Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0W0F0

Protein Details
Accession A0A4U0W0F0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-70KANNSQPRNNGPRRDNRNRNQGDREVHydrophilic
246-267FGAPKAASNKQKKQKEAKTFLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-109ARRGGRGGRGGRAPGGGNPRG
274-310PPRRDTRDARESTRGGRPARGRGEGRGRGGASRGSTR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10, cyto 10, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MAGVFSRNAFAALGDGDDFAPVAAKSKAAAAPAPAAPAAAAAAPKANNSQPRNNGPRRDNRNRNQGDREVNAAVPVGEGAKEDRAQNFARRGGRGGRGGRAPGGGNPRGNSGTYLGGARPRRENGGGRPFDRQSQTGRVDSEKAEAAGWGAEDGKKELEAEVLAEADAKAEAPAEGAATPVREAPVVEEEEEDNTQTYEEYLAAKAAKKLNISELPEARPANEGEDLFANAQAVTKKSEQEEEWLFGAPKAASNKQKKQKEAKTFLEIEFTSRPPRRDTRDARESTRGGRPARGRGEGRGRGGASRGSTRGQGRSQGAAAPAVSDASAFPALA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.08
6 0.07
7 0.08
8 0.07
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.14
14 0.16
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.18
22 0.16
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.08
27 0.07
28 0.06
29 0.09
30 0.09
31 0.11
32 0.14
33 0.19
34 0.27
35 0.32
36 0.41
37 0.46
38 0.55
39 0.64
40 0.69
41 0.73
42 0.73
43 0.77
44 0.79
45 0.83
46 0.84
47 0.82
48 0.85
49 0.84
50 0.83
51 0.8
52 0.77
53 0.73
54 0.64
55 0.59
56 0.5
57 0.42
58 0.35
59 0.27
60 0.2
61 0.13
62 0.11
63 0.07
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.09
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.17
72 0.2
73 0.25
74 0.29
75 0.32
76 0.35
77 0.34
78 0.36
79 0.37
80 0.4
81 0.41
82 0.39
83 0.37
84 0.35
85 0.35
86 0.33
87 0.29
88 0.25
89 0.22
90 0.26
91 0.26
92 0.25
93 0.25
94 0.27
95 0.26
96 0.26
97 0.22
98 0.17
99 0.15
100 0.13
101 0.14
102 0.12
103 0.17
104 0.2
105 0.21
106 0.23
107 0.24
108 0.26
109 0.29
110 0.33
111 0.35
112 0.42
113 0.43
114 0.41
115 0.44
116 0.42
117 0.43
118 0.41
119 0.34
120 0.28
121 0.32
122 0.33
123 0.31
124 0.31
125 0.28
126 0.28
127 0.26
128 0.24
129 0.17
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.1
192 0.13
193 0.16
194 0.18
195 0.18
196 0.19
197 0.23
198 0.27
199 0.29
200 0.31
201 0.3
202 0.3
203 0.34
204 0.33
205 0.27
206 0.25
207 0.21
208 0.19
209 0.18
210 0.16
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.07
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.14
223 0.16
224 0.17
225 0.21
226 0.2
227 0.24
228 0.26
229 0.25
230 0.24
231 0.23
232 0.22
233 0.19
234 0.2
235 0.15
236 0.15
237 0.18
238 0.24
239 0.32
240 0.41
241 0.51
242 0.59
243 0.66
244 0.71
245 0.77
246 0.8
247 0.82
248 0.82
249 0.78
250 0.76
251 0.72
252 0.64
253 0.59
254 0.49
255 0.42
256 0.37
257 0.32
258 0.34
259 0.35
260 0.36
261 0.37
262 0.45
263 0.49
264 0.57
265 0.64
266 0.65
267 0.71
268 0.74
269 0.73
270 0.73
271 0.67
272 0.62
273 0.61
274 0.58
275 0.49
276 0.52
277 0.51
278 0.53
279 0.56
280 0.58
281 0.53
282 0.54
283 0.62
284 0.6
285 0.59
286 0.55
287 0.5
288 0.44
289 0.44
290 0.39
291 0.33
292 0.31
293 0.3
294 0.27
295 0.32
296 0.35
297 0.39
298 0.39
299 0.42
300 0.41
301 0.42
302 0.41
303 0.38
304 0.35
305 0.3
306 0.26
307 0.2
308 0.17
309 0.13
310 0.12
311 0.09
312 0.08
313 0.1