Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FDP2

Protein Details
Accession A0A4T0FDP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-299QPERTAPKAPKRTKPLAPSRSHydrophilic
303-326NDITNRYRFTKKEQKRRALHTQSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MASSRLYTSRGGDKTRTCGTRRAHSMKDDYDYYDKWIGSIVRVDNVSDNGDDKHCRSLIRWVVATDTTLLSAFRPAGPIRHIHIETVYSTPSDFRYAVIIYHNPQHARLATALSGMMIRGRYVTVTLVNSCCEIIPYHPQTMNDVLLEQRERFFLSSKIPQVSIFGSAPAVPSTMNKMDLLTTPHPSICLPPSDCVEPGSKLDEKDGDAKYLLDATEKVVLHGAELDDKEFIAEGSASVDDRSEEKAVAEARKVEKHTAKQAKAGQRNQYNDWEEIPDQPERTAPKAPKRTKPLAPSRSVNTNDITNRYRFTKKEQKRRALHTQSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.56
3 0.58
4 0.52
5 0.55
6 0.56
7 0.59
8 0.65
9 0.66
10 0.63
11 0.63
12 0.67
13 0.64
14 0.63
15 0.54
16 0.49
17 0.47
18 0.42
19 0.41
20 0.38
21 0.33
22 0.28
23 0.29
24 0.25
25 0.22
26 0.27
27 0.23
28 0.21
29 0.22
30 0.23
31 0.21
32 0.22
33 0.22
34 0.17
35 0.17
36 0.15
37 0.18
38 0.2
39 0.2
40 0.24
41 0.24
42 0.24
43 0.24
44 0.32
45 0.36
46 0.39
47 0.39
48 0.33
49 0.35
50 0.34
51 0.33
52 0.25
53 0.18
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.12
62 0.12
63 0.14
64 0.16
65 0.19
66 0.21
67 0.27
68 0.27
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.19
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.14
80 0.12
81 0.11
82 0.13
83 0.13
84 0.14
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.21
89 0.23
90 0.21
91 0.22
92 0.24
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.16
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.16
123 0.18
124 0.21
125 0.22
126 0.23
127 0.24
128 0.26
129 0.24
130 0.17
131 0.14
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.11
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.14
143 0.18
144 0.21
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.2
149 0.19
150 0.17
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.17
168 0.15
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.16
174 0.17
175 0.13
176 0.16
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.15
185 0.15
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.22
193 0.22
194 0.19
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.16
199 0.14
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.07
218 0.07
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.14
234 0.17
235 0.19
236 0.19
237 0.22
238 0.25
239 0.3
240 0.32
241 0.36
242 0.4
243 0.44
244 0.53
245 0.57
246 0.55
247 0.58
248 0.63
249 0.66
250 0.68
251 0.69
252 0.68
253 0.66
254 0.69
255 0.66
256 0.66
257 0.6
258 0.52
259 0.46
260 0.41
261 0.35
262 0.33
263 0.32
264 0.27
265 0.24
266 0.23
267 0.26
268 0.25
269 0.28
270 0.33
271 0.37
272 0.45
273 0.55
274 0.63
275 0.68
276 0.74
277 0.78
278 0.78
279 0.81
280 0.81
281 0.8
282 0.78
283 0.74
284 0.71
285 0.71
286 0.67
287 0.59
288 0.5
289 0.48
290 0.45
291 0.46
292 0.45
293 0.39
294 0.39
295 0.42
296 0.46
297 0.42
298 0.48
299 0.53
300 0.6
301 0.68
302 0.75
303 0.8
304 0.83
305 0.88
306 0.89