Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W619

Protein Details
Accession A0A4U0W619    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-364RQEINKKRKSTERRAKREIRSANBasic
690-712DEDKARKRRKVEAREARKRKLAABasic
890-964RADREKFGSHKHKKLNEKAHSTTNAEKKRKKNFMMLSHSYQVTSKKRMSLHQKSRKMLNHVKHQKSGRRRNGEHKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-371INKKRKSTERRAKREIRSANVRRRAKE
693-709KARKRRKVEAREARKRK
889-920GRADREKFGSHKHKKLNEKAHSTTNAEKKRKK
935-964KRMSLHQKSRKMLNHVKHQKSGRRRNGEHK
Subcellular Location(s) mito 18.5, mito_nucl 12.499, cyto_mito 12.166, nucl 5, cyto_nucl 4.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
Gene Ontology GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MSVAVGSAARPAASVAGSRASSSRSRNTNGPSSSGLRDKTQRGALITSSLPMLQNLIKRAPESYAEEFQVQWARFGSQVKIVQLGLGGAKADEEQLKEVTNFVAHLYPKTTVSLPSVLSGLLLSSAPTASTSAASTAAGPAGVSNGISGGGVQLSPETRKTMMQGLVLLRRREVITGVELLKTLFPLLSITTSPNLRTFILKTIIGDIKNANLKTKATKLNSMVQGLLMAMIERGIAAEQERVGTGVKASRRGASTGKDGKVVGGREAMWAVKVATELWRKNVWRGDKMTVKVVARACFHPDTKVQSAAMHFFLVTPDANAEDVDSDVEEAAGPDIMAVKHRQEINKKRKSTERRAKREIRSANVRRRAKEIAAKEPQTNFSALQQLDDAYSFGERLYEQLVKYDKAYTLEHKILIMQLFGRVCGAFKLTVPAFYSYILKYLTHHQLEITKILVAVAQSVHDQIPAGSFNEDTADMDGTTRAQQEQDDPLYPVLRKLANEFVHSGVSAEVNAAGLNAITEICRRQPLAMSPDLLQDLVEYRKSKDKGVMVAARGLLSFYREVDPTMLKRRDWGIRATKDAIEEKRGGADASAVAEGAADKRRRLKFGEDRETVTGIEGLDLFAKHLAEQAEQKAEDGEEGAEDAEDDDEAGWEGWDVEDDSDEDSDSSGGWINVSDEDSDLELSDSDDDDEDKARKRRKVEAREARKRKLAAVAEEDEEDAPTGKKVVDVAGTKADDKISFGDDGDDSGSDEEEDSDDEDEDDSEDESEDEEASPRKKARTQEDQEEYEMSLSRANKVLEGTTFADIATIKILTPADFAKINELRTEAAEADAKSGGGAAARRKLAALAAARKANHGEQESFLDEVDILGAVKKAKNNYEERMAKIAEGRADREKFGSHKHKKLNEKAHSTTNAEKKRKKNFMMLSHSYQVTSKKRMSLHQKSRKMLNHVKHQKSGRRRNGEHK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.15
4 0.16
5 0.17
6 0.18
7 0.2
8 0.25
9 0.3
10 0.37
11 0.39
12 0.44
13 0.5
14 0.55
15 0.6
16 0.57
17 0.55
18 0.51
19 0.48
20 0.49
21 0.49
22 0.44
23 0.41
24 0.46
25 0.46
26 0.48
27 0.5
28 0.48
29 0.44
30 0.44
31 0.39
32 0.36
33 0.32
34 0.26
35 0.22
36 0.2
37 0.17
38 0.14
39 0.16
40 0.16
41 0.2
42 0.23
43 0.26
44 0.27
45 0.27
46 0.29
47 0.29
48 0.29
49 0.32
50 0.34
51 0.34
52 0.34
53 0.34
54 0.33
55 0.34
56 0.37
57 0.3
58 0.26
59 0.23
60 0.22
61 0.24
62 0.26
63 0.24
64 0.25
65 0.29
66 0.28
67 0.3
68 0.28
69 0.26
70 0.23
71 0.22
72 0.15
73 0.11
74 0.1
75 0.07
76 0.08
77 0.07
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.17
84 0.16
85 0.17
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.16
91 0.15
92 0.17
93 0.19
94 0.19
95 0.2
96 0.22
97 0.22
98 0.19
99 0.22
100 0.23
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.17
105 0.16
106 0.13
107 0.1
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.08
142 0.1
143 0.12
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.19
148 0.24
149 0.25
150 0.24
151 0.27
152 0.28
153 0.35
154 0.4
155 0.38
156 0.32
157 0.32
158 0.31
159 0.28
160 0.25
161 0.19
162 0.16
163 0.2
164 0.2
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.16
169 0.14
170 0.12
171 0.07
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.14
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.2
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.23
187 0.25
188 0.24
189 0.22
190 0.26
191 0.29
192 0.27
193 0.26
194 0.21
195 0.23
196 0.28
197 0.28
198 0.25
199 0.23
200 0.25
201 0.28
202 0.35
203 0.39
204 0.37
205 0.43
206 0.43
207 0.5
208 0.52
209 0.48
210 0.41
211 0.32
212 0.29
213 0.22
214 0.19
215 0.1
216 0.06
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.09
233 0.12
234 0.14
235 0.19
236 0.21
237 0.23
238 0.24
239 0.27
240 0.29
241 0.28
242 0.35
243 0.37
244 0.37
245 0.36
246 0.34
247 0.33
248 0.34
249 0.32
250 0.24
251 0.18
252 0.17
253 0.16
254 0.17
255 0.15
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.07
260 0.08
261 0.07
262 0.13
263 0.2
264 0.21
265 0.24
266 0.3
267 0.3
268 0.36
269 0.41
270 0.4
271 0.4
272 0.43
273 0.47
274 0.47
275 0.48
276 0.47
277 0.46
278 0.41
279 0.39
280 0.39
281 0.35
282 0.31
283 0.31
284 0.32
285 0.3
286 0.3
287 0.28
288 0.28
289 0.31
290 0.31
291 0.31
292 0.27
293 0.25
294 0.26
295 0.25
296 0.23
297 0.17
298 0.14
299 0.12
300 0.11
301 0.11
302 0.09
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.05
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.03
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.13
328 0.16
329 0.22
330 0.3
331 0.41
332 0.51
333 0.59
334 0.61
335 0.62
336 0.69
337 0.74
338 0.75
339 0.76
340 0.76
341 0.76
342 0.82
343 0.87
344 0.83
345 0.83
346 0.77
347 0.73
348 0.73
349 0.73
350 0.73
351 0.73
352 0.72
353 0.64
354 0.63
355 0.59
356 0.52
357 0.51
358 0.45
359 0.45
360 0.47
361 0.48
362 0.46
363 0.44
364 0.42
365 0.36
366 0.33
367 0.24
368 0.18
369 0.22
370 0.19
371 0.17
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.11
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.08
385 0.1
386 0.1
387 0.14
388 0.16
389 0.16
390 0.17
391 0.18
392 0.16
393 0.17
394 0.19
395 0.18
396 0.21
397 0.22
398 0.22
399 0.2
400 0.19
401 0.18
402 0.16
403 0.14
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.06
414 0.06
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.13
419 0.14
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.11
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.16
429 0.22
430 0.21
431 0.21
432 0.2
433 0.22
434 0.23
435 0.23
436 0.17
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.09
472 0.12
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.13
484 0.19
485 0.19
486 0.21
487 0.21
488 0.2
489 0.19
490 0.19
491 0.16
492 0.09
493 0.08
494 0.06
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.02
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.04
507 0.05
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.1
513 0.14
514 0.18
515 0.19
516 0.2
517 0.19
518 0.2
519 0.2
520 0.18
521 0.13
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.11
526 0.11
527 0.12
528 0.2
529 0.21
530 0.22
531 0.25
532 0.27
533 0.27
534 0.32
535 0.34
536 0.27
537 0.28
538 0.27
539 0.22
540 0.2
541 0.17
542 0.1
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.11
550 0.13
551 0.15
552 0.24
553 0.25
554 0.24
555 0.26
556 0.3
557 0.33
558 0.33
559 0.37
560 0.37
561 0.38
562 0.42
563 0.42
564 0.39
565 0.36
566 0.39
567 0.33
568 0.28
569 0.25
570 0.22
571 0.2
572 0.2
573 0.17
574 0.12
575 0.11
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.06
584 0.12
585 0.12
586 0.14
587 0.22
588 0.25
589 0.28
590 0.31
591 0.39
592 0.42
593 0.52
594 0.6
595 0.54
596 0.55
597 0.54
598 0.52
599 0.42
600 0.33
601 0.23
602 0.13
603 0.11
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.09
613 0.09
614 0.1
615 0.13
616 0.15
617 0.17
618 0.17
619 0.17
620 0.15
621 0.14
622 0.12
623 0.1
624 0.08
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.05
644 0.04
645 0.05
646 0.05
647 0.06
648 0.06
649 0.07
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.08
667 0.07
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.07
677 0.1
678 0.12
679 0.18
680 0.25
681 0.32
682 0.37
683 0.41
684 0.5
685 0.58
686 0.66
687 0.71
688 0.75
689 0.79
690 0.85
691 0.9
692 0.85
693 0.81
694 0.71
695 0.63
696 0.6
697 0.53
698 0.47
699 0.45
700 0.42
701 0.37
702 0.36
703 0.34
704 0.25
705 0.21
706 0.16
707 0.11
708 0.08
709 0.07
710 0.08
711 0.07
712 0.07
713 0.08
714 0.09
715 0.13
716 0.15
717 0.17
718 0.21
719 0.22
720 0.22
721 0.22
722 0.22
723 0.17
724 0.17
725 0.16
726 0.13
727 0.12
728 0.12
729 0.13
730 0.12
731 0.12
732 0.12
733 0.1
734 0.09
735 0.09
736 0.09
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.06
741 0.07
742 0.07
743 0.08
744 0.08
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.08
749 0.08
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.06
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.09
759 0.12
760 0.13
761 0.18
762 0.21
763 0.25
764 0.3
765 0.37
766 0.44
767 0.52
768 0.58
769 0.63
770 0.67
771 0.66
772 0.63
773 0.56
774 0.47
775 0.37
776 0.3
777 0.2
778 0.17
779 0.15
780 0.16
781 0.18
782 0.18
783 0.18
784 0.19
785 0.2
786 0.17
787 0.21
788 0.21
789 0.18
790 0.18
791 0.16
792 0.16
793 0.14
794 0.13
795 0.11
796 0.08
797 0.07
798 0.1
799 0.1
800 0.1
801 0.11
802 0.12
803 0.13
804 0.15
805 0.15
806 0.21
807 0.24
808 0.24
809 0.24
810 0.25
811 0.23
812 0.22
813 0.24
814 0.16
815 0.15
816 0.18
817 0.16
818 0.17
819 0.16
820 0.15
821 0.12
822 0.12
823 0.1
824 0.09
825 0.12
826 0.15
827 0.2
828 0.21
829 0.22
830 0.22
831 0.22
832 0.21
833 0.24
834 0.26
835 0.27
836 0.32
837 0.36
838 0.36
839 0.37
840 0.39
841 0.36
842 0.35
843 0.33
844 0.29
845 0.27
846 0.32
847 0.32
848 0.29
849 0.26
850 0.2
851 0.15
852 0.13
853 0.11
854 0.07
855 0.05
856 0.06
857 0.08
858 0.1
859 0.13
860 0.17
861 0.22
862 0.28
863 0.35
864 0.41
865 0.45
866 0.53
867 0.55
868 0.56
869 0.56
870 0.51
871 0.44
872 0.42
873 0.4
874 0.35
875 0.33
876 0.33
877 0.36
878 0.38
879 0.38
880 0.36
881 0.37
882 0.34
883 0.42
884 0.49
885 0.5
886 0.57
887 0.66
888 0.73
889 0.79
890 0.86
891 0.86
892 0.85
893 0.84
894 0.8
895 0.78
896 0.75
897 0.7
898 0.68
899 0.68
900 0.68
901 0.69
902 0.73
903 0.74
904 0.79
905 0.84
906 0.81
907 0.81
908 0.8
909 0.81
910 0.82
911 0.8
912 0.76
913 0.71
914 0.66
915 0.56
916 0.5
917 0.48
918 0.46
919 0.46
920 0.43
921 0.44
922 0.48
923 0.56
924 0.64
925 0.67
926 0.71
927 0.74
928 0.79
929 0.79
930 0.84
931 0.83
932 0.82
933 0.8
934 0.78
935 0.79
936 0.8
937 0.82
938 0.81
939 0.82
940 0.82
941 0.83
942 0.85
943 0.85
944 0.85