FuNGI

A0A4U0W8H2

Protein Details

Accession

A0A4U0W8H2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
86-114	DYDHDYDRRDRDRRRTRSPSPSAARDRRE	Basic
185-206	NRPLDKIRSRHHPTSRRQSHGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
51-69	RGGGGGRGYESRRSRSPVP
95-123	DRDRRRTRSPSPSAARDRREENGGRDTKG

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013957 SNRNP27
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF08648 SNRNP27

Amino Acid Sequences

MGRAPVRYDDVDAAAPSSHRAPPPPPSYPDRYGGHRGYDRRDSRDYDRDRRGGGGGRGYESRRSRSPVPQPRRDADTRGGRPRAYDYDHDYDRRDRDRRRTRSPSPSAARDRREENGGRDTKGKGKDVVTADDAAEVDAQDIAALMGFGGFGTTQGKEHVQEIEGVATKQERHYRQYMNRKGGFNRPLDKIRSRHHPTSRRQSHGLAGEEVLELTTFSEKKAWIDEKIQFLSALPEIKASEPEPPASPAATFAELEAWWEEHGRIEREIDEYDMGDLARMRQLARDKSKHALSPRDTDLIEITLTTLFSVDKLLHLLRHRRRALTLLRHRLQWEETTETAWERYRAIVESDLPAFLRHAQAASGPSRDPLRSSQRSSLSTSTSSTDLGASLRSLSASTSSRDLASNAGSSSTNRVQMSQLAYTTLTTNARTLSASLVPAAAASLDKLIDASPVPLPDSFLDAQDRLEEAVSALLGDGLDRFAAEVIRQSEMVVIMRTELDRVQEESTSLASSAASTPTREMLAELLGRLERVQTRVDDVQDQLRDLPRPRQSAVPSQSEHTASFVAEIETRLSSCRKSLSETSAIIDIYRQRLDVLTEVESLLRDVQESSGRLQKLVAESGSSDGRPACDLQLPDDDDSRQGSSTRRLFSEHAAACESRASSLSAAVLRAQDLYKRAARLVNVSRDVHLDASIRQDLRRASDNLREKVAEGSRILESETAHCERAVELSAWLLSLERCQVLVAEAESNARENLQLALWRDGTAAVIDDDGGTGARLMASIDAALADSSAKRRLVSEMRSARSDQAQEAAFEVDAGDVPADRDAGLEPAMPSPLPPPFEPPVRSADEARLDLEPAGTPAFEAKSASDSDNAAPRVADDLFSPDAGLQGSAVEHRVDDDWLTPLEEPAAVRSVRRRIRAIPTLSWLSPSTLRLPGDADVEDIVAETADCTATLEHLLAEGSSGDAPPLQALRDELAALEPATNRVQKLAAFAECTTRTDRAFSGLLNHIDEADLQADREDERSEALSAAADAMTALHRAAIECADDLRVQRTLQRVESTYNELLDLLPPKTYPTIPAGQPTLPNKFVAGVDRAQQPEQVHRLAIRRDHPNDYTMAPIIRLIFSPKLDHRSQAQPFDRNAPFLVRPGKFSRRHPQAGMDVASVDSPSSGTDFCVERNPTAQQGQRICLAGSSVDPVAVEANGEADIWHHTARCHPSARPQSPENRSFG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.17
3	0.16
4	0.18
5	0.2
6	0.21
7	0.25
8	0.29
9	0.37
10	0.45
11	0.49
12	0.52
13	0.54
14	0.6
15	0.6
16	0.63
17	0.57
18	0.57
19	0.58
20	0.56
21	0.57
22	0.56
23	0.57
24	0.57
25	0.64
26	0.63
27	0.61
28	0.64
29	0.61
30	0.62
31	0.67
32	0.69
33	0.68
34	0.71
35	0.69
36	0.65
37	0.61
38	0.57
39	0.54
40	0.5
41	0.47
42	0.4
43	0.39
44	0.42
45	0.42
46	0.46
47	0.45
48	0.46
49	0.44
50	0.48
51	0.51
52	0.57
53	0.65
54	0.67
55	0.72
56	0.76
57	0.78
58	0.77
59	0.79
60	0.74
61	0.68
62	0.67
63	0.67
64	0.66
65	0.68
66	0.68
67	0.6
68	0.58
69	0.59
70	0.56
71	0.51
72	0.47
73	0.45
74	0.48
75	0.53
76	0.53
77	0.51
78	0.51
79	0.54
80	0.57
81	0.58
82	0.59
83	0.65
84	0.74
85	0.79
86	0.82
87	0.85
88	0.85
89	0.87
90	0.87
91	0.86
92	0.83
93	0.84
94	0.84
95	0.82
96	0.79
97	0.73
98	0.69
99	0.62
100	0.63
101	0.58
102	0.53
103	0.54
104	0.52
105	0.49
106	0.48
107	0.48
108	0.47
109	0.48
110	0.46
111	0.4
112	0.38
113	0.43
114	0.43
115	0.44
116	0.39
117	0.34
118	0.31
119	0.27
120	0.25
121	0.18
122	0.15
123	0.11
124	0.08
125	0.07
126	0.07
127	0.05
128	0.05
129	0.04
130	0.04
131	0.04
132	0.03
133	0.03
134	0.03
135	0.03
136	0.03
137	0.03
138	0.04
139	0.06
140	0.07
141	0.08
142	0.1
143	0.13
144	0.13
145	0.15
146	0.17
147	0.16
148	0.17
149	0.17
150	0.19
151	0.19
152	0.17
153	0.17
154	0.17
155	0.18
156	0.22
157	0.3
158	0.3
159	0.35
160	0.42
161	0.5
162	0.58
163	0.68
164	0.72
165	0.73
166	0.75
167	0.74
168	0.72
169	0.72
170	0.69
171	0.65
172	0.62
173	0.58
174	0.58
175	0.59
176	0.62
177	0.6
178	0.59
179	0.63
180	0.65
181	0.69
182	0.73
183	0.76
184	0.78
185	0.83
186	0.85
187	0.81
188	0.77
189	0.7
190	0.66
191	0.63
192	0.56
193	0.46
194	0.36
195	0.31
196	0.26
197	0.24
198	0.17
199	0.1
200	0.07
201	0.06
202	0.1
203	0.09
204	0.09
205	0.12
206	0.13
207	0.15
208	0.22
209	0.25
210	0.25
211	0.31
212	0.35
213	0.39
214	0.4
215	0.39
216	0.31
217	0.28
218	0.28
219	0.23
220	0.21
221	0.15
222	0.14
223	0.15
224	0.16
225	0.18
226	0.15
227	0.19
228	0.19
229	0.21
230	0.21
231	0.22
232	0.23
233	0.21
234	0.2
235	0.16
236	0.17
237	0.16
238	0.15
239	0.12
240	0.13
241	0.12
242	0.14
243	0.12
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.12
249	0.16
250	0.17
251	0.17
252	0.18
253	0.19
254	0.2
255	0.21
256	0.19
257	0.15
258	0.13
259	0.13
260	0.12
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.1
266	0.1
267	0.1
268	0.15
269	0.22
270	0.3
271	0.39
272	0.44
273	0.45
274	0.51
275	0.55
276	0.56
277	0.55
278	0.55
279	0.5
280	0.51
281	0.51
282	0.48
283	0.43
284	0.39
285	0.33
286	0.25
287	0.2
288	0.14
289	0.11
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.09
300	0.1
301	0.13
302	0.2
303	0.3
304	0.36
305	0.46
306	0.49
307	0.49
308	0.5
309	0.53
310	0.56
311	0.57
312	0.6
313	0.6
314	0.59
315	0.6
316	0.59
317	0.54
318	0.48
319	0.41
320	0.34
321	0.29
322	0.27
323	0.25
324	0.25
325	0.23
326	0.22
327	0.2
328	0.17
329	0.13
330	0.13
331	0.14
332	0.14
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.16
337	0.16
338	0.15
339	0.14
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.1
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.14
349	0.15
350	0.15
351	0.14
352	0.16
353	0.18
354	0.18
355	0.18
356	0.22
357	0.3
358	0.34
359	0.39
360	0.44
361	0.47
362	0.49
363	0.51
364	0.47
365	0.4
366	0.35
367	0.32
368	0.27
369	0.22
370	0.2
371	0.16
372	0.14
373	0.11
374	0.1
375	0.09
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.09
383	0.1
384	0.11
385	0.13
386	0.13
387	0.14
388	0.14
389	0.15
390	0.13
391	0.13
392	0.12
393	0.1
394	0.11
395	0.1
396	0.11
397	0.16
398	0.17
399	0.2
400	0.19
401	0.2
402	0.19
403	0.22
404	0.25
405	0.2
406	0.18
407	0.15
408	0.15
409	0.15
410	0.14
411	0.14
412	0.12
413	0.11
414	0.12
415	0.11
416	0.12
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.07
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.06
438	0.07
439	0.08
440	0.09
441	0.09
442	0.1
443	0.1
444	0.14
445	0.12
446	0.13
447	0.14
448	0.13
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.09
453	0.08
454	0.07
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.04
459	0.04
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.04
470	0.04
471	0.07
472	0.08
473	0.09
474	0.1
475	0.1
476	0.1
477	0.1
478	0.11
479	0.08
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.08
488	0.1
489	0.11
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.11
494	0.09
495	0.08
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.1
506	0.09
507	0.09
508	0.07
509	0.08
510	0.08
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.08
518	0.09
519	0.11
520	0.1
521	0.14
522	0.16
523	0.17
524	0.17
525	0.16
526	0.19
527	0.19
528	0.19
529	0.16
530	0.17
531	0.19
532	0.19
533	0.25
534	0.26
535	0.29
536	0.3
537	0.33
538	0.35
539	0.41
540	0.43
541	0.41
542	0.36
543	0.35
544	0.35
545	0.32
546	0.28
547	0.2
548	0.16
549	0.11
550	0.11
551	0.09
552	0.08
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.12
563	0.12
564	0.16
565	0.19
566	0.22
567	0.25
568	0.25
569	0.25
570	0.23
571	0.22
572	0.17
573	0.16
574	0.13
575	0.12
576	0.11
577	0.1
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.11
582	0.11
583	0.09
584	0.1
585	0.1
586	0.1
587	0.09
588	0.09
589	0.07
590	0.06
591	0.05
592	0.04
593	0.06
594	0.08
595	0.09
596	0.1
597	0.15
598	0.15
599	0.14
600	0.14
601	0.15
602	0.14
603	0.14
604	0.13
605	0.08
606	0.08
607	0.1
608	0.11
609	0.09
610	0.08
611	0.07
612	0.07
613	0.08
614	0.08
615	0.07
616	0.09
617	0.1
618	0.11
619	0.15
620	0.16
621	0.16
622	0.16
623	0.15
624	0.13
625	0.14
626	0.13
627	0.1
628	0.1
629	0.11
630	0.17
631	0.21
632	0.22
633	0.22
634	0.24
635	0.24
636	0.25
637	0.32
638	0.26
639	0.23
640	0.23
641	0.22
642	0.19
643	0.19
644	0.17
645	0.09
646	0.09
647	0.08
648	0.07
649	0.07
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.09
654	0.08
655	0.07
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.1
660	0.13
661	0.14
662	0.15
663	0.16
664	0.17
665	0.17
666	0.22
667	0.26
668	0.28
669	0.3
670	0.3
671	0.29
672	0.29
673	0.29
674	0.22
675	0.18
676	0.13
677	0.1
678	0.13
679	0.15
680	0.14
681	0.13
682	0.16
683	0.16
684	0.18
685	0.21
686	0.21
687	0.21
688	0.29
689	0.37
690	0.36
691	0.37
692	0.34
693	0.3
694	0.32
695	0.3
696	0.24
697	0.17
698	0.17
699	0.16
700	0.16
701	0.15
702	0.11
703	0.11
704	0.1
705	0.15
706	0.14
707	0.14
708	0.14
709	0.14
710	0.13
711	0.13
712	0.13
713	0.09
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.06
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.07
729	0.07
730	0.06
731	0.06
732	0.07
733	0.07
734	0.08
735	0.07
736	0.07
737	0.06
738	0.06
739	0.07
740	0.07
741	0.09
742	0.11
743	0.14
744	0.14
745	0.14
746	0.14
747	0.13
748	0.12
749	0.1
750	0.08
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.04
758	0.03
759	0.03
760	0.03
761	0.03
762	0.03
763	0.03
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.03
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.04
774	0.06
775	0.1
776	0.1
777	0.11
778	0.12
779	0.17
780	0.23
781	0.26
782	0.35
783	0.39
784	0.41
785	0.42
786	0.43
787	0.39
788	0.37
789	0.34
790	0.25
791	0.21
792	0.19
793	0.17
794	0.17
795	0.16
796	0.12
797	0.1
798	0.09
799	0.06
800	0.05
801	0.05
802	0.04
803	0.03
804	0.04
805	0.04
806	0.04
807	0.04
808	0.05
809	0.05
810	0.06
811	0.06
812	0.07
813	0.07
814	0.08
815	0.08
816	0.08
817	0.08
818	0.09
819	0.11
820	0.13
821	0.13
822	0.18
823	0.21
824	0.26
825	0.28
826	0.28
827	0.31
828	0.32
829	0.33
830	0.29
831	0.3
832	0.29
833	0.28
834	0.27
835	0.22
836	0.19
837	0.17
838	0.16
839	0.11
840	0.09
841	0.08
842	0.06
843	0.06
844	0.07
845	0.07
846	0.07
847	0.08
848	0.07
849	0.09
850	0.11
851	0.12
852	0.12
853	0.13
854	0.14
855	0.2
856	0.2
857	0.18
858	0.16
859	0.15
860	0.16
861	0.15
862	0.14
863	0.08
864	0.12
865	0.12
866	0.12
867	0.12
868	0.1
869	0.1
870	0.1
871	0.09
872	0.05
873	0.05
874	0.05
875	0.06
876	0.07
877	0.06
878	0.06
879	0.07
880	0.08
881	0.08
882	0.08
883	0.09
884	0.1
885	0.1
886	0.11
887	0.1
888	0.09
889	0.09
890	0.1
891	0.09
892	0.09
893	0.12
894	0.11
895	0.12
896	0.18
897	0.27
898	0.32
899	0.37
900	0.39
901	0.42
902	0.5
903	0.57
904	0.57
905	0.5
906	0.5
907	0.5
908	0.46
909	0.42
910	0.34
911	0.28
912	0.25
913	0.24
914	0.22
915	0.23
916	0.23
917	0.21
918	0.22
919	0.2
920	0.2
921	0.19
922	0.16
923	0.11
924	0.11
925	0.1
926	0.08
927	0.07
928	0.05
929	0.04
930	0.03
931	0.04
932	0.04
933	0.04
934	0.04
935	0.04
936	0.05
937	0.06
938	0.06
939	0.05
940	0.06
941	0.06
942	0.05
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.05
947	0.05
948	0.05
949	0.05
950	0.06
951	0.06
952	0.07
953	0.07
954	0.07
955	0.08
956	0.09
957	0.1
958	0.1
959	0.09
960	0.09
961	0.09
962	0.09
963	0.1
964	0.09
965	0.11
966	0.14
967	0.16
968	0.15
969	0.16
970	0.17
971	0.16
972	0.19
973	0.21
974	0.18
975	0.19
976	0.2
977	0.25
978	0.24
979	0.26
980	0.26
981	0.24
982	0.24
983	0.24
984	0.24
985	0.21
986	0.21
987	0.19
988	0.21
989	0.25
990	0.26
991	0.24
992	0.24
993	0.2
994	0.19
995	0.19
996	0.15
997	0.11
998	0.09
999	0.08
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.09
1003	0.11
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.1
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.09
1013	0.09
1014	0.07
1015	0.06
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.06
1020	0.06
1021	0.06
1022	0.06
1023	0.07
1024	0.08
1025	0.09
1026	0.09
1027	0.09
1028	0.1
1029	0.11
1030	0.12
1031	0.13
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.15
1035	0.19
1036	0.25
1037	0.28
1038	0.3
1039	0.34
1040	0.33
1041	0.35
1042	0.38
1043	0.41
1044	0.36
1045	0.32
1046	0.28
1047	0.23
1048	0.22
1049	0.22
1050	0.21
1051	0.15
1052	0.14
1053	0.14
1054	0.16
1055	0.18
1056	0.19
1057	0.18
1058	0.2
1059	0.26
1060	0.26
1061	0.31
1062	0.32
1063	0.32
1064	0.38
1065	0.4
1066	0.41
1067	0.36
1068	0.34
1069	0.3
1070	0.29
1071	0.28
1072	0.26
1073	0.25
1074	0.2
1075	0.24
1076	0.3
1077	0.32
1078	0.3
1079	0.33
1080	0.31
1081	0.35
1082	0.38
1083	0.34
1084	0.3
1085	0.31
1086	0.37
1087	0.39
1088	0.44
1089	0.43
1090	0.48
1091	0.51
1092	0.56
1093	0.54
1094	0.5
1095	0.47
1096	0.41
1097	0.38
1098	0.31
1099	0.26
1100	0.2
1101	0.2
1102	0.19
1103	0.17
1104	0.17
1105	0.18
1106	0.19
1107	0.2
1108	0.26
1109	0.3
1110	0.35
1111	0.36
1112	0.39
1113	0.4
1114	0.46
1115	0.5
1116	0.54
1117	0.56
1118	0.55
1119	0.57
1120	0.62
1121	0.58
1122	0.51
1123	0.46
1124	0.41
1125	0.36
1126	0.36
1127	0.42
1128	0.34
1129	0.38
1130	0.44
1131	0.52
1132	0.53
1133	0.61
1134	0.65
1135	0.66
1136	0.72
1137	0.69
1138	0.68
1139	0.65
1140	0.65
1141	0.59
1142	0.48
1143	0.39
1144	0.33
1145	0.3
1146	0.23
1147	0.16
1148	0.09
1149	0.07
1150	0.07
1151	0.08
1152	0.08
1153	0.08
1154	0.12
1155	0.13
1156	0.14
1157	0.23
1158	0.25
1159	0.25
1160	0.28
1161	0.3
1162	0.32
1163	0.38
1164	0.41
1165	0.41
1166	0.43
1167	0.44
1168	0.44
1169	0.43
1170	0.38
1171	0.31
1172	0.28
1173	0.2
1174	0.17
1175	0.17
1176	0.13
1177	0.12
1178	0.12
1179	0.12
1180	0.12
1181	0.1
1182	0.1
1183	0.06
1184	0.07
1185	0.07
1186	0.07
1187	0.06
1188	0.06
1189	0.1
1190	0.12
1191	0.13
1192	0.13
1193	0.14
1194	0.22
1195	0.3
1196	0.36
1197	0.37
1198	0.38
1199	0.48
1200	0.58
1201	0.64
1202	0.63
1203	0.63
1204	0.67
1205	0.72

A0A4U0W8H2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer