Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4U0VNN7

Protein Details
Accession A0A4U0VNN7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-25GRTTTRCWTRTRINKTRPMSARTHydrophilic
397-429ATKVAKQQARGRKKKKEKKPRKKTPRLKADVQABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
399-424KVAKQQARGRKKKKEKKPRKKTPRLK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12.5, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028094  RTC4_C  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSGRTTTRCWTRTRINKTRPMSARTTLFARDLQAVVVQQHVNLPVQQTALFCRRHELQRTVYDQGVAAGYPTTYDFDELDKRVRLLLPKINRFADEPARSSFWREWKDEAPPQPFGKDVASLSAAGHARFLGSLSADPLQGPIHEVTDAVPHHRVEDFTSTVIAGEIACEFIMEDLGLSSRTEAKGVLVRSADYGQLVFSEAVDDDPPPATDSDQLQRTDGSSSSSDGEDGDEDRELTPLSGFETPASCYESETVEPEPSTSKADRRRSGPVDYRALNSGSDYRKTSTATAMSGKRGTKRSAAPQPTVSKPQKREKLSNPSSEAGNTTSRSKVSTLSNDKPSTSKAGKSAAPQPMQLRLPRAVARPSTSAKAQETVESEAHSSSSDDDDEAAAAGRATKVAKQQARGRKKKKEKKPRKKTPRLKADVQAPFDTDPADTDSSGEASPDPKRCPRKKADVLPTSIYIQAAYSGGGALDRQAKTAKMSTSATLPQIHEAISTLTGILQDELDFHSLKFLILPSSSSAIGSKAFSSLVTSVELDHFRDSLRGIAAKGTVLFQLPRPSLLPPPITAWKEKIKERYQVGSGPEHPTAACMIQGQHHYDMLDEARLDAEERRGANLESGLIHPFFGPKRAIGATPDTDAGSGSTLYNMPGKAKTPDMMQALLALQSTTMMLQQQQQQQHQQQPTEQQQQQQHPQPSLGGAPPSEPVSEELVQFAAQHHLEPATAMTISKYGISLHELTPTWN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.82
4 0.82
5 0.84
6 0.81
7 0.77
8 0.72
9 0.68
10 0.62
11 0.56
12 0.55
13 0.47
14 0.43
15 0.38
16 0.34
17 0.31
18 0.27
19 0.23
20 0.22
21 0.2
22 0.18
23 0.21
24 0.19
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.18
35 0.22
36 0.28
37 0.3
38 0.28
39 0.32
40 0.37
41 0.44
42 0.51
43 0.51
44 0.52
45 0.57
46 0.62
47 0.61
48 0.55
49 0.47
50 0.39
51 0.34
52 0.27
53 0.18
54 0.13
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.14
64 0.2
65 0.22
66 0.26
67 0.27
68 0.27
69 0.28
70 0.31
71 0.32
72 0.33
73 0.4
74 0.45
75 0.51
76 0.56
77 0.56
78 0.54
79 0.51
80 0.5
81 0.51
82 0.46
83 0.41
84 0.39
85 0.41
86 0.4
87 0.42
88 0.42
89 0.41
90 0.43
91 0.43
92 0.44
93 0.44
94 0.52
95 0.55
96 0.57
97 0.53
98 0.52
99 0.51
100 0.47
101 0.44
102 0.38
103 0.31
104 0.26
105 0.21
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.2
111 0.19
112 0.16
113 0.16
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.12
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.18
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.2
142 0.18
143 0.22
144 0.2
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.12
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.16
173 0.17
174 0.19
175 0.16
176 0.16
177 0.18
178 0.19
179 0.17
180 0.13
181 0.12
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.14
200 0.18
201 0.23
202 0.23
203 0.22
204 0.22
205 0.23
206 0.22
207 0.19
208 0.16
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.11
215 0.12
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.06
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.14
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.12
247 0.16
248 0.16
249 0.21
250 0.29
251 0.38
252 0.42
253 0.44
254 0.52
255 0.52
256 0.58
257 0.59
258 0.56
259 0.53
260 0.5
261 0.48
262 0.41
263 0.38
264 0.3
265 0.23
266 0.23
267 0.2
268 0.21
269 0.21
270 0.21
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.2
275 0.19
276 0.18
277 0.22
278 0.22
279 0.23
280 0.26
281 0.27
282 0.29
283 0.31
284 0.31
285 0.31
286 0.34
287 0.4
288 0.46
289 0.49
290 0.46
291 0.49
292 0.51
293 0.49
294 0.54
295 0.52
296 0.5
297 0.52
298 0.59
299 0.61
300 0.62
301 0.66
302 0.66
303 0.71
304 0.69
305 0.68
306 0.63
307 0.56
308 0.51
309 0.43
