Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VWK0

Protein Details
Accession A0A4U0VWK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-111GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-397RRE
400-409ERQDRAEKRR
Subcellular Location(s) cysk 16, cyto 8, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MPVVEEQAVVIPGKDGQPDETIPVDMSGPNPNGEEYDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPKTEEEMMREVFIYTDRVVSMVRPRKLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKQKEDDRQNAIAELEAMGKEVSDEYRNEKGWDSNAITPGTPFMDLLAKSLRYWVRKKINEDPGWAGLEVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRVSGEHDPNTKHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFKVLREDVFADDKKRGCHRCGQPGHHSRQCTGEVKKPEADLTPKGQPAPLKPFLFLDVSVLREYLAVELSAPVHSFPFSLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLMGIWKSNLERMGGYLTNHGKVELARAQIILEQLAMREDEIFRKRREAEERQDRAEKRRRIDRENQQTVSQRSSASNHAQLSQTGGQTHRNGVDYVEVNANGSTIAPSTPGLPAKPAAEASSAPAKSAAAMVGSNKSIVANRMALRMANLSAADMLKAELAGENAASSADATDSEAELVQEREAEEAGRAEAEKNSAAAAKLKAELLASDPPEEDASPRGTKRTASVAAEDDSTDSAFDQEPGDDDDEDADVNAFLQDSLVPPKPAMVAGLNIEQPPPLKLLGNNVVEQDDAVKLWEPGYKERYYRQKFGVELSDVEFRRKIVKSYVEGLCWVLEYYYQGTPSWQWYYPYHFSPFASDFVDLDKLDIQFDIGAPFRPYEQLMGVFPAASRVHLPEPFQTLMIEKESPILDFYPEEFHIDMNGKKMLWQGVALLPFIDQQRLLEAMATKYPELTDYEHQRNERGKDVILVGNKHPLFDYLEGLYGKKKAKEPVPIVAKRSKGIAGAVLPDDTLPGTTFDSPLPSMPDIVNDESISAYFFFPPQSTPHRSVLLPGAKPPRSVLSAHDKDSVRRGAGERTEGNGFHSMRNRDQSGPGFAKLDRGPGGGRNTPQGRNSPYQGGAQPGYGSPAGYGAPAGYPGPGPAGRDPYGGYAYGGYNAPPPPAHQMPYGGYAPPTGYLPPPMQGYRPPAPPPPPPAAYPPYPGGPPGQYPPPGPPGYGNYRPPGGGGPYGGYQGGGRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.2
5 0.21
6 0.23
7 0.23
8 0.22
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.15
13 0.16
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.2
18 0.2
19 0.2
20 0.21
21 0.22
22 0.18
23 0.21
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.19
28 0.18
29 0.16
30 0.13
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.14
37 0.17
38 0.21
39 0.21
40 0.27
41 0.36
42 0.44
43 0.51
44 0.53
45 0.54
46 0.54
47 0.57
48 0.56
49 0.56
50 0.5
51 0.47
52 0.43
53 0.38
54 0.35
55 0.31
56 0.26
57 0.18
58 0.17
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.16
65 0.25
66 0.31
67 0.33
68 0.34
69 0.35
70 0.38
71 0.4
72 0.4
73 0.32
74 0.29
75 0.27
76 0.25
77 0.25
78 0.21
79 0.21
80 0.18
81 0.16
82 0.11
83 0.14
84 0.2
85 0.27
86 0.37
87 0.46
88 0.55
89 0.66
90 0.74
91 0.8
92 0.81
93 0.78
94 0.75
95 0.76
96 0.76
97 0.74
98 0.77
99 0.74
100 0.7
101 0.74
102 0.68
103 0.65
104 0.65
105 0.61
106 0.56
107 0.53
108 0.5
109 0.43
110 0.41
111 0.34
112 0.24
113 0.19
114 0.14
115 0.11
116 0.1
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.11
123 0.13
124 0.18
125 0.24
126 0.26
127 0.27
128 0.28
129 0.29
130 0.28
131 0.33
132 0.32
133 0.31
134 0.33
135 0.33
136 0.31
137 0.28
138 0.27
139 0.22
140 0.18
141 0.13
142 0.1
143 0.14
144 0.14
145 0.16
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.26
150 0.3
151 0.32
152 0.37
153 0.45
154 0.51
155 0.57
156 0.64
157 0.68
158 0.73
159 0.7
160 0.7
161 0.64
162 0.57
163 0.52
164 0.44
165 0.34
166 0.23
167 0.19
168 0.14
169 0.1
170 0.07
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.16
186 0.2
187 0.27
188 0.37
189 0.37
190 0.38
191 0.39
192 0.43
193 0.47
194 0.5
195 0.52
196 0.48
197 0.53
198 0.55
199 0.54
200 0.54
201 0.45
202 0.35
203 0.28
204 0.23
205 0.19
206 0.2
207 0.18
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.11
212 0.1
213 0.08
214 0.04
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.1
223 0.12
224 0.13
225 0.16
226 0.17
227 0.18
228 0.2
229 0.22
230 0.22
231 0.26
232 0.27
233 0.26
234 0.29
235 0.3
236 0.33
237 0.4
238 0.41
239 0.38
240 0.46
241 0.52
242 0.58
243 0.64
244 0.66
245 0.68
246 0.73
247 0.78
248 0.74
249 0.67
250 0.58
251 0.54
252 0.52
253 0.49
254 0.44
255 0.43
256 0.43
257 0.45
258 0.47
259 0.43
260 0.39
261 0.36
262 0.36
263 0.32
264 0.31
265 0.33
266 0.32
267 0.31
268 0.32
269 0.31
270 0.32
271 0.36
272 0.39
273 0.35
274 0.34
275 0.34
276 0.34
277 0.33
278 0.27
279 0.22
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.09
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.1
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.1
335 0.06
336 0.04
337 0.05
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.08
343 0.08
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.18
353 0.19
354 0.2
355 0.2
356 0.19
357 0.16
358 0.15
359 0.19
360 0.17
361 0.16
362 0.15
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.11
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.05
374 0.06
375 0.07
376 0.13
377 0.18
378 0.23
379 0.24
380 0.29
381 0.31
382 0.36
383 0.44
384 0.46
385 0.51
386 0.57
387 0.61
388 0.6
389 0.66
390 0.62
391 0.63
392 0.64
393 0.59
394 0.54
395 0.6
396 0.61
397 0.61
398 0.69
399 0.7
400 0.71
401 0.74
402 0.69
403 0.64
404 0.64
405 0.59
406 0.51
407 0.42
408 0.32
409 0.25
410 0.26
411 0.26
412 0.24
413 0.26
414 0.24
415 0.25
416 0.24
417 0.23
418 0.25
419 0.23
420 0.2
421 0.16
422 0.17
423 0.19
424 0.19
425 0.21
426 0.18
427 0.17
428 0.16
429 0.15
430 0.17
431 0.14
432 0.15
433 0.14
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.11
438 0.07
439 0.07
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.06
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.17
459 0.16
460 0.15
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.13
465 0.11
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.11
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.11
485 0.08
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.03
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.07
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.11
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.1
549 0.11
550 0.11
551 0.09
552 0.08
553 0.11
554 0.12
555 0.13
556 0.14
557 0.14
558 0.15
559 0.16
560 0.2
561 0.19
562 0.18
563 0.2
564 0.2
565 0.2
566 0.2
567 0.18
568 0.13
569 0.1
570 0.09
571 0.07
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.05
577 0.05
578 0.06
579 0.07
580 0.08
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.06
587 0.05
588 0.03
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.04
596 0.08
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.08
605 0.07
606 0.08
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.11
611 0.1
612 0.1
613 0.09
614 0.09
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.13
619 0.2
620 0.22
621 0.22
622 0.21
623 0.21
624 0.19
625 0.19
626 0.15
627 0.08
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.07
633 0.09
634 0.1
635 0.14
636 0.19
637 0.21
638 0.22
639 0.29
640 0.39
641 0.42
642 0.45
643 0.45
644 0.44
645 0.43
646 0.44
647 0.42
648 0.32
649 0.27
650 0.25
651 0.28
652 0.23
653 0.24
654 0.22
655 0.18
656 0.23
657 0.22
658 0.22
659 0.21
660 0.26
661 0.27
662 0.33
663 0.35
664 0.29
665 0.29
666 0.28
667 0.22
668 0.17
669 0.14
670 0.08
671 0.06
672 0.07
673 0.09
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.11
678 0.12
679 0.15
680 0.17
681 0.16
682 0.18
683 0.19
684 0.26
685 0.29
686 0.31
687 0.3
688 0.28
689 0.27
690 0.29
691 0.29
692 0.23
693 0.21
694 0.18
695 0.15
696 0.15
697 0.18
698 0.13
699 0.12
700 0.13
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.09
705 0.07
706 0.08
707 0.09
708 0.07
709 0.08
710 0.09
711 0.09
712 0.1
713 0.11
714 0.11
715 0.1
716 0.11
717 0.11
718 0.11
719 0.12
720 0.12
721 0.1
722 0.1
723 0.12
724 0.11
725 0.1
726 0.11
727 0.12
728 0.15
729 0.17
730 0.18
731 0.17
732 0.22
733 0.22
734 0.21
735 0.19
736 0.17
737 0.17
738 0.18
739 0.16
740 0.11
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.13
745 0.12
746 0.1
747 0.1
748 0.11
749 0.12
750 0.12
751 0.14
752 0.13
753 0.13
754 0.14
755 0.16
756 0.16
757 0.15
758 0.16
759 0.14
760 0.15
761 0.17
762 0.17
763 0.15
764 0.14
765 0.14
766 0.15
767 0.16
768 0.15
769 0.13
770 0.11
771 0.13
772 0.13
773 0.12
774 0.09
775 0.08
776 0.1
777 0.11
778 0.11
779 0.1
780 0.11
781 0.12
782 0.14
783 0.15
784 0.13
785 0.13
786 0.13
787 0.12
788 0.12
789 0.15
790 0.2
791 0.26
792 0.33
793 0.37
794 0.38
795 0.42
796 0.46
797 0.45
798 0.44
799 0.38
800 0.32
801 0.3
802 0.32
803 0.31
804 0.29
805 0.29
806 0.24
807 0.31
808 0.3
809 0.28
810 0.26
811 0.23
812 0.22
813 0.21
814 0.22
815 0.14
816 0.18
817 0.18
818 0.18
819 0.19
820 0.2
821 0.23
822 0.25
823 0.29
824 0.32
825 0.38
826 0.47
827 0.49
828 0.53
829 0.6
830 0.59
831 0.6
832 0.59
833 0.55
834 0.46
835 0.44
836 0.36
837 0.27
838 0.24
839 0.22
840 0.17
841 0.18
842 0.18
843 0.15
844 0.14
845 0.12
846 0.12
847 0.09
848 0.08
849 0.06
850 0.07
851 0.09
852 0.1
853 0.11
854 0.11
855 0.14
856 0.14
857 0.14
858 0.17
859 0.15
860 0.16
861 0.15
862 0.18
863 0.19
864 0.2
865 0.2
866 0.16
867 0.16
868 0.15
869 0.15
870 0.13
871 0.1
872 0.09
873 0.08
874 0.09
875 0.1
876 0.1
877 0.12
878 0.16
879 0.22
880 0.28
881 0.33
882 0.36
883 0.38
884 0.37
885 0.39
886 0.43
887 0.42
888 0.37
889 0.39
890 0.44
891 0.43
892 0.44
893 0.43
894 0.38
895 0.33
896 0.33
897 0.31
898 0.33
899 0.36
900 0.39
901 0.44
902 0.41
903 0.41
904 0.47
905 0.45
906 0.35
907 0.34
908 0.33
909 0.33
910 0.36
911 0.39
912 0.34
913 0.34
914 0.35
915 0.32
916 0.33
917 0.32
918 0.3
919 0.28
920 0.34
921 0.36
922 0.39
923 0.45
924 0.45
925 0.41
926 0.46
927 0.45
928 0.46
929 0.44
930 0.41
931 0.36
932 0.33
933 0.37
934 0.32
935 0.32
936 0.25
937 0.24
938 0.24
939 0.27
940 0.33
941 0.32
942 0.33
943 0.37
944 0.41
945 0.43
946 0.46
947 0.47
948 0.48
949 0.48
950 0.51
951 0.48
952 0.45
953 0.45
954 0.43
955 0.41
956 0.35
957 0.3
958 0.27
959 0.21
960 0.23
961 0.18
962 0.17
963 0.11
964 0.12
965 0.11
966 0.1
967 0.1
968 0.07
969 0.07
970 0.08
971 0.08
972 0.07
973 0.07
974 0.08
975 0.12
976 0.13
977 0.16
978 0.18
979 0.25
980 0.25
981 0.26
982 0.27
983 0.26
984 0.27
985 0.24
986 0.21
987 0.16
988 0.16
989 0.17
990 0.16
991 0.13
992 0.15
993 0.16
994 0.18
995 0.16
996 0.18
997 0.24
998 0.27
999 0.29
1000 0.27
1001 0.3
1002 0.31
1003 0.35
1004 0.35
1005 0.27
1006 0.24
1007 0.22
1008 0.21
1009 0.18
1010 0.17
1011 0.14
1012 0.14
1013 0.17
1014 0.18
1015 0.2
1016 0.25
1017 0.25
1018 0.27
1019 0.31
1020 0.37
1021 0.39
1022 0.44
1023 0.45
1024 0.48
1025 0.52
1026 0.57
1027 0.57
1028 0.57
1029 0.54
1030 0.51
1031 0.54
1032 0.52
1033 0.5
1034 0.48
1035 0.45
1036 0.4
1037 0.38
1038 0.36
1039 0.33
1040 0.3
1041 0.3
1042 0.3
1043 0.33
1044 0.33
1045 0.34
1046 0.38
1047 0.42
1048 0.4
1049 0.38
1050 0.36
1051 0.37
1052 0.43
1053 0.49
1054 0.48
1055 0.45
1056 0.46
1057 0.45
1058 0.42
1059 0.39
1060 0.34
1061 0.28
1062 0.24
1063 0.23
1064 0.22
1065 0.23
1066 0.22
1067 0.18
1068 0.16