Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VTL8

Protein Details
Accession A0A4U0VTL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-283AEMEKRRKVREGKKRKRDEVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-278EKRRKVREGKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 7.5, cyto_nucl 7, mito 6, extr 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
Amino Acid Sequences MSSLAALSQAAKPRHVYQSDIAMMLLALCAIRQPDDALTQYIEDVVRNHVQQLVLQARAQAARRNAKAVAVEDLVFLVRHDRARLNRLRTYLSWKDVRKKMRELDQVGAVSSTGADDDQIDSIEEPVSDKSLKVIKTTVRLPWELNDAWADYLHTVDDDPEDDEAEAYEVNKQRLREADLLTSRMSREEYEQYSQARQASFVFRKNKKFRDFIALPAILDMVAPQDEVLDVLGFLAYECVRTLCDAGVAHKKCVVEARRQVAEMEKRRKVREGKKRKRDEVAEAEAEQSDEGARAEATTDDAALKAEDPSTTPASNASPGRQARSPNKKDNTSQASPTRKKPKDATGPTNNKQPGSASSPSSSSSSSSSSSSSSSSSPPSPKRKPLEIPTSLFSAPLPDAAASAPAFGAAAAAVMLGVGVGGDGETAGSAATATAATAAANESFAAAAAARVLFQLEDVELGLHAVEHTYASLKTSGMRNWRGGISRIPTRLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.43
3 0.43
4 0.39
5 0.46
6 0.45
7 0.42
8 0.35
9 0.26
10 0.24
11 0.19
12 0.16
13 0.07
14 0.04
15 0.04
16 0.05
17 0.06
18 0.08
19 0.08
20 0.1
21 0.12
22 0.16
23 0.18
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.17
28 0.18
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.16
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.21
39 0.28
40 0.27
41 0.25
42 0.25
43 0.26
44 0.25
45 0.29
46 0.3
47 0.28
48 0.32
49 0.39
50 0.4
51 0.42
52 0.4
53 0.39
54 0.4
55 0.36
56 0.32
57 0.25
58 0.23
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.13
63 0.12
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.16
68 0.22
69 0.27
70 0.37
71 0.45
72 0.49
73 0.51
74 0.53
75 0.55
76 0.51
77 0.55
78 0.52
79 0.51
80 0.51
81 0.53
82 0.6
83 0.62
84 0.69
85 0.66
86 0.68
87 0.68
88 0.7
89 0.73
90 0.68
91 0.64
92 0.6
93 0.54
94 0.46
95 0.38
96 0.28
97 0.19
98 0.14
99 0.1
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.12
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.22
122 0.24
123 0.28
124 0.32
125 0.33
126 0.33
127 0.33
128 0.33
129 0.3
130 0.33
131 0.27
132 0.25
133 0.21
134 0.17
135 0.16
136 0.15
137 0.14
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.1
156 0.13
157 0.15
158 0.18
159 0.18
160 0.2
161 0.23
162 0.28
163 0.28
164 0.27
165 0.31
166 0.31
167 0.32
168 0.31
169 0.29
170 0.24
171 0.2
172 0.19
173 0.13
174 0.14
175 0.18
176 0.21
177 0.22
178 0.25
179 0.25
180 0.26
181 0.27
182 0.26
183 0.2
184 0.18
185 0.17
186 0.22
187 0.25
188 0.3
189 0.38
190 0.42
191 0.52
192 0.6
193 0.66
194 0.64
195 0.64
196 0.6
197 0.6
198 0.55
199 0.49
200 0.48
201 0.39
202 0.33
203 0.29
204 0.27
205 0.16
206 0.15
207 0.11
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.09
234 0.18
235 0.19
236 0.19
237 0.21
238 0.21
239 0.2
240 0.26
241 0.26
242 0.25
243 0.3
244 0.35
245 0.34
246 0.34
247 0.34
248 0.34
249 0.39
250 0.4
251 0.42
252 0.43
253 0.46
254 0.48
255 0.54
256 0.58
257 0.59
258 0.61
259 0.65
260 0.7
261 0.77
262 0.85
263 0.84
264 0.82
265 0.76
266 0.72
267 0.68
268 0.63
269 0.54
270 0.45
271 0.4
272 0.32
273 0.28
274 0.2
275 0.12
276 0.07
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.1
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.18
303 0.18
304 0.16
305 0.21
306 0.22
307 0.26
308 0.27
309 0.33
310 0.39
311 0.49
312 0.55
313 0.58
314 0.63
315 0.64
316 0.65
317 0.68
318 0.66
319 0.58
320 0.57
321 0.55
322 0.59
323 0.59
324 0.65
325 0.67
326 0.62
327 0.65
328 0.64
329 0.66
330 0.66
331 0.71
332 0.71
333 0.71
334 0.77
335 0.74
336 0.77
337 0.69
338 0.58
339 0.5
340 0.42
341 0.35
342 0.32
343 0.32
344 0.26
345 0.25
346 0.26
347 0.27
348 0.27
349 0.23
350 0.18
351 0.17
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.15
361 0.16
362 0.19
363 0.23
364 0.3
365 0.37
366 0.46
367 0.52
368 0.6
369 0.65
370 0.69
371 0.72
372 0.73
373 0.74
374 0.71
375 0.67
376 0.6
377 0.57
378 0.49
379 0.41
380 0.31
381 0.24
382 0.18
383 0.15
384 0.13
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.02
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.01
407 0.02
408 0.02
409 0.02
410 0.02
411 0.02
412 0.02
413 0.02
414 0.02
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.12
460 0.12
461 0.16
462 0.21
463 0.26
464 0.34
465 0.39
466 0.4
467 0.43
468 0.48
469 0.47
470 0.46
471 0.47
472 0.45
473 0.47