FuNGI

A0A4T0FUS6

Protein Details

Accession

A0A4T0FUS6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
539-591	SEDEEDKPRRPKKQTITRDRNESKEDKKARKQAAKSEKQNRRVEKKETKEAFA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-52	RVGKEREGSGSKGKG
488-493	KKKSAG
545-587	KPRRPKKQTITRDRNESKEDKKARKQAAKSEKQNRRVEKKETK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPVSIFKKPGAQKFQLVHRSQRDEGRDPSKDEGVLKRVGKEREGSGSKGKGKANAGDAANFGIYYDDTEYDYTQHLRTIGGQDAFGDELDSVMIAAPQPQDAKAAKRGFMLKQQQEQEDKEKAMLKAYESQTAIPLELQGFNPDMDPALRQTLEALEDDAYLGEDPGDFDEAEEVDAADEGADEEWFDDLVGGGIRANDEVVDFGPDEQEDPAITARKEREREEYETAKANGEDLTPYHTEDWMQKFREFKLANKDKASPPASDDLPSDADEMEEITDYGSEGADTVGSLRTGIGAARTRRKLRKAGSDASGYSMSSSSMFRNDGLQSLDAQFDRIEEEYNSEDDDVDEEDDDDFDPTSELNVNSREDFDTILDEFLDKYEVIGGKVKQKLEGDTAADKLNTMRLAMADLAPKGEQLKKHEEAASKRITSAYRIAEGEEEEDDSTMPMPYDIDAKEDRMDAQTILSTYTNTENHPTKIRSQDLLNRKKKSAGASKGPEKHVAFAEKEDVAPIKKVQIVVDPKTGFPMEIAEGEESEESEDEEDKPRRPKKQTITRDRNESKEDKKARKQAAKSEKQNRRVEKKETKEAFASERKSQLSQTANAKQREDVQASMKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.68
3	0.7
4	0.67
5	0.66
6	0.67
7	0.69
8	0.66
9	0.68
10	0.65
11	0.62
12	0.65
13	0.65
14	0.61
15	0.58
16	0.58
17	0.54
18	0.49
19	0.47
20	0.45
21	0.41
22	0.43
23	0.42
24	0.44
25	0.47
26	0.48
27	0.47
28	0.44
29	0.43
30	0.46
31	0.47
32	0.45
33	0.46
34	0.5
35	0.53
36	0.55
37	0.54
38	0.5
39	0.5
40	0.51
41	0.48
42	0.46
43	0.41
44	0.36
45	0.35
46	0.3
47	0.26
48	0.2
49	0.16
50	0.1
51	0.09
52	0.09
53	0.1
54	0.1
55	0.11
56	0.13
57	0.13
58	0.14
59	0.16
60	0.17
61	0.16
62	0.17
63	0.16
64	0.15
65	0.18
66	0.2
67	0.23
68	0.22
69	0.21
70	0.19
71	0.2
72	0.2
73	0.17
74	0.13
75	0.07
76	0.07
77	0.06
78	0.06
79	0.04
80	0.04
81	0.04
82	0.04
83	0.07
84	0.07
85	0.09
86	0.11
87	0.11
88	0.16
89	0.18
90	0.23
91	0.29
92	0.32
93	0.32
94	0.35
95	0.4
96	0.38
97	0.45
98	0.51
99	0.49
100	0.53
101	0.57
102	0.58
103	0.58
104	0.59
105	0.56
106	0.5
107	0.44
108	0.4
109	0.4
110	0.35
111	0.35
112	0.32
113	0.28
114	0.32
115	0.33
116	0.35
117	0.31
118	0.31
119	0.29
120	0.28
121	0.26
122	0.17
123	0.16
124	0.12
125	0.13
126	0.13
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.1
133	0.09
134	0.1
135	0.1
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.12
140	0.13
141	0.13
142	0.13
143	0.12
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.08
149	0.06
150	0.06
151	0.05
152	0.04
153	0.05
154	0.05
155	0.07
156	0.06
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.03
168	0.03
169	0.04
170	0.03
171	0.03
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.03
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.05
199	0.06
200	0.08
201	0.11
202	0.11
203	0.14
204	0.18
205	0.25
206	0.29
207	0.3
208	0.37
209	0.39
210	0.45
211	0.47
212	0.46
213	0.41
214	0.42
215	0.41
216	0.33
217	0.28
218	0.23
219	0.17
220	0.14
221	0.12
222	0.08
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.12
227	0.11
228	0.12
229	0.17
230	0.23
231	0.25
232	0.27
233	0.28
234	0.29
235	0.3
236	0.38
237	0.34
238	0.32
239	0.38
240	0.44
241	0.46
242	0.47
243	0.5
244	0.43
245	0.5
246	0.47
247	0.37
248	0.31
249	0.3
250	0.28
251	0.25
252	0.23
253	0.17
254	0.16
255	0.16
256	0.14
257	0.1
258	0.1
259	0.08
260	0.08
261	0.06
262	0.05
263	0.04
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.07
283	0.11
284	0.15
285	0.22
286	0.27
287	0.33
288	0.39
289	0.44
290	0.48
291	0.49
292	0.56
293	0.55
294	0.55
295	0.52
296	0.49
297	0.44
298	0.39
299	0.34
300	0.23
301	0.17
302	0.13
303	0.1
304	0.08
305	0.09
306	0.07
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.11
311	0.11
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.11
316	0.12
317	0.13
318	0.1
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.09
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.08
350	0.1
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.11
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.05
367	0.05
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.13
372	0.15
373	0.21
374	0.25
375	0.25
376	0.26
377	0.26
378	0.27
379	0.26
380	0.27
381	0.23
382	0.21
383	0.22
384	0.2
385	0.18
386	0.16
387	0.13
388	0.14
389	0.11
390	0.1
391	0.08
392	0.07
393	0.09
394	0.09
395	0.11
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.1
401	0.12
402	0.14
403	0.16
404	0.2
405	0.28
406	0.29
407	0.33
408	0.37
409	0.41
410	0.42
411	0.46
412	0.46
413	0.39
414	0.37
415	0.36
416	0.33
417	0.3
418	0.31
419	0.26
420	0.23
421	0.23
422	0.23
423	0.21
424	0.21
425	0.19
426	0.14
427	0.12
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.06
438	0.09
439	0.09
440	0.13
441	0.13
442	0.15
443	0.16
444	0.16
445	0.17
446	0.15
447	0.16
448	0.13
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.13
453	0.12
454	0.1
455	0.11
456	0.16
457	0.16
458	0.16
459	0.22
460	0.24
461	0.26
462	0.33
463	0.34
464	0.35
465	0.42
466	0.44
467	0.41
468	0.42
469	0.49
470	0.53
471	0.61
472	0.64
473	0.61
474	0.59
475	0.61
476	0.6
477	0.59
478	0.59
479	0.56
480	0.58
481	0.61
482	0.69
483	0.71
484	0.7
485	0.69
486	0.6
487	0.54
488	0.49
489	0.45
490	0.37
491	0.32
492	0.33
493	0.26
494	0.25
495	0.24
496	0.21
497	0.19
498	0.19
499	0.18
500	0.18
501	0.19
502	0.21
503	0.2
504	0.26
505	0.32
506	0.34
507	0.41
508	0.38
509	0.36
510	0.39
511	0.38
512	0.29
513	0.22
514	0.21
515	0.14
516	0.14
517	0.16
518	0.13
519	0.12
520	0.13
521	0.13
522	0.11
523	0.1
524	0.09
525	0.08
526	0.08
527	0.09
528	0.1
529	0.18
530	0.22
531	0.27
532	0.37
533	0.44
534	0.52
535	0.58
536	0.67
537	0.7
538	0.78
539	0.83
540	0.85
541	0.88
542	0.87
543	0.9
544	0.86
545	0.82
546	0.78
547	0.75
548	0.7
549	0.7
550	0.72
551	0.71
552	0.75
553	0.78
554	0.81
555	0.83
556	0.83
557	0.83
558	0.85
559	0.85
560	0.86
561	0.87
562	0.87
563	0.87
564	0.89
565	0.89
566	0.88
567	0.85
568	0.85
569	0.85
570	0.84
571	0.85
572	0.81
573	0.76
574	0.7
575	0.65
576	0.63
577	0.61
578	0.57
579	0.52
580	0.53
581	0.51
582	0.48
583	0.46
584	0.46
585	0.43
586	0.44
587	0.48
588	0.51
589	0.56
590	0.59
591	0.59
592	0.53
593	0.55
594	0.57
595	0.51
596	0.45

A0A4T0FUS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer