Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FUN4

Protein Details
Accession A0A4T0FUN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
570-592LSTSLPRRRRHSSRSENRPRIDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MSNKIVHDIYRGVIHDVSSNVKYDFEEMGIEDVVLQELLRIWQNKLDDTNSHQEASTDDSILQSLIHQQQSLQQQGKTGESSNLDDFEEDKKGVKEDTKKDTNEDDDNAINSDLDDDDDDDNDLDSNDDIVLCLYDKVQRVKNKWRMQLKDGIISINNKDYLFSKCSGEFECLILAGHDGVYELDSSFSNMYNLVLPSTSSPHHIEPITAIDASSSTLYFARENNVYASDTLTKRIQLLYQGHTGIILHLSLSINQNHLASCSKAGALILHDLTHHSYHVLNYSPRESLSYCAFSPHYNNILSTATASGTLLIHNTSYLDDSPYLIFPKLHPSPITCIAYSQASKSLIATVSKDGWIAVIDIESKSVIRVINTAHQLTSLAFEGALLVAGSSQGKIFVYNLRSGSSPQTINCTTQPIDSLAFQKDKRKPSGLKSRDYAVHFAEPLVTEHSSKDDRLTKEKKSSSSSNISALAANPARHSTSSLISSSTAPIPPPKDGQKDASNQNLPVYMPSSAGALRPNATLSEKVHSDDVLHVRPRRTSNNAPPPPRPASIANSTDSHLATVNASLNLSTSLPRRRRHSSRSENRPRIDDVDWLKELRAKEKTSTQTAAPVSYHNTSLKRSGSSSSLRHHGHSRTNSFDKNTEKPTVAHSAQSSQEETLRKLVESANALSLSNEIQKARDVLEGDYKSKIENYAQEIRKLRSENSLLRRENERLRRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.22
4 0.25
5 0.22
6 0.23
7 0.21
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.16
13 0.15
14 0.14
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.11
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.05
24 0.06
25 0.08
26 0.14
27 0.16
28 0.16
29 0.21
30 0.23
31 0.27
32 0.3
33 0.31
34 0.3
35 0.34
36 0.42
37 0.4
38 0.39
39 0.35
40 0.32
41 0.29
42 0.32
43 0.28
44 0.2
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.09
51 0.14
52 0.19
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.27
57 0.34
58 0.41
59 0.39
60 0.33
61 0.36
62 0.39
63 0.41
64 0.37
65 0.32
66 0.28
67 0.26
68 0.3
69 0.27
70 0.26
71 0.24
72 0.22
73 0.21
74 0.21
75 0.21
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.19
80 0.22
81 0.28
82 0.34
83 0.39
84 0.48
85 0.53
86 0.54
87 0.56
88 0.59
89 0.57
90 0.52
91 0.46
92 0.4
93 0.33
94 0.33
95 0.3
96 0.25
97 0.19
98 0.14
99 0.13
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.11
123 0.16
124 0.22
125 0.29
126 0.36
127 0.43
128 0.54
129 0.63
130 0.68
131 0.72
132 0.76
133 0.75
134 0.73
135 0.74
136 0.67
137 0.63
138 0.55
139 0.48
140 0.41
141 0.37
142 0.34
143 0.29
144 0.27
145 0.21
146 0.21
147 0.21
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.22
152 0.21
153 0.24
154 0.25
155 0.26
156 0.22
157 0.19
158 0.18
159 0.15
160 0.14
161 0.11
162 0.1
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.16
189 0.17
190 0.2
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.2
195 0.18
196 0.15
197 0.14
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.13
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.16
216 0.18
217 0.17
218 0.2
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.18
224 0.19
225 0.23
226 0.23
227 0.25
228 0.25
229 0.24
230 0.23
231 0.22
232 0.15
233 0.12
234 0.08
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.11
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.11
267 0.13
268 0.13
269 0.15
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.16
279 0.17
280 0.18
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.17
290 0.14
291 0.11
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.22
321 0.28
322 0.3
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.22
327 0.21
328 0.17
329 0.14
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.13
359 0.15
360 0.16
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.08
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.03
374 0.02
375 0.02
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.09
385 0.11
386 0.14
387 0.15
388 0.15
389 0.16
390 0.17
391 0.19
392 0.18
393 0.18
394 0.15
395 0.2
396 0.2
397 0.22
398 0.21
399 0.21
400 0.19
401 0.18
402 0.19
403 0.15
404 0.14
405 0.14
406 0.16
407 0.15
408 0.19
409 0.2
410 0.28
411 0.33
412 0.38
413 0.42
414 0.46
415 0.47
416 0.53
417 0.62
418 0.6
419 0.58
420 0.54
421 0.54
422 0.52
423 0.5
424 0.43
425 0.34
426 0.3
427 0.24
428 0.22
429 0.19
430 0.14
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.1
435 0.11
436 0.14
437 0.15
438 0.14
439 0.18
440 0.23
441 0.25
442 0.34
443 0.39
444 0.41
445 0.49
446 0.53
447 0.52
448 0.51
449 0.53
450 0.5
451 0.52
452 0.48
453 0.42
454 0.39
455 0.35
456 0.3
457 0.25
458 0.24
459 0.19
460 0.18
461 0.16
462 0.16
463 0.16
464 0.16
465 0.18
466 0.14
467 0.15
468 0.17
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.16
475 0.14
476 0.13
477 0.16
478 0.18
479 0.19
480 0.23
481 0.27
482 0.31
483 0.33
484 0.37
485 0.4
486 0.44
487 0.46
488 0.5
489 0.46
490 0.41
491 0.39
492 0.35
493 0.29
494 0.24
495 0.21
496 0.13
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.1
501 0.11
502 0.12
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.14
509 0.16
510 0.16
511 0.19
512 0.18
513 0.19
514 0.19
515 0.18
516 0.17
517 0.2
518 0.23
519 0.25
520 0.3
521 0.32
522 0.34
523 0.39
524 0.43
525 0.44
526 0.47
527 0.51
528 0.56
529 0.63
530 0.7
531 0.7
532 0.69
533 0.69
534 0.66
535 0.58
536 0.5
537 0.43
538 0.4
539 0.42
540 0.42
541 0.37
542 0.33
543 0.33
544 0.32
545 0.28
546 0.23
547 0.16
548 0.13
549 0.11
550 0.12
551 0.13
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.15
560 0.24
561 0.32
562 0.38
563 0.44
564 0.52
565 0.61
566 0.68
567 0.73
568 0.75
569 0.79
570 0.84
571 0.89
572 0.89
573 0.83
574 0.78
575 0.71
576 0.64
577 0.55
578 0.51
579 0.44
580 0.42
581 0.4
582 0.36
583 0.33
584 0.33
585 0.32
586 0.32
587 0.34
588 0.3
589 0.32
590 0.4
591 0.46
592 0.48
593 0.49
594 0.43
595 0.43
596 0.42
597 0.4
598 0.32
599 0.28
600 0.26
601 0.26
602 0.28
603 0.25
604 0.27
605 0.27
606 0.32
607 0.33
608 0.31
609 0.31
610 0.31
611 0.32
612 0.36
613 0.39
614 0.39
615 0.44
616 0.44
617 0.45
618 0.49
619 0.5
620 0.52
621 0.56
622 0.56
623 0.56
624 0.61
625 0.63
626 0.6
627 0.6
628 0.57
629 0.55
630 0.55
631 0.51
632 0.46
633 0.42
634 0.44
635 0.46
636 0.4
637 0.38
638 0.34
639 0.34
640 0.36
641 0.38
642 0.34
643 0.27
644 0.31
645 0.3
646 0.3
647 0.31
648 0.29
649 0.26
650 0.26
651 0.27
652 0.27
653 0.28
654 0.27
655 0.25
656 0.25
657 0.25
658 0.23
659 0.22
660 0.19
661 0.19
662 0.2
663 0.17
664 0.17
665 0.2
666 0.21
667 0.22
668 0.23
669 0.21
670 0.21
671 0.3
672 0.32
673 0.32
674 0.33
675 0.32
676 0.29
677 0.29
678 0.3
679 0.25
680 0.27
681 0.33
682 0.4
683 0.43
684 0.5
685 0.54
686 0.54
687 0.56
688 0.54
689 0.49
690 0.48
691 0.52
692 0.54
693 0.57
694 0.64
695 0.6
696 0.61
697 0.65
698 0.63
699 0.65