Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4T0FKU0

Protein Details
Accession A0A4T0FKU0    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-155YSNNMKEYIRRTKKRSNKSNIANDLSHydrophilic
539-565GLRVDAEDNKTKKKRRKSNKGDLVAGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
548-558KTKKKRRKSNK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000608  UBQ-conjugat_E2  
IPR023313  UBQ-conjugating_AS  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00179  UQ_con  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS00183  UBC_1  
PS50127  UBC_2  
CDD cd00195  UBCc  
Amino Acid Sequences MSTASRRRLIRDFKRLSSDPPGGVSGAPCGDNIMIWNAVIFGPGETPFEDGTFRLLLTFDEQYPNKPPTVKFTSKMFHPNVYANGELCLDILQNRWSPTYDVAAVLTSIQSLLHDPNPNSPANSEAASLYSNNMKEYIRRTKKRSNKSNIANDLSNLSIQSAQIPQAPQYSQEYSSNALLWLSMALTPASLDRNTQVHEHVLRYNGWVSASHLIKHTPFLNQLKPFNGQQQLISQHIRNDPDCGLECMLDGTRGICIRRADTLDMDLDVDEMSVYLQGLPLSLSTYQGVFDFLKDKVPEIQSLHFPRLFSKGSDATGVYRGMVFVSFWSTSDASSVLTKWPWLSGTSAVNSSKNQIRSLSVQRWNELQEEYTAYCNKIRQQNQSHRAQLCAAAETHQSSMQSTSNTIDPDVKSQNNQDQTPQQPQFPSGCVLELTDVDSTTSKPAIRADVLKAVDQSELAYIEYTKALSLAVIRFTTSAAAAKAQQALGGEIISGIREANYWNSIPERLRLQALEKSGQASIDSEIPADSSEQGGLQSGLRVDAEDNKTKKKRRKSNKGDLVAGDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.72
3 0.69
4 0.67
5 0.62
6 0.52
7 0.47
8 0.42
9 0.34
10 0.33
11 0.27
12 0.21
13 0.18
14 0.16
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.06
29 0.08
30 0.09
31 0.11
32 0.1
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.14
45 0.16
46 0.15
47 0.22
48 0.23
49 0.26
50 0.32
51 0.33
52 0.32
53 0.34
54 0.34
55 0.35
56 0.44
57 0.46
58 0.44
59 0.49
60 0.51
61 0.51
62 0.6
63 0.54
64 0.49
65 0.46
66 0.47
67 0.44
68 0.43
69 0.39
70 0.3
71 0.27
72 0.24
73 0.2
74 0.16
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.13
80 0.15
81 0.17
82 0.18
83 0.19
84 0.21
85 0.22
86 0.24
87 0.21
88 0.18
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.07
99 0.09
100 0.14
101 0.2
102 0.21
103 0.27
104 0.31
105 0.31
106 0.3
107 0.28
108 0.25
109 0.22
110 0.22
111 0.16
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.16
121 0.15
122 0.18
123 0.25
124 0.35
125 0.42
126 0.49
127 0.56
128 0.65
129 0.75
130 0.82
131 0.85
132 0.84
133 0.84
134 0.85
135 0.88
136 0.85
137 0.79
138 0.69
139 0.59
140 0.5
141 0.4
142 0.31
143 0.21
144 0.14
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.2
157 0.21
158 0.21
159 0.22
160 0.23
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.16
165 0.13
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.17
185 0.19
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.2
191 0.2
192 0.16
193 0.15
194 0.13
195 0.13
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.2
203 0.18
204 0.14
205 0.2
206 0.23
207 0.29
208 0.32
209 0.33
210 0.34
211 0.35
212 0.34
213 0.34
214 0.33
215 0.28
216 0.24
217 0.26
218 0.26
219 0.27
220 0.28
221 0.23
222 0.23
223 0.25
224 0.27
225 0.23
226 0.23
227 0.2
228 0.2
229 0.21
230 0.18
231 0.15
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.05
239 0.06
240 0.08
241 0.08
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.09
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.15
284 0.16
285 0.18
286 0.18
287 0.19
288 0.23
289 0.25
290 0.28
291 0.25
292 0.24
293 0.23
294 0.25
295 0.24
296 0.18
297 0.2
298 0.18
299 0.18
300 0.19
301 0.18
302 0.14
303 0.16
304 0.15
305 0.11
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.14
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.2
339 0.22
340 0.22
341 0.22
342 0.2
343 0.21
344 0.26
345 0.33
346 0.37
347 0.4
348 0.39
349 0.39
350 0.4
351 0.4
352 0.36
353 0.29
354 0.21
355 0.15
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.15
361 0.17
362 0.18
363 0.23
364 0.29
365 0.34
366 0.41
367 0.5
368 0.6
369 0.66
370 0.71
371 0.73
372 0.65
373 0.61
374 0.52
375 0.45
376 0.35
377 0.29
378 0.21
379 0.15
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.13
390 0.14
391 0.15
392 0.15
393 0.16
394 0.18
395 0.16
396 0.21
397 0.25
398 0.25
399 0.25
400 0.29
401 0.35
402 0.36
403 0.36
404 0.35
405 0.37
406 0.41
407 0.48
408 0.45
409 0.41
410 0.37
411 0.39
412 0.37
413 0.31
414 0.29
415 0.2
416 0.19
417 0.16
418 0.15
419 0.13
420 0.12
421 0.12
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.12
430 0.13
431 0.15
432 0.17
433 0.2
434 0.22
435 0.24
436 0.28
437 0.29
438 0.29
439 0.28
440 0.25
441 0.22
442 0.19
443 0.16
444 0.11
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.09
457 0.1
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.14
463 0.14
464 0.12
465 0.12
466 0.1
467 0.12
468 0.13
469 0.15
470 0.17
471 0.16
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.14
476 0.12
477 0.09
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.07
486 0.1
487 0.14
488 0.14
489 0.16
490 0.18
491 0.23
492 0.24
493 0.27
494 0.27
495 0.27
496 0.29
497 0.29
498 0.31
499 0.31
500 0.34
501 0.34
502 0.3
503 0.3
504 0.28
505 0.27
506 0.23
507 0.19
508 0.16
509 0.16
510 0.15
511 0.13
512 0.13
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.11
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.2
531 0.26
532 0.33
533 0.37
534 0.47
535 0.56
536 0.65
537 0.73
538 0.75
539 0.8
540 0.83
541 0.9
542 0.91
543 0.93
544 0.94
545 0.92
546 0.88