Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VTJ6

Protein Details
Accession A0A4U0VTJ6    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-213EEIPVDRKPAKRPRTRRRDPEQESTPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-204RKPAKRPRTRRR
421-431KAKKAKEEAAA
433-433K
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 12.833, mito 11, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039577  Rad18  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006301  P:postreplication repair  
GO:0006513  P:protein monoubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MAPSTRKGKGRSVTTAAELAAAGELDADSDFAFPSLSALDSSLRCAICSELYTAPVLLTHCGHSFDSRCLAQHFVVKRSCPTCHREAFHDHTVRNQALSELVESWRAARSDLLQLQAQAARNATPEAGHSRGLKPTNGETESHDKDRTRSATTKDGKRKAASSSSPVPRAVKREKFEDASSDIEILEEIPVDRKPAKRPRTRRRDPEQESTPPLAAADPTDPNLVVECPLCGRSLKNGLMSGHLDRCTGEPSSTTGTRPDAGPSQAWSKLMSTSTSNGSRSAGGSNTKDGSSSASTNAGDMDLSKKLPLGSYQHKKSAQLVKMLKDYGLPTDSPNGLSPEAKVTHLQRRHRQFVILWNANADLDSEHPARKTAKQLRSELRRWEDDQDRAEGKGEIAEDHAVKYAEQYRELIAQARASHEKAKKAKEEAAAVKAPGAHRSKTPEAAAPPTTEQEKEATPPSREEDQPEQRKKSVRVVSPPPRSSPSPSPALIGTAERRGASDDSGSTGPSSSSPLLPSSPLLAASAEPDDDSEEERRSRGTSLKRRTPSPFDPAGPRPSQRNREEERMFAELYGDRAADESLQVMEEDSGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.53
3 0.44
4 0.36
5 0.28
6 0.2
7 0.14
8 0.11
9 0.07
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.05
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.12
27 0.13
28 0.16
29 0.2
30 0.2
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.19
35 0.2
36 0.21
37 0.17
38 0.18
39 0.19
40 0.18
41 0.16
42 0.16
43 0.15
44 0.13
45 0.13
46 0.15
47 0.15
48 0.18
49 0.19
50 0.22
51 0.24
52 0.25
53 0.29
54 0.28
55 0.28
56 0.28
57 0.3
58 0.27
59 0.32
60 0.32
61 0.34
62 0.38
63 0.38
64 0.43
65 0.44
66 0.47
67 0.46
68 0.49
69 0.5
70 0.54
71 0.54
72 0.53
73 0.57
74 0.59
75 0.62
76 0.62
77 0.53
78 0.51
79 0.55
80 0.5
81 0.42
82 0.35
83 0.26
84 0.22
85 0.22
86 0.18
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.16
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.16
97 0.22
98 0.25
99 0.26
100 0.24
101 0.24
102 0.26
103 0.28
104 0.27
105 0.2
106 0.18
107 0.16
108 0.16
109 0.17
110 0.14
111 0.11
112 0.12
113 0.16
114 0.17
115 0.2
116 0.21
117 0.23
118 0.29
119 0.31
120 0.3
121 0.28
122 0.31
123 0.35
124 0.34
125 0.33
126 0.31
127 0.37
128 0.41
129 0.41
130 0.4
131 0.34
132 0.35
133 0.41
134 0.4
135 0.38
136 0.38
137 0.39
138 0.45
139 0.53
140 0.61
141 0.63
142 0.67
143 0.66
144 0.64
145 0.62
146 0.57
147 0.57
148 0.5
149 0.47
150 0.48
151 0.49
152 0.49
153 0.48
154 0.47
155 0.42
156 0.47
157 0.5
158 0.49
159 0.46
160 0.48
161 0.51
162 0.51
163 0.48
164 0.44
165 0.37
166 0.32
167 0.29
168 0.24
169 0.19
170 0.15
171 0.14
172 0.1
173 0.07
174 0.05
175 0.04
176 0.06
177 0.06
178 0.09
179 0.13
180 0.16
181 0.25
182 0.35
183 0.45
184 0.54
185 0.65
186 0.74
187 0.82
188 0.89
189 0.9
190 0.89
191 0.9
192 0.87
193 0.85
194 0.81
195 0.75
196 0.7
197 0.61
198 0.52
199 0.4
200 0.33
201 0.24
202 0.17
203 0.13
204 0.1
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.12
221 0.18
222 0.2
223 0.2
224 0.22
225 0.22
226 0.24
227 0.25
228 0.24
229 0.21
230 0.19
231 0.18
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.14
236 0.12
237 0.09
238 0.11
239 0.15
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.15
251 0.16
252 0.17
253 0.17
254 0.16
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.12
261 0.16
262 0.18
263 0.18
264 0.16
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.09
286 0.07
287 0.06
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.14
297 0.22
298 0.31
299 0.34
300 0.4
301 0.41
302 0.42
303 0.46
304 0.49
305 0.43
306 0.42
307 0.43
308 0.39
309 0.41
310 0.4
311 0.33
312 0.26
313 0.23
314 0.17
315 0.15
316 0.13
317 0.11
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.16
330 0.18
331 0.26
332 0.33
333 0.4
334 0.45
335 0.52
336 0.57
337 0.55
338 0.53
339 0.46
340 0.48
341 0.51
342 0.46
343 0.38
344 0.32
345 0.31
346 0.29
347 0.27
348 0.18
349 0.09
350 0.06
351 0.1
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.15
356 0.17
357 0.19
358 0.29
359 0.34
360 0.41
361 0.46
362 0.54
363 0.6
364 0.66
365 0.68
366 0.67
367 0.62
368 0.59
369 0.55
370 0.54
371 0.5
372 0.47
373 0.44
374 0.4
375 0.36
376 0.32
377 0.31
378 0.24
379 0.19
380 0.15
381 0.14
382 0.09
383 0.09
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.1
389 0.1
390 0.12
391 0.18
392 0.18
393 0.18
394 0.19
395 0.18
396 0.2
397 0.21
398 0.22
399 0.16
400 0.17
401 0.17
402 0.2
403 0.22
404 0.22
405 0.29
406 0.29
407 0.37
408 0.41
409 0.47
410 0.49
411 0.5
412 0.54
413 0.5
414 0.54
415 0.49
416 0.48
417 0.43
418 0.37
419 0.34
420 0.3
421 0.27
422 0.27
423 0.26
424 0.22
425 0.23
426 0.31
427 0.34
428 0.35
429 0.37
430 0.34
431 0.34
432 0.37
433 0.36
434 0.31
435 0.29
436 0.28
437 0.28
438 0.23
439 0.21
440 0.19
441 0.18
442 0.18
443 0.24
444 0.26
445 0.26
446 0.28
447 0.32
448 0.35
449 0.35
450 0.38
451 0.41
452 0.47
453 0.56
454 0.62
455 0.62
456 0.62
457 0.68
458 0.65
459 0.65
460 0.63
461 0.59
462 0.6
463 0.65
464 0.71
465 0.74
466 0.73
467 0.68
468 0.64
469 0.61
470 0.59
471 0.57
472 0.52
473 0.47
474 0.44
475 0.42
476 0.37
477 0.36
478 0.29
479 0.25
480 0.22
481 0.21
482 0.22
483 0.2
484 0.2
485 0.21
486 0.21
487 0.19
488 0.19
489 0.15
490 0.17
491 0.18
492 0.18
493 0.15
494 0.14
495 0.13
496 0.11
497 0.15
498 0.13
499 0.14
500 0.15
501 0.17
502 0.17
503 0.18
504 0.19
505 0.17
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.13
510 0.12
511 0.13
512 0.13
513 0.11
514 0.1
515 0.1
516 0.11
517 0.11
518 0.14
519 0.15
520 0.18
521 0.19
522 0.2
523 0.21
524 0.21
525 0.24
526 0.29
527 0.37
528 0.43
529 0.52
530 0.62
531 0.66
532 0.71
533 0.75
534 0.77
535 0.72
536 0.7
537 0.66
538 0.61
539 0.63
540 0.62
541 0.63
542 0.59
543 0.56
544 0.57
545 0.61
546 0.66
547 0.65
548 0.68
549 0.68
550 0.72
551 0.72
552 0.67
553 0.62
554 0.56
555 0.5
556 0.4
557 0.36
558 0.27
559 0.25
560 0.22
561 0.17
562 0.13
563 0.13
564 0.14
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.09