Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VX01

Protein Details
Accession A0A4U0VX01    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-292HDRDRERDREYRSRDRDREKDWDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-318RDREYRSRDRDREKDWDKGGEGKKSRWDRGGAAGRDRSRSPRRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012479  SAP30BP  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07818  HCNGP  
Amino Acid Sequences MQNLAGYGSDSDDDAAGPSTARSVGTPQATETSNGTAKDSLPDPRAVSSAPPPALTRIKGAASSRSHTPLSGVRLPTSTASSPRSGPSSAALGKRRESSTSPPPFARTNTSDRNGDAATPPVGLAVNLDTLAEFGIPPIPTGPCAPSVQAKLANFHNLRLSRGLHFNDSLHASKAFRNPRIYAKLVEFVDVDETGSNWDKEIWDSKAIGPDATSSRLAELQKIRSEAKQAGASQRSSIAFAPSTSSSTSAASRAADDPRNAGLNSRRDHDRDRERDREYRSRDRDREKDWDKGGEGKKSRWDRGGAAGRDRSRSPRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.12
11 0.17
12 0.21
13 0.21
14 0.22
15 0.25
16 0.25
17 0.26
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.24
22 0.24
23 0.22
24 0.21
25 0.23
26 0.24
27 0.24
28 0.24
29 0.27
30 0.26
31 0.26
32 0.27
33 0.24
34 0.24
35 0.24
36 0.29
37 0.26
38 0.26
39 0.26
40 0.3
41 0.34
42 0.32
43 0.3
44 0.26
45 0.26
46 0.28
47 0.29
48 0.31
49 0.31
50 0.33
51 0.33
52 0.34
53 0.34
54 0.3
55 0.31
56 0.27
57 0.3
58 0.33
59 0.31
60 0.28
61 0.28
62 0.29
63 0.28
64 0.27
65 0.22
66 0.2
67 0.22
68 0.23
69 0.24
70 0.24
71 0.26
72 0.23
73 0.21
74 0.19
75 0.21
76 0.23
77 0.28
78 0.32
79 0.32
80 0.34
81 0.37
82 0.37
83 0.35
84 0.34
85 0.35
86 0.4
87 0.45
88 0.46
89 0.42
90 0.44
91 0.44
92 0.42
93 0.41
94 0.35
95 0.35
96 0.39
97 0.41
98 0.39
99 0.37
100 0.37
101 0.31
102 0.27
103 0.21
104 0.16
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.16
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.25
141 0.22
142 0.22
143 0.26
144 0.23
145 0.24
146 0.23
147 0.24
148 0.18
149 0.23
150 0.23
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.18
155 0.19
156 0.18
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.16
161 0.23
162 0.28
163 0.29
164 0.32
165 0.33
166 0.39
167 0.43
168 0.42
169 0.37
170 0.33
171 0.34
172 0.31
173 0.29
174 0.22
175 0.17
176 0.17
177 0.14
178 0.12
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.21
194 0.21
195 0.2
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.18
200 0.17
201 0.12
202 0.13
203 0.17
204 0.17
205 0.2
206 0.23
207 0.25
208 0.27
209 0.3
210 0.31
211 0.29
212 0.33
213 0.29
214 0.29
215 0.29
216 0.28
217 0.33
218 0.35
219 0.34
220 0.3
221 0.31
222 0.28
223 0.25
224 0.23
225 0.18
226 0.15
227 0.15
228 0.18
229 0.15
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.14
237 0.14
238 0.13
239 0.15
240 0.16
241 0.2
242 0.23
243 0.22
244 0.24
245 0.25
246 0.27
247 0.25
248 0.27
249 0.29
250 0.33
251 0.34
252 0.37
253 0.39
254 0.41
255 0.47
256 0.52
257 0.56
258 0.58
259 0.64
260 0.68
261 0.69
262 0.73
263 0.75
264 0.75
265 0.73
266 0.74
267 0.75
268 0.77
269 0.8
270 0.83
271 0.82
272 0.79
273 0.81
274 0.75
275 0.74
276 0.68
277 0.64
278 0.57
279 0.58
280 0.57
281 0.56
282 0.56
283 0.52
284 0.58
285 0.61
286 0.64
287 0.6
288 0.58
289 0.51
290 0.57
291 0.62
292 0.57
293 0.57
294 0.6
295 0.58
296 0.58
297 0.58
298 0.58