Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4U0VMD6

Protein Details
Accession A0A4U0VMD6    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-120DEDQARSRKKTKSRAAKSDARAAKHydrophilic
151-174DAAAAPPPKKRSRKAARPDPVDAMHydrophilic
305-325DRRSSSPKKRGSPAKNRQNDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-135RSRKKTKSRAAKSDARAAKGDKSKGKGKGKGKGK
157-167PPKKRSRKAAR
302-319PPADRRSSSPKKRGSPAK
Subcellular Location(s) cyto 17, nucl 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005819  H1/H5  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0000786  C:nucleosome  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0030527  F:structural constituent of chromatin  
GO:0006334  P:nucleosome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MTTPPSYLLHDFDPRAVKVADLRGILLAHDVPYASNAKKSDLVAAFEKSIRPQAARLLADLQAVRASDHGVLDGESQGSSLRELDTDYERDGDLEADEDQARSRKKTKSRAAKSDARAAKGDKSKGKGKGKGKGKVVEQDDTTATDEDSADAAAAPPPKKRSRKAARPDPVDAMEVDEPVDLAYEEPVEYEAPLRDEYDTEDDEAPRVSSPKKRKATEGGPATPRLSEITAAARKGRVSVGAGGGDGNFSDYNPFQSGGEDTPMRDTKRRKSSLGPARQRDDLEQEHRLASRKSMPALAAHPPADRRSSSPKKRGSPAKNRQNDYAAEVPARPQEAREVEETSPAYEEEIEAGPEPEIEPERPQPASPPKASPSSAKRKSLAGRASLGNGTPVGVQYMVPTTKVKTTPPQFAELLKQREAASAGRVVGPAPRGRRSSSPVEVRGRRFEGRSSLSPEGVANQRAIVVMPDARPGFDWAGWSRLARWILLGLTIAYVLWWREEKLAAGFCDTGSRSNPLVASRRTSLAAAGLPELPPSVLRAADRLHLRPTCTPCPQHGHCRDGNFVGCTLDYVPRQSPLRLGGLLPIPPKCVPDTEKLMMVAMQASKASRLLRQRRGEVVCKGMERMRRKERNEEAWVFGLQAEALLTALRSENERAGRPFDEDVLEEVNRLALRDLESHGEVKVWRNGDEYWFATETAEMPMSCRLRLAAIRALKRHKAGLSTILALAAALVWARYKLRTRRSDAELVRHLVQVALRQLQQQERSHYADPVHVPFPHVVPSHMRDLILQDEHSPRRRAELWKRVEKIVEGNANVRVADVEQYGEEMRGWLWTGPSGRIEAGQVTSESPGKPQMVEGAKVYPSLMQSPAQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.33
4 0.3
5 0.29
6 0.33
7 0.33
8 0.27
9 0.28
10 0.25
11 0.25
12 0.24
13 0.21
14 0.16
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.13
20 0.18
21 0.16
22 0.21
23 0.21
24 0.24
25 0.27
26 0.28
27 0.34
28 0.32
29 0.35
30 0.33
31 0.35
32 0.34
33 0.33
34 0.34
35 0.28
36 0.32
37 0.3
38 0.28
39 0.27
40 0.32
41 0.38
42 0.37
43 0.37
44 0.33
45 0.32
46 0.34
47 0.32
48 0.25
49 0.19
50 0.18
51 0.16
52 0.13
53 0.14
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.13
72 0.17
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.15
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.19
88 0.22
89 0.26
90 0.33
91 0.39
92 0.48
93 0.59
94 0.67
95 0.72
96 0.79
97 0.84
98 0.86
99 0.86
100 0.82
101 0.81
102 0.76
103 0.68
104 0.61
105 0.53
106 0.53
107 0.51
108 0.54
109 0.5
110 0.51
111 0.56
112 0.62
113 0.68
114 0.69
115 0.69
116 0.71
117 0.74
118 0.76
119 0.76
120 0.73
121 0.69
122 0.68
123 0.65
124 0.6
125 0.51
126 0.46
127 0.39
128 0.35
129 0.32
130 0.24
131 0.19
132 0.15
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.09
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.09
141 0.14
142 0.15
143 0.2
144 0.27
145 0.36
146 0.45
147 0.51
148 0.59
149 0.65
150 0.74
151 0.81
152 0.84
153 0.85
154 0.83
155 0.81
156 0.75
157 0.66
158 0.56
159 0.45
160 0.38
161 0.29
162 0.22
163 0.18
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.15
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.16
193 0.13
194 0.14
195 0.16
196 0.23
197 0.33
198 0.43
199 0.51
200 0.53
201 0.58
202 0.64
203 0.67
204 0.68
205 0.66
206 0.63
207 0.58
208 0.58
209 0.52
210 0.43
211 0.37
212 0.29
213 0.21
214 0.15
215 0.13
216 0.18
217 0.2
218 0.21
219 0.22
220 0.22
221 0.21
222 0.22
223 0.21
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.08
234 0.08
235 0.06
236 0.05
237 0.08
238 0.08
239 0.11
240 0.12
241 0.13
242 0.11
243 0.12
244 0.14
245 0.13
246 0.16
247 0.14
248 0.13
249 0.18
250 0.22
251 0.24
252 0.28
253 0.33
254 0.4
255 0.5
256 0.54
257 0.52
258 0.54
259 0.62
260 0.67
261 0.71
262 0.71
263 0.67
264 0.66
265 0.66
266 0.6
267 0.52
268 0.47
269 0.42
270 0.38
271 0.34
272 0.32
273 0.3
274 0.31
275 0.32
276 0.26
277 0.23
278 0.26
279 0.25
280 0.25
281 0.25
282 0.24
283 0.24
284 0.26
285 0.28
286 0.24
287 0.22
288 0.22
289 0.22
290 0.23
291 0.24
292 0.22
293 0.21
294 0.29
295 0.38
296 0.46
297 0.54
298 0.6
299 0.63
300 0.71
301 0.77
302 0.77
303 0.78
304 0.79
305 0.81
306 0.81
307 0.78
308 0.73
309 0.66
310 0.57
311 0.5
312 0.43
313 0.34
314 0.26
315 0.23
316 0.21
317 0.19
318 0.2
319 0.15
320 0.11
321 0.15
322 0.16
323 0.18
324 0.19
325 0.21
326 0.19
327 0.23
328 0.23
329 0.18
330 0.16
331 0.14
332 0.12
333 0.09
334 0.09
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.08
345 0.08
346 0.1
347 0.12
348 0.15
349 0.15
350 0.15
351 0.2
352 0.27
353 0.32
354 0.31
355 0.32
356 0.33
357 0.36
358 0.37
359 0.37
360 0.37
361 0.43
362 0.47
363 0.48
364 0.46
365 0.48
366 0.5
367 0.52
368 0.47
369 0.39
370 0.35
371 0.32
372 0.32
373 0.28
374 0.24
375 0.17
376 0.13
377 0.1
378 0.07
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.13
390 0.14
391 0.16
392 0.22
393 0.26
394 0.32
395 0.33
396 0.36
397 0.33
398 0.33
399 0.38
400 0.37
401 0.36
402 0.29
403 0.29
404 0.26
405 0.26
406 0.26
407 0.2
408 0.15
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.11
416 0.13
417 0.14
418 0.18
419 0.2
420 0.22
421 0.24
422 0.28
423 0.32
424 0.35
425 0.37
426 0.4
427 0.46
428 0.48
429 0.48
430 0.47
431 0.45
432 0.41
433 0.36
434 0.32
435 0.29
436 0.29
437 0.29
438 0.31
439 0.28
440 0.27
441 0.26
442 0.24
443 0.22
444 0.19
445 0.17
446 0.11
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.07
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.12
460 0.12
461 0.1
462 0.12
463 0.1
464 0.12
465 0.13
466 0.12
467 0.11
468 0.15
469 0.15
470 0.13
471 0.12
472 0.11
473 0.1
474 0.11
475 0.1
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.04
480 0.03
481 0.04
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.1
490 0.13
491 0.12
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.14
496 0.13
497 0.13
498 0.11
499 0.14
500 0.13
501 0.14
502 0.15
503 0.16
504 0.21
505 0.21
506 0.23
507 0.22
508 0.23
509 0.23
510 0.22
511 0.19
512 0.15
513 0.14
514 0.11
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.07
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.09
527 0.1
528 0.15
529 0.18
530 0.18
531 0.23
532 0.24
533 0.26
534 0.31
535 0.36
536 0.38
537 0.4
538 0.41
539 0.39
540 0.46
541 0.47
542 0.52
543 0.51
544 0.51
545 0.48
546 0.49
547 0.46
548 0.41
549 0.39
550 0.29
551 0.23
552 0.18
553 0.15
554 0.13
555 0.12
556 0.13
557 0.12
558 0.14
559 0.14
560 0.17
561 0.19
562 0.19
563 0.2
564 0.19
565 0.21
566 0.19
567 0.18
568 0.17
569 0.17
570 0.2
571 0.2
572 0.18
573 0.18
574 0.18
575 0.19
576 0.17
577 0.19
578 0.2
579 0.23
580 0.3
581 0.29
582 0.3
583 0.28
584 0.28
585 0.24
586 0.21
587 0.17
588 0.1
589 0.09
590 0.08
591 0.08
592 0.08
593 0.11
594 0.12
595 0.15
596 0.25
597 0.34
598 0.43
599 0.48
600 0.52
601 0.57
602 0.61
603 0.62
604 0.56
605 0.51
606 0.45
607 0.4
608 0.38
609 0.34
610 0.37
611 0.38
612 0.44
613 0.5
614 0.56
615 0.6
616 0.68
617 0.72
618 0.73
619 0.74
620 0.68
621 0.6
622 0.53
623 0.49
624 0.39
625 0.31
626 0.22
627 0.13
628 0.1
629 0.06
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.03
634 0.04
635 0.05
636 0.05
637 0.07
638 0.09
639 0.14
640 0.17
641 0.21
642 0.22
643 0.26
644 0.26
645 0.27
646 0.27
647 0.24
648 0.22
649 0.19
650 0.19
651 0.18
652 0.17
653 0.14
654 0.13
655 0.14
656 0.12
657 0.12
658 0.1
659 0.09
660 0.11
661 0.12
662 0.14
663 0.15
664 0.17
665 0.17
666 0.17
667 0.17
668 0.17
669 0.19
670 0.22
671 0.21
672 0.2
673 0.22
674 0.23
675 0.24
676 0.27
677 0.24
678 0.23
679 0.22
680 0.22
681 0.2
682 0.19
683 0.17
684 0.15
685 0.15
686 0.1
687 0.11
688 0.17
689 0.18
690 0.18
691 0.17
692 0.16
693 0.17
694 0.2
695 0.23
696 0.24
697 0.3
698 0.36
699 0.42
700 0.48
701 0.5
702 0.5
703 0.5
704 0.45
705 0.42
706 0.39
707 0.39
708 0.35
709 0.32
710 0.3
711 0.25
712 0.22
713 0.18
714 0.15
715 0.08
716 0.05
717 0.03
718 0.03
719 0.04
720 0.05
721 0.07
722 0.11
723 0.2
724 0.29
725 0.39
726 0.47
727 0.55
728 0.62
729 0.67
730 0.73
731 0.69
732 0.7
733 0.66
734 0.62
735 0.55
736 0.48
737 0.41
738 0.33
739 0.29
740 0.25
741 0.23
742 0.23
743 0.22
744 0.24
745 0.29
746 0.34
747 0.41
748 0.41
749 0.43
750 0.44
751 0.49
752 0.47
753 0.46
754 0.41
755 0.39
756 0.39
757 0.36
758 0.35
759 0.29
760 0.3
761 0.28
762 0.28
763 0.28
764 0.25
765 0.23
766 0.25
767 0.29
768 0.33
769 0.33
770 0.32
771 0.26
772 0.29
773 0.32
774 0.28
775 0.25
776 0.24
777 0.3
778 0.37
779 0.43
780 0.44
781 0.39
782 0.43
783 0.48
784 0.54
785 0.57
786 0.6
787 0.64
788 0.7
789 0.73
790 0.7
791 0.67
792 0.59
793 0.54
794 0.52
795 0.48
796 0.4
797 0.39
798 0.39
799 0.37
800 0.34
801 0.28
802 0.2
803 0.15
804 0.16
805 0.13
806 0.11
807 0.1
808 0.13
809 0.13
810 0.13
811 0.12
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.11
816 0.1
817 0.11
818 0.15
819 0.17
820 0.19
821 0.21
822 0.21
823 0.21
824 0.2
825 0.21
826 0.19
827 0.18
828 0.17
829 0.16
830 0.16
831 0.18
832 0.2
833 0.19
834 0.19
835 0.22
836 0.22
837 0.22
838 0.21
839 0.27
840 0.29
841 0.31
842 0.31
843 0.3
844 0.29
845 0.29
846 0.28
847 0.23
848 0.2
849 0.21
850 0.21