FuNGI

A0A4U0W4R2

Protein Details

Accession

A0A4U0W4R2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-110	TAPVRRGDKFRAQRKERNFKNRLKAKARLAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
84-107	RRGDKFRAQRKERNFKNRLKAKAR

Subcellular Location(s)

extr 10, cyto 5.5, mito 4, cyto_nucl 4, plas 2, pero 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MFSKEYRAALAAIKAADVKLETVYSSHLLNALPPALSAFQTSLAITNSSELPSTDRILDLVRNEVLRLLSSLSARTGSVTAPVRRGDKFRAQRKERNFKNRLKAKARLAQAGEANAQLASLLDEDTGVEVWLTMSFSATPRSLKPTIDSGATHSMCGEISLFFNLRRCRPSPVGGVSGAKNGLVVTGVGSLPVKLVSGRIVVIHQALLVPGIAANLISSSQLYDNHGVTTTFGQGATLSRNGVVIATGTRLRKHLYPLDGELIAPSTAKELLELVHTDVLSINVPSYGGRRYVVTFVDDHSRMLWVEALARKSDVFGAFPRFKAAAENESGKHIQRLRSDNGGEYTSHEFRDFLAEHGIHHEMPPPYSPQANGAQAPKALWAEALLAFVFVKNRSPHAALAGGVPLTVWRGKPVRVDMLRVWGCRAYHTVINGRAKLDDKAVPLVFIGYDGDTAAYRLFDPASRKTVRSRDARLVEDEFPFAAATPSTAQSLPQPTPAPDDLIILASSQAPSAANDATPQTPARAPPVVPRPPVRAAQAREVVVTPPPPPVFHRASAPSPPSPEPVLPDEESRDELDFLGNDPFGATLADVEALYSAAGEDLSASDEQFSLPTSDPRNHREAMRDTDSERWRLGEHDEFTSLQNEYNVFHPVDRSEVPPDARFLGAHFVYRRKKDQNGQVTGHKVRLVAQGFTQRPNVDFREMFAPVVKFTSIRVLLALAARHRLHVHQANVDKAYLHGALAEELYMRVPEGINGSDYAGKVLKLDCALEGGHTHYIALYVDDLLFVSPDLDEIQRIKDGLKREYGIKDLGEAKFILGIQVHRRSNGGIFLSQRAYLEDVLLRLGYADGRTAPTPMQPNLQLAVAPEDHRPTPAFRSRYLQAVGSLMYAMLGTRPDLCYAVGVLGRHAARPDNSHWAAVIRVLAYIKGTLDFGLEFQPDDSPLAGFEAYSDSDWGACPSTSRSTMGYTFVLASGAVSWSSKLQPRVTASSTEAEYLGLSHASKEAIHLSQLLSELAQRSGRPIELFCDNQGANALSRDPQFHNRTRHLRLTEHFVREQVQQGDITVTYIPTARMVADVMTKSIPLPAFIQHRVALGIRPFRARGGVAADALSPG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.17
3	0.16
4	0.14
5	0.13
6	0.11
7	0.11
8	0.11
9	0.11
10	0.14
11	0.14
12	0.14
13	0.13
14	0.14
15	0.13
16	0.14
17	0.16
18	0.15
19	0.14
20	0.13
21	0.15
22	0.14
23	0.14
24	0.15
25	0.13
26	0.13
27	0.14
28	0.14
29	0.14
30	0.14
31	0.15
32	0.13
33	0.14
34	0.14
35	0.14
36	0.15
37	0.13
38	0.16
39	0.17
40	0.19
41	0.19
42	0.17
43	0.17
44	0.19
45	0.22
46	0.2
47	0.21
48	0.22
49	0.21
50	0.21
51	0.22
52	0.21
53	0.18
54	0.17
55	0.15
56	0.15
57	0.16
58	0.17
59	0.16
60	0.16
61	0.15
62	0.16
63	0.15
64	0.12
65	0.18
66	0.24
67	0.26
68	0.3
69	0.34
70	0.36
71	0.38
72	0.43
73	0.44
74	0.47
75	0.54
76	0.6
77	0.67
78	0.72
79	0.78
80	0.84
81	0.88
82	0.87
83	0.88
84	0.88
85	0.87
86	0.89
87	0.88
88	0.87
89	0.84
90	0.82
91	0.8
92	0.79
93	0.74
94	0.71
95	0.65
96	0.6
97	0.54
98	0.49
99	0.4
100	0.33
101	0.28
102	0.2
103	0.17
104	0.11
105	0.09
106	0.07
107	0.06
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.06
112	0.07
113	0.07
114	0.06
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.09
124	0.12
125	0.14
126	0.16
127	0.18
128	0.25
129	0.27
130	0.27
131	0.29
132	0.31
133	0.32
134	0.32
135	0.31
136	0.28
137	0.35
138	0.34
139	0.31
140	0.25
141	0.23
142	0.2
143	0.2
144	0.16
145	0.07
146	0.08
147	0.11
148	0.12
149	0.13
150	0.2
151	0.25
152	0.29
153	0.34
154	0.35
155	0.4
156	0.44
157	0.48
158	0.49
159	0.49
160	0.48
161	0.44
162	0.45
163	0.38
164	0.36
165	0.3
166	0.23
167	0.18
168	0.14
169	0.12
170	0.09
171	0.07
172	0.05
173	0.07
174	0.07
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.06
182	0.07
183	0.08
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.1
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.09
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.06
207	0.07
208	0.09
209	0.13
210	0.15
211	0.16
212	0.16
213	0.17
214	0.16
215	0.16
216	0.16
217	0.14
218	0.12
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.11
223	0.13
224	0.13
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.09
231	0.07
232	0.06
233	0.09
234	0.13
235	0.14
236	0.16
237	0.17
238	0.2
239	0.22
240	0.28
241	0.32
242	0.32
243	0.34
244	0.35
245	0.37
246	0.35
247	0.32
248	0.26
249	0.2
250	0.16
251	0.12
252	0.09
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.12
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.12
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.08
274	0.09
275	0.1
276	0.11
277	0.12
278	0.14
279	0.16
280	0.17
281	0.17
282	0.16
283	0.16
284	0.22
285	0.21
286	0.19
287	0.17
288	0.17
289	0.15
290	0.15
291	0.15
292	0.08
293	0.13
294	0.16
295	0.17
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.16
300	0.19
301	0.14
302	0.13
303	0.14
304	0.22
305	0.23
306	0.24
307	0.25
308	0.23
309	0.22
310	0.24
311	0.24
312	0.2
313	0.21
314	0.24
315	0.22
316	0.26
317	0.27
318	0.24
319	0.26
320	0.26
321	0.28
322	0.31
323	0.37
324	0.37
325	0.41
326	0.42
327	0.39
328	0.38
329	0.34
330	0.27
331	0.25
332	0.27
333	0.22
334	0.21
335	0.19
336	0.17
337	0.16
338	0.22
339	0.19
340	0.14
341	0.18
342	0.17
343	0.17
344	0.2
345	0.21
346	0.16
347	0.15
348	0.19
349	0.15
350	0.16
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.18
355	0.18
356	0.17
357	0.2
358	0.22
359	0.23
360	0.22
361	0.22
362	0.21
363	0.21
364	0.19
365	0.15
366	0.12
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.09
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.07
378	0.11
379	0.12
380	0.14
381	0.17
382	0.19
383	0.19
384	0.19
385	0.2
386	0.16
387	0.15
388	0.14
389	0.11
390	0.09
391	0.08
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.1
397	0.12
398	0.14
399	0.18
400	0.21
401	0.28
402	0.28
403	0.32
404	0.29
405	0.36
406	0.38
407	0.35
408	0.33
409	0.26
410	0.25
411	0.23
412	0.25
413	0.18
414	0.17
415	0.19
416	0.23
417	0.27
418	0.31
419	0.31
420	0.29
421	0.27
422	0.27
423	0.25
424	0.23
425	0.19
426	0.17
427	0.2
428	0.19
429	0.17
430	0.16
431	0.15
432	0.12
433	0.09
434	0.09
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.08
447	0.12
448	0.15
449	0.21
450	0.23
451	0.24
452	0.3
453	0.36
454	0.41
455	0.44
456	0.46
457	0.47
458	0.5
459	0.5
460	0.47
461	0.44
462	0.39
463	0.33
464	0.28
465	0.2
466	0.16
467	0.14
468	0.11
469	0.07
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.1
478	0.15
479	0.14
480	0.17
481	0.17
482	0.16
483	0.2
484	0.2
485	0.19
486	0.16
487	0.16
488	0.13
489	0.12
490	0.12
491	0.08
492	0.08
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.04
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.08
504	0.08
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.11
510	0.13
511	0.13
512	0.13
513	0.18
514	0.27
515	0.3
516	0.32
517	0.34
518	0.35
519	0.37
520	0.38
521	0.36
522	0.34
523	0.32
524	0.35
525	0.35
526	0.31
527	0.29
528	0.27
529	0.24
530	0.18
531	0.17
532	0.12
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.13
537	0.19
538	0.21
539	0.2
540	0.23
541	0.23
542	0.25
543	0.28
544	0.29
545	0.25
546	0.25
547	0.25
548	0.24
549	0.22
550	0.2
551	0.18
552	0.17
553	0.2
554	0.17
555	0.17
556	0.17
557	0.16
558	0.17
559	0.15
560	0.14
561	0.1
562	0.1
563	0.09
564	0.08
565	0.08
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.04
574	0.03
575	0.03
576	0.04
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.02
585	0.02
586	0.02
587	0.02
588	0.02
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.1
600	0.13
601	0.18
602	0.22
603	0.26
604	0.29
605	0.28
606	0.29
607	0.33
608	0.34
609	0.36
610	0.37
611	0.34
612	0.32
613	0.39
614	0.39
615	0.35
616	0.31
617	0.25
618	0.2
619	0.2
620	0.23
621	0.2
622	0.19
623	0.18
624	0.19
625	0.2
626	0.2
627	0.2
628	0.17
629	0.12
630	0.11
631	0.1
632	0.09
633	0.1
634	0.12
635	0.1
636	0.1
637	0.1
638	0.1
639	0.13
640	0.13
641	0.14
642	0.14
643	0.17
644	0.18
645	0.18
646	0.19
647	0.17
648	0.16
649	0.14
650	0.12
651	0.14
652	0.13
653	0.15
654	0.16
655	0.22
656	0.28
657	0.32
658	0.38
659	0.38
660	0.44
661	0.49
662	0.56
663	0.58
664	0.59
665	0.58
666	0.57
667	0.58
668	0.53
669	0.47
670	0.39
671	0.29
672	0.25
673	0.28
674	0.25
675	0.19
676	0.2
677	0.27
678	0.28
679	0.29
680	0.29
681	0.24
682	0.23
683	0.27
684	0.27
685	0.23
686	0.21
687	0.21
688	0.23
689	0.23
690	0.22
691	0.2
692	0.18
693	0.14
694	0.15
695	0.14
696	0.1
697	0.09
698	0.15
699	0.13
700	0.12
701	0.12
702	0.12
703	0.12
704	0.14
705	0.15
706	0.1
707	0.15
708	0.15
709	0.16
710	0.17
711	0.16
712	0.22
713	0.26
714	0.28
715	0.29
716	0.32
717	0.33
718	0.33
719	0.32
720	0.25
721	0.2
722	0.2
723	0.14
724	0.11
725	0.08
726	0.07
727	0.08
728	0.08
729	0.07
730	0.05
731	0.05
732	0.05
733	0.05
734	0.04
735	0.05
736	0.05
737	0.05
738	0.07
739	0.08
740	0.08
741	0.09
742	0.1
743	0.11
744	0.11
745	0.12
746	0.1
747	0.1
748	0.1
749	0.1
750	0.11
751	0.1
752	0.1
753	0.09
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.1
760	0.1
761	0.1
762	0.08
763	0.09
764	0.08
765	0.08
766	0.06
767	0.05
768	0.05
769	0.05
770	0.06
771	0.05
772	0.05
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.04
777	0.05
778	0.06
779	0.07
780	0.08
781	0.1
782	0.1
783	0.11
784	0.12
785	0.14
786	0.19
787	0.21
788	0.24
789	0.24
790	0.28
791	0.3
792	0.31
793	0.3
794	0.25
795	0.25
796	0.26
797	0.24
798	0.22
799	0.19
800	0.17
801	0.16
802	0.16
803	0.14
804	0.09
805	0.12
806	0.18
807	0.25
808	0.26
809	0.25
810	0.26
811	0.27
812	0.27
813	0.28
814	0.23
815	0.18
816	0.19
817	0.22
818	0.23
819	0.22
820	0.21
821	0.18
822	0.17
823	0.15
824	0.14
825	0.12
826	0.11
827	0.11
828	0.1
829	0.09
830	0.07
831	0.07
832	0.07
833	0.06
834	0.07
835	0.07
836	0.09
837	0.1
838	0.11
839	0.11
840	0.15
841	0.2
842	0.2
843	0.23
844	0.23
845	0.24
846	0.24
847	0.24
848	0.2
849	0.16
850	0.18
851	0.15
852	0.15
853	0.15
854	0.17
855	0.17
856	0.19
857	0.19
858	0.19
859	0.25
860	0.32
861	0.33
862	0.33
863	0.38
864	0.38
865	0.42
866	0.41
867	0.34
868	0.27
869	0.25
870	0.23
871	0.18
872	0.16
873	0.1
874	0.08
875	0.07
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.05
880	0.07
881	0.08
882	0.09
883	0.1
884	0.11
885	0.1
886	0.1
887	0.12
888	0.12
889	0.11
890	0.11
891	0.15
892	0.15
893	0.15
894	0.16
895	0.17
896	0.18
897	0.22
898	0.26
899	0.31
900	0.31
901	0.31
902	0.3
903	0.27
904	0.26
905	0.23
906	0.2
907	0.11
908	0.11
909	0.11
910	0.11
911	0.1
912	0.11
913	0.1
914	0.09
915	0.09
916	0.08
917	0.09
918	0.08
919	0.09
920	0.11
921	0.11
922	0.1
923	0.1
924	0.11
925	0.11
926	0.12
927	0.11
928	0.09
929	0.09
930	0.1
931	0.09
932	0.08
933	0.08
934	0.09
935	0.1
936	0.1
937	0.1
938	0.09
939	0.1
940	0.1
941	0.11
942	0.1
943	0.09
944	0.1
945	0.14
946	0.18
947	0.2
948	0.22
949	0.22
950	0.24
951	0.26
952	0.27
953	0.24
954	0.2
955	0.19
956	0.17
957	0.16
958	0.12
959	0.1
960	0.08
961	0.08
962	0.07
963	0.07
964	0.07
965	0.1
966	0.14
967	0.19
968	0.24
969	0.26
970	0.32
971	0.37
972	0.43
973	0.43
974	0.42
975	0.39
976	0.38
977	0.36
978	0.31
979	0.26
980	0.2
981	0.17
982	0.14
983	0.12
984	0.1
985	0.09
986	0.09
987	0.09
988	0.1
989	0.1
990	0.11
991	0.14
992	0.14
993	0.15
994	0.15
995	0.15
996	0.16
997	0.17
998	0.15
999	0.11
1000	0.13
1001	0.14
1002	0.15
1003	0.17
1004	0.15
1005	0.18
1006	0.21
1007	0.23
1008	0.22
1009	0.21
1010	0.23
1011	0.27
1012	0.29
1013	0.26
1014	0.29
1015	0.27
1016	0.25
1017	0.27
1018	0.25
1019	0.2
1020	0.19
1021	0.19
1022	0.17
1023	0.19
1024	0.23
1025	0.25
1026	0.33
1027	0.4
1028	0.47
1029	0.54
1030	0.6
1031	0.68
1032	0.71
1033	0.75
1034	0.7
1035	0.69
1036	0.65
1037	0.66
1038	0.65
1039	0.62
1040	0.56
1041	0.49
1042	0.47
1043	0.43
1044	0.47
1045	0.39
1046	0.32
1047	0.26
1048	0.25
1049	0.25
1050	0.23
1051	0.21
1052	0.14
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.12
1056	0.11
1057	0.1
1058	0.11
1059	0.1
1060	0.1
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.15
1064	0.16
1065	0.17
1066	0.17
1067	0.16
1068	0.16
1069	0.2
1070	0.19
1071	0.15
1072	0.16
1073	0.21
1074	0.27
1075	0.29
1076	0.33
1077	0.29
1078	0.3
1079	0.3
1080	0.3
1081	0.29
1082	0.29
1083	0.34
1084	0.33
1085	0.36
1086	0.37
1087	0.36
1088	0.38
1089	0.33
1090	0.29
1091	0.28
1092	0.27
1093	0.24
1094	0.24

A0A4U0W4R2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer