Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W401

Protein Details
Accession A0A4U0W401    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-79VDARIDERRRARREAREKEEAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-69RAR
Subcellular Location(s) mito 10, mito_nucl 9.833, nucl 8.5, cyto_mito 7.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MADIFGLRGDRYAFLRLAPPPSYVAGAGRGAQGFTTRSDIGTVYEADDEEADRIYEAVDARIDERRRARREAREKEEAAQLLAERPTIQSQFADLKRGLADMSEDEWYNLPEVSNLIGNRVKKPRLEGRSYVVPDSILVGNRDQNALESSLAEEEMKGGLQTPADAMTDFAEIGQAREKMLSIKLEQAGTDSALGSTNIDPKGYLTGLDSQLLKTSTEIGDIKRARALLQSLTKTNPKHAPGWVAAAWLENVAGKQVAARKLIAEGCERCPKSEDVWLCASELNTNENAKVILANAIQELPQSVRIWMRAVELENDVKAKKRVLRKALEYIPASVKLWKETVKLEENPEDARVLLARAVEVIPHSQELWLALARLETPDRARQVLNKARKTIPTSHEIWIAAGRLQEQEGNIAQVDAIIANGVAALKKNGAELSREQWLAEAERAEQQGSTVTAQAIIKATIHLDLDEEDRQAVWMDDAETMANKGMVASARAIYAYALNVYPQKQSLWRKAADLEKQHGDHASLLALLERAVESVPQAEVLWLMAAKESWNAGDVDGARQILSRAFESNPDSEGIWLAAVKLEAENGQIEAAKQLMQRAREVSGTERIWVKSAVFERTHSDAAAALDMVKQGLKIYPSSAKLHMMHAQLLQAQTPPNVSAARDALAAGLRKCPTATPLWIMASRLEEQAGLRIKARALLEKGRTLNPKSEELWLESVQVEQRDGSGAHKPMLARALQALPSSGLLHSYSVWLEPRPTRKTRSVDALKKTNNAPSVIVTVARLFWAERKIEKARDWFGRAVAADPDYGDAWAWWWKFEKQHGTEEHRAALKDKCVAADPRHGQIWPTILKDPENVGKDVPALLDLASEALEDAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.25
3 0.27
4 0.32
5 0.31
6 0.3
7 0.28
8 0.29
9 0.29
10 0.24
11 0.22
12 0.2
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.16
19 0.18
20 0.15
21 0.16
22 0.2
23 0.17
24 0.17
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.19
29 0.18
30 0.14
31 0.15
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.14
48 0.22
49 0.24
50 0.29
51 0.38
52 0.46
53 0.51
54 0.59
55 0.66
56 0.69
57 0.78
58 0.82
59 0.81
60 0.8
61 0.77
62 0.71
63 0.69
64 0.59
65 0.49
66 0.4
67 0.32
68 0.26
69 0.25
70 0.21
71 0.15
72 0.16
73 0.2
74 0.19
75 0.2
76 0.16
77 0.19
78 0.28
79 0.28
80 0.32
81 0.27
82 0.28
83 0.27
84 0.27
85 0.23
86 0.15
87 0.16
88 0.13
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.13
102 0.13
103 0.16
104 0.2
105 0.23
106 0.3
107 0.37
108 0.4
109 0.39
110 0.47
111 0.52
112 0.57
113 0.62
114 0.58
115 0.57
116 0.62
117 0.62
118 0.56
119 0.46
120 0.38
121 0.3
122 0.29
123 0.25
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.19
128 0.2
129 0.21
130 0.18
131 0.17
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.17
168 0.19
169 0.16
170 0.21
171 0.23
172 0.23
173 0.23
174 0.23
175 0.2
176 0.18
177 0.17
178 0.11
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.17
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.16
194 0.17
195 0.19
196 0.19
197 0.16
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.12
202 0.14
203 0.12
204 0.16
205 0.17
206 0.15
207 0.24
208 0.25
209 0.26
210 0.25
211 0.25
212 0.22
213 0.23
214 0.24
215 0.21
216 0.27
217 0.29
218 0.29
219 0.33
220 0.38
221 0.36
222 0.4
223 0.4
224 0.36
225 0.36
226 0.36
227 0.37
228 0.33
229 0.37
230 0.3
231 0.25
232 0.22
233 0.19
234 0.17
235 0.12
236 0.11
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.07
243 0.12
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.17
248 0.2
249 0.21
250 0.21
251 0.22
252 0.21
253 0.25
254 0.34
255 0.34
256 0.32
257 0.33
258 0.33
259 0.3
260 0.35
261 0.31
262 0.26
263 0.29
264 0.28
265 0.25
266 0.25
267 0.22
268 0.17
269 0.16
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.11
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.16
301 0.15
302 0.16
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.18
307 0.22
308 0.3
309 0.38
310 0.44
311 0.5
312 0.53
313 0.59
314 0.6
315 0.6
316 0.52
317 0.46
318 0.4
319 0.35
320 0.3
321 0.25
322 0.21
323 0.17
324 0.18
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.22
329 0.25
330 0.27
331 0.29
332 0.29
333 0.29
334 0.28
335 0.26
336 0.21
337 0.16
338 0.13
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.1
365 0.13
366 0.15
367 0.16
368 0.17
369 0.19
370 0.28
371 0.36
372 0.42
373 0.42
374 0.45
375 0.46
376 0.49
377 0.5
378 0.48
379 0.43
380 0.38
381 0.38
382 0.35
383 0.35
384 0.31
385 0.27
386 0.2
387 0.18
388 0.14
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.03
404 0.03
405 0.02
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.02
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.06
417 0.07
418 0.09
419 0.1
420 0.12
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.12
428 0.1
429 0.08
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.07
439 0.06
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.05
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.08
488 0.09
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.17
493 0.24
494 0.31
495 0.34
496 0.34
497 0.35
498 0.39
499 0.44
500 0.43
501 0.41
502 0.37
503 0.35
504 0.35
505 0.34
506 0.3
507 0.25
508 0.19
509 0.15
510 0.11
511 0.07
512 0.07
513 0.06
514 0.06
515 0.05
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.11
554 0.14
555 0.17
556 0.17
557 0.16
558 0.16
559 0.15
560 0.13
561 0.13
562 0.1
563 0.08
564 0.06
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.08
581 0.08
582 0.13
583 0.16
584 0.17
585 0.19
586 0.2
587 0.21
588 0.2
589 0.21
590 0.2
591 0.24
592 0.23
593 0.23
594 0.25
595 0.24
596 0.24
597 0.23
598 0.2
599 0.18
600 0.21
601 0.24
602 0.22
603 0.23
604 0.26
605 0.29
606 0.3
607 0.24
608 0.21
609 0.17
610 0.17
611 0.16
612 0.11
613 0.08
614 0.07
615 0.08
616 0.08
617 0.06
618 0.05
619 0.06
620 0.08
621 0.09
622 0.09
623 0.12
624 0.17
625 0.2
626 0.24
627 0.25
628 0.28
629 0.28
630 0.31
631 0.34
632 0.3
633 0.28
634 0.26
635 0.25
636 0.22
637 0.21
638 0.18
639 0.14
640 0.14
641 0.13
642 0.13
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.12
647 0.14
648 0.13
649 0.14
650 0.13
651 0.12
652 0.11
653 0.13
654 0.16
655 0.14
656 0.18
657 0.18
658 0.18
659 0.18
660 0.18
661 0.18
662 0.2
663 0.22
664 0.21
665 0.23
666 0.25
667 0.26
668 0.26
669 0.24
670 0.23
671 0.22
672 0.19
673 0.16
674 0.14
675 0.13
676 0.19
677 0.21
678 0.19
679 0.19
680 0.2
681 0.2
682 0.24
683 0.25
684 0.25
685 0.25
686 0.32
687 0.35
688 0.39
689 0.42
690 0.44
691 0.49
692 0.46
693 0.48
694 0.44
695 0.44
696 0.4
697 0.42
698 0.38
699 0.36
700 0.37
701 0.3
702 0.28
703 0.24
704 0.24
705 0.21
706 0.2
707 0.17
708 0.12
709 0.12
710 0.13
711 0.13
712 0.14
713 0.18
714 0.19
715 0.2
716 0.22
717 0.22
718 0.22
719 0.26
720 0.24
721 0.18
722 0.19
723 0.21
724 0.21
725 0.21
726 0.19
727 0.16
728 0.16
729 0.17
730 0.13
731 0.12
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.12
738 0.14
739 0.14
740 0.18
741 0.24
742 0.33
743 0.39
744 0.44
745 0.49
746 0.56
747 0.61
748 0.62
749 0.66
750 0.68
751 0.69
752 0.72
753 0.75
754 0.71
755 0.69
756 0.66
757 0.62
758 0.55
759 0.48
760 0.4
761 0.33
762 0.31
763 0.27
764 0.25
765 0.19
766 0.16
767 0.15
768 0.14
769 0.12
770 0.1
771 0.13
772 0.18
773 0.21
774 0.23
775 0.3
776 0.36
777 0.42
778 0.47
779 0.51
780 0.53
781 0.57
782 0.59
783 0.54
784 0.49
785 0.47
786 0.42
787 0.36
788 0.31
789 0.24
790 0.2
791 0.18
792 0.18
793 0.14
794 0.13
795 0.12
796 0.08
797 0.09
798 0.15
799 0.15
800 0.16
801 0.19
802 0.23
803 0.29
804 0.38
805 0.46
806 0.44
807 0.52
808 0.59
809 0.64
810 0.68
811 0.65
812 0.62
813 0.56
814 0.53
815 0.47
816 0.44
817 0.39
818 0.37
819 0.35
820 0.31
821 0.33
822 0.38
823 0.4
824 0.45
825 0.45
826 0.43
827 0.45
828 0.43
829 0.39
830 0.36
831 0.39
832 0.32
833 0.32
834 0.32
835 0.32
836 0.34
837 0.35
838 0.37
839 0.38
840 0.37
841 0.35
842 0.31
843 0.3
844 0.29
845 0.27
846 0.22
847 0.15
848 0.12
849 0.1
850 0.1
851 0.08
852 0.08
853 0.07
854 0.06