Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VYK6

Protein Details
Accession A0A4U0VYK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-194GEDNKDKQQQRKERPRFQSIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-28GAKGGKVGKGGGKGGKGKSKA
164-171KARRSKPG
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11, cyto 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MGPNKSSGAKGGKVGKGGGKGGKGKSKANYYSSRRPVGGKGIFVTTVRGKESRCAGEMYDLLDEVADRLYPPERIQKMQQARLAWIQSRSDGPKAGEGQDLELGDEQEVVMEEEEEEEDRETVPNANDDDDDDDDDEDLDIEASIQKELAGLRAGHGGQVAPAKARRSKPGNGGEDNKDKQQQRKERPRFQSIQTDTECLCFIATAWPYDPVELTEAIIAEVQETGQSRTRFVLPLPSPSFSPRYHWHIEPNLRTTSRLSSLSDWPANQNSRSYVQRLSPLSFSCHSLSVDQVELQSARLIEQTFTNWATANNKTSITYAIEPSVRSHQAPLSRHVLLSLLGSQITKLSSPPTISSPCPSRPLLTVRADLKQPDLVLLPTVLRNVYGLSIVEGNLWRGKKFNVAEIAAQKRNEKANEEAEVKGEGGSVVTETRAAATTASAAGPEASAPAPSTSEKISSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.4
4 0.42
5 0.41
6 0.38
7 0.42
8 0.46
9 0.51
10 0.51
11 0.53
12 0.55
13 0.6
14 0.6
15 0.61
16 0.65
17 0.65
18 0.72
19 0.74
20 0.72
21 0.65
22 0.62
23 0.58
24 0.58
25 0.54
26 0.46
27 0.4
28 0.37
29 0.36
30 0.33
31 0.34
32 0.28
33 0.26
34 0.27
35 0.27
36 0.26
37 0.3
38 0.37
39 0.37
40 0.34
41 0.33
42 0.31
43 0.32
44 0.32
45 0.29
46 0.22
47 0.18
48 0.16
49 0.14
50 0.13
51 0.09
52 0.08
53 0.06
54 0.05
55 0.07
56 0.1
57 0.12
58 0.15
59 0.24
60 0.27
61 0.31
62 0.36
63 0.44
64 0.51
65 0.56
66 0.57
67 0.5
68 0.5
69 0.51
70 0.5
71 0.44
72 0.38
73 0.33
74 0.3
75 0.34
76 0.33
77 0.3
78 0.3
79 0.27
80 0.3
81 0.31
82 0.31
83 0.29
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.23
88 0.18
89 0.16
90 0.14
91 0.11
92 0.11
93 0.09
94 0.06
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.16
117 0.14
118 0.15
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.13
150 0.17
151 0.23
152 0.25
153 0.32
154 0.35
155 0.4
156 0.47
157 0.53
158 0.56
159 0.54
160 0.57
161 0.55
162 0.57
163 0.54
164 0.48
165 0.45
166 0.43
167 0.45
168 0.5
169 0.54
170 0.57
171 0.67
172 0.74
173 0.78
174 0.81
175 0.83
176 0.78
177 0.72
178 0.71
179 0.63
180 0.6
181 0.51
182 0.46
183 0.38
184 0.34
185 0.3
186 0.19
187 0.15
188 0.08
189 0.07
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.07
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.22
221 0.18
222 0.25
223 0.26
224 0.26
225 0.25
226 0.27
227 0.31
228 0.23
229 0.27
230 0.23
231 0.28
232 0.31
233 0.31
234 0.34
235 0.37
236 0.43
237 0.42
238 0.42
239 0.4
240 0.36
241 0.36
242 0.33
243 0.28
244 0.25
245 0.23
246 0.21
247 0.2
248 0.23
249 0.27
250 0.27
251 0.24
252 0.23
253 0.26
254 0.27
255 0.24
256 0.22
257 0.2
258 0.22
259 0.24
260 0.24
261 0.22
262 0.22
263 0.27
264 0.28
265 0.27
266 0.26
267 0.25
268 0.27
269 0.25
270 0.26
271 0.21
272 0.2
273 0.19
274 0.17
275 0.17
276 0.14
277 0.14
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.12
296 0.15
297 0.17
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.19
302 0.19
303 0.2
304 0.19
305 0.19
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.2
311 0.24
312 0.22
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.28
317 0.3
318 0.32
319 0.31
320 0.3
321 0.3
322 0.28
323 0.25
324 0.18
325 0.17
326 0.14
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.11
337 0.13
338 0.15
339 0.19
340 0.22
341 0.23
342 0.28
343 0.32
344 0.33
345 0.36
346 0.36
347 0.33
348 0.33
349 0.37
350 0.39
351 0.38
352 0.4
353 0.39
354 0.41
355 0.41
356 0.38
357 0.35
358 0.3
359 0.25
360 0.21
361 0.19
362 0.16
363 0.14
364 0.14
365 0.13
366 0.11
367 0.13
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.11
379 0.11
380 0.13
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.18
385 0.2
386 0.26
387 0.27
388 0.31
389 0.33
390 0.34
391 0.39
392 0.45
393 0.52
394 0.48
395 0.49
396 0.45
397 0.43
398 0.47
399 0.45
400 0.41
401 0.39
402 0.4
403 0.45
404 0.45
405 0.41
406 0.36
407 0.34
408 0.3
409 0.24
410 0.18
411 0.11
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.1
437 0.13
438 0.14
439 0.16
440 0.17