FuNGI

A0A4V5NAN0

Protein Details

Accession

A0A4V5NAN0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
372-393	EAPSAAAKRKRRRAGKGSDDDD	Basic
403-433	DDGGGRKKKGSSKRRQKRVKRRVKAEGDSDQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
284-308	ARKGGKANGKKPAKKSSSSSKRKKG
326-350	GGKGKKGKGGGKRAANGKAKRKRAK
378-387	AKRKRRRAGK
407-426	GRKKKGSSKRRQKRVKRRVK

Subcellular Location(s)

mito 15.5, cyto_mito 11.333, cyto 6, cyto_nucl 5.833, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MPPRASTSNAGAAAASAKKLSPVELKLLNAGLAVKGGEMLQNDLFAACGLSVTATTMDAVNGLLRKGLAQMLRTSSGQTMFRFLGKEEAKAMSSMDAEEKLVLNHIRDAGNMGIWSRTLTTKTGLPRATIAKALKVLEGKKTIKTVKSVKTPTRKIYMLTGIAPSVELTGGPWFTDNELDVELVETLKRVVRKFLQQKSQPPSVTVTDPSTSEPARIKPIYPVTATPLLPTSEQVLEWILKSGAAIVDLAKEHVEDLLDLMVFDGDVEKVLVNRLGPDGMPVAARKGGKANGKKPAKKSSSSSKRKKGAESSSSEEDSDDSDTGGGGKGKKGKGGGKRAANGKAKRKRAKLGSDTETESDDDQSSDFDSDAEAPSAAAKRKRRRAGKGSDDDDGEEATGGDSDDGGGRKKKGSSKRRQKRVKRRVKAEGDSDQGMSSSESEDESSRRRKRGQAGDDVAAEGGGEGQGEGTDGNTQYVYRMIRQYRPTVGWTDMPCGRCPVEEFCSEPPRRRAEAVRRPAQVTTSTGAPSTRIEFEGGIQGIGMLGGAGAAIGVSDAKWGELKGGIGNGVAPVNPVDCPAYKAWLDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.19
3	0.13
4	0.12
5	0.15
6	0.16
7	0.2
8	0.23
9	0.24
10	0.3
11	0.33
12	0.34
13	0.33
14	0.33
15	0.29
16	0.23
17	0.2
18	0.14
19	0.11
20	0.1
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.09
25	0.09
26	0.12
27	0.12
28	0.12
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.09
33	0.09
34	0.05
35	0.05
36	0.04
37	0.05
38	0.05
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.09
48	0.1
49	0.09
50	0.1
51	0.09
52	0.1
53	0.11
54	0.15
55	0.15
56	0.16
57	0.2
58	0.24
59	0.27
60	0.27
61	0.27
62	0.25
63	0.27
64	0.28
65	0.25
66	0.25
67	0.24
68	0.25
69	0.25
70	0.23
71	0.28
72	0.25
73	0.26
74	0.25
75	0.26
76	0.25
77	0.24
78	0.24
79	0.16
80	0.15
81	0.14
82	0.14
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.11
88	0.14
89	0.15
90	0.14
91	0.15
92	0.18
93	0.17
94	0.17
95	0.2
96	0.16
97	0.16
98	0.15
99	0.13
100	0.11
101	0.1
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.12
106	0.13
107	0.15
108	0.19
109	0.24
110	0.31
111	0.3
112	0.29
113	0.31
114	0.34
115	0.33
116	0.35
117	0.31
118	0.26
119	0.28
120	0.28
121	0.27
122	0.28
123	0.28
124	0.28
125	0.34
126	0.34
127	0.33
128	0.39
129	0.41
130	0.4
131	0.45
132	0.48
133	0.48
134	0.56
135	0.61
136	0.64
137	0.69
138	0.73
139	0.71
140	0.69
141	0.62
142	0.54
143	0.51
144	0.48
145	0.4
146	0.34
147	0.3
148	0.23
149	0.22
150	0.2
151	0.14
152	0.09
153	0.07
154	0.05
155	0.05
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.05
173	0.05
174	0.08
175	0.11
176	0.11
177	0.16
178	0.2
179	0.3
180	0.4
181	0.47
182	0.55
183	0.58
184	0.66
185	0.67
186	0.71
187	0.61
188	0.53
189	0.49
190	0.42
191	0.37
192	0.31
193	0.27
194	0.2
195	0.2
196	0.2
197	0.2
198	0.17
199	0.18
200	0.18
201	0.17
202	0.23
203	0.23
204	0.22
205	0.25
206	0.29
207	0.29
208	0.28
209	0.27
210	0.25
211	0.29
212	0.28
213	0.23
214	0.2
215	0.18
216	0.17
217	0.17
218	0.15
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.09
225	0.1
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.12
274	0.16
275	0.22
276	0.29
277	0.33
278	0.4
279	0.48
280	0.52
281	0.55
282	0.6
283	0.57
284	0.54
285	0.54
286	0.56
287	0.59
288	0.65
289	0.69
290	0.68
291	0.71
292	0.71
293	0.71
294	0.68
295	0.65
296	0.62
297	0.57
298	0.53
299	0.49
300	0.46
301	0.41
302	0.33
303	0.25
304	0.19
305	0.16
306	0.1
307	0.07
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.08
313	0.07
314	0.09
315	0.15
316	0.15
317	0.17
318	0.21
319	0.26
320	0.33
321	0.42
322	0.46
323	0.46
324	0.5
325	0.53
326	0.58
327	0.6
328	0.58
329	0.59
330	0.61
331	0.66
332	0.7
333	0.7
334	0.7
335	0.7
336	0.72
337	0.7
338	0.69
339	0.63
340	0.58
341	0.55
342	0.48
343	0.41
344	0.32
345	0.25
346	0.18
347	0.14
348	0.11
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.08
362	0.11
363	0.14
364	0.2
365	0.28
366	0.37
367	0.47
368	0.56
369	0.64
370	0.71
371	0.76
372	0.81
373	0.82
374	0.82
375	0.75
376	0.68
377	0.6
378	0.51
379	0.42
380	0.31
381	0.2
382	0.11
383	0.08
384	0.06
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.06
391	0.07
392	0.1
393	0.13
394	0.14
395	0.17
396	0.22
397	0.3
398	0.38
399	0.49
400	0.57
401	0.66
402	0.75
403	0.83
404	0.9
405	0.93
406	0.94
407	0.94
408	0.94
409	0.93
410	0.92
411	0.92
412	0.9
413	0.85
414	0.8
415	0.75
416	0.68
417	0.59
418	0.5
419	0.39
420	0.3
421	0.24
422	0.17
423	0.12
424	0.09
425	0.08
426	0.07
427	0.09
428	0.1
429	0.12
430	0.18
431	0.28
432	0.33
433	0.39
434	0.44
435	0.5
436	0.59
437	0.66
438	0.67
439	0.68
440	0.66
441	0.63
442	0.59
443	0.52
444	0.42
445	0.31
446	0.23
447	0.12
448	0.07
449	0.04
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.04
457	0.06
458	0.07
459	0.08
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.13
464	0.14
465	0.15
466	0.23
467	0.27
468	0.34
469	0.39
470	0.44
471	0.45
472	0.47
473	0.46
474	0.42
475	0.4
476	0.39
477	0.35
478	0.36
479	0.35
480	0.34
481	0.33
482	0.32
483	0.3
484	0.25
485	0.27
486	0.27
487	0.27
488	0.27
489	0.29
490	0.32
491	0.42
492	0.43
493	0.48
494	0.49
495	0.52
496	0.53
497	0.55
498	0.58
499	0.59
500	0.67
501	0.7
502	0.71
503	0.68
504	0.67
505	0.63
506	0.56
507	0.48
508	0.4
509	0.32
510	0.27
511	0.23
512	0.22
513	0.21
514	0.2
515	0.19
516	0.19
517	0.2
518	0.18
519	0.18
520	0.18
521	0.19
522	0.24
523	0.22
524	0.18
525	0.15
526	0.14
527	0.12
528	0.12
529	0.1
530	0.03
531	0.02
532	0.02
533	0.02
534	0.02
535	0.02
536	0.02
537	0.02
538	0.02
539	0.02
540	0.03
541	0.04
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.08
546	0.09
547	0.11
548	0.12
549	0.13
550	0.14
551	0.14
552	0.13
553	0.13
554	0.13
555	0.12
556	0.11
557	0.1
558	0.09
559	0.1
560	0.1
561	0.11
562	0.13
563	0.13
564	0.17
565	0.18
566	0.23

A0A4V5NAN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer