Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VNF1

Protein Details
Accession A0A4U0VNF1    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-278ERRSSRRYDSRSPPPPRRARSPSRSRSRSPBasic
616-635YDQIAKKCRHVQPKLQKWIAHydrophilic
872-891APAPPVPPKQQQQQQQKDAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-283GERRSSRRYDSRSPPPPRRARSPSRSRSRSPVRRSR
298-307GRSRSPAGGR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR004152  GAT_dom  
IPR038425  GAT_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF03127  GAT  
PF00076  RRM_1  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50909  GAT  
PS50102  RRM  
PS50179  VHS  
CDD cd14235  GAT_GGA_fungi  
cd16998  VHS_GGA_fungi  
Amino Acid Sequences MADDPYAAEQPRGGHLRDNYARPDDREPYHADPRDSAPPPPRSAPVAPLRPRGAPVPQPSNVLGVFGLSIRTQDRDLHDYFGANGRRVEKALVVYDQRSGRSRGFGFVTMGSVEEAEAAIAELNGIDLHGRRIRVDFSATQRPHDPTPGEYRGPRRPDDDYDPPRGGGYPPPPGGDRWASRGDPYRGGGGGYGGGGYGGGGRGGGYDDPYGGRSYRAPLPSRGEDDRYGYSSGGRSSRHYDDDDGRGGERRSSRRYDSRSPPPPRRARSPSRSRSRSPVRRSRGDYADEDGINGRGGGRSRSPAGGRLPPPPRDRSLTPTARDSWATTSSPSPPPSAARFGQPPTAKETLVAYIERACDPSLHEPNLSLDLEIADLINSKKANTPREAAVEVVRLINHRNTHVAMLALHASPSPRTVHGLVHLLDILVKNCGYPFHLQISTKEFLNELVRRFPERPPTFPPPPMKKILELVHEWKNTICVTSKHKEDLVHIRDMHRLLSYKGYRFPDFDRRAVQVLNPTENLQTPDELEEEDREAQAAASLLSCKLQELIRRGTPKDLAAAQELMKIMAGAEPEKKPNYEAQVSKELDRVQQRVLLLNEMLNNAAPKERFVEGDAYDQIAKKCRHVQPKLQKWIADSAESNPDAMDRLLLINDLINNVIKRYDAFKAGDRSATAEIDPALSSGGAGSKARAQAQQVSLIDFDDDDAFAAPTPPAVSTPSAMTTANNNAGPSNPLDDLASLSLGGGGVGGGLGSGQSQQTNGGGSGGSLFDLNAAFGAPAPAQQQQQQRPFGSNTSSSMMMPSWANGSASNAPMGSVRPMQQQQPVAGTFFSNPAVRYSSPSGSGSPSPSPSPSVTTFGGGSSSGLGSISLGAPAPPVPPKQQQQQQQKDAFADLLGDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.42
4 0.46
5 0.5
6 0.48
7 0.52
8 0.55
9 0.52
10 0.57
11 0.53
12 0.5
13 0.5
14 0.51
15 0.51
16 0.57
17 0.57
18 0.52
19 0.49
20 0.5
21 0.54
22 0.5
23 0.49
24 0.48
25 0.5
26 0.53
27 0.53
28 0.52
29 0.49
30 0.49
31 0.51
32 0.51
33 0.55
34 0.56
35 0.59
36 0.59
37 0.55
38 0.55
39 0.51
40 0.48
41 0.47
42 0.49
43 0.49
44 0.48
45 0.49
46 0.48
47 0.47
48 0.4
49 0.32
50 0.23
51 0.16
52 0.14
53 0.11
54 0.12
55 0.08
56 0.1
57 0.11
58 0.13
59 0.15
60 0.19
61 0.24
62 0.29
63 0.3
64 0.32
65 0.31
66 0.3
67 0.3
68 0.33
69 0.31
70 0.28
71 0.3
72 0.28
73 0.29
74 0.3
75 0.3
76 0.24
77 0.24
78 0.25
79 0.27
80 0.28
81 0.27
82 0.32
83 0.33
84 0.33
85 0.33
86 0.34
87 0.31
88 0.34
89 0.35
90 0.33
91 0.34
92 0.32
93 0.31
94 0.28
95 0.27
96 0.2
97 0.19
98 0.15
99 0.12
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.11
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.19
120 0.21
121 0.22
122 0.27
123 0.27
124 0.31
125 0.41
126 0.41
127 0.42
128 0.45
129 0.46
130 0.43
131 0.44
132 0.38
133 0.32
134 0.41
135 0.43
136 0.42
137 0.44
138 0.49
139 0.52
140 0.55
141 0.53
142 0.49
143 0.48
144 0.51
145 0.54
146 0.57
147 0.54
148 0.56
149 0.54
150 0.5
151 0.46
152 0.4
153 0.33
154 0.3
155 0.28
156 0.29
157 0.29
158 0.31
159 0.31
160 0.31
161 0.35
162 0.34
163 0.32
164 0.29
165 0.33
166 0.31
167 0.34
168 0.42
169 0.4
170 0.37
171 0.37
172 0.34
173 0.29
174 0.28
175 0.25
176 0.17
177 0.13
178 0.1
179 0.08
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.15
202 0.21
203 0.27
204 0.29
205 0.32
206 0.39
207 0.42
208 0.46
209 0.45
210 0.43
211 0.39
212 0.39
213 0.37
214 0.32
215 0.29
216 0.24
217 0.22
218 0.2
219 0.22
220 0.22
221 0.2
222 0.21
223 0.26
224 0.3
225 0.31
226 0.32
227 0.33
228 0.33
229 0.36
230 0.36
231 0.31
232 0.28
233 0.28
234 0.26
235 0.27
236 0.29
237 0.31
238 0.34
239 0.38
240 0.45
241 0.5
242 0.57
243 0.62
244 0.64
245 0.68
246 0.73
247 0.77
248 0.8
249 0.81
250 0.83
251 0.79
252 0.8
253 0.79
254 0.79
255 0.8
256 0.81
257 0.81
258 0.83
259 0.83
260 0.77
261 0.78
262 0.79
263 0.79
264 0.78
265 0.78
266 0.75
267 0.77
268 0.79
269 0.76
270 0.71
271 0.65
272 0.57
273 0.5
274 0.46
275 0.37
276 0.31
277 0.25
278 0.2
279 0.16
280 0.14
281 0.1
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.13
287 0.15
288 0.19
289 0.19
290 0.22
291 0.25
292 0.31
293 0.31
294 0.37
295 0.41
296 0.45
297 0.49
298 0.48
299 0.48
300 0.46
301 0.46
302 0.45
303 0.49
304 0.48
305 0.45
306 0.45
307 0.44
308 0.41
309 0.39
310 0.33
311 0.27
312 0.24
313 0.22
314 0.2
315 0.19
316 0.22
317 0.25
318 0.25
319 0.23
320 0.21
321 0.23
322 0.25
323 0.28
324 0.25
325 0.24
326 0.26
327 0.26
328 0.32
329 0.31
330 0.29
331 0.3
332 0.31
333 0.27
334 0.24
335 0.24
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.09
346 0.12
347 0.19
348 0.22
349 0.22
350 0.21
351 0.21
352 0.22
353 0.25
354 0.22
355 0.14
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.12
368 0.17
369 0.22
370 0.23
371 0.26
372 0.26
373 0.29
374 0.29
375 0.25
376 0.21
377 0.18
378 0.16
379 0.14
380 0.12
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.13
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.1
403 0.11
404 0.12
405 0.14
406 0.17
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.09
421 0.1
422 0.14
423 0.16
424 0.17
425 0.19
426 0.24
427 0.23
428 0.21
429 0.19
430 0.16
431 0.15
432 0.2
433 0.21
434 0.16
435 0.19
436 0.2
437 0.23
438 0.24
439 0.26
440 0.31
441 0.31
442 0.34
443 0.37
444 0.43
445 0.44
446 0.48
447 0.54
448 0.51
449 0.52
450 0.54
451 0.48
452 0.41
453 0.43
454 0.4
455 0.34
456 0.3
457 0.3
458 0.31
459 0.3
460 0.3
461 0.24
462 0.23
463 0.2
464 0.18
465 0.16
466 0.13
467 0.19
468 0.23
469 0.25
470 0.25
471 0.27
472 0.27
473 0.29
474 0.36
475 0.33
476 0.34
477 0.32
478 0.32
479 0.33
480 0.32
481 0.29
482 0.2
483 0.18
484 0.14
485 0.21
486 0.23
487 0.22
488 0.27
489 0.3
490 0.3
491 0.31
492 0.35
493 0.37
494 0.38
495 0.39
496 0.36
497 0.34
498 0.34
499 0.33
500 0.29
501 0.25
502 0.23
503 0.23
504 0.2
505 0.19
506 0.19
507 0.19
508 0.21
509 0.15
510 0.13
511 0.11
512 0.12
513 0.11
514 0.11
515 0.1
516 0.08
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.05
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.07
533 0.09
534 0.13
535 0.17
536 0.22
537 0.27
538 0.31
539 0.32
540 0.33
541 0.33
542 0.29
543 0.27
544 0.23
545 0.2
546 0.18
547 0.19
548 0.16
549 0.16
550 0.16
551 0.13
552 0.11
553 0.09
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.1
559 0.12
560 0.15
561 0.17
562 0.17
563 0.18
564 0.21
565 0.25
566 0.28
567 0.29
568 0.3
569 0.38
570 0.39
571 0.39
572 0.38
573 0.34
574 0.32
575 0.35
576 0.32
577 0.24
578 0.25
579 0.25
580 0.26
581 0.25
582 0.22
583 0.18
584 0.17
585 0.17
586 0.14
587 0.14
588 0.1
589 0.1
590 0.08
591 0.11
592 0.09
593 0.09
594 0.12
595 0.13
596 0.13
597 0.14
598 0.18
599 0.16
600 0.19
601 0.19
602 0.18
603 0.18
604 0.19
605 0.19
606 0.22
607 0.22
608 0.23
609 0.32
610 0.38
611 0.47
612 0.52
613 0.61
614 0.65
615 0.75
616 0.8
617 0.74
618 0.68
619 0.6
620 0.61
621 0.52
622 0.43
623 0.34
624 0.26
625 0.29
626 0.28
627 0.26
628 0.18
629 0.16
630 0.15
631 0.14
632 0.11
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.09
648 0.12
649 0.14
650 0.17
651 0.19
652 0.24
653 0.29
654 0.31
655 0.31
656 0.28
657 0.29
658 0.26
659 0.25
660 0.19
661 0.14
662 0.13
663 0.12
664 0.12
665 0.09
666 0.07
667 0.06
668 0.06
669 0.05
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.08
674 0.11
675 0.14
676 0.17
677 0.18
678 0.2
679 0.25
680 0.26
681 0.32
682 0.29
683 0.28
684 0.26
685 0.24
686 0.22
687 0.15
688 0.14
689 0.08
690 0.07
691 0.06
692 0.07
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.06
697 0.06
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.09
702 0.1
703 0.11
704 0.13
705 0.14
706 0.15
707 0.15
708 0.14
709 0.16
710 0.19
711 0.22
712 0.21
713 0.2
714 0.19
715 0.2
716 0.21
717 0.19
718 0.17
719 0.13
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.14
724 0.13
725 0.11
726 0.08
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.06
731 0.04
732 0.03
733 0.03
734 0.03
735 0.02
736 0.02
737 0.02
738 0.02
739 0.02
740 0.04
741 0.05
742 0.05
743 0.06
744 0.07
745 0.08
746 0.09
747 0.09
748 0.09
749 0.08
750 0.08
751 0.09
752 0.08
753 0.07
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.07
764 0.06
765 0.08
766 0.1
767 0.14
768 0.16
769 0.22
770 0.31
771 0.39
772 0.46
773 0.51
774 0.51
775 0.52
776 0.53
777 0.5
778 0.46
779 0.39
780 0.35
781 0.31
782 0.3
783 0.26
784 0.25
785 0.21
786 0.18
787 0.16
788 0.14
789 0.13
790 0.12
791 0.13
792 0.12
793 0.16
794 0.18
795 0.18
796 0.19
797 0.16
798 0.16
799 0.16
800 0.17
801 0.16
802 0.17
803 0.18
804 0.25
805 0.29
806 0.33
807 0.38
808 0.4
809 0.39
810 0.4
811 0.38
812 0.32
813 0.29
814 0.26
815 0.21
816 0.2
817 0.2
818 0.17
819 0.17
820 0.18
821 0.22
822 0.22
823 0.26
824 0.3
825 0.3
826 0.31
827 0.33
828 0.32
829 0.31
830 0.34
831 0.33
832 0.31
833 0.32
834 0.31
835 0.31
836 0.33
837 0.3
838 0.33
839 0.31
840 0.32
841 0.29
842 0.29
843 0.27
844 0.24
845 0.23
846 0.18
847 0.15
848 0.12
849 0.11
850 0.09
851 0.08
852 0.08
853 0.07
854 0.08
855 0.08
856 0.07
857 0.07
858 0.07
859 0.08
860 0.09
861 0.12
862 0.15
863 0.19
864 0.25
865 0.34
866 0.41
867 0.5
868 0.58
869 0.65
870 0.72
871 0.78
872 0.82
873 0.79
874 0.75
875 0.67
876 0.61
877 0.51
878 0.4