Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FRM0

Protein Details
Accession A0A4T0FRM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-121GHSKKDCVERPRKRGANKTNYVTHydrophilic
506-528KDKLKLAVDRERRRKTNNLTREEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021715  Slu7_dom  
IPR039974  Splicing_factor_SLU7  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF11708  Slu7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSAREEMRKKRELEEARKAGTAPAELDEDGKPINPHIPQYISQAPWYMDTGKPGLAHQRLNKEYDNSADKLSKWYDRSAKGFKAQRFRKGACDNCGAMGHSKKDCVERPRKRGANKTNYVTQSDDIVHDIATDFDAKRDRWNGYDPSTHRRVVEEYDAVEQERRRLQEDELDKQNSVSAAKKVVDATKQKIKDEFGSSDEEDEDDEKYADNADAVGQNVDANNRMTVRNLRIREDTAKYLMNLDLESAHYDPKTRSMREAPHADVKPEDSAFAGENFLRDSGDAAGIQNTQLFAWQSAGRGHDMHVQANPTATEMAHGAFKVKKDEIKDTQKNSMLSRYGGEEYLTPSHIPKEIRQGQNEDYVEYSRSGQLIKGKERAVAKSKYEEDGELAQIDRFLANSIITVFPGNHTAVFGSWFSIQVKSWGYACCHSTIYTSYCQGEAGKAAAQSTFSRHEIEAASKPQKSLAEQHKDKIASGTADLKGRAEREGNKYGFTKDPKALGDLDKDKLKLAVDRERRRKTNNLTREELEEEATKVDSGKVTAEDIEAQRLVKLDEDDPLRNVNLDANGVLPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.7
3 0.65
4 0.64
5 0.59
6 0.52
7 0.44
8 0.36
9 0.26
10 0.21
11 0.21
12 0.19
13 0.21
14 0.19
15 0.17
16 0.16
17 0.17
18 0.15
19 0.14
20 0.2
21 0.2
22 0.22
23 0.26
24 0.29
25 0.29
26 0.35
27 0.4
28 0.37
29 0.36
30 0.36
31 0.32
32 0.3
33 0.31
34 0.27
35 0.21
36 0.23
37 0.24
38 0.23
39 0.22
40 0.23
41 0.29
42 0.31
43 0.37
44 0.39
45 0.48
46 0.49
47 0.53
48 0.54
49 0.49
50 0.46
51 0.46
52 0.44
53 0.36
54 0.37
55 0.35
56 0.32
57 0.34
58 0.36
59 0.36
60 0.34
61 0.4
62 0.44
63 0.48
64 0.55
65 0.57
66 0.58
67 0.6
68 0.65
69 0.64
70 0.66
71 0.67
72 0.69
73 0.7
74 0.67
75 0.68
76 0.7
77 0.71
78 0.66
79 0.65
80 0.56
81 0.49
82 0.48
83 0.4
84 0.35
85 0.33
86 0.32
87 0.27
88 0.29
89 0.3
90 0.35
91 0.4
92 0.46
93 0.52
94 0.57
95 0.64
96 0.72
97 0.77
98 0.79
99 0.82
100 0.83
101 0.82
102 0.8
103 0.77
104 0.75
105 0.7
106 0.65
107 0.57
108 0.47
109 0.39
110 0.32
111 0.27
112 0.2
113 0.18
114 0.14
115 0.12
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.1
120 0.08
121 0.11
122 0.15
123 0.16
124 0.21
125 0.26
126 0.27
127 0.28
128 0.34
129 0.36
130 0.36
131 0.44
132 0.41
133 0.45
134 0.47
135 0.46
136 0.4
137 0.37
138 0.35
139 0.31
140 0.32
141 0.27
142 0.23
143 0.25
144 0.25
145 0.23
146 0.24
147 0.21
148 0.2
149 0.23
150 0.23
151 0.23
152 0.25
153 0.25
154 0.3
155 0.35
156 0.37
157 0.39
158 0.4
159 0.36
160 0.34
161 0.34
162 0.27
163 0.23
164 0.19
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.18
169 0.19
170 0.21
171 0.27
172 0.29
173 0.33
174 0.38
175 0.4
176 0.41
177 0.42
178 0.41
179 0.39
180 0.38
181 0.34
182 0.28
183 0.3
184 0.28
185 0.26
186 0.24
187 0.19
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.15
214 0.21
215 0.27
216 0.28
217 0.3
218 0.31
219 0.34
220 0.38
221 0.37
222 0.33
223 0.28
224 0.27
225 0.24
226 0.23
227 0.21
228 0.16
229 0.12
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.18
240 0.22
241 0.21
242 0.25
243 0.29
244 0.34
245 0.39
246 0.43
247 0.38
248 0.41
249 0.41
250 0.37
251 0.32
252 0.29
253 0.24
254 0.2
255 0.17
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.05
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.16
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.13
309 0.14
310 0.17
311 0.19
312 0.26
313 0.33
314 0.41
315 0.47
316 0.47
317 0.52
318 0.53
319 0.52
320 0.46
321 0.42
322 0.33
323 0.27
324 0.24
325 0.21
326 0.18
327 0.16
328 0.15
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.24
340 0.33
341 0.37
342 0.39
343 0.42
344 0.41
345 0.47
346 0.45
347 0.35
348 0.27
349 0.24
350 0.22
351 0.19
352 0.18
353 0.11
354 0.12
355 0.11
356 0.12
357 0.17
358 0.22
359 0.25
360 0.29
361 0.29
362 0.32
363 0.35
364 0.38
365 0.39
366 0.38
367 0.37
368 0.38
369 0.39
370 0.37
371 0.36
372 0.31
373 0.26
374 0.23
375 0.22
376 0.16
377 0.14
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.1
394 0.11
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.14
408 0.16
409 0.15
410 0.17
411 0.18
412 0.2
413 0.22
414 0.23
415 0.22
416 0.21
417 0.2
418 0.2
419 0.2
420 0.21
421 0.21
422 0.22
423 0.21
424 0.2
425 0.2
426 0.19
427 0.17
428 0.14
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.13
435 0.13
436 0.16
437 0.19
438 0.18
439 0.2
440 0.2
441 0.22
442 0.22
443 0.25
444 0.27
445 0.3
446 0.35
447 0.33
448 0.34
449 0.35
450 0.35
451 0.33
452 0.37
453 0.4
454 0.45
455 0.47
456 0.5
457 0.53
458 0.52
459 0.5
460 0.43
461 0.36
462 0.26
463 0.26
464 0.28
465 0.24
466 0.26
467 0.26
468 0.24
469 0.24
470 0.24
471 0.25
472 0.24
473 0.28
474 0.33
475 0.42
476 0.41
477 0.42
478 0.43
479 0.44
480 0.46
481 0.45
482 0.43
483 0.38
484 0.42
485 0.39
486 0.4
487 0.4
488 0.36
489 0.39
490 0.37
491 0.38
492 0.38
493 0.37
494 0.35
495 0.33
496 0.32
497 0.28
498 0.3
499 0.36
500 0.43
501 0.53
502 0.63
503 0.71
504 0.75
505 0.77
506 0.8
507 0.81
508 0.81
509 0.8
510 0.77
511 0.74
512 0.7
513 0.68
514 0.61
515 0.51
516 0.43
517 0.35
518 0.28
519 0.23
520 0.21
521 0.17
522 0.14
523 0.15
524 0.13
525 0.12
526 0.14
527 0.14
528 0.15
529 0.15
530 0.16
531 0.2
532 0.2
533 0.23
534 0.22
535 0.21
536 0.2
537 0.21
538 0.2
539 0.17
540 0.19
541 0.16
542 0.21
543 0.26
544 0.28
545 0.29
546 0.31
547 0.28
548 0.26
549 0.26
550 0.23
551 0.2
552 0.19
553 0.17