FuNGI

A0A4T0FFM3

Protein Details

Accession

A0A4T0FFM3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
556-580	ITPKISRTNKFKRPKPAHKVVRSSS	Hydrophilic
1008-1040	DTSKHPRKSIWSKLYGRYTKRTRHRLNIVPIYS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
566-571	FKRPKP

Subcellular Location(s)

cyto 10, cyto_nucl 10, nucl 8, mito 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037202 ESCRT_assembly_dom IPR010920 LSM_dom_sf IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc IPR007143 Vps28 IPR017899 VPS28_C IPR037206 VPS28_C_sf IPR017898 VPS28_N IPR038358 VPS28_N_sf
Gene Ontology	GO:0000813 C:ESCRT I complex GO:0032509 P:endosome transport via multivesicular body sorting pathway GO:0072666 P:establishment of protein localization to vacuole GO:0006886 P:intracellular protein transport GO:0006364 P:rRNA processing GO:0043162 P:ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway GO:0007034 P:vacuolar transport
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM PF03997 VPS28
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM PS51310 VPS28_C PS51313 VPS28_N
CDD	cd01717 Sm_B

Amino Acid Sequences

MELLQEVKLYSTTTERDRYENLATLFGIIQSLDYLERAYVRDSVSQAQYAPACVKLLAQFKTILKLVAGDIAGSVDEFMAQYNMDCPAAAHRLHVGVPATVEHSAEEGVETGKWVAETTQCFITFMDALRLNLRAKDQLHPMLTDLMSVYSRFKGSSEWEGRPKLVGWLITLNKMKAADEITDEQSRQMLFDVDHAYNEFFRSLVECRNEQNQKASKLQLVPPVYQRVYQLRRQSKNEERVHEHLDCLRAVVEGGVEAYGVVGVEITVRIQQQPHVLRQANEEDPEAEGDGGECDALEECPASASAPPPKPKNSRMLTLINYRLRVTLNDTRQIVGQMLAFDKHMNLVLVDSIEFRRLKGPSSQGDIPKEMKRALGLIVLRGENIISIAVEGPPPVKEEDPISAGPGVGAPAGRGMPLGAGVGGAAPPAFQARPMPYAGGPPPPGFPGAAPGFRPPPGFPGAPAGLPTPPPGLARDGHLASFITEETLENVKHFASTDSLNATYVSLDGVLSLIDSLLVSSPKQENLLDEEPLEEISFIQNMGDSPLKAAEQDTGITPKISRTNKFKRPKPAHKVVRSSSSYTDLSDYYPSDTDYNDIALHSPSTTSPPLTPNMDAEKNYAGLDGLMLAGGAAHTTNISNDTLIHTQNQIRDLEKRNAELEKRLKESERSYTQTTSQNEDYISIMEDQLKENDAKLEALVREEKDLRAKDRQTTFAINKLEHEIATYQRQAETARIQASTLQNQNADVAAEIDSLRDSLREKDREVREARGRADWYEHQAKKWENERRGYEDALQHIKAQLDEARLSERELDVQKSENVGLKVGVAFVRLSSSNTTHQETIDRLRSDLNHQLAYSGSTDDSSGQLGSVSRNLGKELARQLTETDSGAFDHRHSRHELSEGEIETVVTTRRRKVKPSGGVGVKDGGGAEARANTAANTATNTIESPPPYSSDQPLDYEYVDDVREVCSRGVQAAVEGRAMETQTDGAEGEDEEVEEEAEEEAEEQNTSDTSKHPRKSIWSKLYGRYTKRTRHRLNIVPIYSTIVFICGMVGGAWLLPSSTSSVESLRSAGVEDKAIFVAYNTFEGASSFLNSDNRLVRFIQSVVWSGVDTSQLFPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.33
3	0.37
4	0.39
5	0.42
6	0.42
7	0.44
8	0.39
9	0.34
10	0.32
11	0.29
12	0.26
13	0.21
14	0.17
15	0.1
16	0.09
17	0.07
18	0.09
19	0.07
20	0.07
21	0.08
22	0.08
23	0.1
24	0.12
25	0.13
26	0.16
27	0.17
28	0.21
29	0.23
30	0.28
31	0.3
32	0.3
33	0.28
34	0.29
35	0.28
36	0.26
37	0.25
38	0.2
39	0.18
40	0.17
41	0.19
42	0.21
43	0.27
44	0.27
45	0.27
46	0.31
47	0.31
48	0.37
49	0.35
50	0.3
51	0.23
52	0.22
53	0.2
54	0.19
55	0.18
56	0.12
57	0.12
58	0.11
59	0.11
60	0.09
61	0.08
62	0.04
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.07
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.14
75	0.18
76	0.18
77	0.18
78	0.19
79	0.2
80	0.21
81	0.24
82	0.2
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.16
87	0.15
88	0.15
89	0.12
90	0.11
91	0.11
92	0.1
93	0.09
94	0.07
95	0.08
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.13
104	0.16
105	0.18
106	0.23
107	0.22
108	0.23
109	0.23
110	0.24
111	0.2
112	0.19
113	0.22
114	0.19
115	0.2
116	0.21
117	0.24
118	0.23
119	0.24
120	0.26
121	0.25
122	0.26
123	0.3
124	0.35
125	0.39
126	0.39
127	0.37
128	0.36
129	0.35
130	0.32
131	0.27
132	0.21
133	0.16
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.13
138	0.14
139	0.14
140	0.14
141	0.15
142	0.19
143	0.29
144	0.33
145	0.38
146	0.44
147	0.47
148	0.47
149	0.46
150	0.41
151	0.35
152	0.32
153	0.26
154	0.21
155	0.26
156	0.27
157	0.32
158	0.35
159	0.3
160	0.3
161	0.29
162	0.27
163	0.22
164	0.22
165	0.17
166	0.18
167	0.22
168	0.24
169	0.26
170	0.26
171	0.24
172	0.24
173	0.22
174	0.18
175	0.15
176	0.13
177	0.1
178	0.15
179	0.19
180	0.17
181	0.18
182	0.19
183	0.19
184	0.18
185	0.19
186	0.14
187	0.09
188	0.09
189	0.11
190	0.13
191	0.18
192	0.22
193	0.23
194	0.26
195	0.36
196	0.41
197	0.4
198	0.47
199	0.48
200	0.48
201	0.51
202	0.51
203	0.46
204	0.46
205	0.48
206	0.46
207	0.43
208	0.41
209	0.41
210	0.46
211	0.42
212	0.38
213	0.38
214	0.4
215	0.42
216	0.45
217	0.51
218	0.53
219	0.6
220	0.64
221	0.7
222	0.7
223	0.76
224	0.76
225	0.73
226	0.7
227	0.67
228	0.67
229	0.58
230	0.51
231	0.44
232	0.39
233	0.31
234	0.25
235	0.2
236	0.14
237	0.13
238	0.11
239	0.08
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.02
250	0.02
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.09
258	0.12
259	0.2
260	0.24
261	0.28
262	0.34
263	0.36
264	0.36
265	0.4
266	0.43
267	0.38
268	0.35
269	0.31
270	0.24
271	0.22
272	0.21
273	0.17
274	0.11
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.09
292	0.18
293	0.24
294	0.3
295	0.34
296	0.42
297	0.49
298	0.53
299	0.59
300	0.55
301	0.54
302	0.54
303	0.55
304	0.51
305	0.52
306	0.55
307	0.48
308	0.46
309	0.41
310	0.37
311	0.32
312	0.29
313	0.29
314	0.29
315	0.3
316	0.34
317	0.35
318	0.34
319	0.33
320	0.33
321	0.26
322	0.19
323	0.15
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.07
340	0.12
341	0.12
342	0.12
343	0.16
344	0.16
345	0.18
346	0.22
347	0.28
348	0.27
349	0.33
350	0.38
351	0.38
352	0.41
353	0.42
354	0.41
355	0.38
356	0.37
357	0.31
358	0.27
359	0.22
360	0.2
361	0.18
362	0.18
363	0.15
364	0.14
365	0.15
366	0.15
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.08
371	0.08
372	0.06
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.07
382	0.09
383	0.08
384	0.09
385	0.11
386	0.13
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.13
391	0.13
392	0.12
393	0.1
394	0.08
395	0.06
396	0.05
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.02
413	0.02
414	0.03
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.07
419	0.09
420	0.12
421	0.12
422	0.14
423	0.13
424	0.16
425	0.17
426	0.19
427	0.19
428	0.17
429	0.18
430	0.17
431	0.17
432	0.14
433	0.12
434	0.14
435	0.14
436	0.15
437	0.15
438	0.16
439	0.18
440	0.19
441	0.2
442	0.15
443	0.16
444	0.18
445	0.18
446	0.16
447	0.19
448	0.19
449	0.17
450	0.18
451	0.15
452	0.12
453	0.13
454	0.13
455	0.09
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.12
460	0.11
461	0.13
462	0.16
463	0.15
464	0.14
465	0.14
466	0.13
467	0.11
468	0.11
469	0.09
470	0.06
471	0.05
472	0.05
473	0.07
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.09
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.1
486	0.1
487	0.11
488	0.1
489	0.1
490	0.08
491	0.07
492	0.06
493	0.04
494	0.04
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.02
501	0.02
502	0.02
503	0.02
504	0.03
505	0.04
506	0.04
507	0.06
508	0.07
509	0.08
510	0.09
511	0.1
512	0.1
513	0.16
514	0.17
515	0.16
516	0.15
517	0.15
518	0.13
519	0.13
520	0.12
521	0.06
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.07
541	0.08
542	0.08
543	0.09
544	0.08
545	0.1
546	0.17
547	0.2
548	0.23
549	0.31
550	0.41
551	0.51
552	0.6
553	0.64
554	0.68
555	0.75
556	0.81
557	0.81
558	0.82
559	0.82
560	0.8
561	0.82
562	0.73
563	0.7
564	0.62
565	0.56
566	0.46
567	0.41
568	0.33
569	0.27
570	0.25
571	0.18
572	0.16
573	0.14
574	0.13
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.09
580	0.1
581	0.09
582	0.09
583	0.08
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.09
592	0.09
593	0.1
594	0.11
595	0.12
596	0.15
597	0.16
598	0.17
599	0.16
600	0.2
601	0.21
602	0.2
603	0.2
604	0.18
605	0.17
606	0.16
607	0.14
608	0.09
609	0.07
610	0.06
611	0.05
612	0.04
613	0.03
614	0.03
615	0.02
616	0.02
617	0.02
618	0.02
619	0.02
620	0.02
621	0.02
622	0.03
623	0.03
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.09
629	0.11
630	0.11
631	0.12
632	0.13
633	0.15
634	0.17
635	0.19
636	0.17
637	0.17
638	0.22
639	0.27
640	0.31
641	0.31
642	0.3
643	0.3
644	0.33
645	0.33
646	0.35
647	0.36
648	0.35
649	0.37
650	0.37
651	0.36
652	0.37
653	0.39
654	0.39
655	0.38
656	0.37
657	0.37
658	0.37
659	0.39
660	0.42
661	0.4
662	0.37
663	0.32
664	0.29
665	0.26
666	0.25
667	0.22
668	0.15
669	0.14
670	0.09
671	0.09
672	0.1
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.11
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.1
681	0.09
682	0.09
683	0.11
684	0.1
685	0.12
686	0.14
687	0.13
688	0.16
689	0.17
690	0.18
691	0.22
692	0.24
693	0.26
694	0.31
695	0.33
696	0.38
697	0.4
698	0.43
699	0.39
700	0.43
701	0.41
702	0.4
703	0.4
704	0.32
705	0.3
706	0.3
707	0.27
708	0.2
709	0.2
710	0.15
711	0.15
712	0.18
713	0.18
714	0.15
715	0.15
716	0.16
717	0.16
718	0.17
719	0.17
720	0.18
721	0.18
722	0.17
723	0.17
724	0.21
725	0.24
726	0.26
727	0.27
728	0.24
729	0.23
730	0.23
731	0.24
732	0.19
733	0.16
734	0.1
735	0.08
736	0.06
737	0.07
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.07
745	0.13
746	0.21
747	0.23
748	0.26
749	0.35
750	0.38
751	0.46
752	0.47
753	0.49
754	0.48
755	0.5
756	0.5
757	0.46
758	0.43
759	0.36
760	0.39
761	0.34
762	0.33
763	0.39
764	0.38
765	0.35
766	0.4
767	0.41
768	0.43
769	0.49
770	0.51
771	0.48
772	0.54
773	0.57
774	0.58
775	0.58
776	0.53
777	0.49
778	0.43
779	0.42
780	0.39
781	0.35
782	0.28
783	0.27
784	0.26
785	0.21
786	0.2
787	0.17
788	0.16
789	0.16
790	0.16
791	0.18
792	0.17
793	0.18
794	0.18
795	0.15
796	0.17
797	0.19
798	0.2
799	0.18
800	0.2
801	0.2
802	0.2
803	0.21
804	0.21
805	0.19
806	0.17
807	0.16
808	0.14
809	0.13
810	0.13
811	0.11
812	0.08
813	0.07
814	0.07
815	0.09
816	0.09
817	0.1
818	0.12
819	0.15
820	0.2
821	0.23
822	0.27
823	0.25
824	0.25
825	0.26
826	0.27
827	0.3
828	0.32
829	0.29
830	0.27
831	0.29
832	0.3
833	0.32
834	0.37
835	0.34
836	0.28
837	0.27
838	0.27
839	0.24
840	0.24
841	0.2
842	0.13
843	0.1
844	0.09
845	0.09
846	0.09
847	0.1
848	0.09
849	0.08
850	0.07
851	0.07
852	0.08
853	0.09
854	0.1
855	0.12
856	0.13
857	0.14
858	0.15
859	0.17
860	0.18
861	0.22
862	0.26
863	0.29
864	0.28
865	0.28
866	0.28
867	0.28
868	0.28
869	0.23
870	0.17
871	0.13
872	0.14
873	0.15
874	0.14
875	0.13
876	0.21
877	0.22
878	0.24
879	0.29
880	0.31
881	0.31
882	0.35
883	0.34
884	0.3
885	0.33
886	0.31
887	0.27
888	0.24
889	0.21
890	0.17
891	0.17
892	0.15
893	0.15
894	0.18
895	0.24
896	0.33
897	0.37
898	0.44
899	0.53
900	0.61
901	0.65
902	0.69
903	0.72
904	0.68
905	0.65
906	0.6
907	0.52
908	0.42
909	0.32
910	0.25
911	0.16
912	0.11
913	0.09
914	0.09
915	0.08
916	0.08
917	0.09
918	0.09
919	0.08
920	0.09
921	0.1
922	0.09
923	0.1
924	0.11
925	0.11
926	0.12
927	0.12
928	0.13
929	0.16
930	0.16
931	0.17
932	0.17
933	0.2
934	0.23
935	0.25
936	0.27
937	0.29
938	0.3
939	0.29
940	0.3
941	0.28
942	0.25
943	0.23
944	0.2
945	0.16
946	0.14
947	0.12
948	0.11
949	0.12
950	0.13
951	0.14
952	0.14
953	0.14
954	0.15
955	0.15
956	0.16
957	0.14
958	0.14
959	0.17
960	0.18
961	0.16
962	0.16
963	0.15
964	0.15
965	0.16
966	0.13
967	0.09
968	0.09
969	0.08
970	0.09
971	0.08
972	0.07
973	0.08
974	0.08
975	0.08
976	0.08
977	0.08
978	0.08
979	0.08
980	0.07
981	0.06
982	0.07
983	0.06
984	0.05
985	0.05
986	0.06
987	0.06
988	0.07
989	0.07
990	0.07
991	0.07
992	0.08
993	0.09
994	0.09
995	0.12
996	0.22
997	0.31
998	0.36
999	0.4
1000	0.44
1001	0.53
1002	0.62
1003	0.7
1004	0.69
1005	0.7
1006	0.72
1007	0.76
1008	0.82
1009	0.81
1010	0.77
1011	0.76
1012	0.76
1013	0.76
1014	0.8
1015	0.82
1016	0.81
1017	0.82
1018	0.86
1019	0.85
1020	0.86
1021	0.86
1022	0.77
1023	0.69
1024	0.6
1025	0.55
1026	0.46
1027	0.37
1028	0.27
1029	0.18
1030	0.16
1031	0.13
1032	0.12
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.06
1036	0.06
1037	0.05
1038	0.05
1039	0.05
1040	0.05
1041	0.05
1042	0.05
1043	0.06
1044	0.08
1045	0.09
1046	0.1
1047	0.12
1048	0.13
1049	0.15
1050	0.16
1051	0.17
1052	0.15
1053	0.14
1054	0.14
1055	0.16
1056	0.16
1057	0.18
1058	0.17
1059	0.18
1060	0.17
1061	0.17
1062	0.16
1063	0.13
1064	0.15
1065	0.13
1066	0.14
1067	0.13
1068	0.12
1069	0.12
1070	0.13
1071	0.14
1072	0.11
1073	0.12
1074	0.12
1075	0.14
1076	0.17
1077	0.18
1078	0.22
1079	0.27
1080	0.27
1081	0.28
1082	0.28
1083	0.27
1084	0.28
1085	0.27
1086	0.27
1087	0.23
1088	0.25
1089	0.24
1090	0.23
1091	0.21
1092	0.19
1093	0.19
1094	0.19
1095	0.17

A0A4T0FFM3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer