FuNGI

A0A4V5NBX6

Protein Details

Accession

A0A4V5NBX6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
437-459	SPEPVPPPVKKSKKAKAAAIEKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
443-476	PPVKKSKKAKAAAIEKPAEAATTEKKSKSKKAKA

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_mito 9, mito 4.5, nucl 4, extr 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MATHAAGAAAAAGSLRLEAVASSSSHSQQPDSEFIAFKASMRLPIAPVFASKGDNLFPGHDGGMDGVREVLAGWVMRQVSPPYLPPLRAVLLSFSPTPRFLHPAQRFRSSRVPFDSMYESGDESEEDQEEQEEGAGDAAKRTVWLKSLPMVDGSGFTLANVEWEGVGWRPRVGMKLVGTLTLASASHVSLLLHNLFNASIPVSHIPTDTWEWDPDFPVPPVVLERRNAALPHKQVVSDVVEKAKEAAKVDEEEEGGGADAATEELEKVAEEQEEAAKEEEEAEFAERGWWVHRKSREPLGGQDGRLEFTLVGLTTSNSLLSCTGSLLAEPFSASAIASLQSSLLTPLSASSTLLQSKLSTKGKKRARDDDEVEEVIGAGEDDDDDESDSDDSEEGLDADDDDRVGTGIPRGHGAQAIPRFNEDDDGSAASDSSRSPSPEPVPPPVKKSKKAKAAAIEKPAEAATTEKKSKSKKAKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.04
2	0.04
3	0.04
4	0.04
5	0.04
6	0.06
7	0.08
8	0.08
9	0.11
10	0.14
11	0.16
12	0.2
13	0.21
14	0.21
15	0.23
16	0.27
17	0.29
18	0.3
19	0.3
20	0.28
21	0.27
22	0.3
23	0.27
24	0.23
25	0.25
26	0.22
27	0.24
28	0.25
29	0.26
30	0.23
31	0.26
32	0.27
33	0.21
34	0.21
35	0.2
36	0.19
37	0.19
38	0.18
39	0.17
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.17
44	0.17
45	0.16
46	0.16
47	0.14
48	0.13
49	0.12
50	0.13
51	0.11
52	0.1
53	0.08
54	0.08
55	0.07
56	0.07
57	0.06
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.14
65	0.15
66	0.17
67	0.18
68	0.2
69	0.24
70	0.27
71	0.27
72	0.26
73	0.28
74	0.26
75	0.25
76	0.24
77	0.2
78	0.18
79	0.2
80	0.2
81	0.19
82	0.19
83	0.2
84	0.22
85	0.21
86	0.25
87	0.25
88	0.34
89	0.41
90	0.49
91	0.52
92	0.6
93	0.59
94	0.59
95	0.66
96	0.59
97	0.57
98	0.54
99	0.53
100	0.43
101	0.46
102	0.44
103	0.35
104	0.33
105	0.26
106	0.21
107	0.17
108	0.17
109	0.13
110	0.1
111	0.11
112	0.1
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.08
118	0.07
119	0.06
120	0.05
121	0.06
122	0.07
123	0.06
124	0.06
125	0.07
126	0.06
127	0.07
128	0.08
129	0.09
130	0.1
131	0.12
132	0.13
133	0.17
134	0.19
135	0.19
136	0.19
137	0.18
138	0.16
139	0.15
140	0.14
141	0.1
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.06
146	0.07
147	0.06
148	0.06
149	0.04
150	0.05
151	0.06
152	0.06
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.11
158	0.13
159	0.14
160	0.17
161	0.15
162	0.2
163	0.2
164	0.19
165	0.18
166	0.16
167	0.15
168	0.11
169	0.1
170	0.05
171	0.06
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.08
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.06
186	0.04
187	0.06
188	0.07
189	0.08
190	0.08
191	0.09
192	0.08
193	0.11
194	0.12
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.14
199	0.14
200	0.15
201	0.14
202	0.14
203	0.12
204	0.11
205	0.1
206	0.09
207	0.11
208	0.13
209	0.14
210	0.13
211	0.14
212	0.15
213	0.16
214	0.17
215	0.17
216	0.2
217	0.2
218	0.22
219	0.21
220	0.2
221	0.19
222	0.2
223	0.2
224	0.16
225	0.16
226	0.14
227	0.14
228	0.13
229	0.14
230	0.15
231	0.13
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.13
236	0.14
237	0.14
238	0.11
239	0.1
240	0.09
241	0.08
242	0.06
243	0.05
244	0.04
245	0.03
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.02
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.07
260	0.07
261	0.09
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.09
266	0.08
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.1
276	0.15
277	0.16
278	0.23
279	0.28
280	0.33
281	0.37
282	0.45
283	0.48
284	0.45
285	0.46
286	0.48
287	0.46
288	0.41
289	0.41
290	0.33
291	0.28
292	0.26
293	0.22
294	0.13
295	0.1
296	0.11
297	0.06
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.05
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.12
339	0.13
340	0.13
341	0.13
342	0.13
343	0.15
344	0.23
345	0.3
346	0.35
347	0.41
348	0.5
349	0.58
350	0.66
351	0.71
352	0.74
353	0.73
354	0.74
355	0.72
356	0.69
357	0.66
358	0.57
359	0.49
360	0.38
361	0.31
362	0.22
363	0.16
364	0.09
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.09
394	0.12
395	0.12
396	0.15
397	0.16
398	0.17
399	0.18
400	0.18
401	0.23
402	0.27
403	0.31
404	0.3
405	0.31
406	0.32
407	0.31
408	0.33
409	0.26
410	0.21
411	0.18
412	0.19
413	0.18
414	0.16
415	0.15
416	0.11
417	0.12
418	0.1
419	0.11
420	0.13
421	0.16
422	0.18
423	0.25
424	0.3
425	0.37
426	0.41
427	0.47
428	0.53
429	0.54
430	0.59
431	0.63
432	0.68
433	0.7
434	0.76
435	0.76
436	0.77
437	0.81
438	0.81
439	0.8
440	0.81
441	0.8
442	0.78
443	0.72
444	0.61
445	0.56
446	0.48
447	0.38
448	0.29
449	0.25
450	0.23
451	0.28
452	0.34
453	0.37
454	0.45
455	0.52
456	0.62

A0A4V5NBX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer