Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FN88

Protein Details
Accession A0A4T0FN88    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-317YRDYSPPRGGRRGRNKYGRDRRDRDRDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-312PRGGRRGRNKYGRDRRDR
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MSSNNKLLSRINFGGRIYKIEDADLDNIEAYESHSADKGGDEAETSLQVDDDTRARRQSKFGGVDDTEMRDSKDEPEEHKEQENTENHNNTTNATTHDTVNIDDAVVRPYSLFLVGDIVGKLSTQQLLAYASEFCDPPPYGMEWIDDQRCVFLWHESHDFRQAWRGLLLDPPEGGMARHGQPHFFDLHAARNVPSTLSKVDPTTSDADADAVQIRVRPATTADVKQKTQYRNSRWYSNHGRRAGKIGDEPVRARSDSTRDHPREVSPGRWQNDKADLDAELDGISKGDYRDYSPPRGGRRGRNKYGRDRRDRDRDGDTRKHISNADDLDKELDEYLSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.4
4 0.35
5 0.35
6 0.31
7 0.28
8 0.29
9 0.24
10 0.26
11 0.23
12 0.2
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.14
39 0.17
40 0.2
41 0.27
42 0.3
43 0.32
44 0.36
45 0.41
46 0.45
47 0.48
48 0.47
49 0.47
50 0.44
51 0.45
52 0.42
53 0.38
54 0.31
55 0.26
56 0.24
57 0.18
58 0.19
59 0.19
60 0.24
61 0.23
62 0.26
63 0.32
64 0.36
65 0.37
66 0.41
67 0.39
68 0.34
69 0.39
70 0.4
71 0.39
72 0.43
73 0.43
74 0.39
75 0.42
76 0.4
77 0.33
78 0.31
79 0.26
80 0.21
81 0.22
82 0.23
83 0.19
84 0.21
85 0.21
86 0.19
87 0.19
88 0.15
89 0.11
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.05
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.12
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.13
142 0.17
143 0.18
144 0.19
145 0.23
146 0.23
147 0.21
148 0.26
149 0.24
150 0.2
151 0.2
152 0.19
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.14
173 0.11
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.13
207 0.17
208 0.21
209 0.29
210 0.33
211 0.34
212 0.39
213 0.44
214 0.44
215 0.5
216 0.54
217 0.54
218 0.59
219 0.63
220 0.66
221 0.62
222 0.66
223 0.68
224 0.68
225 0.69
226 0.67
227 0.65
228 0.58
229 0.61
230 0.55
231 0.47
232 0.4
233 0.37
234 0.36
235 0.36
236 0.36
237 0.34
238 0.34
239 0.31
240 0.3
241 0.27
242 0.27
243 0.3
244 0.35
245 0.42
246 0.43
247 0.47
248 0.48
249 0.46
250 0.49
251 0.47
252 0.45
253 0.44
254 0.49
255 0.48
256 0.52
257 0.51
258 0.46
259 0.51
260 0.48
261 0.39
262 0.32
263 0.3
264 0.26
265 0.24
266 0.2
267 0.11
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.24
278 0.29
279 0.35
280 0.41
281 0.47
282 0.51
283 0.6
284 0.64
285 0.65
286 0.71
287 0.75
288 0.79
289 0.83
290 0.84
291 0.86
292 0.9
293 0.9
294 0.89
295 0.87
296 0.86
297 0.87
298 0.85
299 0.79
300 0.77
301 0.76
302 0.74
303 0.76
304 0.73
305 0.69
306 0.65
307 0.63
308 0.56
309 0.5
310 0.48
311 0.45
312 0.44
313 0.38
314 0.36
315 0.35
316 0.32
317 0.3
318 0.24
319 0.18