Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FSM2

Protein Details
Accession A0A4T0FSM2    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-97AMYQVAQRKADRKKKRADTFKRALEHYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-86KADRKKKR
193-208KGWKPRRLGGGLGGKP
247-327GGPRRSDGGGRFGGPPGGGRFGRDRDGPPRFGGGGFGDRERGDRDRFGGDRGDRGGDRPMRQWGGAPRDRDRDRDRDGPRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR005225  Small_GTP-bd_dom  
IPR001806  Small_GTPase  
IPR017231  Small_GTPase_Tem1/Spg1  
IPR034143  snRNP70_RRM  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00071  Ras  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51419  RAB  
PS50102  RRM  
CDD cd12236  RRM_snRNP70  
cd04128  Spg1  
Amino Acid Sequences LFAPRPPLTYAKPLERDPTRGKRNAQGGVGELLQSLREQEEDKLAQKGGVNDTQEQREGVEATTAQSQLAAMYQVAQRKADRKKKRADTFKRALEHYNPSGDAEAIGDPFKTLFIARLTPETAESDLRKEFEVYGPVERVRIVRHKDTGKSRRYAFIIYEKERDMKAAYKDAEGLKIHGNRILVDVERGRTVKGWKPRRLGGGLGGKPKVVLPDMPPPRGGRWVSTSPLLTPNLHSHSGGFGGGFRGGPRRSDGGGRFGGPPGGGRFGRDRDGPPRFGGGGFGDRERGDRDRFGGDRGDRGGDRPMRQWGGAPRDRDRDRDRDGPRRSFGGFKRDFDGGEDRESKRYIQHPVMALYLKTALVGDSSIGKTSLMVKYVEGSFDEDYIQTLGARIAWLLEYFLIYKFIGVNFMEKTISIRQTEITFSIWDLGGQREFVNMLPLVCNDAVAILFMFDLSRKSTLNSIKEWYRQARGFNKTAIPFLVGTKFDIFAGLPKEEQEEITKQAKRFARAMHAPLIFCSTSHSIHVQKIFKIVLSKAFDLKCTIPEVHESGEPLLIYKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.57
3 0.61
4 0.61
5 0.65
6 0.66
7 0.68
8 0.7
9 0.69
10 0.73
11 0.7
12 0.63
13 0.55
14 0.48
15 0.43
16 0.39
17 0.3
18 0.23
19 0.17
20 0.14
21 0.12
22 0.11
23 0.09
24 0.1
25 0.11
26 0.13
27 0.2
28 0.23
29 0.25
30 0.28
31 0.27
32 0.28
33 0.29
34 0.31
35 0.29
36 0.31
37 0.31
38 0.33
39 0.38
40 0.39
41 0.38
42 0.33
43 0.28
44 0.26
45 0.24
46 0.18
47 0.16
48 0.13
49 0.14
50 0.17
51 0.17
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.06
59 0.09
60 0.12
61 0.17
62 0.19
63 0.21
64 0.24
65 0.32
66 0.43
67 0.5
68 0.58
69 0.63
70 0.72
71 0.8
72 0.87
73 0.9
74 0.9
75 0.9
76 0.89
77 0.88
78 0.82
79 0.74
80 0.69
81 0.64
82 0.61
83 0.54
84 0.48
85 0.4
86 0.36
87 0.34
88 0.28
89 0.22
90 0.16
91 0.13
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.08
101 0.1
102 0.13
103 0.14
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.2
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.21
120 0.19
121 0.21
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.21
126 0.2
127 0.2
128 0.27
129 0.29
130 0.33
131 0.39
132 0.44
133 0.51
134 0.6
135 0.65
136 0.64
137 0.64
138 0.61
139 0.59
140 0.56
141 0.51
142 0.44
143 0.44
144 0.44
145 0.42
146 0.43
147 0.39
148 0.39
149 0.37
150 0.34
151 0.27
152 0.25
153 0.24
154 0.27
155 0.27
156 0.25
157 0.28
158 0.28
159 0.31
160 0.25
161 0.24
162 0.24
163 0.25
164 0.25
165 0.24
166 0.23
167 0.19
168 0.2
169 0.2
170 0.14
171 0.14
172 0.16
173 0.15
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.21
179 0.24
180 0.32
181 0.41
182 0.46
183 0.51
184 0.54
185 0.57
186 0.55
187 0.5
188 0.47
189 0.47
190 0.43
191 0.43
192 0.39
193 0.33
194 0.31
195 0.31
196 0.25
197 0.16
198 0.13
199 0.12
200 0.22
201 0.26
202 0.27
203 0.29
204 0.29
205 0.29
206 0.34
207 0.31
208 0.23
209 0.25
210 0.27
211 0.27
212 0.28
213 0.26
214 0.22
215 0.25
216 0.24
217 0.19
218 0.18
219 0.2
220 0.22
221 0.22
222 0.21
223 0.18
224 0.16
225 0.17
226 0.14
227 0.1
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.14
237 0.16
238 0.16
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.23
243 0.24
244 0.22
245 0.2
246 0.19
247 0.14
248 0.14
249 0.1
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.18
256 0.19
257 0.2
258 0.24
259 0.28
260 0.29
261 0.27
262 0.26
263 0.24
264 0.22
265 0.21
266 0.14
267 0.13
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.14
274 0.16
275 0.14
276 0.14
277 0.16
278 0.18
279 0.19
280 0.19
281 0.22
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.16
287 0.17
288 0.22
289 0.21
290 0.22
291 0.22
292 0.26
293 0.25
294 0.25
295 0.27
296 0.26
297 0.31
298 0.34
299 0.35
300 0.35
301 0.43
302 0.44
303 0.48
304 0.47
305 0.45
306 0.46
307 0.52
308 0.55
309 0.56
310 0.62
311 0.6
312 0.57
313 0.53
314 0.48
315 0.46
316 0.43
317 0.43
318 0.39
319 0.35
320 0.36
321 0.34
322 0.33
323 0.29
324 0.31
325 0.22
326 0.24
327 0.27
328 0.26
329 0.27
330 0.28
331 0.26
332 0.25
333 0.28
334 0.29
335 0.27
336 0.3
337 0.3
338 0.3
339 0.32
340 0.28
341 0.24
342 0.18
343 0.16
344 0.12
345 0.1
346 0.08
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.12
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.09
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.1
395 0.13
396 0.11
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.15
401 0.17
402 0.21
403 0.19
404 0.19
405 0.2
406 0.22
407 0.23
408 0.21
409 0.17
410 0.14
411 0.14
412 0.14
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.12
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.13
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.14
429 0.13
430 0.13
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.08
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.2
447 0.27
448 0.31
449 0.33
450 0.36
451 0.4
452 0.45
453 0.51
454 0.49
455 0.49
456 0.48
457 0.53
458 0.56
459 0.58
460 0.56
461 0.53
462 0.54
463 0.48
464 0.47
465 0.4
466 0.33
467 0.27
468 0.26
469 0.27
470 0.21
471 0.21
472 0.21
473 0.2
474 0.18
475 0.18
476 0.15
477 0.15
478 0.18
479 0.17
480 0.16
481 0.16
482 0.2
483 0.19
484 0.21
485 0.21
486 0.2
487 0.24
488 0.32
489 0.37
490 0.34
491 0.42
492 0.46
493 0.45
494 0.47
495 0.47
496 0.48
497 0.5
498 0.54
499 0.54
500 0.52
501 0.48
502 0.44
503 0.45
504 0.35
505 0.27
506 0.28
507 0.24
508 0.22
509 0.24
510 0.29
511 0.27
512 0.33
513 0.41
514 0.4
515 0.38
516 0.41
517 0.39
518 0.37
519 0.37
520 0.34
521 0.34
522 0.36
523 0.37
524 0.39
525 0.39
526 0.38
527 0.38
528 0.38
529 0.32
530 0.31
531 0.3
532 0.24
533 0.28
534 0.3
535 0.28
536 0.28
537 0.28
538 0.24
539 0.25
540 0.23