Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W5A6

Protein Details
Accession A0A4U0W5A6    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
388-412GDLNQKRKKELKQAKLKKRIARKEABasic
804-833NLENPTKRPRSTPRVRKKPYHALLNPPPDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-70KRVVKEAK
389-413DLNQKRKKELKQAKLKKRIARKEAE
813-820RSTPRVRK
Subcellular Location(s) cyto 14.5, nucl 11, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
IPR003617  TFIIS/CRSP70_N_sub  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PF08711  Med26  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS51319  TFIIS_N  
CDD cd00183  TFIIS_I  
Amino Acid Sequences MLTAESVKSLGKALLAAHEKNKSEECLKLLRDLEHGVKPTEELLKETKIGMTVNKLARKSGDKRVVKEAKRVVGKWKDVLGVTDQKGNGKDAAKKKDGDSAPQTTSNSPDTVPQVTSASLAADGSPSTTEPAEAAAVVQRRKRSESPTPPNEMGDTSPPACKKPKTDNGESETTPEPAAVKNDDKNKDKAARTHKSDKVDFATRLTAAAPRCPQKAYKNRLRCCESLYDALASESEATSAVLAERALAVENATWDKAEKDKGKEGALAAYTPHMRSLYQHLRSAKTPSLRQDLVSGTLSAQQLVDMSPADFRTAEQKALDEAVQQQLTRAACFSSMSVAEDMRQSVMWRGGGRPASGHERDPLSTGKKQTMPLKAADISRVRNKVVRGDLNQKRKKELKQAKLKKRIARKEAEARGETVERGIPRTIENTREWLGDEDGEYADPRTRPAPVSVNEETGDVTVDMGSLSNLFPTNAAAPEASTSELPPPEPKVLITTSPGKPPTPHTRGFLEDLQALLGGKTRADVVPRRSPKFELGRVARWARKRGYGAIMVVGEDHAKPTSLTVSLLPYGPTAHFRLTGITLCKDIPGHAKPTSHPPELVLNHFATPLGLSLATLLSQLFLPPSQAAKLQRQGFQGRQVVLAQNSRDFVFVRRYRYMFALKSHRLGKTKKQSDVARITEPNPEDEIDDTVKTRFQEIGPQFTLKMRWIRRGQLGETGHEREAREKHEAATGEQATEYGERAEGGDGEDDELAGGGAEDEEGMAIDDEDIHDEEEDDDAEAEAAAKKAIGFDETDAAGQPNFTNLENPTKRPRSTPRVRKKPYHALLNPPPDSDSDSPEPEAVPLPMAGKKKNPELKSAFDTVGHTWHAGKGEGGVREGAKRREWNWDARMQVSRRKFFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.24
3 0.27
4 0.31
5 0.37
6 0.38
7 0.41
8 0.44
9 0.4
10 0.38
11 0.39
12 0.38
13 0.39
14 0.39
15 0.42
16 0.42
17 0.39
18 0.39
19 0.4
20 0.41
21 0.39
22 0.4
23 0.34
24 0.31
25 0.3
26 0.3
27 0.32
28 0.27
29 0.25
30 0.26
31 0.28
32 0.29
33 0.29
34 0.27
35 0.22
36 0.23
37 0.22
38 0.24
39 0.29
40 0.35
41 0.4
42 0.39
43 0.4
44 0.43
45 0.49
46 0.49
47 0.52
48 0.55
49 0.56
50 0.6
51 0.69
52 0.74
53 0.69
54 0.73
55 0.69
56 0.68
57 0.68
58 0.66
59 0.65
60 0.65
61 0.65
62 0.6
63 0.56
64 0.51
65 0.44
66 0.44
67 0.4
68 0.39
69 0.36
70 0.37
71 0.34
72 0.35
73 0.36
74 0.35
75 0.34
76 0.3
77 0.37
78 0.41
79 0.49
80 0.5
81 0.51
82 0.51
83 0.55
84 0.53
85 0.52
86 0.5
87 0.48
88 0.47
89 0.48
90 0.49
91 0.41
92 0.42
93 0.37
94 0.31
95 0.25
96 0.25
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.21
101 0.2
102 0.19
103 0.19
104 0.16
105 0.13
106 0.1
107 0.1
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.16
124 0.2
125 0.24
126 0.28
127 0.31
128 0.38
129 0.43
130 0.46
131 0.53
132 0.6
133 0.66
134 0.69
135 0.73
136 0.68
137 0.64
138 0.57
139 0.48
140 0.39
141 0.32
142 0.29
143 0.23
144 0.27
145 0.26
146 0.29
147 0.34
148 0.36
149 0.39
150 0.46
151 0.54
152 0.57
153 0.65
154 0.69
155 0.69
156 0.7
157 0.63
158 0.56
159 0.48
160 0.41
161 0.32
162 0.24
163 0.19
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.2
168 0.25
169 0.34
170 0.41
171 0.45
172 0.47
173 0.52
174 0.55
175 0.56
176 0.59
177 0.6
178 0.62
179 0.66
180 0.72
181 0.7
182 0.7
183 0.68
184 0.64
185 0.6
186 0.57
187 0.5
188 0.42
189 0.39
190 0.32
191 0.29
192 0.25
193 0.23
194 0.17
195 0.22
196 0.26
197 0.27
198 0.29
199 0.31
200 0.36
201 0.42
202 0.51
203 0.55
204 0.6
205 0.66
206 0.71
207 0.78
208 0.78
209 0.69
210 0.63
211 0.59
212 0.53
213 0.46
214 0.41
215 0.33
216 0.27
217 0.25
218 0.21
219 0.15
220 0.12
221 0.08
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.13
244 0.2
245 0.24
246 0.28
247 0.34
248 0.36
249 0.37
250 0.38
251 0.35
252 0.31
253 0.26
254 0.21
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.11
262 0.13
263 0.22
264 0.29
265 0.31
266 0.37
267 0.39
268 0.41
269 0.43
270 0.46
271 0.42
272 0.38
273 0.38
274 0.39
275 0.43
276 0.4
277 0.39
278 0.36
279 0.33
280 0.3
281 0.27
282 0.21
283 0.15
284 0.18
285 0.18
286 0.15
287 0.13
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.13
300 0.14
301 0.16
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.11
308 0.11
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.13
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.09
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.16
338 0.18
339 0.17
340 0.16
341 0.17
342 0.22
343 0.23
344 0.23
345 0.21
346 0.21
347 0.22
348 0.23
349 0.24
350 0.22
351 0.24
352 0.25
353 0.27
354 0.28
355 0.32
356 0.36
357 0.39
358 0.37
359 0.34
360 0.35
361 0.33
362 0.31
363 0.32
364 0.28
365 0.26
366 0.3
367 0.31
368 0.29
369 0.29
370 0.29
371 0.3
372 0.33
373 0.34
374 0.32
375 0.4
376 0.47
377 0.55
378 0.6
379 0.55
380 0.56
381 0.58
382 0.59
383 0.6
384 0.62
385 0.61
386 0.67
387 0.76
388 0.8
389 0.84
390 0.86
391 0.81
392 0.81
393 0.81
394 0.77
395 0.71
396 0.68
397 0.67
398 0.66
399 0.65
400 0.55
401 0.47
402 0.42
403 0.37
404 0.29
405 0.2
406 0.16
407 0.11
408 0.13
409 0.12
410 0.1
411 0.1
412 0.14
413 0.15
414 0.17
415 0.17
416 0.19
417 0.2
418 0.19
419 0.19
420 0.17
421 0.16
422 0.12
423 0.12
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.13
436 0.18
437 0.18
438 0.25
439 0.25
440 0.26
441 0.25
442 0.24
443 0.21
444 0.16
445 0.14
446 0.07
447 0.06
448 0.04
449 0.04
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.1
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.14
481 0.15
482 0.19
483 0.2
484 0.24
485 0.25
486 0.23
487 0.23
488 0.29
489 0.36
490 0.35
491 0.36
492 0.35
493 0.36
494 0.38
495 0.4
496 0.35
497 0.27
498 0.22
499 0.19
500 0.16
501 0.14
502 0.11
503 0.07
504 0.08
505 0.06
506 0.05
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.11
511 0.16
512 0.21
513 0.3
514 0.37
515 0.4
516 0.41
517 0.43
518 0.46
519 0.48
520 0.46
521 0.45
522 0.42
523 0.43
524 0.47
525 0.5
526 0.47
527 0.45
528 0.47
529 0.41
530 0.42
531 0.4
532 0.38
533 0.37
534 0.35
535 0.3
536 0.26
537 0.24
538 0.18
539 0.16
540 0.13
541 0.1
542 0.07
543 0.07
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.12
560 0.12
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.14
565 0.14
566 0.17
567 0.16
568 0.15
569 0.16
570 0.15
571 0.16
572 0.14
573 0.14
574 0.17
575 0.17
576 0.21
577 0.23
578 0.24
579 0.25
580 0.35
581 0.4
582 0.36
583 0.33
584 0.3
585 0.35
586 0.36
587 0.38
588 0.3
589 0.25
590 0.23
591 0.23
592 0.21
593 0.13
594 0.11
595 0.09
596 0.06
597 0.05
598 0.04
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.04
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.07
611 0.08
612 0.09
613 0.13
614 0.17
615 0.22
616 0.3
617 0.33
618 0.36
619 0.4
620 0.45
621 0.43
622 0.47
623 0.45
624 0.39
625 0.36
626 0.33
627 0.31
628 0.29
629 0.3
630 0.23
631 0.2
632 0.21
633 0.2
634 0.19
635 0.17
636 0.17
637 0.23
638 0.26
639 0.31
640 0.35
641 0.36
642 0.37
643 0.4
644 0.44
645 0.37
646 0.4
647 0.43
648 0.41
649 0.45
650 0.48
651 0.49
652 0.5
653 0.52
654 0.55
655 0.57
656 0.62
657 0.62
658 0.65
659 0.64
660 0.66
661 0.7
662 0.64
663 0.59
664 0.54
665 0.49
666 0.48
667 0.44
668 0.37
669 0.3
670 0.26
671 0.21
672 0.19
673 0.21
674 0.16
675 0.16
676 0.15
677 0.14
678 0.16
679 0.15
680 0.16
681 0.15
682 0.14
683 0.23
684 0.24
685 0.31
686 0.31
687 0.32
688 0.31
689 0.31
690 0.33
691 0.28
692 0.34
693 0.3
694 0.37
695 0.41
696 0.46
697 0.52
698 0.55
699 0.52
700 0.52
701 0.5
702 0.45
703 0.45
704 0.43
705 0.37
706 0.34
707 0.33
708 0.31
709 0.33
710 0.33
711 0.34
712 0.31
713 0.31
714 0.33
715 0.34
716 0.29
717 0.33
718 0.3
719 0.24
720 0.23
721 0.22
722 0.18
723 0.17
724 0.16
725 0.08
726 0.08
727 0.07
728 0.08
729 0.09
730 0.08
731 0.08
732 0.09
733 0.09
734 0.1
735 0.09
736 0.08
737 0.08
738 0.07
739 0.06
740 0.04
741 0.04
742 0.03
743 0.03
744 0.03
745 0.03
746 0.03
747 0.03
748 0.03
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.04
753 0.04
754 0.05
755 0.07
756 0.07
757 0.08
758 0.07
759 0.08
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.07
764 0.07
765 0.07
766 0.07
767 0.06
768 0.07
769 0.07
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.08
775 0.09
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.13
780 0.14
781 0.14
782 0.13
783 0.14
784 0.12
785 0.12
786 0.1
787 0.1
788 0.11
789 0.11
790 0.14
791 0.15
792 0.26
793 0.3
794 0.35
795 0.43
796 0.49
797 0.5
798 0.56
799 0.63
800 0.63
801 0.71
802 0.77
803 0.78
804 0.82
805 0.89
806 0.9
807 0.9
808 0.9
809 0.87
810 0.87
811 0.81
812 0.8
813 0.81
814 0.81
815 0.73
816 0.62
817 0.55
818 0.45
819 0.47
820 0.38
821 0.36
822 0.31
823 0.32
824 0.32
825 0.32
826 0.31
827 0.25
828 0.25
829 0.18
830 0.15
831 0.13
832 0.14
833 0.18
834 0.23
835 0.25
836 0.31
837 0.36
838 0.45
839 0.54
840 0.53
841 0.58
842 0.59
843 0.63
844 0.61
845 0.6
846 0.51
847 0.43
848 0.44
849 0.36
850 0.34
851 0.28
852 0.23
853 0.2
854 0.22
855 0.22
856 0.19
857 0.18
858 0.19
859 0.23
860 0.23
861 0.23
862 0.23
863 0.23
864 0.29
865 0.36
866 0.36
867 0.39
868 0.44
869 0.45
870 0.53
871 0.56
872 0.59
873 0.59
874 0.61
875 0.57
876 0.56
877 0.62
878 0.56
879 0.61
880 0.61