360 0.16
361 0.16
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.13
367 0.11
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.09
380 0.12
381 0.14
382 0.2
383 0.26
384 0.3
385 0.31
386 0.35
387 0.36
388 0.36
389 0.38
390 0.32
391 0.3
392 0.26
393 0.28
394 0.26
395 0.26
396 0.22
397 0.19
398 0.21
399 0.17
400 0.21
401 0.19
402 0.18
403 0.16
404 0.18
405 0.17
406 0.15
407 0.17
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.11
413 0.14
414 0.14
415 0.15
416 0.22
417 0.25
418 0.24
419 0.25
420 0.24
421 0.23
422 0.24
423 0.23
424 0.2
425 0.17
426 0.19
427 0.18
428 0.18
429 0.19
430 0.19
431 0.22
432 0.21
433 0.24
434 0.26
435 0.29
436 0.35
437 0.37
438 0.37
439 0.35
440 0.36
441 0.41
442 0.48
443 0.55
444 0.55
445 0.59
446 0.63
447 0.67
448 0.66
449 0.58
450 0.49
451 0.4
452 0.36
453 0.36
454 0.32
455 0.27
456 0.27
457 0.27
458 0.25
459 0.26
460 0.25
461 0.2
462 0.23
463 0.22
464 0.26
465 0.28
466 0.32
467 0.36
468 0.39
469 0.38
470 0.38
471 0.43
472 0.38
473 0.36
474 0.34
475 0.29
476 0.26
477 0.25
478 0.21
479 0.15
480 0.13
481 0.13
482 0.1
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.06
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.08
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.17
520 0.17
521 0.16
522 0.15
523 0.16
524 0.2
525 0.2
526 0.2
527 0.18
528 0.18
529 0.2
530 0.2
531 0.21
532 0.16
533 0.17
534 0.16
535 0.13
536 0.14
537 0.11
538 0.09
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.05
544 0.06
545 0.07
546 0.08
547 0.08
548 0.11
549 0.12
550 0.18
551 0.22
552 0.23
553 0.25
554 0.29
555 0.36
556 0.36
557 0.37
558 0.33
559 0.33
560 0.32
561 0.28
562 0.23
563 0.16
564 0.12
565 0.1
566 0.08
567 0.05
568 0.04
569 0.06
570 0.08
571 0.09
572 0.12
573 0.13
574 0.16
575 0.16
576 0.17
577 0.17
578 0.19
579 0.21
580 0.18
581 0.2
582 0.16
583 0.16
584 0.18
585 0.15
586 0.12
587 0.1
588 0.11
589 0.11
590 0.12
591 0.12
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.1
596 0.1
597 0.09
598 0.08
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.05
606 0.06
607 0.07
608 0.08
609 0.08
610 0.09
611 0.11
612 0.12
613 0.13
614 0.14
615 0.19
616 0.25
617 0.26
618 0.25
619 0.24
620 0.24
621 0.24
622 0.24
623 0.19
624 0.14
625 0.15
626 0.16
627 0.16
628 0.15
629 0.14
630 0.13
631 0.13
632 0.12
633 0.1
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.08
638 0.08
639 0.07
640 0.06
641 0.08
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.08
646 0.09
647 0.09
648 0.1
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.05
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.09
670 0.11
671 0.14
672 0.22
673 0.29
674 0.37
675 0.45
676 0.53
677 0.6
678 0.67
679 0.68
680 0.68
681 0.71
682 0.73
683 0.74
684 0.74
685 0.71
686 0.66
687 0.66
688 0.59
689 0.5
690 0.4
691 0.3
692 0.21
693 0.17
694 0.13
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.07
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.1
705 0.11
706 0.12
707 0.14
708 0.17
709 0.18
710 0.19
711 0.2
712 0.19
713 0.22
714 0.29
715 0.36
716 0.35
717 0.36
718 0.36
719 0.36
720 0.34
721 0.31
722 0.27
723 0.28
724 0.29
725 0.29
726 0.3
727 0.3
728 0.32
729 0.31
730 0.28
731 0.26
732 0.24
733 0.27
734 0.27
735 0.26
736 0.24
737 0.25
738 0.25
739 0.19
740 0.2
741 0.18
742 0.17
743 0.18
744 0.18
745 0.18
746 0.17
747 0.17
748 0.18
749 0.19
750 0.21
751 0.22
752 0.22
753 0.25
754 0.32
755 0.33
756 0.34
757 0.32
758 0.32
759 0.32
760 0.34
761 0.31
762 0.24
763 0.21
764 0.18
765 0.17
766 0.14
767 0.12
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.14
773 0.15
774 0.15
775 0.17
776 0.15
777 0.17
778 0.25
779 0.32
780 0.33
781 0.41
782 0.43
783 0.48
784 0.56
785 0.54
786 0.47
787 0.45
788 0.43
789 0.37
790 0.35
791 0.32
792 0.26
793 0.24
794 0.24
795 0.26
796 0.26
797 0.24
798 0.23
799 0.2
800 0.18
801 0.18
802 0.17
803 0.13
804 0.12
805 0.1
806 0.11
807 0.11
808 0.11
809 0.11
810 0.1
811 0.09
812 0.08
813 0.08
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.11
818 0.13
819 0.13
820 0.14
821 0.16
822 0.16
823 0.16
824 0.15
825 0.12
826 0.1
827 0.1
828 0.12
829 0.1
830 0.09
831 0.08
832 0.09
833 0.08
834 0.08
835 0.08
836 0.07
837 0.15
838 0.21
839 0.27
840 0.32
841 0.42
842 0.52
843 0.62
844 0.71
845 0.74
846 0.8
847 0.85
848 0.91
849 0.92
850 0.93
851 0.9
852 0.88
853 0.88
854 0.87
855 0.86
856 0.88
857 0.88
858 0.88
859 0.92
860 0.94
861 0.94
862 0.95
863 0.95
864 0.96
865 0.96
866 0.96
867 0.96
868 0.96
869 0.96
870 0.95
871 0.94
872 0.93
873 0.92
874 0.92
875 0.91
876 0.91
877 0.89
878 0.88
879 0.89
880 0.9
881 0.9
882 0.9
883 0.9
884 0.91
885 0.92
886 0.94
887 0.95
888 0.95
889 0.95
890 0.95
891 0.96
892 0.94