Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W1D6

Protein Details
Accession A0A4U0W1D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-38QSASSASTRPQRKERQTRLQEHLRAVKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-113PKRRAA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
CDD cd15489  PHD_SF  
Amino Acid Sequences MTTTHPQQPAQSASSASTRPQRKERQTRLQEHLRAVKPGSRSSSPNGGAGINSKQQAPLTTTTTSMGRSTSRKSTPSAKKAAAAAAAAAAAAAADPEPVQATTATGRPKRRAAKARVALADLQSSDDEAVGTTSKSGPAEATKADAPDPTEEEETSLASATPTRSTVGKARNQARQPVPLSRQPSIDNLAPSTTTTTTTRTSVGRKSPAKQIQSAAAQRRKREASGGSASGQRSSSAQPSPSPYQTDPGLMQKHQFRSVLAQHGFNPEEEVLERAIQTISSSKQELTVDTFLRVLGTLDTNVSPLKRSTTTAGVPQPLSVSVSRSNALSSSNKHSGGGGGFSALESPLTPSSIVADGRFLPSPPLSSSPAGRSHHPGSGSYCSTGVYRQSPASATFPAPPPPPQSQSEILPVPPPPRPTLYAHRSISAPSLPTLESTMRSQATPALPVLHEMSAPLQPQPAATTSSSATPAGAGAGGLFATSVAGMGRVALSRRSMFGQLGSAPAPTVAMTSLVEPPPAMSFHQLSPPSRASPAPTTPTTSGLLPAFAVGAAPGSTAQTTTRSRASSTSRSSASPVKATDDARLAKLRSWLADDDEEEETTGGEEGGKAGAADATLAAEASLKASAASGKLASSLSALDGVLNSFEVRAQPTEVEGVKPEPVGPPAAEIRVGGKNVSILRQSQKRQLDEVTATVEEPDSPVKMATRATTRASSSSKGKGKAQHHCVCGEDAEEEPRTIACAECDIAYHLACLNATSARQLPSPFVCSRCVAVSPPATAEPSLAAGQRTPELASKRVRIGTTSTPHLLSEPTFVASTPLSAPRGDAFGPLVADLALAPSPTASPVRRFASARAPVSPVHQRAQLPIPTTPRLGDALIRGPGDYSPTSPQNTRTRASRTRLVSNTGAAFFGGNGAEWLEAWDQHQFPVADSMQAQAPSSAMSSLAEDDWRMPSWSDVNMTPSRALSSTTPATSSSSSVWDTPYVHSSPQARRTHSQGPYMLGHHARTPSQDLMAMLDREHASEPAHHSYSQRLFGGGGPGSGAGDSPTFDAGLQHSMVPPGHPLSPLNPRRQPASFGHARKQSLGDGLGRAPFAYPHSPAHAHSYLPPSHMHGLGSAGMKPSFSAPGGRLVDLMPSLSYVEQQQLDDLLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.3
4 0.34
5 0.39
6 0.45
7 0.54
8 0.62
9 0.68
10 0.78
11 0.84
12 0.86
13 0.89
14 0.9
15 0.9
16 0.89
17 0.84
18 0.81
19 0.81
20 0.73
21 0.67
22 0.6
23 0.56
24 0.5
25 0.5
26 0.49
27 0.43
28 0.44
29 0.46
30 0.52
31 0.49
32 0.47
33 0.42
34 0.35
35 0.32
36 0.32
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.24
41 0.24
42 0.25
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.26
47 0.26
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.26
52 0.22
53 0.2
54 0.21
55 0.25
56 0.29
57 0.36
58 0.41
59 0.42
60 0.46
61 0.54
62 0.6
63 0.65
64 0.67
65 0.61
66 0.59
67 0.58
68 0.57
69 0.48
70 0.37
71 0.28
72 0.2
73 0.17
74 0.13
75 0.1
76 0.06
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.04
83 0.04
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.11
90 0.16
91 0.24
92 0.29
93 0.37
94 0.42
95 0.51
96 0.58
97 0.66
98 0.72
99 0.72
100 0.77
101 0.78
102 0.8
103 0.74
104 0.68
105 0.6
106 0.52
107 0.46
108 0.35
109 0.29
110 0.2
111 0.18
112 0.15
113 0.12
114 0.11
115 0.08
116 0.09
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.18
127 0.17
128 0.2
129 0.2
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.2
135 0.21
136 0.21
137 0.22
138 0.2
139 0.21
140 0.2
141 0.18
142 0.15
143 0.13
144 0.09
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.17
153 0.25
154 0.31
155 0.36
156 0.44
157 0.5
158 0.58
159 0.61
160 0.67
161 0.64
162 0.64
163 0.61
164 0.61
165 0.59
166 0.57
167 0.59
168 0.52
169 0.51
170 0.45
171 0.44
172 0.4
173 0.38
174 0.33
175 0.28
176 0.27
177 0.24
178 0.23
179 0.22
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.19
184 0.2
185 0.21
186 0.23
187 0.24
188 0.28
189 0.32
190 0.38
191 0.44
192 0.48
193 0.5
194 0.58
195 0.62
196 0.62
197 0.58
198 0.54
199 0.5
200 0.53
201 0.56
202 0.56
203 0.56
204 0.56
205 0.56
206 0.61
207 0.58
208 0.52
209 0.5
210 0.43
211 0.42
212 0.44
213 0.43
214 0.37
215 0.38
216 0.37
217 0.33
218 0.3
219 0.23
220 0.19
221 0.19
222 0.22
223 0.21
224 0.22
225 0.23
226 0.3
227 0.35
228 0.36
229 0.38
230 0.34
231 0.34
232 0.33
233 0.33
234 0.29
235 0.31
236 0.32
237 0.27
238 0.31
239 0.35
240 0.38
241 0.4
242 0.38
243 0.32
244 0.34
245 0.39
246 0.43
247 0.38
248 0.35
249 0.33
250 0.38
251 0.37
252 0.31
253 0.28
254 0.19
255 0.18
256 0.17
257 0.16
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.18
271 0.19
272 0.19
273 0.21
274 0.23
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.17
279 0.17
280 0.16
281 0.11
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.19
296 0.23
297 0.25
298 0.3
299 0.33
300 0.32
301 0.31
302 0.29
303 0.26
304 0.21
305 0.22
306 0.16
307 0.15
308 0.15
309 0.17
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.18
315 0.18
316 0.19
317 0.24
318 0.28
319 0.29
320 0.28
321 0.28
322 0.26
323 0.23
324 0.21
325 0.13
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.06
331 0.05
332 0.04
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.07
338 0.09
339 0.11
340 0.12
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.14
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.14
351 0.17
352 0.18
353 0.19
354 0.21
355 0.23
356 0.3
357 0.3
358 0.3
359 0.33
360 0.32
361 0.34
362 0.33
363 0.3
364 0.27
365 0.3
366 0.29
367 0.24
368 0.21
369 0.19
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.16
377 0.17
378 0.18
379 0.19
380 0.18
381 0.17
382 0.18
383 0.19
384 0.22
385 0.23
386 0.23
387 0.26
388 0.28
389 0.31
390 0.3
391 0.33
392 0.31
393 0.32
394 0.33
395 0.29
396 0.25
397 0.23
398 0.23
399 0.21
400 0.22
401 0.22
402 0.2
403 0.22
404 0.25
405 0.28
406 0.36
407 0.38
408 0.44
409 0.43
410 0.42
411 0.39
412 0.37
413 0.34
414 0.26
415 0.21
416 0.13
417 0.14
418 0.12
419 0.12
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.13
424 0.16
425 0.15
426 0.14
427 0.14
428 0.16
429 0.16
430 0.16
431 0.15
432 0.13
433 0.12
434 0.14
435 0.15
436 0.11
437 0.1
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.13
454 0.12
455 0.11
456 0.08
457 0.08
458 0.06
459 0.06
460 0.04
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.02
466 0.02
467 0.02
468 0.02
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.02
473 0.03
474 0.03
475 0.04
476 0.05
477 0.06
478 0.08
479 0.08
480 0.1
481 0.11
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.12
488 0.11
489 0.09
490 0.08
491 0.07
492 0.07
493 0.05
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.06
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.08
508 0.1
509 0.11
510 0.16
511 0.18
512 0.19
513 0.22
514 0.23
515 0.22
516 0.22
517 0.22
518 0.2
519 0.22
520 0.24
521 0.24
522 0.23
523 0.25
524 0.24
525 0.26
526 0.24
527 0.2
528 0.18
529 0.14
530 0.13
531 0.1
532 0.09
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.03
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.04
544 0.05
545 0.09
546 0.1
547 0.13
548 0.16
549 0.16
550 0.17
551 0.2
552 0.25
553 0.28
554 0.3
555 0.32
556 0.3
557 0.3
558 0.32
559 0.32
560 0.29
561 0.24
562 0.21
563 0.2
564 0.22
565 0.22
566 0.21
567 0.21
568 0.2
569 0.19
570 0.21
571 0.19
572 0.18
573 0.21
574 0.2
575 0.16
576 0.17
577 0.16
578 0.16
579 0.16
580 0.15
581 0.14
582 0.14
583 0.13
584 0.11
585 0.1
586 0.08
587 0.07
588 0.07
589 0.04
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.03
611 0.04
612 0.04
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.03
632 0.04
633 0.04
634 0.06
635 0.06
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.1
643 0.1
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.08
648 0.09
649 0.1
650 0.09
651 0.1
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.09
656 0.11
657 0.13
658 0.13
659 0.11
660 0.1
661 0.12
662 0.13
663 0.15
664 0.13
665 0.13
666 0.19
667 0.26
668 0.29
669 0.34
670 0.4
671 0.39
672 0.4
673 0.39
674 0.37
675 0.31
676 0.29
677 0.24
678 0.18
679 0.16
680 0.14
681 0.12
682 0.08
683 0.08
684 0.08
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.07
689 0.08
690 0.09
691 0.11
692 0.14
693 0.16
694 0.19
695 0.21
696 0.21
697 0.24
698 0.26
699 0.27
700 0.27
701 0.32
702 0.35
703 0.36
704 0.39
705 0.43
706 0.48
707 0.54
708 0.6
709 0.59
710 0.55
711 0.53
712 0.5
713 0.43
714 0.36
715 0.27
716 0.18
717 0.12
718 0.13
719 0.12
720 0.11
721 0.1
722 0.1
723 0.1
724 0.09
725 0.09
726 0.06
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.09
733 0.09
734 0.09
735 0.08
736 0.08
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.09
743 0.1
744 0.11
745 0.13
746 0.14
747 0.15
748 0.16
749 0.22
750 0.22
751 0.22
752 0.23
753 0.23
754 0.23
755 0.22
756 0.21
757 0.17
758 0.19
759 0.2
760 0.18
761 0.18
762 0.18
763 0.17
764 0.16
765 0.15
766 0.11
767 0.1
768 0.11
769 0.1
770 0.1
771 0.09
772 0.1
773 0.11
774 0.11
775 0.1
776 0.14
777 0.16
778 0.2
779 0.25
780 0.27
781 0.3
782 0.33
783 0.32
784 0.29
785 0.31
786 0.34
787 0.34
788 0.35
789 0.32
790 0.3
791 0.29
792 0.28
793 0.25
794 0.17
795 0.16
796 0.13
797 0.12
798 0.12
799 0.11
800 0.12
801 0.11
802 0.12
803 0.1
804 0.13
805 0.13
806 0.12
807 0.13
808 0.13
809 0.15
810 0.14
811 0.13
812 0.11
813 0.11
814 0.11
815 0.1
816 0.09
817 0.07
818 0.07
819 0.06
820 0.06
821 0.05
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.05
826 0.06
827 0.1
828 0.11
829 0.15
830 0.21
831 0.24
832 0.27
833 0.29
834 0.3
835 0.36
836 0.42
837 0.41
838 0.37
839 0.36
840 0.33
841 0.37
842 0.42
843 0.36
844 0.31
845 0.34
846 0.32
847 0.33
848 0.39
849 0.37
850 0.32
851 0.33
852 0.35
853 0.33
854 0.33
855 0.3
856 0.25
857 0.24
858 0.21
859 0.19
860 0.16
861 0.18
862 0.2
863 0.19
864 0.18
865 0.17
866 0.16
867 0.18
868 0.16
869 0.15
870 0.17
871 0.2
872 0.24
873 0.25
874 0.33
875 0.38
876 0.41
877 0.42
878 0.43
879 0.48
880 0.54
881 0.58
882 0.58
883 0.54
884 0.59
885 0.58
886 0.58
887 0.51
888 0.46
889 0.42
890 0.35
891 0.3
892 0.21
893 0.18
894 0.12
895 0.12
896 0.08
897 0.06
898 0.05
899 0.06
900 0.05
901 0.05
902 0.08
903 0.07
904 0.08
905 0.09
906 0.13
907 0.13
908 0.13
909 0.18
910 0.16
911 0.16
912 0.21
913 0.21
914 0.18
915 0.18
916 0.19
917 0.17
918 0.17
919 0.16
920 0.11
921 0.11
922 0.1
923 0.1
924 0.09
925 0.07
926 0.06
927 0.07
928 0.08
929 0.09
930 0.09
931 0.09
932 0.1
933 0.12
934 0.13
935 0.14
936 0.13
937 0.14
938 0.16
939 0.17
940 0.19
941 0.17
942 0.22
943 0.23
944 0.25
945 0.24
946 0.22
947 0.22
948 0.2
949 0.21
950 0.16
951 0.2
952 0.22
953 0.22
954 0.22
955 0.21
956 0.24
957 0.23
958 0.23
959 0.18
960 0.18
961 0.18
962 0.18
963 0.19
964 0.19
965 0.2
966 0.2
967 0.24
968 0.22
969 0.21
970 0.25
971 0.31
972 0.36
973 0.44
974 0.48
975 0.5
976 0.51
977 0.58
978 0.63
979 0.6
980 0.59
981 0.52
982 0.5
983 0.47
984 0.45
985 0.44
986 0.37
987 0.33
988 0.3
989 0.3
990 0.27
991 0.27
992 0.31
993 0.27
994 0.25
995 0.26
996 0.22
997 0.23
998 0.27
999 0.24
1000 0.19
1001 0.21
1002 0.2
1003 0.2
1004 0.21
1005 0.18
1006 0.15
1007 0.19
1008 0.24
1009 0.27
1010 0.29
1011 0.28
1012 0.28
1013 0.36
1014 0.4
1015 0.4
1016 0.35
1017 0.29
1018 0.27
1019 0.28
1020 0.32
1021 0.24
1022 0.19
1023 0.15
1024 0.14
1025 0.14
1026 0.13
1027 0.11
1028 0.06
1029 0.06
1030 0.07
1031 0.08
1032 0.08
1033 0.08
1034 0.08
1035 0.1
1036 0.1
1037 0.13
1038 0.13
1039 0.13
1040 0.13
1041 0.16
1042 0.16
1043 0.16
1044 0.17
1045 0.17
1046 0.17
1047 0.18
1048 0.19
1049 0.22
1050 0.32
1051 0.39
1052 0.45
1053 0.49
1054 0.5
1055 0.54
1056 0.55
1057 0.56
1058 0.5
1059 0.52
1060 0.52
1061 0.52
1062 0.58
1063 0.59
1064 0.59
1065 0.56
1066 0.53
1067 0.46
1068 0.41
1069 0.38
1070 0.32
1071 0.27
1072 0.28
1073 0.27
1074 0.24
1075 0.22
1076 0.18
1077 0.17
1078 0.19
1079 0.2
1080 0.21
1081 0.22
1082 0.28
1083 0.3
1084 0.32
1085 0.38
1086 0.35
1087 0.32
1088 0.35
1089 0.39
1090 0.35
1091 0.34
1092 0.34
1093 0.31
1094 0.34
1095 0.33
1096 0.28
1097 0.22
1098 0.22
1099 0.24
1100 0.24
1101 0.21
1102 0.2
1103 0.19
1104 0.18
1105 0.18
1106 0.18
1107 0.17
1108 0.16
1109 0.19
1110 0.17
1111 0.26
1112 0.29
1113 0.28
1114 0.27
1115 0.24
1116 0.26
1117 0.22
1118 0.22
1119 0.13
1120 0.11
1121 0.12
1122 0.12
1123 0.13
1124 0.12
1125 0.17
1126 0.18
1127 0.18
1128 0.18