FuNGI

A0A4U0VZJ6

Protein Details

Accession

A0A4U0VZJ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-28	TYNLTRFTRQVLKRHRRAPPSVVI	Hydrophilic
430-467	RDKAALEKKRLQQQQKRAQAQRRKERKKLELEKAQQAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
436-457	EKKRLQQQQKRAQAQRRKERKK

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 8, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSGATYNLTRFTRQVLKRHRRAPPSVVIHLYPTHFRFEHQHGNFGYDSPMKCFLEAVREQKLPTDLLDVLDDAGVRYYDGESFPPTSPKKSEGLTRLLPTGCLIVEVHDHRQSPAANPPNLRSSLSASFSLAQNREIPAASKAEVYRIVLAPNPATLWTELSIASRKMEQEAAAAGRNEVGWTEDEAVEIESVILNRTMPPLCLSPSIQTSRIANSMLRATTLRPPKRNRFCSTGDCSDGDDGEEGQKREREEHEKLMKVGDEGVPRTRGPAFSRLAFIQAYRERQQNPTLAAQPGSSATSIRLGGAQQQQQQQQQQPHQAAAVHASAIPAVASAQQAHAARDSPRHSRAASPAVSVTSGRPHKKPKALDGMMSDSGSGISATVINTAAQQKKAAKLAAGAGAGAVGVDVHAAAAAAPESQQAALERSERDKAALEKKRLQQQQKRAQAQRRKERKKLELEKAQQAGDLQVGTPGSSVAGTPNWQG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.56
3	0.65
4	0.73
5	0.81
6	0.84
7	0.82
8	0.83
9	0.81
10	0.79
11	0.76
12	0.73
13	0.67
14	0.58
15	0.53
16	0.48
17	0.43
18	0.39
19	0.33
20	0.33
21	0.3
22	0.31
23	0.34
24	0.39
25	0.47
26	0.42
27	0.48
28	0.42
29	0.46
30	0.44
31	0.38
32	0.35
33	0.3
34	0.29
35	0.26
36	0.32
37	0.28
38	0.28
39	0.28
40	0.25
41	0.28
42	0.33
43	0.35
44	0.35
45	0.36
46	0.36
47	0.39
48	0.4
49	0.32
50	0.27
51	0.25
52	0.19
53	0.19
54	0.19
55	0.16
56	0.14
57	0.13
58	0.12
59	0.08
60	0.08
61	0.07
62	0.06
63	0.07
64	0.07
65	0.08
66	0.09
67	0.11
68	0.13
69	0.16
70	0.18
71	0.25
72	0.27
73	0.3
74	0.32
75	0.34
76	0.34
77	0.34
78	0.4
79	0.38
80	0.42
81	0.42
82	0.41
83	0.42
84	0.39
85	0.37
86	0.29
87	0.25
88	0.18
89	0.14
90	0.12
91	0.09
92	0.14
93	0.17
94	0.21
95	0.23
96	0.24
97	0.23
98	0.27
99	0.27
100	0.25
101	0.31
102	0.35
103	0.35
104	0.36
105	0.39
106	0.4
107	0.41
108	0.39
109	0.31
110	0.29
111	0.29
112	0.3
113	0.27
114	0.24
115	0.24
116	0.24
117	0.28
118	0.23
119	0.21
120	0.2
121	0.2
122	0.2
123	0.19
124	0.18
125	0.15
126	0.16
127	0.15
128	0.16
129	0.15
130	0.16
131	0.17
132	0.17
133	0.18
134	0.16
135	0.16
136	0.15
137	0.16
138	0.14
139	0.13
140	0.12
141	0.1
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.11
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.14
153	0.13
154	0.14
155	0.15
156	0.13
157	0.11
158	0.13
159	0.13
160	0.14
161	0.14
162	0.12
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.08
167	0.07
168	0.06
169	0.07
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.1
175	0.08
176	0.07
177	0.06
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.1
188	0.11
189	0.12
190	0.14
191	0.15
192	0.14
193	0.18
194	0.21
195	0.2
196	0.2
197	0.2
198	0.19
199	0.2
200	0.19
201	0.14
202	0.13
203	0.14
204	0.13
205	0.13
206	0.11
207	0.12
208	0.18
209	0.27
210	0.32
211	0.37
212	0.45
213	0.55
214	0.65
215	0.71
216	0.68
217	0.65
218	0.64
219	0.63
220	0.62
221	0.55
222	0.47
223	0.39
224	0.36
225	0.3
226	0.25
227	0.18
228	0.11
229	0.08
230	0.09
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.14
235	0.14
236	0.17
237	0.21
238	0.25
239	0.26
240	0.34
241	0.39
242	0.39
243	0.38
244	0.37
245	0.33
246	0.26
247	0.24
248	0.18
249	0.14
250	0.14
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.17
255	0.17
256	0.16
257	0.17
258	0.22
259	0.22
260	0.21
261	0.23
262	0.22
263	0.23
264	0.21
265	0.18
266	0.18
267	0.2
268	0.24
269	0.24
270	0.29
271	0.29
272	0.32
273	0.35
274	0.32
275	0.31
276	0.29
277	0.3
278	0.26
279	0.25
280	0.22
281	0.18
282	0.16
283	0.14
284	0.11
285	0.08
286	0.07
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.14
293	0.19
294	0.23
295	0.26
296	0.31
297	0.35
298	0.38
299	0.43
300	0.42
301	0.43
302	0.44
303	0.47
304	0.43
305	0.39
306	0.36
307	0.32
308	0.27
309	0.23
310	0.18
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.08
315	0.07
316	0.07
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.1
324	0.11
325	0.12
326	0.13
327	0.14
328	0.15
329	0.21
330	0.25
331	0.27
332	0.3
333	0.32
334	0.32
335	0.34
336	0.38
337	0.39
338	0.36
339	0.31
340	0.28
341	0.26
342	0.26
343	0.22
344	0.18
345	0.19
346	0.26
347	0.28
348	0.33
349	0.42
350	0.49
351	0.57
352	0.61
353	0.61
354	0.64
355	0.62
356	0.6
357	0.55
358	0.53
359	0.46
360	0.41
361	0.33
362	0.22
363	0.19
364	0.16
365	0.11
366	0.05
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.1
374	0.16
375	0.19
376	0.19
377	0.24
378	0.26
379	0.3
380	0.34
381	0.33
382	0.27
383	0.26
384	0.27
385	0.27
386	0.23
387	0.19
388	0.14
389	0.13
390	0.12
391	0.09
392	0.06
393	0.02
394	0.02
395	0.02
396	0.02
397	0.02
398	0.02
399	0.02
400	0.02
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.08
410	0.1
411	0.12
412	0.15
413	0.18
414	0.21
415	0.25
416	0.24
417	0.24
418	0.27
419	0.32
420	0.4
421	0.46
422	0.5
423	0.55
424	0.62
425	0.7
426	0.75
427	0.79
428	0.78
429	0.8
430	0.83
431	0.85
432	0.88
433	0.87
434	0.88
435	0.88
436	0.89
437	0.89
438	0.9
439	0.89
440	0.88
441	0.9
442	0.89
443	0.9
444	0.9
445	0.89
446	0.89
447	0.86
448	0.86
449	0.79
450	0.7
451	0.6
452	0.5
453	0.4
454	0.31
455	0.24
456	0.15
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.11
461	0.1
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.1

A0A4U0VZJ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer