FuNGI

A0A4U0W603

Protein Details

Accession

A0A4U0W603

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
410-432	AKERDEMRRERRKEREREMRMSH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
213-235	RFKGKKVPRGPPSPPPPVLRSPP
408-426	RAAKERDEMRRERRKERER

Subcellular Location(s)

cyto 13, cyto_nucl 11.5, nucl 8, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MAALFSSLPAPLHKAAGDAQDEPSRIQQQQQQPSTALAVQLPQIPPYGQRKGWKPKSQLDFGDGGSYPECHCAQYPLELGRKKTAAGNTLALQVDGDGNVDYGVIAQQGQRSGVHVQTSFKDLVPMAQRTDVAKDALAMERPSEDEVQATADRTKAALERLVQGKIKAAQPKNVEQRGGDVSYMRYTPQNGGVEKQKIIKMMEVVEDPLEPPRFKGKKVPRGPPSPPPPVLRSPPRKVTAQEQKEWMIPPCVSNWKNNKGYTIPLDKRLAADGRGLQDVQINDRFAQFSEALYVADRHARDEVRQRALMQQKIAQKEKEAKEENLRMLAQRAREERSGVVVQPAAASMGGNIGGALAGYGSGSDSEDEESAAIARGAQGQRAPSTVASDDSEAEEADRDAGETEEERRAAKERDEMRRERRKEREREMRMSHMGTEQRAKVLAKATGRDISEKIALGLAKPTVSKDSMLDARLFNREQYSASFGDEDSYNLYDKPLFSGSSAAAAIYKPRGRNVDDEGYEVDQGEVEKAMRNDRFGLGVAGSGRGFEGADTSEVRDGPVAFERDTADPFGVDAFLESAKQGGGAGEKKRGLDTGEDERRKRARDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.2
3	0.25
4	0.27
5	0.24
6	0.27
7	0.29
8	0.3
9	0.3
10	0.33
11	0.32
12	0.3
13	0.34
14	0.39
15	0.44
16	0.53
17	0.56
18	0.53
19	0.49
20	0.5
21	0.47
22	0.4
23	0.31
24	0.22
25	0.19
26	0.18
27	0.22
28	0.21
29	0.19
30	0.19
31	0.19
32	0.24
33	0.31
34	0.36
35	0.35
36	0.42
37	0.51
38	0.61
39	0.71
40	0.74
41	0.74
42	0.76
43	0.79
44	0.79
45	0.72
46	0.66
47	0.58
48	0.49
49	0.46
50	0.36
51	0.3
52	0.23
53	0.21
54	0.17
55	0.19
56	0.19
57	0.16
58	0.16
59	0.18
60	0.19
61	0.23
62	0.26
63	0.28
64	0.35
65	0.38
66	0.4
67	0.42
68	0.42
69	0.38
70	0.39
71	0.38
72	0.34
73	0.34
74	0.34
75	0.3
76	0.33
77	0.32
78	0.27
79	0.22
80	0.18
81	0.15
82	0.11
83	0.11
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.05
89	0.05
90	0.05
91	0.05
92	0.05
93	0.07
94	0.09
95	0.1
96	0.11
97	0.11
98	0.14
99	0.16
100	0.18
101	0.2
102	0.2
103	0.21
104	0.22
105	0.26
106	0.25
107	0.22
108	0.22
109	0.18
110	0.22
111	0.25
112	0.26
113	0.24
114	0.24
115	0.25
116	0.25
117	0.27
118	0.24
119	0.18
120	0.16
121	0.15
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.15
126	0.13
127	0.13
128	0.14
129	0.16
130	0.15
131	0.13
132	0.11
133	0.11
134	0.14
135	0.14
136	0.14
137	0.13
138	0.13
139	0.13
140	0.12
141	0.13
142	0.12
143	0.13
144	0.15
145	0.15
146	0.21
147	0.23
148	0.27
149	0.27
150	0.25
151	0.27
152	0.28
153	0.31
154	0.34
155	0.34
156	0.37
157	0.4
158	0.49
159	0.55
160	0.54
161	0.51
162	0.42
163	0.43
164	0.4
165	0.37
166	0.28
167	0.2
168	0.18
169	0.18
170	0.19
171	0.16
172	0.13
173	0.14
174	0.15
175	0.2
176	0.23
177	0.22
178	0.25
179	0.31
180	0.32
181	0.32
182	0.34
183	0.29
184	0.28
185	0.28
186	0.26
187	0.21
188	0.2
189	0.2
190	0.17
191	0.16
192	0.13
193	0.12
194	0.11
195	0.14
196	0.15
197	0.13
198	0.14
199	0.24
200	0.25
201	0.26
202	0.36
203	0.42
204	0.51
205	0.59
206	0.67
207	0.65
208	0.71
209	0.75
210	0.74
211	0.71
212	0.68
213	0.63
214	0.57
215	0.54
216	0.51
217	0.53
218	0.53
219	0.55
220	0.54
221	0.57
222	0.56
223	0.54
224	0.51
225	0.54
226	0.55
227	0.52
228	0.49
229	0.45
230	0.43
231	0.43
232	0.42
233	0.34
234	0.26
235	0.21
236	0.18
237	0.18
238	0.25
239	0.24
240	0.3
241	0.36
242	0.41
243	0.47
244	0.46
245	0.46
246	0.39
247	0.41
248	0.39
249	0.41
250	0.34
251	0.34
252	0.35
253	0.33
254	0.32
255	0.31
256	0.27
257	0.18
258	0.18
259	0.15
260	0.15
261	0.16
262	0.15
263	0.13
264	0.14
265	0.14
266	0.15
267	0.15
268	0.13
269	0.13
270	0.14
271	0.14
272	0.11
273	0.14
274	0.11
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.07
282	0.1
283	0.1
284	0.09
285	0.11
286	0.12
287	0.14
288	0.22
289	0.27
290	0.28
291	0.29
292	0.28
293	0.33
294	0.38
295	0.38
296	0.31
297	0.3
298	0.31
299	0.36
300	0.39
301	0.32
302	0.29
303	0.36
304	0.37
305	0.4
306	0.39
307	0.36
308	0.4
309	0.43
310	0.41
311	0.35
312	0.32
313	0.25
314	0.24
315	0.24
316	0.19
317	0.2
318	0.22
319	0.22
320	0.23
321	0.24
322	0.21
323	0.23
324	0.22
325	0.18
326	0.16
327	0.13
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.07
332	0.05
333	0.05
334	0.03
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.02
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.03
350	0.03
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.09
363	0.09
364	0.11
365	0.12
366	0.13
367	0.14
368	0.15
369	0.15
370	0.1
371	0.13
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.09
380	0.09
381	0.08
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.09
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.17
396	0.18
397	0.2
398	0.25
399	0.31
400	0.41
401	0.48
402	0.54
403	0.6
404	0.69
405	0.72
406	0.73
407	0.77
408	0.77
409	0.79
410	0.82
411	0.83
412	0.8
413	0.83
414	0.79
415	0.74
416	0.68
417	0.6
418	0.51
419	0.45
420	0.39
421	0.33
422	0.33
423	0.27
424	0.24
425	0.25
426	0.24
427	0.21
428	0.22
429	0.24
430	0.22
431	0.23
432	0.25
433	0.27
434	0.28
435	0.28
436	0.25
437	0.24
438	0.23
439	0.21
440	0.18
441	0.16
442	0.15
443	0.13
444	0.14
445	0.12
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.13
450	0.14
451	0.15
452	0.14
453	0.19
454	0.21
455	0.22
456	0.23
457	0.21
458	0.23
459	0.27
460	0.27
461	0.23
462	0.22
463	0.21
464	0.2
465	0.21
466	0.23
467	0.19
468	0.19
469	0.19
470	0.16
471	0.17
472	0.16
473	0.15
474	0.13
475	0.13
476	0.13
477	0.12
478	0.13
479	0.13
480	0.13
481	0.15
482	0.15
483	0.14
484	0.14
485	0.16
486	0.15
487	0.16
488	0.15
489	0.12
490	0.11
491	0.11
492	0.13
493	0.17
494	0.22
495	0.21
496	0.26
497	0.31
498	0.33
499	0.38
500	0.42
501	0.44
502	0.41
503	0.41
504	0.39
505	0.36
506	0.33
507	0.29
508	0.21
509	0.13
510	0.12
511	0.11
512	0.09
513	0.08
514	0.12
515	0.13
516	0.21
517	0.22
518	0.24
519	0.26
520	0.26
521	0.27
522	0.23
523	0.23
524	0.16
525	0.17
526	0.15
527	0.14
528	0.13
529	0.12
530	0.11
531	0.09
532	0.09
533	0.07
534	0.08
535	0.07
536	0.1
537	0.11
538	0.13
539	0.15
540	0.15
541	0.15
542	0.16
543	0.15
544	0.16
545	0.21
546	0.22
547	0.2
548	0.22
549	0.24
550	0.24
551	0.26
552	0.25
553	0.19
554	0.16
555	0.16
556	0.15
557	0.12
558	0.1
559	0.09
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.08
567	0.07
568	0.07
569	0.13
570	0.19
571	0.23
572	0.29
573	0.32
574	0.33
575	0.34
576	0.35
577	0.31
578	0.3
579	0.33
580	0.36
581	0.45
582	0.52
583	0.52
584	0.59
585	0.64

A0A4U0W603

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer