FuNGI

A0A4U0W0R2

Protein Details

Accession

A0A4U0W0R2

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
171-192	DGNNFRGKRPPRAPRPRQELEM	Hydrophilic
529-570	KDSADEEKRTRREKKQARKDEKEAKMKKKKKPAQEIPADSLV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
177-186	GKRPPRAPRP
536-560	KRTRREKKQARKDEKEAKMKKKKKP
600-629	KEAERRAKLEKANRAAAIAKKREGTAAPRR

Subcellular Location(s)

mito 15, mito_nucl 11.666, cyto_mito 10.666, nucl 7, cyto_nucl 6.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSGRGRGRGRRVAAQTLSGAAAITAAGGAGPSPSPAPERSAASSRASSTAESTPAPPPGATDDAPNDASGGRGGGDKPARAAAGVRRVPSVGVGSTRAPSVGLLARTPSIGPPGVGTMRERPVGGLLGSTSEFRPSANAGTSSGKAKFKPNMKRRDKALEVSDDEDVKMEDGNNFRGKRPPRAPRPRQELEMTASGPMAQGPGGPPRAWGARPAAGGSSGAAVMAASRAGTLNQMLDADSDASDLEVDDDPLLDEGSGALRFKAVDLNDIGTVTSPDDTTLPPLTLPRDPKVKAKSEGALAGVKPEPGDESMPTSATATPAPIDSKEGSLALFSVDEEKEAKDLRDLEQEEKKEIILSEAFDLAASPARDPGSSFFLLANKLTKEPGTTSSLADLSLADGAGVKGDPDAPPPRRKAAPPPWGRFGTMQEKAARWSEHAGRIGELCVHQSGKVTLRLAGDLRYEVLPAAQPSFLQEIAVLDHPSKRPATASGTNGSKSRHESSDSASEASDSDSDVSRSSISSLSDLDGKDSADEEKRTRREKKQARKDEKEAKMKKKKKPAQEIPADSLVLLGQTSKKFIVVPDMQDLLDKVGQEERAEKEAERRAKLEKANRAAAIAKKREGTAAPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.49
3	0.42
4	0.37
5	0.28
6	0.22
7	0.13
8	0.11
9	0.07
10	0.06
11	0.04
12	0.03
13	0.03
14	0.03
15	0.03
16	0.04
17	0.04
18	0.05
19	0.06
20	0.08
21	0.12
22	0.13
23	0.18
24	0.21
25	0.25
26	0.29
27	0.34
28	0.35
29	0.37
30	0.38
31	0.35
32	0.35
33	0.32
34	0.28
35	0.27
36	0.26
37	0.25
38	0.23
39	0.24
40	0.24
41	0.26
42	0.26
43	0.22
44	0.21
45	0.23
46	0.26
47	0.24
48	0.24
49	0.24
50	0.27
51	0.27
52	0.26
53	0.21
54	0.17
55	0.17
56	0.13
57	0.11
58	0.07
59	0.09
60	0.09
61	0.16
62	0.19
63	0.19
64	0.21
65	0.22
66	0.22
67	0.2
68	0.23
69	0.23
70	0.3
71	0.33
72	0.32
73	0.31
74	0.32
75	0.31
76	0.3
77	0.25
78	0.17
79	0.15
80	0.17
81	0.17
82	0.18
83	0.18
84	0.16
85	0.14
86	0.12
87	0.13
88	0.15
89	0.15
90	0.14
91	0.16
92	0.16
93	0.17
94	0.17
95	0.15
96	0.14
97	0.13
98	0.13
99	0.12
100	0.15
101	0.16
102	0.17
103	0.19
104	0.21
105	0.24
106	0.25
107	0.24
108	0.21
109	0.21
110	0.21
111	0.18
112	0.13
113	0.1
114	0.11
115	0.11
116	0.12
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.1
121	0.12
122	0.12
123	0.14
124	0.15
125	0.16
126	0.17
127	0.2
128	0.22
129	0.23
130	0.26
131	0.27
132	0.26
133	0.32
134	0.36
135	0.42
136	0.52
137	0.58
138	0.64
139	0.7
140	0.75
141	0.74
142	0.77
143	0.73
144	0.68
145	0.64
146	0.6
147	0.54
148	0.49
149	0.45
150	0.35
151	0.31
152	0.25
153	0.19
154	0.12
155	0.1
156	0.09
157	0.1
158	0.12
159	0.17
160	0.23
161	0.24
162	0.26
163	0.33
164	0.36
165	0.43
166	0.51
167	0.57
168	0.61
169	0.71
170	0.8
171	0.82
172	0.87
173	0.81
174	0.76
175	0.69
176	0.62
177	0.54
178	0.48
179	0.38
180	0.29
181	0.24
182	0.19
183	0.16
184	0.12
185	0.08
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.1
190	0.12
191	0.12
192	0.13
193	0.15
194	0.18
195	0.18
196	0.19
197	0.19
198	0.2
199	0.21
200	0.21
201	0.19
202	0.16
203	0.16
204	0.13
205	0.1
206	0.06
207	0.05
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.04
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.04
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.09
251	0.08
252	0.1
