FuNGI

A0A4U0VV51

Protein Details

Accession

A0A4U0VV51

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
76-95	SLFLRPVKLNRKDPRTVRRL	Hydrophilic
162-184	GTTTVQRRGPRGQFKKKFQRVYV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
626-633	KRRKAGGK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MELRVKSEDAAAATNDSPSVTASPLPTSSDYNDFLLRSSAPQSSSSDPNGGGGGWKYNVMKFTAVGDRVIDPADESLFLRPVKLNRKDPRTVRRLTDEDRERHNKRALDRAAKAAGLDPNAMDVDTKPNVDGDGDNNGGEGTGAAEEKEELDPDLVGKGVDGTTTVQRRGPRGQFKKKFQRVYVASEEARRLKREEWQPWVLEDDEGRERWVGRLEGGAGEIGGSANKKGGENAGGAASDQGRIAPSTSTGNGSPASLDGWRPAAEASAAGGGGSAYVAFVFGDNGDEFKVVPINRWYRFNQGPKYLTLAEEEAEAEYARQQKSKEHERWQMRRRAAPISAPTSGSATPRAGPAGQASGGGPATASALRSRMLERSTVGTKPDPDDGGGDLDDFDRPRIRTVISSTSGGGGGAAGGSGGVGGRGGPKRRGGQDQDDDEFDYEEDFQDDEEGIAKIDDLADEEETRELEERIRREMRAAERPDAIPDEPADEDADRLTGTGKEIKKLVRKSDKTGVYESDDEDDNPYASSDAESDGAASTASGDRDRSGSRPSTPRPGSPPSNYRSGSVSRGPSRATSPSSSGAAYLAKRATSPAPSSSSHSNGKRKRDRASTTDGAASDSDADGSKRRKAGGKSPSPAPGGGVLTQADIVAYLRTRPNQTSTTKEVLTHFRKAIKGDARNKASIGGLLRAAANLVDGNLVLKPGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.16
3	0.14
4	0.12
5	0.12
6	0.12
7	0.11
8	0.13
9	0.14
10	0.17
11	0.18
12	0.21
13	0.22
14	0.23
15	0.26
16	0.28
17	0.29
18	0.29
19	0.3
20	0.27
21	0.25
22	0.24
23	0.22
24	0.19
25	0.2
26	0.21
27	0.2
28	0.22
29	0.26
30	0.28
31	0.33
32	0.33
33	0.32
34	0.29
35	0.28
36	0.26
37	0.22
38	0.2
39	0.16
40	0.16
41	0.14
42	0.17
43	0.18
44	0.2
45	0.22
46	0.21
47	0.21
48	0.18
49	0.22
50	0.26
51	0.26
52	0.24
53	0.24
54	0.23
55	0.23
56	0.23
57	0.18
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.11
63	0.12
64	0.15
65	0.15
66	0.17
67	0.19
68	0.26
69	0.36
70	0.44
71	0.52
72	0.58
73	0.66
74	0.73
75	0.79
76	0.82
77	0.8
78	0.77
79	0.73
80	0.72
81	0.71
82	0.67
83	0.68
84	0.66
85	0.63
86	0.66
87	0.7
88	0.65
89	0.66
90	0.67
91	0.62
92	0.57
93	0.62
94	0.61
95	0.61
96	0.6
97	0.58
98	0.53
99	0.49
100	0.45
101	0.38
102	0.33
103	0.25
104	0.22
105	0.16
106	0.15
107	0.15
108	0.15
109	0.11
110	0.09
111	0.14
112	0.15
113	0.15
114	0.14
115	0.14
116	0.14
117	0.15
118	0.15
119	0.12
120	0.15
121	0.16
122	0.15
123	0.15
124	0.14
125	0.13
126	0.12
127	0.09
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.06
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.07
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.09
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.05
147	0.05
148	0.06
149	0.08
150	0.14
151	0.18
152	0.19
153	0.21
154	0.24
155	0.29
156	0.37
157	0.44
158	0.48
159	0.56
160	0.66
161	0.72
162	0.8
163	0.87
164	0.88
165	0.87
166	0.79
167	0.78
168	0.71
169	0.69
170	0.65
171	0.59
172	0.51
173	0.46
174	0.47
175	0.44
176	0.43
177	0.38
178	0.34
179	0.31
180	0.38
181	0.44
182	0.47
183	0.48
184	0.49
185	0.48
186	0.46
187	0.47
188	0.39
189	0.3
190	0.23
191	0.2
192	0.18
193	0.17
194	0.17
195	0.15
196	0.15
197	0.15
198	0.19
199	0.15
200	0.12
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.06
233	0.07
234	0.09
235	0.1
236	0.12
237	0.11
238	0.13
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.09
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.1
278	0.08
279	0.1
280	0.17
281	0.23
282	0.25
283	0.29
284	0.31
285	0.34
286	0.41
287	0.46
288	0.45
289	0.45
290	0.45
291	0.42
292	0.44
293	0.38
294	0.31
295	0.25
296	0.2
297	0.14
298	0.12
299	0.11
