Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FJB8

Protein Details
Accession A0A4T0FJB8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-210ADIHKRSRGRRVPTHDNQRVFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8, golg 5, mito 4, cyto 3, plas 2, pero 2, extr 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019410  Methyltransf_16  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006224  PsdUridine_synth_RluA-like_CS  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF10294  Methyltransf_16  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01129  PSI_RLU  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
cd02869  PseudoU_synth_RluA_like  
Amino Acid Sequences MSDKYSHYRQSNEDLVWSPSSNASNEYSLSSMGFDSPPEYSTSLPPINILGRESTLNNSRSLPSSIPTSIPLGELSINPSHITVPPPHDIDRGLGLIDDNGVAMTSLEFDGDALYDAHANDNDIDNDSDDDYADDLVEGGFDDDDEWVYGGAEHAQLGSSTTAATHTRRQSTTTNNTHNRAKSPTPIIDADIHKRSRGRRVPTHDNQRVFKCPDTRCQKVFVRNEHLKRHIKSLHRDEKPYECLDQSCNKRFTRLDNAYLSPPLALLITNVVHTLCYMMTSITAIKPRLRVLFKDNLVMVVDKRPGMLSQGGKHSRLSIDDYLEDLKLDYEYPPKPLHRLDYQTSGCLLLGRTDRAAKQFSSALANNKVSKEYWALVENIHKVHNDRGVINDPISLSSSGRPYVGGDRAASTQWEILRHNANTGVGLCKFQIKTGRKHQIRLHASQVLGWPIVGDKLYNAGTKSRVLHLHARSLEFERFYKSRSGKAHKEQVRVEAPIPGEWAAEMEKSGFEDLLGLVYLVFVFVFSSPFMSQRALFNEAYDISEDLFSDSLEAIFGHHQVNWRSLWPSNTAYTHQPSQGEPGARFSYRSPWKTLDIRIPNQPTGGLFSQMQWDSGLYLSDMISDGLDSFNDLSHKRVLEFGAGTGLPSLLAALRGCPHVVCSDYDDAALIDNLRRNVAVNEVQNVHVVPHIWGQDASALIPPSDGRKFNLILCADTLWMSDQLENLLKSLVATIDTQDESSRVVIIAGFHTNRPPLAKFFRLAKEYGLIPDERGIKEWDIVDNTVREFTYDGVLESSICSRWKIMSYLRYASTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.38
4 0.34
5 0.28
6 0.26
7 0.27
8 0.24
9 0.24
10 0.23
11 0.22
12 0.22
13 0.23
14 0.2
15 0.18
16 0.17
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.18
29 0.25
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.24
34 0.27
35 0.26
36 0.24
37 0.19
38 0.19
39 0.21
40 0.22
41 0.25
42 0.29
43 0.29
44 0.29
45 0.3
46 0.3
47 0.31
48 0.33
49 0.29
50 0.24
51 0.27
52 0.27
53 0.26
54 0.26
55 0.25
56 0.22
57 0.21
58 0.19
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.2
70 0.2
71 0.24
72 0.28
73 0.31
74 0.33
75 0.33
76 0.32
77 0.3
78 0.28
79 0.24
80 0.19
81 0.15
82 0.14
83 0.12
84 0.11
85 0.09
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.08
150 0.11
151 0.14
152 0.21
153 0.27
154 0.33
155 0.34
156 0.38
157 0.41
158 0.48
159 0.55
160 0.56
161 0.6
162 0.61
163 0.65
164 0.68
165 0.66
166 0.6
167 0.56
168 0.5
169 0.47
170 0.47
171 0.45
172 0.42
173 0.4
174 0.38
175 0.38
176 0.39
177 0.39
178 0.39
179 0.37
180 0.35
181 0.39
182 0.41
183 0.46
184 0.5
185 0.52
186 0.55
187 0.63
188 0.71
189 0.76
190 0.83
191 0.8
192 0.78
193 0.75
194 0.7
195 0.68
196 0.61
197 0.57
198 0.54
199 0.49
200 0.52
201 0.55
202 0.57
203 0.52
204 0.55
205 0.56
206 0.57
207 0.62
208 0.6
209 0.62
210 0.64
211 0.69
212 0.7
213 0.72
214 0.71
215 0.65
216 0.66
217 0.63
218 0.61
219 0.64
220 0.68
221 0.69
222 0.65
223 0.67
224 0.63
225 0.62
226 0.6
227 0.53
228 0.44
229 0.35
230 0.32
231 0.32
232 0.37
233 0.38
234 0.41
235 0.45
236 0.43
237 0.46
238 0.46
239 0.48
240 0.51
241 0.48
242 0.45
243 0.43
244 0.45
245 0.42
246 0.41
247 0.35
248 0.24
249 0.19
250 0.13
251 0.09
252 0.07
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.12
271 0.14
272 0.16
273 0.18
274 0.21
275 0.27
276 0.28
277 0.28
278 0.31
279 0.38
280 0.36
281 0.37
282 0.34
283 0.29
284 0.27
285 0.25
286 0.2
287 0.15
288 0.15
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.13
294 0.17
295 0.16
296 0.18
297 0.27
298 0.29
299 0.3
300 0.3
301 0.3
302 0.25
303 0.24
304 0.26
305 0.19
306 0.18
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.15
312 0.1
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.11
318 0.12
319 0.15
320 0.18
321 0.19
322 0.22
323 0.24
324 0.27
325 0.27
326 0.32
327 0.32
328 0.37
329 0.37
330 0.34
331 0.33
332 0.28
333 0.23
334 0.18
335 0.15
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.19
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.19
349 0.2
350 0.21
351 0.23
352 0.26
353 0.26
354 0.25
355 0.25
356 0.21
357 0.2
358 0.18
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.17
365 0.17
366 0.15
367 0.16
368 0.14
369 0.14
370 0.16
371 0.18
372 0.16
373 0.15
374 0.17
375 0.19
376 0.19
377 0.18
378 0.16
379 0.13
380 0.12
381 0.13
382 0.11
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.13
404 0.17
405 0.17
406 0.17
407 0.16
408 0.15
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.22
419 0.24
420 0.31
421 0.4
422 0.51
423 0.49
424 0.55
425 0.58
426 0.59
427 0.6
428 0.56
429 0.51
430 0.43
431 0.41
432 0.36
433 0.33
434 0.24
435 0.18
436 0.15
437 0.1
438 0.07
439 0.08
440 0.06
441 0.05
442 0.04
443 0.06
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.12
449 0.15
450 0.16
451 0.17
452 0.18
453 0.2
454 0.27
455 0.28
456 0.33
457 0.32
458 0.32
459 0.31
460 0.32
461 0.3
462 0.24
463 0.23
464 0.21
465 0.2
466 0.2
467 0.26
468 0.24
469 0.29
470 0.36
471 0.43
472 0.46
473 0.54
474 0.62
475 0.61
476 0.65
477 0.6
478 0.59
479 0.54
480 0.48
481 0.4
482 0.34
483 0.28
484 0.22
485 0.22
486 0.15
487 0.12
488 0.1
489 0.1
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.03
508 0.03
509 0.02
510 0.03
511 0.03
512 0.04
513 0.04
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.1
518 0.11
519 0.12
520 0.14
521 0.18
522 0.2
523 0.2
524 0.19
525 0.19
526 0.19
527 0.18
528 0.16
529 0.12
530 0.08
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.08
544 0.08
545 0.09
546 0.14
547 0.15
548 0.18
549 0.17
550 0.18
551 0.19
552 0.21
553 0.22
554 0.22
555 0.23
556 0.24
557 0.25
558 0.26
559 0.28
560 0.3
561 0.31
562 0.29
563 0.28
564 0.25
565 0.28
566 0.3
567 0.28
568 0.24
569 0.26
570 0.27
571 0.26
572 0.27
573 0.23
574 0.29
575 0.34
576 0.37
577 0.36
578 0.36
579 0.42
580 0.45
581 0.49
582 0.49
583 0.48
584 0.49
585 0.53
586 0.54
587 0.49
588 0.45
589 0.41
590 0.31
591 0.28
592 0.26
593 0.2
594 0.15
595 0.15
596 0.2
597 0.2
598 0.2
599 0.15
600 0.14
601 0.13
602 0.13
603 0.12
604 0.07
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.06
610 0.06
611 0.05
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.05
617 0.07
618 0.1
619 0.1
620 0.12
621 0.16
622 0.17
623 0.16
624 0.19
625 0.18
626 0.19
627 0.19
628 0.17
629 0.16
630 0.15
631 0.15
632 0.13
633 0.12
634 0.08
635 0.07
636 0.07
637 0.04
638 0.06
639 0.06
640 0.07
641 0.09
642 0.1
643 0.11
644 0.1
645 0.11
646 0.12
647 0.14
648 0.14
649 0.17
650 0.19
651 0.19
652 0.19
653 0.18
654 0.15
655 0.15
656 0.14
657 0.1
658 0.1
659 0.13
660 0.14
661 0.14
662 0.14
663 0.15
664 0.15
665 0.2
666 0.23
667 0.21
668 0.25
669 0.26
670 0.27
671 0.26
672 0.25
673 0.2
674 0.16
675 0.15
676 0.12
677 0.14
678 0.15
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.16
683 0.15
684 0.14
685 0.13
686 0.13
687 0.12
688 0.12
689 0.13
690 0.16
691 0.2
692 0.21
693 0.21
694 0.25
695 0.27
696 0.28
697 0.35
698 0.31
699 0.27
700 0.27
701 0.25
702 0.21
703 0.2
704 0.18
705 0.13
706 0.13
707 0.12
708 0.12
709 0.11
710 0.14
711 0.17
712 0.17
713 0.15
714 0.14
715 0.13
716 0.13
717 0.13
718 0.11
719 0.08
720 0.09
721 0.1
722 0.13
723 0.14
724 0.14
725 0.14
726 0.14
727 0.14
728 0.14
729 0.13
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.1
734 0.12
735 0.17
736 0.18
737 0.19
738 0.22
739 0.23
740 0.24
741 0.27
742 0.27
743 0.29
744 0.35
745 0.38
746 0.39
747 0.45
748 0.51
749 0.51
750 0.49
751 0.44
752 0.4
753 0.37
754 0.36
755 0.32
756 0.24
757 0.22
758 0.26
759 0.29
760 0.26
761 0.27
762 0.27
763 0.25
764 0.28
765 0.28
766 0.28
767 0.26
768 0.27
769 0.28
770 0.27
771 0.27
772 0.26
773 0.24
774 0.2
775 0.17
776 0.17
777 0.17
778 0.16
779 0.15
780 0.14
781 0.14
782 0.14
783 0.15
784 0.16
785 0.14
786 0.15
787 0.15
788 0.16
789 0.19
790 0.22
791 0.26
792 0.32
793 0.37
794 0.43
795 0.47