Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FIR7

Protein Details
Accession A0A4T0FIR7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
336-357MNIISKASKQRKPKRNEDICVFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007242  Atg12  
IPR015350  Beta-trefoil_DNA-bd_dom  
IPR036358  BTD_sf  
IPR040159  CLS_fam  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR015351  RBP-J/Cbf11/Cbf12_DNA-bd  
IPR037095  RBP-J/Cbf11_DNA-bd_sf  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000045  P:autophagosome assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04110  APG12  
PF09271  LAG1-DNAbind  
CDD cd01612  Ubl_ATG12  
Amino Acid Sequences MDFDFSNYSIAEQAQPEDAYDSAYDPLSISPTEGVRDVAVKTEAEEEEVEIDGGREGGGEQLPPQYRPNRHRGSVPSLSSAFSSFTVEQQSPVTPTSGYFGHPFVGLSNANRHSVSVVAPSDTFVKPAAVVPPPAPQAWQSRRYNGEEDRRLNERLTITIKNFVNAPHRLDFGEQIVSITTPQTAQKSYGTEKRFIAPPPQVCLIGKNWNSDNKKNKYSHALGLDLGQLSPSVQIKLSANHEAHRCELKWTEFQSESSAGAEMPLTPPTSSPSSDKSDSLPHDSNDRLMHGKAVAKHLHISDVSDDRRISNCYAEIVIPSILSRNPFKGSFSLPNMNIISKASKQRKPKRNEDICVFHGSIVSLYNRAKSQTSSTRYLTVTGTPCIWPVGSDDEKNFDGGIDLKNATFTPDPNYWDPFIIWMYDTVYAHDTLPEVPADWPTPPVGAVPNDMHTTPIRANSVIVLQSLAHGVVSPPLIVRRAGKGSSVTGGGKVDEHRRRSSLDSNTQQRHRQMGCIRGSVLGEPTVQLNKVGLELAVQSPRDANELEASGMYLTCVDDLIRLIHPPKASSGKVDFPSRDQEASKSRRTSYTSEMHDDSADGAYRPRSRRASARSSISEPSGTASGRSKRRSSQYDANNLDAYAEDGMTWSLDVGEIALWTLSGAEVRNHHIYTPEFPSSGVEHLSTNRRPSMELPTPIPYLDSWVRCDRSTRKQYADFAELDLVRIKGKDLDSFSDIAGGVSGAAAALYFSGKMVKYQGVGLGLDLGDDANASAIHSNRSEEVGVWQATLIDVLSYEEMIVGLPFAQQVHQLGELIDDELSVIAIMKHNGCIIPSRVKSTQMSGDPPTLPPLPTSEALFSPKNSPNLDTIGSPQPRAVSQVHSTASGGAPVAVDDVADIETEYRENGIHAAAERGLASYRRRDGRKVVVRFKAIGAAPIMKQNYYKISDSNRFATVIQFLRKECGLANSACPVFCYINSAFAPSPDDTIGNLYKCYGTEGHVIVNYSTSVAWG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.17
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.16
28 0.16
29 0.2
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.1
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.06
42 0.05
43 0.05
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.17
49 0.2
50 0.22
51 0.29
52 0.35
53 0.44
54 0.51
55 0.6
56 0.61
57 0.62
58 0.68
59 0.68
60 0.69
61 0.68
62 0.63
63 0.58
64 0.51
65 0.48
66 0.41
67 0.35
68 0.28
69 0.2
70 0.22
71 0.17
72 0.18
73 0.23
74 0.22
75 0.22
76 0.23
77 0.24
78 0.21
79 0.21
80 0.2
81 0.15
82 0.15
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.13
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.24
96 0.25
97 0.27
98 0.27
99 0.27
100 0.23
101 0.23
102 0.22
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.21
109 0.2
110 0.2
111 0.15
112 0.14
113 0.13
114 0.15
115 0.19
116 0.17
117 0.19
118 0.19
119 0.24
120 0.26
121 0.25
122 0.24
123 0.23
124 0.31
125 0.37
126 0.45
127 0.44
128 0.49
129 0.54
130 0.58
131 0.61
132 0.59
133 0.62
134 0.62
135 0.62
136 0.6
137 0.58
138 0.56
139 0.49
140 0.46
141 0.36
142 0.32
143 0.33
144 0.33
145 0.31
146 0.37
147 0.36
148 0.32
149 0.32
150 0.31
151 0.34
152 0.32
153 0.35
154 0.29
155 0.31
156 0.31
157 0.31
158 0.29
159 0.24
160 0.23
161 0.17
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.11
170 0.14
171 0.15
172 0.17
173 0.19
174 0.24
175 0.29
176 0.36
177 0.37
178 0.38
179 0.38
180 0.4
181 0.42
182 0.39
183 0.41
184 0.41
185 0.41
186 0.41
187 0.42
188 0.39
189 0.35
190 0.36
191 0.32
192 0.34
193 0.33
194 0.33
195 0.34
196 0.41
197 0.47
198 0.53
199 0.59
200 0.57
201 0.64
202 0.62
203 0.63
204 0.63
205 0.61
206 0.59
207 0.53
208 0.46
209 0.38
210 0.36
211 0.34
212 0.25
213 0.2
214 0.14
215 0.1
216 0.08
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.12
222 0.13
223 0.17
224 0.21
225 0.25
226 0.25
227 0.29
228 0.32
229 0.31
230 0.33
231 0.35
232 0.31
233 0.28
234 0.31
235 0.31
236 0.33
237 0.34
238 0.37
239 0.33
240 0.33
241 0.33
242 0.3
243 0.27
244 0.21
245 0.19
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.12
256 0.15
257 0.16
258 0.18
259 0.21
260 0.27
261 0.29
262 0.29
263 0.28
264 0.32
265 0.33
266 0.38
267 0.36
268 0.3
269 0.33
270 0.32
271 0.33
272 0.27
273 0.27
274 0.22
275 0.19
276 0.2
277 0.18
278 0.21
279 0.21
280 0.26
281 0.25
282 0.24
283 0.27
284 0.26
285 0.26
286 0.22
287 0.21
288 0.18
289 0.22
290 0.22
291 0.22
292 0.22
293 0.21
294 0.23
295 0.24
296 0.22
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.17
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.16
313 0.17
314 0.19
315 0.2
316 0.24
317 0.27
318 0.31
319 0.34
320 0.31
321 0.35
322 0.34
323 0.32
324 0.28
325 0.23
326 0.21
327 0.19
328 0.28
329 0.32
330 0.37
331 0.48
332 0.58
333 0.67
334 0.72
335 0.78
336 0.8
337 0.81
338 0.81
339 0.77
340 0.73
341 0.66
342 0.63
343 0.52
344 0.41
345 0.32
346 0.26
347 0.19
348 0.15
349 0.13
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.21
358 0.27
359 0.32
360 0.35
361 0.36
362 0.38
363 0.37
364 0.37
365 0.32
366 0.28
367 0.24
368 0.2
369 0.2
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.14
374 0.09
375 0.09
376 0.15
377 0.15
378 0.16
379 0.17
380 0.2
381 0.2
382 0.2
383 0.18
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.14
397 0.16
398 0.2
399 0.21
400 0.23
401 0.21
402 0.21
403 0.21
404 0.17
405 0.15
406 0.12
407 0.1
408 0.08
409 0.08
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.1
434 0.1
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.12
440 0.14
441 0.12
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.13
448 0.11
449 0.1
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.11
467 0.13
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.15
474 0.12
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.11
480 0.19
481 0.23
482 0.26
483 0.27
484 0.28
485 0.3
486 0.34
487 0.39
488 0.37
489 0.4
490 0.43
491 0.49
492 0.53
493 0.55
494 0.55
495 0.49
496 0.49
497 0.41
498 0.4
499 0.36
500 0.39
501 0.37
502 0.34
503 0.33
504 0.27
505 0.27
506 0.21
507 0.18
508 0.11
509 0.08
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.05
520 0.04
521 0.05
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.1
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.05
539 0.04
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.04
545 0.04
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.08
550 0.11
551 0.11
552 0.12
553 0.14
554 0.17
555 0.17
556 0.2
557 0.22
558 0.25
559 0.27
560 0.3
561 0.28
562 0.25
563 0.3
564 0.28
565 0.27
566 0.22
567 0.23
568 0.29
569 0.34
570 0.38
571 0.36
572 0.35
573 0.38
574 0.41
575 0.41
576 0.38
577 0.4
578 0.37
579 0.38
580 0.38
581 0.34
582 0.31
583 0.27
584 0.21
585 0.15
586 0.12
587 0.08
588 0.08
589 0.11
590 0.17
591 0.19
592 0.25
593 0.28
594 0.3
595 0.38
596 0.44
597 0.49
598 0.49
599 0.53
600 0.49
601 0.49
602 0.48
603 0.41
604 0.34
605 0.25
606 0.21
607 0.17
608 0.13
609 0.12
610 0.15
611 0.21
612 0.28
613 0.32
614 0.34
615 0.38
616 0.46
617 0.51