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.05
304	0.07
305	0.11
306	0.12
307	0.14
308	0.14
309	0.19
310	0.26
311	0.36
312	0.41
313	0.45
314	0.53
315	0.61
316	0.7
317	0.74
318	0.75
319	0.68
320	0.65
321	0.59
322	0.55
323	0.46
324	0.41
325	0.36
326	0.32
327	0.3
328	0.26
329	0.23
330	0.21
331	0.2
332	0.17
333	0.15
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.08
357	0.09
358	0.11
359	0.11
360	0.12
361	0.12
362	0.15
363	0.17
364	0.17
365	0.18
366	0.17
367	0.18
368	0.19
369	0.2
370	0.16
371	0.14
372	0.14
373	0.12
374	0.12
375	0.1
376	0.09
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.1
383	0.1
384	0.12
385	0.13
386	0.13
387	0.14
388	0.18
389	0.23
390	0.21
391	0.22
392	0.2
393	0.2
394	0.19
395	0.17
396	0.13
397	0.07
398	0.04
399	0.03
400	0.03
401	0.02
402	0.02
403	0.02
404	0.02
405	0.02
406	0.02
407	0.02
408	0.02
409	0.06
410	0.1
411	0.13
412	0.16
413	0.2
414	0.25
415	0.29
416	0.36
417	0.37
418	0.42
419	0.46
420	0.48
421	0.45
422	0.42
423	0.39
424	0.32
425	0.27
426	0.19
427	0.13
428	0.08
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.05
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.11
455	0.15
456	0.17
457	0.24
458	0.26
459	0.26
460	0.27
461	0.33
462	0.36
463	0.41
464	0.43
465	0.39
466	0.39
467	0.39
468	0.39
469	0.35
470	0.29
471	0.21
472	0.17
473	0.16
474	0.13
475	0.14
476	0.13
477	0.1
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.06
485	0.08
486	0.15
487	0.16
488	0.18
489	0.21
490	0.27
491	0.34
492	0.39
493	0.47
494	0.51
495	0.54
496	0.59
497	0.65
498	0.66
499	0.61
500	0.59
501	0.52
502	0.45
503	0.43
504	0.37
505	0.3
506	0.24
507	0.21
508	0.2
509	0.17
510	0.13
511	0.12
512	0.11
513	0.09
514	0.08
515	0.09
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.08
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.13
532	0.15
533	0.16
534	0.2
535	0.23
536	0.28
537	0.36
538	0.4
539	0.48
540	0.49
541	0.52
542	0.53
543	0.57
544	0.57
545	0.57
546	0.6
547	0.53
548	0.58
549	0.54
550	0.49
551	0.46
552	0.42
553	0.39
554	0.37
555	0.42
556	0.37
557	0.39
558	0.39
559	0.37
560	0.38
561	0.38
562	0.36
563	0.32
564	0.31
565	0.31
566	0.31
567	0.29
568	0.25
569	0.22
570	0.21
571	0.19
572	0.19
573	0.18
574	0.16
575	0.16
576	0.19
577	0.2
578	0.22
579	0.24
580	0.25
581	0.27
582	0.29
583	0.33
584	0.36
585	0.39
586	0.42
587	0.47
588	0.53
589	0.57
590	0.66
591	0.72
592	0.73
593	0.76
594	0.78
595	0.77
596	0.73
597	0.75
598	0.69
599	0.62
600	0.59
601	0.5
602	0.42
603	0.34
604	0.28
605	0.2
606	0.15
607	0.13
608	0.1
609	0.11
610	0.16
611	0.2
612	0.25
613	0.27
614	0.31
615	0.37
616	0.42
617	0.5
618	0.55
619	0.61
620	0.61
621	0.63
622	0.65
623	0.6
624	0.54
625	0.46
626	0.39
627	0.31
628	0.27
629	0.24
630	0.18
631	0.16
632	0.16
633	0.14
634	0.1
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.11
640	0.16
641	0.21
642	0.26
643	0.29
644	0.34
645	0.39
646	0.44
647	0.47
648	0.5
649	0.51
650	0.48
651	0.47
652	0.46
653	0.5
654	0.5
655	0.5
656	0.47
657	0.47
658	0.48
659	0.48
660	0.53
661	0.52
662	0.57
663	0.59
664	0.65
665	0.66
666	0.65
667	0.63
668	0.55
669	0.47
670	0.41
671	0.34
672	0.27
673	0.21
674	0.2
675	0.2
676	0.18
677	0.17
678	0.13
679	0.11
680	0.08
681	0.07
682	0.07
683	0.06
684	0.08
685	0.07

A0A4U0VV51

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer