Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VUQ3

Protein Details
Accession A0A4U0VUQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-294DSEDDAPKRKKRKQRGEPSSRTKKKSKKSKQGIFSKGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-287PKRKKRKQRGEPSSRTKKKSKKSKQ
Subcellular Location(s) nucl 11, mito_nucl 10.166, cyto_nucl 9.166, mito 8, cyto_mito 7.666, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013197  RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH  
IPR008806  RNA_pol_III_Rpc82_C  
IPR039748  RPC3  
IPR024550  TFIIEa/SarR/Rpc3_HTH_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF08221  HTH_9  
PF05645  RNA_pol_Rpc82  
PF02002  TFIIE_alpha  
Amino Acid Sequences MSSATQSGTERSRLLQHVVYQQFGAAVGEIASILLFRGALSFPQLAKLTALPPSLVHASLLVLSTHCLLFHSETEVGGRLTELYELNHDAIERRLRGGMYVEMATEWQGGAQLGQVVEVLWKEGMLRREDLIEVVRCQLAVERGVDAFGGGGEATDGDDLKGKKRAKDADKVAEDAERLVRKAFAQGYIQIVTPGSQLSPSSLEIKWEEELRALIKGIPSTKDMKEVKDKLEQKQKSWAEEERARAMGKSADVAAEDSEDDAPKRKKRKQRGEPSSRTKKKSKKSKQGIFSKGGGSESDTVSERGCDDDSDDDDDDEAPEEVFYRVNEERFHLQWRAQLLRSYASDLYNPQVAAVLGIILDITTTDCQSMAETQSRPVSLHQISQYYERLKHKPDLSAALAKHKHDPSWPPSSSSSKRGSSPRAGDYILATCEVLSGLDRWGISTQETLLMQQGESTHAKWAVDWAMLGKAMKRSLVEAVIRDKLGDKAIRCWRILEAKGKLEEKHLARLAFLPVKEAREVLSQLSSAGLIEPQEIPRSADRAPSRTIYLWFVDFNKVVTSLIHHHYKALANLQAQRQHQLELRRGLVDKRERSDVRADPSLLSARDREMIIELDKVLEALSVACLRVDEQLFVLREFDPEPEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.37
4 0.43
5 0.44
6 0.43
7 0.36
8 0.33
9 0.29
10 0.25
11 0.2
12 0.1
13 0.08
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.05
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.11
28 0.14
29 0.14
30 0.19
31 0.21
32 0.2
33 0.21
34 0.22
35 0.2
36 0.22
37 0.22
38 0.18
39 0.17
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.18
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.11
56 0.13
57 0.14
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.18
62 0.19
63 0.17
64 0.14
65 0.13
66 0.09
67 0.09
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.12
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.18
78 0.24
79 0.22
80 0.21
81 0.23
82 0.23
83 0.24
84 0.25
85 0.22
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.11
93 0.09
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.11
111 0.15
112 0.17
113 0.19
114 0.19
115 0.2
116 0.21
117 0.21
118 0.22
119 0.2
120 0.19
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.1
134 0.08
135 0.05
136 0.05
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.09
146 0.1
147 0.14
148 0.22
149 0.25
150 0.28
151 0.36
152 0.45
153 0.47
154 0.56
155 0.61
156 0.63
157 0.62
158 0.6
159 0.53
160 0.45
161 0.39
162 0.3
163 0.28
164 0.19
165 0.17
166 0.16
167 0.17
168 0.15
169 0.2
170 0.2
171 0.17
172 0.18
173 0.19
174 0.22
175 0.21
176 0.21
177 0.17
178 0.15
179 0.13
180 0.11
181 0.1
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.09
187 0.1
188 0.13
189 0.13
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.19
208 0.2
209 0.27
210 0.28
211 0.3
212 0.38
213 0.4
214 0.41
215 0.46
216 0.5
217 0.49
218 0.58
219 0.56
220 0.48
221 0.55
222 0.54
223 0.48
224 0.48
225 0.44
226 0.41
227 0.43
228 0.44
229 0.37
230 0.36
231 0.33
232 0.28
233 0.26
234 0.2
235 0.15
236 0.13
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.13
249 0.18
250 0.24
251 0.34
252 0.41
253 0.5
254 0.61
255 0.72
256 0.77
257 0.83
258 0.88
259 0.9
260 0.91
261 0.92
262 0.92
263 0.89
264 0.84
265 0.82
266 0.79
267 0.78
268 0.8
269 0.8
270 0.8
271 0.83
272 0.85
273 0.86
274 0.87
275 0.83
276 0.76
277 0.67
278 0.57
279 0.47
280 0.39
281 0.29
282 0.21
283 0.17
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.12
298 0.12
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.09
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.14
316 0.17
317 0.17
318 0.21
319 0.18
320 0.18
321 0.19
322 0.22
323 0.23
324 0.21
325 0.22
326 0.2
327 0.21
328 0.2
329 0.21
330 0.18
331 0.16
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.07
357 0.08
358 0.12
359 0.13
360 0.15
361 0.16
362 0.17
363 0.17
364 0.16
365 0.2
366 0.17
367 0.2
368 0.2
369 0.21
370 0.21
371 0.24
372 0.27
373 0.24
374 0.29
375 0.31
376 0.33
377 0.34
378 0.4
379 0.39
380 0.39
381 0.38
382 0.37
383 0.35
384 0.36
385 0.33
386 0.36
387 0.36
388 0.33
389 0.38
390 0.34
391 0.32
392 0.31
393 0.36
394 0.33
395 0.4
396 0.39
397 0.36
398 0.39
399 0.46
400 0.45
401 0.45
402 0.45
403 0.39
404 0.43
405 0.45
406 0.47
407 0.46
408 0.47
409 0.44
410 0.41
411 0.39
412 0.34
413 0.3
414 0.26
415 0.19
416 0.15
417 0.12
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.14
445 0.15
446 0.15
447 0.14
448 0.17
449 0.14
450 0.13
451 0.13
452 0.11
453 0.1
454 0.11
455 0.12
456 0.11
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.15
462 0.16
463 0.2
464 0.2
465 0.19
466 0.23
467 0.24
468 0.24
469 0.22
470 0.21
471 0.19
472 0.22
473 0.23
474 0.2
475 0.26
476 0.35
477 0.39
478 0.39
479 0.38
480 0.38
481 0.42
482 0.45
483 0.45
484 0.41
485 0.42
486 0.47
487 0.49
488 0.45
489 0.41
490 0.44
491 0.38
492 0.41
493 0.39
494 0.34
495 0.32
496 0.33
497 0.35
498 0.32
499 0.3
500 0.26
501 0.25
502 0.27
503 0.27
504 0.25
505 0.21
506 0.2
507 0.21
508 0.18
509 0.18
510 0.15
511 0.15
512 0.15
513 0.13
514 0.09
515 0.08
516 0.07
517 0.06
518 0.08
519 0.09
520 0.11
521 0.13
522 0.14
523 0.16
524 0.18
525 0.2
526 0.2
527 0.26
528 0.29
529 0.3
530 0.33
531 0.33
532 0.35
533 0.34
534 0.36
535 0.31
536 0.29
537 0.27
538 0.25
539 0.25
540 0.26
541 0.24
542 0.22
543 0.2
544 0.18
545 0.17
546 0.15
547 0.17
548 0.18
549 0.23
550 0.28
551 0.27
552 0.27
553 0.31
554 0.33
555 0.33
556 0.32
557 0.32
558 0.3
559 0.36
560 0.41
561 0.44
562 0.43
563 0.45
564 0.41
565 0.39
566 0.39
567 0.41
568 0.43
569 0.42
570 0.43
571 0.41
572 0.42
573 0.43
574 0.48
575 0.5
576 0.49
577 0.48
578 0.55
579 0.53
580 0.55
581 0.59
582 0.56
583 0.53
584 0.52
585 0.49
586 0.41
587 0.43
588 0.44
589 0.37
590 0.33
591 0.28
592 0.24
593 0.26
594 0.25
595 0.22
596 0.19
597 0.21
598 0.2
599 0.2
600 0.18
601 0.16
602 0.16
603 0.14
604 0.12
605 0.09
606 0.08
607 0.06
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.11
614 0.16
615 0.17
616 0.15
617 0.15
618 0.22
619 0.23
620 0.24
621 0.25
622 0.19
623 0.2
624 0.2
625 0.2