618 0.53
619 0.55
620 0.56
621 0.61
622 0.61
623 0.57
624 0.5
625 0.44
626 0.36
627 0.27
628 0.2
629 0.1
630 0.07
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.03
640 0.03
641 0.03
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.04
650 0.04
651 0.06
652 0.08
653 0.12
654 0.16
655 0.16
656 0.16
657 0.18
658 0.19
659 0.21
660 0.25
661 0.22
662 0.19
663 0.19
664 0.21
665 0.19
666 0.19
667 0.16
668 0.12
669 0.11
670 0.15
671 0.21
672 0.22
673 0.24
674 0.25
675 0.25
676 0.25
677 0.27
678 0.33
679 0.33
680 0.33
681 0.33
682 0.34
683 0.34
684 0.33
685 0.31
686 0.22
687 0.2
688 0.22
689 0.21
690 0.22
691 0.27
692 0.3
693 0.29
694 0.35
695 0.37
696 0.43
697 0.51
698 0.52
699 0.53
700 0.56
701 0.6
702 0.59
703 0.57
704 0.47
705 0.39
706 0.36
707 0.3
708 0.25
709 0.22
710 0.17
711 0.14
712 0.13
713 0.12
714 0.13
715 0.14
716 0.17
717 0.18
718 0.21
719 0.23
720 0.24
721 0.23
722 0.2
723 0.19
724 0.15
725 0.12
726 0.08
727 0.06
728 0.05
729 0.05
730 0.03
731 0.02
732 0.02
733 0.02
734 0.02
735 0.03
736 0.03
737 0.03
738 0.06
739 0.06
740 0.08
741 0.1
742 0.11
743 0.12
744 0.13
745 0.14
746 0.14
747 0.13
748 0.12
749 0.11
750 0.1
751 0.09
752 0.08
753 0.06
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.03
758 0.03
759 0.04
760 0.06
761 0.07
762 0.09
763 0.1
764 0.12
765 0.12
766 0.14
767 0.14
768 0.12
769 0.14
770 0.17
771 0.17
772 0.15
773 0.14
774 0.13
775 0.12
776 0.12
777 0.09
778 0.04
779 0.04
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.04
788 0.04
789 0.04
790 0.04
791 0.05
792 0.05
793 0.05
794 0.07
795 0.08
796 0.1
797 0.11
798 0.11
799 0.1
800 0.11
801 0.11
802 0.1
803 0.09
804 0.07
805 0.06
806 0.06
807 0.05
808 0.04
809 0.04
810 0.04
811 0.06
812 0.08
813 0.08
814 0.09
815 0.1
816 0.11
817 0.11
818 0.15
819 0.18
820 0.25
821 0.27
822 0.32
823 0.33
824 0.37
825 0.38
826 0.38
827 0.41
828 0.36
829 0.39
830 0.35
831 0.38
832 0.35
833 0.34
834 0.34
835 0.28
836 0.25
837 0.21
838 0.22
839 0.22
840 0.22
841 0.23
842 0.21
843 0.21
844 0.25
845 0.27
846 0.24
847 0.28
848 0.32
849 0.35
850 0.34
851 0.34
852 0.32
853 0.34
854 0.34
855 0.27
856 0.27
857 0.31
858 0.31
859 0.3
860 0.28
861 0.26
862 0.25
863 0.28
864 0.26
865 0.22
866 0.23
867 0.29
868 0.29
869 0.28
870 0.28
871 0.25
872 0.24
873 0.19
874 0.15
875 0.1
876 0.09
877 0.08
878 0.08
879 0.06
880 0.06
881 0.05
882 0.05
883 0.05
884 0.05
885 0.05
886 0.05
887 0.06
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.07
893 0.08
894 0.08
895 0.09
896 0.1
897 0.12
898 0.11
899 0.12
900 0.11
901 0.11
902 0.13
903 0.16
904 0.19
905 0.25
906 0.32
907 0.4
908 0.44
909 0.48
910 0.54
911 0.61
912 0.68
913 0.7
914 0.72
915 0.71
916 0.71
917 0.68
918 0.61
919 0.56
920 0.46
921 0.39
922 0.33
923 0.29
924 0.26
925 0.3
926 0.31
927 0.25
928 0.26
929 0.27
930 0.3
931 0.32
932 0.32
933 0.31
934 0.39
935 0.46
936 0.5
937 0.5
938 0.45
939 0.42
940 0.4
941 0.37
942 0.35
943 0.32
944 0.33
945 0.33
946 0.32
947 0.35
948 0.35
949 0.33
950 0.28
951 0.27
952 0.26
953 0.24
954 0.26
955 0.29
956 0.3
957 0.28
958 0.28
959 0.26
960 0.24
961 0.22
962 0.25
963 0.19
964 0.25
965 0.26
966 0.29
967 0.26
968 0.25
969 0.29
970 0.24
971 0.26
972 0.2
973 0.2
974 0.17
975 0.22
976 0.26
977 0.23
978 0.22
979 0.21
980 0.21
981 0.2
982 0.24
983 0.19
984 0.18
985 0.22
986 0.23
987 0.25
988 0.26
989 0.27
990 0.24
991 0.24
992 0.21
993 0.16