253	0.1
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.11
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.06
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.08
270	0.1
271	0.12
272	0.15
273	0.18
274	0.18
275	0.24
276	0.25
277	0.32
278	0.37
279	0.4
280	0.39
281	0.39
282	0.37
283	0.33
284	0.32
285	0.27
286	0.22
287	0.17
288	0.16
289	0.14
290	0.12
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.07
297	0.09
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.09
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.07
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.11
331	0.12
332	0.18
333	0.2
334	0.23
335	0.27
336	0.28
337	0.27
338	0.26
339	0.24
340	0.19
341	0.17
342	0.14
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.06
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.12
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.14
363	0.15
364	0.16
365	0.16
366	0.17
367	0.13
368	0.13
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.16
374	0.18
375	0.18
376	0.18
377	0.19
378	0.18
379	0.17
380	0.15
381	0.12
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.1
395	0.18
396	0.23
397	0.29
398	0.32
399	0.37
400	0.39
401	0.42
402	0.48
403	0.51
404	0.56
405	0.59
406	0.62
407	0.63
408	0.61
409	0.6
410	0.51
411	0.47
412	0.45
413	0.38
414	0.37
415	0.33
416	0.32
417	0.33
418	0.35
419	0.3
420	0.23
421	0.25
422	0.26
423	0.29
424	0.32
425	0.3
426	0.27
427	0.27
428	0.26
429	0.22
430	0.18
431	0.14
432	0.12
433	0.12
434	0.11
435	0.12
436	0.14
437	0.16
438	0.19
439	0.18
440	0.2
441	0.2
442	0.22
443	0.21
444	0.2
445	0.18
446	0.15
447	0.16
448	0.13
449	0.12
450	0.1
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.11
455	0.09
456	0.09
457	0.11
458	0.14
459	0.13
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.11
464	0.13
465	0.12
466	0.11
467	0.15
468	0.16
469	0.19
470	0.19
471	0.18
472	0.17
473	0.2
474	0.27
475	0.28
476	0.31
477	0.34
478	0.37
479	0.38
480	0.39
481	0.37
482	0.33
483	0.33
484	0.34
485	0.3
486	0.32
487	0.32
488	0.34
489	0.4
490	0.38
491	0.33
492	0.29
493	0.26
494	0.22
495	0.22
496	0.17
497	0.1
498	0.09
499	0.1
500	0.1
501	0.11
502	0.11
503	0.1
504	0.1
505	0.11
506	0.12
507	0.12
508	0.13
509	0.13
510	0.13
511	0.17
512	0.16
513	0.17
514	0.16
515	0.15
516	0.14
517	0.14
518	0.16
519	0.18
520	0.21
521	0.24
522	0.33
523	0.41
524	0.49
525	0.57
526	0.64
527	0.7
528	0.77
529	0.83
530	0.85
531	0.89
532	0.91
533	0.91
534	0.92
535	0.91
536	0.9
537	0.9
538	0.88
539	0.88
540	0.89
541	0.89
542	0.88
543	0.89
544	0.87
545	0.87
546	0.89
547	0.88
548	0.88
549	0.89
550	0.86
551	0.81
552	0.75
553	0.64
554	0.53
555	0.42
556	0.31
557	0.21
558	0.14
559	0.09
560	0.11
561	0.12
562	0.15
563	0.15
564	0.16
565	0.17
566	0.17
567	0.25
568	0.25
569	0.28
570	0.31
571	0.32
572	0.31
573	0.31
574	0.31
575	0.26
576	0.22
577	0.18
578	0.15
579	0.17
580	0.19
581	0.2
582	0.24
583	0.24
584	0.26
585	0.27
586	0.27
587	0.31
588	0.38
589	0.45
590	0.44
591	0.43
592	0.45
593	0.51
594	0.59
595	0.6
596	0.61
597	0.61
598	0.64
599	0.61
600	0.59
601	0.57
602	0.56
603	0.56
604	0.53
605	0.5
606	0.46
607	0.46
608	0.47
609	0.46

A0A4U0W0R2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer