Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VP12

Protein Details
Accession A0A4U0VP12    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-43AEIRKAYRQKSLKVHPDRNPDDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-108KKQKA
116-118RKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036053  PABP-dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051028  P:mRNA transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50076  DNAJ_2  
PS50102  RRM  
CDD cd06257  DnaJ  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MATEDVDYYALLGIEATATSAEIRKAYRQKSLKVHPDRNPDDPQAAALFHELSIAADVLSDPTQRASFDALLTARNARKARFAALDNKRKALAEDLEAREREFKKQKAGEATEAQRKRQELERLKEEGRRLREMKMNEANAGEQARQQEEAERDERRRAREGGAAAANGGGPAGVVELGPLDKTLKVKWQRSVHPSLGSVEALTTFFRTALAPHDPDLDSVVLSSKTLAQPSKGKFGSGVVAFRSLKAAVRAVKGKAADPDGMWRGFEVDWAAGQPPAALGGASTNPAPPVAAASPAPQPIPKTTPVSANEDAVLAKLRQRERERERLMEEMRRQDEEEEPHPLTMATEPASSPPPPPPPHPYLTKSELYISGLPSAVRDTEIVHVLRDCLRVRLHLERDPKDGKSLLSMQLEVYFSQSPAQRADGFGRGLAGTAPLLGKIEFESLDRAEKAYATCNNARVGAHPGSLQLSIIPGSDASLDPVPTAQCLIVKHLPQRFTPSELYDLARPFGAVHSIQLLFTPHPSSGLPTFTGRALVIYYEEEHAAEARIGLHFLEVKGQNIAVQVYDPKRGGGGAKGSMRRGNSPLQSQSPPSSGSAPRTTSPTEFWRPSSSPETPSPLERKSAALLGLGLSSPASASGSQISVRPVQPPSTSKSKWADDGGAASSRGAAKSGISSGDDGSSPAAARTLLEKLSLGTPQATGTSDRSLESSRHARSAASQPQERPKSERERLADQVTVLVPDAATRDKVLALLYELPKRDRAMCLFNSDFLLSKVQDALVIVGTEEEEEKGGGDECLVPKTGPGEEIATAATLPGRLVDLATWSSSRIVPLLPALIKRFDLAVPATGDVTETRTFMGTLEGKPASEVKQKLGERLFRVVKAIGREEGLKGAARITIELLDAEDDLGALAELMHYPGVLREKVIVTAQQLAAKGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.04
5 0.05
6 0.06
7 0.09
8 0.1
9 0.13
10 0.16
11 0.25
12 0.34
13 0.38
14 0.47
15 0.52
16 0.59
17 0.67
18 0.75
19 0.76
20 0.78
21 0.83
22 0.82
23 0.86
24 0.82
25 0.79
26 0.76
27 0.69
28 0.6
29 0.51
30 0.45
31 0.35
32 0.3
33 0.24
34 0.19
35 0.15
36 0.12
37 0.13
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.15
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.21
57 0.19
58 0.19
59 0.21
60 0.26
61 0.25
62 0.31
63 0.33
64 0.3
65 0.37
66 0.38
67 0.42
68 0.4
69 0.43
70 0.46
71 0.54
72 0.62
73 0.59
74 0.59
75 0.55
76 0.5
77 0.47
78 0.43
79 0.36
80 0.31
81 0.37
82 0.39
83 0.44
84 0.44
85 0.43
86 0.44
87 0.42
88 0.46
89 0.46
90 0.45
91 0.49
92 0.54
93 0.6
94 0.61
95 0.65
96 0.62
97 0.61
98 0.64
99 0.64
100 0.62
101 0.59
102 0.54
103 0.5
104 0.47
105 0.47
106 0.5
107 0.5
108 0.56
109 0.6
110 0.61
111 0.63
112 0.65
113 0.65
114 0.62
115 0.58
116 0.58
117 0.53
118 0.52
119 0.56
120 0.54
121 0.56
122 0.56
123 0.52
124 0.45
125 0.44
126 0.38
127 0.35
128 0.33
129 0.24
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.22
136 0.23
137 0.28
138 0.3
139 0.33
140 0.34
141 0.42
142 0.47
143 0.46
144 0.49
145 0.46
146 0.45
147 0.45
148 0.44
149 0.41
150 0.38
151 0.33
152 0.27
153 0.24
154 0.21
155 0.15
156 0.12
157 0.06
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.08
170 0.1
171 0.12
172 0.21
173 0.3
174 0.36
175 0.44
176 0.51
177 0.58
178 0.64
179 0.7
180 0.65
181 0.59
182 0.55
183 0.48
184 0.42
185 0.34
186 0.26
187 0.18
188 0.15
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.12
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.23
205 0.18
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.12
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.27
218 0.3
219 0.38
220 0.35
221 0.33
222 0.3
223 0.3
224 0.32
225 0.26
226 0.25
227 0.17
228 0.22
229 0.22
230 0.22
231 0.22
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.2
236 0.19
237 0.23
238 0.27
239 0.26
240 0.29
241 0.28
242 0.28
243 0.27
244 0.26
245 0.23
246 0.19
247 0.24
248 0.24
249 0.23
250 0.21
251 0.18
252 0.17
253 0.15
254 0.16
255 0.11
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.05
277 0.08
278 0.07
279 0.09
280 0.09
281 0.11
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.17
288 0.2
289 0.22
290 0.24
291 0.24
292 0.31
293 0.32
294 0.38
295 0.35
296 0.32
297 0.29
298 0.25
299 0.23
300 0.17
301 0.16
302 0.09
303 0.11
304 0.16
305 0.19
306 0.27
307 0.32
308 0.42
309 0.47
310 0.58
311 0.6
312 0.58
313 0.58
314 0.56
315 0.55
316 0.53
317 0.5
318 0.47
319 0.44
320 0.41
321 0.39
322 0.34
323 0.34
324 0.31
325 0.28
326 0.26
327 0.24
328 0.23
329 0.22
330 0.2
331 0.17
332 0.13
333 0.12
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.16
342 0.23
343 0.25
344 0.29
345 0.34
346 0.37
347 0.4
348 0.44
349 0.43
350 0.42
351 0.44
352 0.42
353 0.36
354 0.32
355 0.29
356 0.26
357 0.24
358 0.19
359 0.14
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.14
375 0.16
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.17
380 0.2
381 0.27
382 0.29
383 0.31
384 0.38
385 0.38
386 0.43
387 0.44
388 0.41
389 0.36
390 0.33
391 0.28
392 0.23
393 0.23
394 0.22
395 0.2
396 0.19
397 0.17
398 0.18
399 0.18
400 0.15
401 0.15
402 0.1
403 0.1
404 0.12
405 0.14
406 0.13
407 0.14
408 0.16
409 0.13
410 0.14
411 0.17
412 0.17
413 0.15
414 0.14
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.09
419 0.07
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.05
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.12
440 0.14
441 0.17
442 0.18
443 0.2
444 0.2
445 0.21
446 0.2
447 0.17
448 0.2
449 0.17
450 0.16
451 0.14
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.05
474 0.07
475 0.07
476 0.12
477 0.15
478 0.17
479 0.22
480 0.25
481 0.27
482 0.26
483 0.32
484 0.29
485 0.3
486 0.3
487 0.26
488 0.25
489 0.24
490 0.25
491 0.21
492 0.2
493 0.16
494 0.14
495 0.12
496 0.1
497 0.09
498 0.1
499 0.07
500 0.07
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.12
519 0.13
520 0.1
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.12
549 0.12
550 0.07
551 0.07
552 0.11
553 0.12
554 0.15
555 0.14
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.12
561 0.14
562 0.16
563 0.21
564 0.23
565 0.25
566 0.27
567 0.27
568 0.27
569 0.28
570 0.29
571 0.27
572 0.29
573 0.31
574 0.33
575 0.33
576 0.33
577 0.32
578 0.28
579 0.26
580 0.23
581 0.23
582 0.21
583 0.24
584 0.26
585 0.26
586 0.25
587 0.27
588 0.28
589 0.25
590 0.27
591 0.29
592 0.32
593 0.31
594 0.32
595 0.35
596 0.34
597 0.37
598 0.4
599 0.35
600 0.33
601 0.34
602 0.37
603 0.33
604 0.37
605 0.37
606 0.32
607 0.32
608 0.28
609 0.27
610 0.23
611 0.23
612 0.19
613 0.14
614 0.13
615 0.11
616 0.1
617 0.08
618 0.07
619 0.05
620 0.04
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.05
626 0.06
627 0.07
628 0.08
629 0.1
630 0.12
631 0.15
632 0.15
633 0.18
634 0.19
635 0.21
636 0.24
637 0.25
638 0.28
639 0.34
640 0.34
641 0.37
642 0.41
643 0.41
644 0.4
645 0.39
646 0.36
647 0.28
648 0.29
649 0.24
650 0.2
651 0.18
652 0.14
653 0.14
654 0.13
655 0.12
656 0.11
657 0.09
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.1
662 0.09
663 0.1
664 0.1
665 0.11
666 0.11
667 0.09
668 0.09
669 0.08
670 0.08
671 0.07
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.08
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.11
681 0.13
682 0.13
683 0.12
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.11
688 0.11
689 0.12
690 0.13
691 0.15
692 0.15
693 0.15
694 0.16
695 0.17
696 0.17
697 0.21
698 0.27
699 0.26
700 0.28
701 0.28
702 0.26
703 0.29
704 0.38
705 0.4
706 0.39
707 0.42
708 0.44
709 0.54
710 0.6
711 0.57
712 0.54
713 0.54
714 0.57
715 0.6
716 0.62
717 0.58
718 0.58
719 0.61
720 0.59
721 0.51
722 0.41
723 0.37
724 0.3
725 0.25
726 0.18
727 0.13
728 0.09
729 0.08
730 0.1
731 0.09
732 0.09
733 0.09
734 0.1
735 0.1
736 0.11
737 0.1
738 0.09
739 0.1
740 0.16
741 0.19
742 0.23
743 0.25
744 0.26
745 0.28
746 0.3
747 0.3
748 0.29
749 0.29
750 0.32
751 0.33
752 0.39
753 0.37
754 0.36
755 0.35
756 0.31
757 0.27
758 0.21
759 0.23
760 0.15
761 0.15
762 0.15
763 0.13
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.09
768 0.09
769 0.08
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.07
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.1
783 0.11
784 0.13
785 0.14
786 0.13
787 0.13
788 0.15
789 0.15
790 0.12
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.14
795 0.13
796 0.11
797 0.1
798 0.1
799 0.09
800 0.06
801 0.06
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.07
807 0.09
808 0.1
809 0.12
810 0.12
811 0.12
812 0.14
813 0.14
814 0.15
815 0.13
816 0.12
817 0.11
818 0.13
819 0.17
820 0.17
821 0.2
822 0.22
823 0.24
824 0.24
825 0.23
826 0.23
827 0.18
828 0.19
829 0.17
830 0.19
831 0.18
832 0.18
833 0.18
834 0.16
835 0.17
836 0.14
837 0.17
838 0.14
839 0.12
840 0.12
841 0.13
842 0.13
843 0.12
844 0.19
845 0.18
846 0.18
847 0.24
848 0.23
849 0.23
850 0.24
851 0.26
852 0.25
853 0.3
854 0.31
855 0.29
856 0.38
857 0.39
858 0.46
859 0.51
860 0.52
861 0.48
862 0.56
863 0.56
864 0.47
865 0.49
866 0.45
867 0.41
868 0.4
869 0.39
870 0.32
871 0.3
872 0.3
873 0.28
874 0.28
875 0.26
876 0.22
877 0.18
878 0.17
879 0.17
880 0.16
881 0.15
882 0.14
883 0.13
884 0.12
885 0.12
886 0.12
887 0.1
888 0.1
889 0.1
890 0.08
891 0.06
892 0.06
893 0.06
894 0.05
895 0.04
896 0.03
897 0.04
898 0.04
899 0.05
900 0.05
901 0.05
902 0.05
903 0.1
904 0.15
905 0.15
906 0.16
907 0.19
908 0.2
909 0.23
910 0.25
911 0.24
912 0.21
913 0.27
914 0.29
915 0.28