Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W8I8

Protein Details
Accession A0A4U0W8I8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
258-284DEDEQDSPGRRRRRRKRPVVVERGEGQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-275GRRRRRRKRP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 11, cyto_nucl 8, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTRAGALSIHGTNPQYLVPTVIRKRVYDTLYWKEKCFALNAATIIDRAVELEAVGGTYANTRPTEFICLVLKLLQLQPEREIVLEYLRAEEFKYLRALAAFYVRLTFDSLNAYETLEPLLDDYRKLRYRAMDGSYSILTMDEFVDQLLVGESVCEIQLPRLTQRKVLEETEGLAPRRSKLGKALGVMQVEGADGSDVGGGDDDDSADEEGGGGGGGRGRYLSRSPSASPSPSPSGDERADRKEGSPEYWTEASEDEDEQDSPGRRRRRRKRPVVVERGEGQGEGSDDEDAGRYISRSPSPAGSDGRFVSRSPTRSPEPERIQVEHIEGDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.2
4 0.19
5 0.17
6 0.15
7 0.18
8 0.18
9 0.27
10 0.31
11 0.38
12 0.4
13 0.38
14 0.45
15 0.48
16 0.48
17 0.46
18 0.49
19 0.51
20 0.58
21 0.6
22 0.55
23 0.5
24 0.49
25 0.43
26 0.38
27 0.32
28 0.25
29 0.26
30 0.25
31 0.24
32 0.22
33 0.21
34 0.18
35 0.14
36 0.11
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.04
46 0.04
47 0.06
48 0.08
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.2
55 0.19
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.2
60 0.2
61 0.19
62 0.16
63 0.17
64 0.2
65 0.2
66 0.21
67 0.22
68 0.22
69 0.22
70 0.19
71 0.19
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.15
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.14
90 0.12
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.13
96 0.12
97 0.09
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.17
114 0.21
115 0.22
116 0.24
117 0.24
118 0.29
119 0.33
120 0.35
121 0.29
122 0.26
123 0.28
124 0.25
125 0.22
126 0.17
127 0.12
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.06
148 0.07
149 0.12
150 0.19
151 0.19
152 0.24
153 0.26
154 0.29
155 0.3
156 0.3
157 0.27
158 0.21
159 0.22
160 0.22
161 0.23
162 0.19
163 0.18
164 0.17
165 0.16
166 0.21
167 0.2
168 0.16
169 0.19
170 0.25
171 0.26
172 0.26
173 0.3
174 0.28
175 0.28
176 0.27
177 0.22
178 0.15
179 0.12
180 0.11
181 0.06
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.08
210 0.1
211 0.14
212 0.15
213 0.19
214 0.2
215 0.25
216 0.29
217 0.29
218 0.29
219 0.31
220 0.32
221 0.3
222 0.31
223 0.28
224 0.29
225 0.29
226 0.33
227 0.32
228 0.33
229 0.36
230 0.34
231 0.33
232 0.34
233 0.34
234 0.31
235 0.29
236 0.26
237 0.28
238 0.28
239 0.27
240 0.21
241 0.2
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.16
250 0.17
251 0.21
252 0.29
253 0.37
254 0.45
255 0.56
256 0.66
257 0.73
258 0.82
259 0.88
260 0.92
261 0.93
262 0.95
263 0.95
264 0.89
265 0.83
266 0.75
267 0.67
268 0.56
269 0.44
270 0.33
271 0.24
272 0.19
273 0.14
274 0.12
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.1
284 0.14
285 0.17
286 0.19
287 0.21
288 0.24
289 0.28
290 0.32
291 0.35
292 0.32
293 0.34
294 0.34
295 0.36
296 0.33
297 0.29
298 0.32
299 0.34
300 0.36
301 0.37
302 0.42
303 0.44
304 0.51
305 0.58
306 0.61
307 0.62
308 0.67
309 0.67
310 0.63
311 0.61
312 0.55
313 0.51