Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V5NC96

Protein Details
Accession A0A4V5NC96    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-224LVAPTARKRRRRDPLDPELDEHydrophilic
354-377PALGKDGKPKKARPKKPKAGDAGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-214RKRRR
271-274KKRR
324-372EKKAESKGKGKAKDKDGTPATPSGKGGADSPALGKDGKPKKARPKKPKA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MASRTATPQSWDPALVGQGQGQGQPGQGQGQGQAQGQTLQLPQANAAAKAKAQPGGPQAGRGPSAEPEGNAAGLSEPTRATDVNSLMDAVGASGVDLGAEEASLRATNERLHAQAMAAQASAQSSNPNAYTGVDRLRKQDFIDPSVLAEVVKKVAAAFQLKTLEPDTIPFIALATRHRLESLISAAVAARDHRQSSSHFRPPPLVAPTARKRRRRDPLDPELDEAEGDEDEEMEDVSSDQPKVPAWDTLVYDDPERYLTVLERVDRDEERKKRRERMLRDQKEQEERELAEAMAAAEAAQRALDSDGGSSSKKEDGGGSTPAEEKKAESKGKGKAKDKDGTPATPSGKGGADSPALGKDGKPKKARPKKPKAGDAGSGASTPLPAGGSGVKNLSEDVRKRLTDQHALRSLGGQKFSWLNAGVGSPSPAGGLGFGTPTTGGGLPKPKFATASSLPPPSFAPLGNATTSTSNLNPANHAPSTPGPSRPGDGGGILGGGGGSLFGSHNAAASALTTSRLNVPQLHDAQRTQIAKDAWEAGHHVVELPDLLFALERERGMGVGRGSGKNSAVKGRAGLTKSFSFGPGGGKMALGNSSQGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.2
4 0.16
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.19
18 0.21
19 0.21
20 0.22
21 0.2
22 0.21
23 0.2
24 0.2
25 0.17
26 0.18
27 0.19
28 0.17
29 0.17
30 0.21
31 0.22
32 0.22
33 0.23
34 0.21
35 0.2
36 0.24
37 0.26
38 0.24
39 0.23
40 0.26
41 0.29
42 0.36
43 0.35
44 0.35
45 0.35
46 0.35
47 0.35
48 0.31
49 0.28
50 0.21
51 0.26
52 0.24
53 0.21
54 0.21
55 0.2
56 0.19
57 0.17
58 0.15
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.17
69 0.18
70 0.18
71 0.19
72 0.18
73 0.16
74 0.16
75 0.13
76 0.08
77 0.07
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.08
94 0.11
95 0.14
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.19
102 0.18
103 0.15
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.14
118 0.16
119 0.23
120 0.26
121 0.28
122 0.31
123 0.34
124 0.35
125 0.35
126 0.39
127 0.35
128 0.33
129 0.35
130 0.3
131 0.27
132 0.26
133 0.24
134 0.17
135 0.14
136 0.11
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.09
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.17
146 0.2
147 0.2
148 0.22
149 0.21
150 0.19
151 0.16
152 0.17
153 0.16
154 0.13
155 0.14
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.15
181 0.18
182 0.27
183 0.35
184 0.41
185 0.42
186 0.42
187 0.46
188 0.46
189 0.47
190 0.42
191 0.37
192 0.3
193 0.36
194 0.44
195 0.51
196 0.57
197 0.6
198 0.63
199 0.7
200 0.78
201 0.79
202 0.8
203 0.78
204 0.81
205 0.81
206 0.75
207 0.67
208 0.57
209 0.48
210 0.37
211 0.28
212 0.18
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.09
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.16
252 0.16
253 0.21
254 0.27
255 0.34
256 0.42
257 0.5
258 0.55
259 0.61
260 0.69
261 0.74
262 0.74
263 0.77
264 0.79
265 0.79
266 0.79
267 0.76
268 0.72
269 0.71
270 0.63
271 0.53
272 0.44
273 0.36
274 0.31
275 0.25
276 0.2
277 0.11
278 0.1
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.13
304 0.15
305 0.13
306 0.13
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.13
311 0.12
312 0.14
313 0.21
314 0.22
315 0.23
316 0.29
317 0.36
318 0.44
319 0.51
320 0.53
321 0.53
322 0.58
323 0.61
324 0.56
325 0.56
326 0.51
327 0.45
328 0.4
329 0.38
330 0.33
331 0.29
332 0.28
333 0.21
334 0.19
335 0.17
336 0.16
337 0.13
338 0.11
339 0.1
340 0.11
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.17
346 0.24
347 0.32
348 0.37
349 0.44
350 0.54
351 0.65
352 0.75
353 0.77
354 0.81
355 0.84
356 0.87
357 0.88
358 0.84
359 0.77
360 0.7
361 0.62
362 0.53
363 0.43
364 0.34
365 0.26
366 0.18
367 0.14
368 0.1
369 0.07
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.12
381 0.16
382 0.17
383 0.22
384 0.26
385 0.26
386 0.28
387 0.36
388 0.39
389 0.42
390 0.44
391 0.47
392 0.48
393 0.48
394 0.46
395 0.42
396 0.43
397 0.36
398 0.34
399 0.26
400 0.22
401 0.22
402 0.22
403 0.21
404 0.15
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.11
409 0.1
410 0.11
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.1
428 0.19
429 0.19
430 0.24
431 0.25
432 0.24
433 0.25
434 0.25
435 0.3
436 0.25
437 0.32
438 0.32
439 0.36
440 0.35
441 0.35
442 0.35
443 0.3
444 0.28
445 0.2
446 0.19
447 0.17
448 0.19
449 0.19
450 0.19
451 0.17
452 0.17
453 0.18
454 0.17
455 0.14
456 0.17
457 0.19
458 0.19
459 0.2
460 0.22
461 0.25
462 0.23
463 0.23
464 0.22
465 0.22
466 0.28
467 0.28
468 0.3
469 0.28
470 0.3
471 0.31
472 0.29
473 0.28
474 0.22
475 0.2
476 0.17
477 0.13
478 0.11
479 0.09
480 0.07
481 0.05
482 0.04
483 0.03
484 0.02
485 0.02
486 0.03
487 0.03
488 0.04
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.06
495 0.07
496 0.08
497 0.07
498 0.09
499 0.09
500 0.1
501 0.14
502 0.17
503 0.19
504 0.21
505 0.25
506 0.31
507 0.37
508 0.42
509 0.41
510 0.39
511 0.41
512 0.45
513 0.42
514 0.35
515 0.35
516 0.29
517 0.27
518 0.29
519 0.3
520 0.22
521 0.22
522 0.24
523 0.2
524 0.21
525 0.2
526 0.18
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.1
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.09
537 0.11
538 0.11
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.13
543 0.17
544 0.15
545 0.18
546 0.23
547 0.24
548 0.26
549 0.28
550 0.3
551 0.3
552 0.33
553 0.34
554 0.32
555 0.31
556 0.32
557 0.34
558 0.38
559 0.36
560 0.36
561 0.35
562 0.34
563 0.35
564 0.34
565 0.31
566 0.26
567 0.24
568 0.26
569 0.22
570 0.22
571 0.2
572 0.19
573 0.18
574 0.18
575 0.18
576 0.14
577 0.13