Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W4Y9

Protein Details
Accession A0A4U0W4Y9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-165KTEYSKDKYLKRKQAKYLQLFTHydrophilic
328-347APKPPRKNNREALKLKKRRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
329-353PKPPRKNNREALKLKKRRAAFEKAR
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 6, cyto_nucl 6, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSASLEPSPAPAAGPSTSSSSSRRSFIRLGDNVLLKLPSGVLKPVKITANGTISLGKYGSFKGNLLVDHPYGHTYEIDPATAAIHPIEVALNDVEETDANNQLIASTGAQALTFDDIQALKDSGLTGREIIQRQIDEHKAFELKTEYSKDKYLKRKQAKYLQLFTPLEPTVHQIAQFNFDRQASKTRELRPDTLANMLAMANVRPGSRLLVVEDLGGMVVAAAVERMGGRGRIMIVNDADSPPDLHLLESFNFSPQDLAPIASLHWAATQESWSPPDLPLGTADTGAEGGGEGERTAAALPVEGATAEVKKDEPAGGAAEADANATTAPKPPRKNNREALKLKKRRAAFEKAREAREDFFRGDFDGVIIACEYEPFSVIERLLPRIAGSAPVVVFSHHIQVLFPALQALRSHPSFVAPTIHEPFLRRYQVLPGRCHPEMQGMASGGMILSAIRVLENDEAQAISVSRRGKKRPATGTAGSGGGTSRDVSKSASAVTSADEAGAPEKKRAKVEAAAKEEGGDDAELPATAADGSAMQVDTPSAEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.19
4 0.21
5 0.23
6 0.26
7 0.3
8 0.32
9 0.35
10 0.36
11 0.37
12 0.39
13 0.42
14 0.49
15 0.45
16 0.48
17 0.5
18 0.5
19 0.45
20 0.43
21 0.36
22 0.26
23 0.23
24 0.18
25 0.15
26 0.14
27 0.19
28 0.21
29 0.23
30 0.25
31 0.29
32 0.32
33 0.31
34 0.32
35 0.32
36 0.32
37 0.31
38 0.3
39 0.28
40 0.25
41 0.25
42 0.22
43 0.17
44 0.14
45 0.16
46 0.2
47 0.18
48 0.18
49 0.2
50 0.23
51 0.22
52 0.23
53 0.25
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.19
58 0.17
59 0.18
60 0.16
61 0.13
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.08
84 0.08
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.13
115 0.19
116 0.2
117 0.22
118 0.24
119 0.23
120 0.25
121 0.3
122 0.32
123 0.27
124 0.27
125 0.27
126 0.26
127 0.25
128 0.26
129 0.23
130 0.19
131 0.22
132 0.26
133 0.27
134 0.27
135 0.33
136 0.37
137 0.42
138 0.51
139 0.57
140 0.62
141 0.69
142 0.75
143 0.79
144 0.83
145 0.85
146 0.83
147 0.79
148 0.71
149 0.7
150 0.62
151 0.53
152 0.48
153 0.38
154 0.3
155 0.24
156 0.24
157 0.19
158 0.18
159 0.19
160 0.17
161 0.17
162 0.22
163 0.23
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.2
169 0.28
170 0.27
171 0.33
172 0.38
173 0.43
174 0.51
175 0.53
176 0.54
177 0.51
178 0.49
179 0.44
180 0.39
181 0.33
182 0.24
183 0.2
184 0.17
185 0.13
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.04
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.08
243 0.1
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.05
314 0.1
315 0.16
316 0.22
317 0.28
318 0.37
319 0.49
320 0.55
321 0.64
322 0.68
323 0.71
324 0.75
325 0.77
326 0.79
327 0.79
328 0.81
329 0.78
330 0.75
331 0.69
332 0.66
333 0.65
334 0.65
335 0.64
336 0.64
337 0.69
338 0.69
339 0.68
340 0.63
341 0.58
342 0.5
343 0.46
344 0.39
345 0.29
346 0.25
347 0.23
348 0.22
349 0.2
350 0.17
351 0.12
352 0.1
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.08
364 0.09
365 0.1
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.15
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.11
387 0.11
388 0.14
389 0.13
390 0.12
391 0.1
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.15
396 0.16
397 0.17
398 0.18
399 0.17
400 0.19
401 0.18
402 0.19
403 0.21
404 0.17
405 0.23
406 0.25
407 0.26
408 0.26
409 0.27
410 0.3
411 0.34
412 0.36
413 0.31
414 0.28
415 0.36
416 0.43
417 0.47
418 0.48
419 0.46
420 0.5
421 0.49
422 0.49
423 0.4
424 0.4
425 0.35
426 0.31
427 0.28
428 0.21
429 0.21
430 0.2
431 0.18
432 0.11
433 0.09
434 0.07
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.04
441 0.06
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.08
451 0.12
452 0.17
453 0.24
454 0.31
455 0.37
456 0.46
457 0.54
458 0.63
459 0.68
460 0.7
461 0.71
462 0.67
463 0.65
464 0.58
465 0.49
466 0.39
467 0.3
468 0.23
469 0.16
470 0.14
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.16
477 0.16
478 0.17
479 0.17
480 0.15
481 0.14
482 0.15
483 0.15
484 0.13
485 0.12
486 0.11
487 0.1
488 0.13
489 0.19
490 0.18
491 0.23
492 0.3
493 0.34
494 0.38
495 0.41
496 0.43
497 0.46
498 0.54
499 0.57
500 0.57
501 0.55
502 0.51
503 0.48
504 0.43
505 0.35
506 0.27
507 0.17
508 0.11
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07