310 0.36
311 0.27
312 0.23
313 0.18
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.17
321 0.25
322 0.3
323 0.35
324 0.41
325 0.41
326 0.41
327 0.38
328 0.36
329 0.34
330 0.28
331 0.25
332 0.21
333 0.23
334 0.25
335 0.27
336 0.33
337 0.33
338 0.32
339 0.32
340 0.31
341 0.32
342 0.32
343 0.31
344 0.26
345 0.21
346 0.23
347 0.23
348 0.24
349 0.23
350 0.22
351 0.23
352 0.23
353 0.24
354 0.23
355 0.22
356 0.22
357 0.19
358 0.2
359 0.18
360 0.17
361 0.17
362 0.18
363 0.17
364 0.15
365 0.14
366 0.12
367 0.12
368 0.1
369 0.08
370 0.06
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.03
381 0.04
382 0.03
383 0.04
384 0.05
385 0.07
386 0.11
387 0.18
388 0.21
389 0.26
390 0.34
391 0.43
392 0.54
393 0.62
394 0.67
395 0.71
396 0.8
397 0.85
398 0.88
399 0.9
400 0.91
401 0.92
402 0.94
403 0.95
404 0.95
405 0.96
406 0.96
407 0.95
408 0.95
409 0.9
410 0.84
411 0.78
412 0.75
413 0.7
414 0.63
415 0.53
416 0.43
417 0.36
418 0.31
419 0.26
420 0.16
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.07
431 0.09
432 0.13
433 0.17
434 0.2
435 0.26
436 0.37
437 0.43
438 0.51
439 0.56
440 0.63
441 0.68
442 0.75
443 0.78
444 0.73
445 0.72
446 0.66
447 0.59
448 0.5
449 0.41
450 0.31
451 0.2
452 0.14
453 0.11
454 0.08
455 0.07
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.11
463 0.11
464 0.12
465 0.13
466 0.14
467 0.16
468 0.2
469 0.19
470 0.17
471 0.18
472 0.18
473 0.2
474 0.22
475 0.22
476 0.22
477 0.21
478 0.19
479 0.18
480 0.17
481 0.14
482 0.13
483 0.11
484 0.08
485 0.08
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.12
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.13
525 0.14
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.13
531 0.12
532 0.11
533 0.12
534 0.12
535 0.12
536 0.13
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.12
541 0.1
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.18
546 0.18
547 0.19
548 0.2
549 0.21
550 0.24
551 0.28
552 0.27
553 0.22
554 0.26
555 0.32
556 0.34
557 0.34
558 0.34
559 0.38
560 0.42
561 0.47
562 0.51
563 0.5
564 0.55
565 0.58
566 0.58
567 0.53
568 0.52
569 0.49
570 0.45
571 0.43
572 0.4
573 0.35
574 0.31
575 0.27
576 0.23
577 0.22
578 0.16
579 0.13
580 0.1
581 0.1
582 0.13
583 0.17
584 0.2
585 0.2
586 0.2
587 0.19
588 0.18
589 0.2
590 0.17
591 0.15
592 0.12
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.11
597 0.11
598 0.13
599 0.15
600 0.16
601 0.18
602 0.19
603 0.19
604 0.2
605 0.19
606 0.17
607 0.14
608 0.15
609 0.15
610 0.14
611 0.13
612 0.12
613 0.16
614 0.15
615 0.18
616 0.18
617 0.16
618 0.2
619 0.22
620 0.23
621 0.22
622 0.27
623 0.25
624 0.25
625 0.26
626 0.22
627 0.2
628 0.19
629 0.16
630 0.12
631 0.1
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.1
636 0.13
637 0.13
638 0.15
639 0.17
640 0.19
641 0.21
642 0.24
643 0.24
644 0.24
645 0.29
646 0.3
647 0.28
648 0.25
649 0.24
650 0.21
651 0.2
652 0.18
653 0.11
654 0.08
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.07
659 0.07
660 0.09
661 0.14
662 0.21
663 0.28
664 0.35
665 0.4
666 0.48
667 0.55
668 0.62
669 0.64
670 0.6
671 0.58
672 0.6
673 0.64
674 0.65
675 0.61
676 0.59
677 0.62
678 0.67
679 0.72
680 0.72
681 0.68
682 0.6
683 0.58
684 0.52
685 0.45
686 0.4
687 0.33
688 0.27
689 0.21
690 0.2
691 0.21
692 0.21
693 0.2
694 0.17
695 0.17
696 0.2
697 0.21
698 0.2
699 0.19
700 0.18
701 0.18
702 0.17
703 0.16
704 0.16
705 0.15
706 0.15
707 0.15
708 0.15
709 0.15
710 0.15
711 0.15
712 0.11
713 0.11
714 0.11
715 0.1
716 0.11
717 0.12
718 0.12
719 0.11
720 0.1
721 0.11
722 0.16
723 0.18
724 0.18
725 0.23